BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-001D23
Chromosome1 (Build37)
Map Location 126,843,051 - 127,022,813
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDpp10, LOC666998
Downstream geneActr3, Slc35f5, Lypd1, E030049G20Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-001D23.bB6Ng01-001D23.g
ACCDH839624DH839625
length1,156745
definitionDH839624|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-001D23, 5' end.DH839625|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-001D23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,843,051 - 126,844,201)(127,022,069 - 127,022,813)
sequence
gaattcccttcccaaatgctggattgttttcataatttccatcagtcttt
actttttgttgtcctgtgtatcacttgagcatttattatcaagttcttgt
tcattctctttaagttactaagctgcttctttgagtcttggagtcttctt
tgaattcctggaattacatgatgaagttatgattgctctttcaaattttg
tgtcctggagttcatttattcattaatagatatttctgcatgactgctga
gagtattggtggatatacatttatcatttatattatttacatgttagaat
gggagctaggtatgtggacttcttcattagttctgtgtctggtatggaca
gagcaggttggggcaccagacagtctgtacatgctgggttgagtgtaagg
attggatatggctcagttgtattgaagtcagggggacatagagaacttcg
ctggtgagcaggatatttatcctggatcaagcctagagtatggggtagat
cttagtgttggggaagatatatgctgaatcaggaattctgatctcgctag
acaaggagaatgatgtgcaggatctggtagggtagaaaggttagatgtag
catgggtaaggtctgtcaatcatgggcaggcaaggcatgtcctgtcagaa
gcctagaggttggtcgggatgcaggtagtggtggccagagtaggccaggg
cattggatgtgagatgtagtctggatctcaggagggtgcttggaaagaag
acttggaatgactcatctaactagaccctagacaaggacatccacaggct
gatttttaaagcaggtcacgtgagtggctaaaacaacctgaaaagaggac
ttttgttattctctcactagagaagaagcagataattagtcttttattgt
tattctctcatatgttaccccctgaccatagtttcccttttcttaattct
tcccagtcctccttcctcactttccttctccaccagatttacttttctca
cttctccatttccctttaaaaaaaaataggccattcagttatattatgaa
cacagtatacaaaaattacaattaagattagacttcccaattaagaactg
gacaaaggcaaatggccttctacactgcaaagatcagtctttggagttat
tcattt
gaattccagacctcgagggtacagaagcaccactccagttggagagacca
ctgactctaaggggcttgggtgttcataggggtttaggtgttctacccac
tcacccacccttggcaacttctttattggactcaaggggtctctgtgtac
cttctatagcagggtttgggactctgtctctgtaactgttgaatggccag
ggtaagagtggacttcccaaacccctctgctccttgatgtctaacaagta
cagaacaatcaactgcatgttggggaatagtcaataagcagtgagaactt
catgtttgggggcaagatgtcacaaagaaatggaaacttactgccaattg
ctgggagcaagaagtcagcgcagtttaaatcggggtttatgttccccctt
ctcccatgctagaggtccacagtgctccttcccttggtggcggcgaagtt
tggcagaagctctgaggcacctgtaatgcaaaaatgcttttcatctctat
tttactggagacttttgaaactattcaggccctcccagaattaatatttc
atagaaattagtttagggaatacttattttcaaatgactttaagaaaaat
ggctttattcctctctgaccttattcctggggtagaaacttcagtcagag
gatgggacaaacacttctggacttattttcctgatcacttcttcatctca
tttccagaatcagcaggtaggcggcgggtggggggtgggagaggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_126843051_126844201
seq2: B6Ng01-001D23.b_49_1199

seq1  CCCTTCCCAAATGCTGGATTGTTTTCATAATTTCCATCAGTCTTTACTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCCCAAATGCTGGATTGTTTTCATAATTTCCATCAGTCTTTACTTT  50

seq1  TTGTTGTCCTGTGTATCACTTGAGCATTTATTATCAAGTTCTTGTTCATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGTCCTGTGTATCACTTGAGCATTTATTATCAAGTTCTTGTTCATT  100

seq1  CTCTTTAAGTTACTAAGCTGCTTCTTTGAGTCTTGGAGTCTTCTTTGAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTAAGTTACTAAGCTGCTTCTTTGAGTCTTGGAGTCTTCTTTGAAT  150

