BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-002L08
Chromosome1 (Build37)
Map Location 122,038,971 - 122,182,853
singlet/doubletdoublet
Overlap gene3110009E18Rik, Steap3
Upstream geneLOC666838, LOC100041778, Inhbb, Ralb, Tmem185b, Epb4.1l5, Ptpn4, LOC100042447, LOC666870, LOC100041863, Tmem177, Gm101, Sctr, Tmem37, Dbi
Downstream geneC1ql2, Marco, En1, AI848258
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-002L08.bB6Ng01-002L08.g
ACCDH840652DH840653
length7761,086
definitionDH840652|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-002L08, 5' end.DH840653|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-002L08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(122,182,079 - 122,182,853)(122,038,971 - 122,040,058)
sequence
gaattcctccaacaaggctattcctactccaacaaggccacacctactcc
ttcaaggccacacctactccagcaaggccacacctcctaatccctatcac
gtagcatcacttcctaatgatcaagcatccaaataaatgagtctatggga
tcattcctattcaaaccaccacatagtccttacaacaaccacagagacca
aagaagccaagagattccccaaaggccacaaaggcatcagagaaagaagt
tcaaatcttgggctgaagagatggttcagtggttaggagcactgactgat
cttctgaaggtcctgagttcaaatcccagcaaccacatagtggctcacaa
ccatctgtacagctacaatgtacttatatacttaaaataaataaataaat
caagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaaga
agaagaagaagaagaagaagaagaaaagctcaaatcctaaagcccttgca
cacaactattaccttagctaacacagccaccagaactgtcccaaatccaa
ggccaaagctctctaagtccccaccttccttaagtaagttttgaccccta
taaagattgcctttccctgtctcatacttgatgacctcctggcttttttt
ctctactagtagagagatgtatggacatatagatggacagacaggtaggt
aaatggacaagtgaatagacagttggatggatgcaggcatgagtatataa
tcagggagatggatgggagatggatg
gaattcaattttacaaacatacatgacagaacatgacagtttatgtcttg
attaactgacaaaactgccaggaccagaggcttctggtaacctgactccg
tgcttgtcttagcagtggttcgtgatggtaattttgacagccaacttcgt
agacacagactaccatgaatagccagaatcaactgcagttacatgctttt
cctaagctgatagagatcggtctgaagcccacaacccagtgttatgtgaa
catgtgttttccatgtccatgaggacatcaggctgtgccttttgtctcgc
ctcaggagccagccttgctgggtttctagctgtctggctgggaactctgc
caagctgagaggtgccagcttgggacgcttcacgggcctgaagtgttgtg
gcaacctgcacccatgctccttggctcctgaatgtctctcagtctggcaa
ctggaggctgtaagcctgcttgctgactccaagcccctaaacatgcttgt
gcctgggccagtgtggctctcggttcctagggaggacctttgaggggttg
ttgagtatctcggctgcattgatgtggctaccagggaaccaggtgctcca
gcaggcaccagccggaacaggttttatagatgcccaagtttaaagacctt
cctaagcctcgggcactctcgcttttcaaagccctacccaatggtgtcta
tgttagggtgtgaacagtctactttcagcagaactgcatgtaatacagag
atattgagttgctgttttttggttgggaaacagtaaaggttttctttata
tctccttccatcttcccttccctcctgtcctctctcctctccatcctctc
ttccctttttctcttcctttcatatgtcccccttgtcttcctttcctccc
tctccccatcctcttccttctttcctccctccctgtgtgtccttccttcc
ttgactcccccttgcttctttattccttccctctttccctcctatccgtc
tccctctctgatgctttgggatgctgggattcaggcttatgcttgcaagg
cagctgtgtatccactcttcagcttgcttacctctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_122182079_122182853
seq2: B6Ng01-002L08.b_48_823 (reverse)

seq1  CATCCATCT-CCATCCATCTCCCTGATTATATACTCATGCCTGCATCCAT  49
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCATCTCCCATCCATCTCCCTGATTATATACTCATGCCTGCATCCAT  50

seq1  CCAACTGTCTATTCACTTGTCCATTTACCTACCTGTCTGTCCATCTATAT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTGTCTATTCACTTGTCCATTTACCTACCTGTCTGTCCATCTATAT  100