seq1  TCCTGGAATTACATGATGAAGTTATGATTGCTCTTTCAAATTTTGTGTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGAATTACATGATGAAGTTATGATTGCTCTTTCAAATTTTGTGTCC  200

seq1  TGGAGTTCATTTATTCATTAATAGATATTTCTGCATGACTGCTGAGAGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTTCATTTATTCATTAATAGATATTTCTGCATGACTGCTGAGAGTA  250

seq1  TTGGTGGATATACATTTATCATTTATATTATTTACATGTTAGAATGGGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGGATATACATTTATCATTTATATTATTTACATGTTAGAATGGGAG  300

seq1  CTAGGTATGTGGACTTCTTCATTAGTTCTGTGTCTGGTATGGACAGAGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGTATGTGGACTTCTTCATTAGTTCTGTGTCTGGTATGGACAGAGCA  350

seq1  GGTTGGGGCACCAGACAGTCTGTACATGCTGGGTTGAGTGTAAGGATTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGGGGCACCAGACAGTCTGTACATGCTGGGTTGAGTGTAAGGATTGG  400

seq1  ATATGGCTCAGTTGTATTGAAGTCAGGGGGACATAGAGAACTTCGCTGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGGCTCAGTTGTATTGAAGTCAGGGGGACATAGAGAACTTCGCTGGT  450

seq1  GAGCAGGATATTTATCCTGGATCAAGCCTAGAGTATGGGGTAGATCTTAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGGATATTTATCCTGGATCAAGCCTAGAGTATGGGGTAGATCTTAG  500

seq1  TGTTGGGGAAGATATATGCTGAATCAGGAATTCTGATCTCGCTAGACAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGGGGAAGATATATGCTGAATCAGGAATTCTGATCTCGCTAGACAAG  550

seq1  GAGAATGATGTGCAGGATCTGGTAGGGTAGAAAGGTTAGATGTAGCATGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATGATGTGCAGGATCTGGTAGGGTAGAAAGGTTAGATGTAGCATGG  600

seq1  GTAAGGTCTGTCAATCATGGGCAGGCAAGGCATGTCCTGTCAGAAGCCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGGTCTGTCAATCATGGGCAGGCAAGGCATGTCCTGTCAGAAGCCTA  650

seq1  GAGGTTGGTCGGGATGCAGGTAGTGGTGGCCAGAGTAGGCCAGGGCATTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTTGGTCGGGATGCAGGTAGTGGTGGCCAGAGTAGGCCAGGGCATTG  700

seq1  GATGTGAGATGTAGTCTGGATCTCAGGAGGGTGCTTGGAAAGAAGACTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGAGATGTAGTCTGGATCTCAGGAGGGTGCTTGGAAAGAAGACTTG  750

seq1  GAATGACTCATCTAACTAGACCCTAGACAAGGACATCCACAGGCTGATTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGACTCATCTAACTAGACCCTAGACAAGGACATCCACAGGCTGATTT  800

seq1  TTAAAGCAGGTCACGTGAGTGGCTAAAACAACCTGAAAAGAGGACTTTTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGCAGGTCACGTGAGTGGCTAAAACAACCTGAAAAGAGGACTTTTG  850

seq1  TTATTCTCTCACTAGAGAAGAAGCAGATAATTAGTCTTTTATTGTTATTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCTCTCACTAGAGAAGAAGCAGATAATTAGTCTTTTATTGTTATTC  900

seq1  TCTCATATGTTACCCCCTGACCATAGTTTCCCTTTTCTTAATTCTTCCCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATATGTTACCCCCTGACCATAGTTTCCCTTTTCTTAATTCTTCCCA  950

seq1  GTCCTCC-TCCTCACTTTCCTTCTCCACCAGATTTACTCTTCCTCCACTT  999
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||
seq2  GTCCTCCTTCCTCACTTTCCTTCTCCACCAGATTTACTTTTC--TCACTT  998

seq1  CTCCATTTCCCTTTAAAAAAAAATAGGCCATTCAGTAATATTAATGGAAC  1049
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||
seq2  CTCCATTTCCCTTTAAAAAAAAATAGGCCATTCAGTTATATTA--TGAAC  1046