seq1  GTCCATACATCTCTCTACTAGTAGAGAAAAAAAGCCAGGAGGTCATCAAG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCATACATCTCTCTACTAGTAGAGAAAAAAAGCCAGGAGGTCATCAAG  150

seq1  TATGAGACAGGGAAAGGCAATCTTTATAGGGGTCAAAACTTACTTAAGGA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGACAGGGAAAGGCAATCTTTATAGGGGTCAAAACTTACTTAAGGA  200

seq1  AGGTGGGGACTTAGAGAGCTTTGGCCTTGGATTTGGGACAGTTCTGGTGG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGGGACTTAGAGAGCTTTGGCCTTGGATTTGGGACAGTTCTGGTGG  250

seq1  CTGTGTTAGCTAAGGTAATAGTTGTGTGCAAGGGCTTTAGGATTTGAGCT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTTAGCTAAGGTAATAGTTGTGTGCAAGGGCTTTAGGATTTGAGCT  300

seq1  TTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT  350

seq1  TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTGATTTATTTATTTATTTTAAGTATA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTGATTTATTTATTTATTTTAAGTATA  400

seq1  TAAGTACATTGTAGCTGTACAGATGGTTGTGAGCCACTATGTGGTTGCTG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTACATTGTAGCTGTACAGATGGTTGTGAGCCACTATGTGGTTGCTG  450

seq1  GGATTTGAACTCAGGACCTTCAGAAGATCAGTCAGTGCTCCTAACCACTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTGAACTCAGGACCTTCAGAAGATCAGTCAGTGCTCCTAACCACTG  500

seq1  AACCATCTCTTCAGCCCAAGATTTGAACTTCTTTCTCTGATGCCTTTGTG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATCTCTTCAGCCCAAGATTTGAACTTCTTTCTCTGATGCCTTTGTG  550

seq1  GCCTTTGGGGAATCTCTTGGCTTCTTTGGTCTCTGTGGTTGTTGTAAGGA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTGGGGAATCTCTTGGCTTCTTTGGTCTCTGTGGTTGTTGTAAGGA  600

seq1  CTATGTGGTGGTTTGAATAGGAATGATCCCATAGACTCATTTATTTGGAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTGGTGGTTTGAATAGGAATGATCCCATAGACTCATTTATTTGGAT  650

seq1  GCTTGATCATTAGGAAGTGATGCTACGTGATAGGGATTAGGAGGTGTGGC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGATCATTAGGAAGTGATGCTACGTGATAGGGATTAGGAGGTGTGGC  700

seq1  CTTGCTGGAGTAGGTGTGGCCTTGAAGGAGTAGGTGTGGCCTTGTTGGAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTGGAGTAGGTGTGGCCTTGAAGGAGTAGGTGTGGCCTTGTTGGAG  750

seq1  TAGGAATAGCCTTGTTGGAGGAATTC  775
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAATAGCCTTGTTGGAGGAATTC  776

seq1: chr1_122038971_122040058
seq2: B6Ng01-002L08.g_70_1155

seq1  GAATTCAATTTTACAAACATACATGACAGAACATGACAGTTTATGTCTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATTTTACAAACATACATGACAGAACATGACAGTTTATGTCTTG  50

seq1  ATTAACTGACAAAACTGCCAGGACCAGAGGCTTCTGGTAACCTGACTCCG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAACTGACAAAACTGCCAGGACCAGAGGCTTCTGGTAACCTGACTCCG  100

seq1  TGCTTGTCTTAGCAGTGGTTCGTGATGGTAATTTTGACAGCCAACTTCGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGTCTTAGCAGTGGTTCGTGATGGTAATTTTGACAGCCAACTTCGT  150

seq1  AGACACAGACTACCATGAATAGCCAGAATCAACTGCAGTTACATGCTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACAGACTACCATGAATAGCCAGAATCAACTGCAGTTACATGCTTTT  200

seq1  CCTAAGCTGATAGAGATCGGTCTGAAGCCCACAACCCAGTGTTATGTGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAGCTGATAGAGATCGGTCTGAAGCCCACAACCCAGTGTTATGTGAA  250