seq1  ACAGTATAC-AAAATTACAA-TAAGATTAGACTCCCACATTAAG-ACTGG  1096
      ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||
seq2  ACAGTATACAAAAATTACAATTAAGATTAGACTTCCCAATTAAGAACTGG  1096

seq1  ACAAGGCAAAAATGCCTTCTACAACTGCAAAGATCAATCTTT-GAGTTAT  1145
      |||| |  |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||
seq2  ACAAAGGCAAATGGCCTTCTAC-ACTGCAAAGATCAGTCTTTGGAGTTAT  1145

seq1  TCATTT  1151
      ||||||
seq2  TCATTT  1151

seq1: chr1_127022069_127022813
seq2: B6Ng01-001D23.g_67_811 (reverse)

seq1  CCCTCTCCCACCCCCCACCCGCCGCCTACCTGCTGATTCTGGAAATGAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTCCCACCCCCCACCCGCCGCCTACCTGCTGATTCTGGAAATGAGA  50

seq1  TGAAGAAGTGATCAGGAAAATAAGTCCAGAAGTGTTTGTCCCATCCTCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAAGTGATCAGGAAAATAAGTCCAGAAGTGTTTGTCCCATCCTCTG  100

seq1  ACTGAAGTTTCTACCCCAGGAATAAGGTCAGAGAGGAATAAAGCCATTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAGTTTCTACCCCAGGAATAAGGTCAGAGAGGAATAAAGCCATTTT  150

seq1  TCTTAAAGTCATTTGAAAATAAGTATTCCCTAAACTAATTTCTATGAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAAGTCATTTGAAAATAAGTATTCCCTAAACTAATTTCTATGAAAT  200

seq1  ATTAATTCTGGGAGGGCCTGAATAGTTTCAAAAGTCTCCAGTAAAATAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATTCTGGGAGGGCCTGAATAGTTTCAAAAGTCTCCAGTAAAATAGA  250

seq1  GATGAAAAGCATTTTTGCATTACAGGTGCCTCAGAGCTTCTGCCAAACTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAAAAGCATTTTTGCATTACAGGTGCCTCAGAGCTTCTGCCAAACTT  300

seq1  CGCCGCCACCAAGGGAAGGAGCACTGTGGACCTCTAGCATGGGAGAAGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCGCCACCAAGGGAAGGAGCACTGTGGACCTCTAGCATGGGAGAAGGG  350

seq1  GGAACATAAACCCCGATTTAAACTGCGCTGACTTCTTGCTCCCAGCAATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACATAAACCCCGATTTAAACTGCGCTGACTTCTTGCTCCCAGCAATT  400

seq1  GGCAGTAAGTTTCCATTTCTTTGTGACATCTTGCCCCCAAACATGAAGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGTAAGTTTCCATTTCTTTGTGACATCTTGCCCCCAAACATGAAGTT  450

seq1  CTCACTGCTTATTGACTATTCCCCAACATGCAGTTGATTGTTCTGTACTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTGCTTATTGACTATTCCCCAACATGCAGTTGATTGTTCTGTACTT  500

seq1  GTTAGACATCAAGGAGCAGAGGGGTTTGGGAAGTCCACTCTTACCCTGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGACATCAAGGAGCAGAGGGGTTTGGGAAGTCCACTCTTACCCTGGC  550

seq1  CATTCAACAGTTACAGAGACAGAGTCCCAAACCCTGCTATAGAAGGTACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCAACAGTTACAGAGACAGAGTCCCAAACCCTGCTATAGAAGGTACA  600

seq1  CAGAGACCCCTTGAGTCCAATAAAGAAGTTGCCAAGGGTGGGTGAGTGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGACCCCTTGAGTCCAATAAAGAAGTTGCCAAGGGTGGGTGAGTGGG  650

seq1  TAGAACACCTAAACCCCTATGAACACCCAAGCCCCTTAGAGTCAGTGGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACACCTAAACCCCTATGAACACCCAAGCCCCTTAGAGTCAGTGGTC  700

seq1  TCTCCAACTGGAGTGGTGCTTCTGTACCCTCGAGGTCTGGAATTC  745
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAACTGGAGTGGTGCTTCTGTACCCTCGAGGTCTGGAATTC  745