seq1  CATGTGTTTTCCATGTCCATGAGGACATCAGGCTGTGCCTTTTGTCTCGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTTTTCCATGTCCATGAGGACATCAGGCTGTGCCTTTTGTCTCGC  300

seq1  CTCAGGAGCCAGCCTTGCTGGGTTTCTAGCTGTCTGGCTGGGAACTCTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGAGCCAGCCTTGCTGGGTTTCTAGCTGTCTGGCTGGGAACTCTGC  350

seq1  CAAGCTGAGAGGTGCCAGCTTGGGACGCTTCACGGGCCTGAAGTGTTGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTGAGAGGTGCCAGCTTGGGACGCTTCACGGGCCTGAAGTGTTGTG  400

seq1  GCAACCTGCACCCATGCTCCTTGGCTCCTGAATGTCTCTCAGTCTGGCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACCTGCACCCATGCTCCTTGGCTCCTGAATGTCTCTCAGTCTGGCAA  450

seq1  CTGGAGGCTGTAAGCCTGCTTGCTGACTCCAAGCCCCTAAACATGCTTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGGCTGTAAGCCTGCTTGCTGACTCCAAGCCCCTAAACATGCTTGT  500

seq1  GCCTGGGCCAGTGTGGCTCTCGGTTCCTAGGGAGGACCTTTGAGGGGTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGGCCAGTGTGGCTCTCGGTTCCTAGGGAGGACCTTTGAGGGGTTG  550

seq1  TTGAGTATCTCGGCTGCATTGATGTGGCTACCAGGGAACCAGGTGCTCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTATCTCGGCTGCATTGATGTGGCTACCAGGGAACCAGGTGCTCCA  600

seq1  GCAGGCACCAGCCGGAACAGGTTTTATAGATGCCCAAGTTTAAAGACCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGCACCAGCCGGAACAGGTTTTATAGATGCCCAAGTTTAAAGACCTT  650

seq1  CCTAAGCCTCGGGCACTCTCGCTTTTCAAAGCCCTACCCAATGGTGTCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAGCCTCGGGCACTCTCGCTTTTCAAAGCCCTACCCAATGGTGTCTA  700

seq1  TGTTAGGGTGTGAACAGTCTACTTTCAGCAGAACTGCATGTAATACAGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGGGTGTGAACAGTCTACTTTCAGCAGAACTGCATGTAATACAGAG  750

seq1  ATATTGAGTTGCTGTTTTTTGGTTGGGAAACAGT-AAGGTTTTCTTTATA  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ATATTGAGTTGCTGTTTTTTGGTTGGGAAACAGTAAAGGTTTTCTTTATA  800

seq1  TCTCCTTCCATCTTCCCTTCCCTCCTGTCCTCTCTCCTCTCCATCCTCTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTTCCATCTTCCCTTCCCTCCTGTCCTCTCTCCTCTCCATCCTCTC  850

seq1  TTCCCTTTTTCTCTTCCTTTCATATGTCCCCCTTGTCTTCCTTTCCTCCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTTTTTCTCTTCCTTTCATATGTCCCCCTTGTCTTCCTTTCCTCCC  900

seq1  TCTCCCCCATCCTCTTCCTTCTTTCCTCCCTCCCTGTGTGTCCTTCCTTC  949
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCT-CCCCATCCTCTTCCTTCTTTCCTCCCTCCCTGTGTGTCCTTCCTTC  949

seq1  CTTGACTCCCCCTTGCTTCTTTATTCCTTCCCTCTTTCCCTCCTATCCGT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGACTCCCCCTTGCTTCTTTATTCCTTCCCTCTTTCCCTCCTATCCGT  999

seq1  CCTCCCTCTCTGATGGCTTTGGGATGCTGGGGATCCAGCCTTATGCCTGC  1049
       ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||
seq2  -CTCCCTCTCTGAT-GCTTTGGGATGCT-GGGATTCAGGCTTATGCTTGC  1046

seq1  CAGGCAGGCTGTGTA-CCACTC-TCAGCTTGCGTACCTCTC  1088
       ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||
seq2  AAGGCA-GCTGTGTATCCACTCTTCAGCTTGCTTACCTCTC  1086