BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-008D14
Chromosome1 (Build37)
Map Location 108,092,267 - 108,211,285
singlet/doubletdoublet
Overlap genePhlpp
Upstream geneRnf152, LOC100041985, Pign, LOC666249, 2310035C23Rik, LOC100042023, Tnfrsf11a, EG635504, Zcchc2, EG435634
Downstream geneLOC626075, Bcl2, LOC100042085, Fvt1, Vps4b, Serpinb5, LOC671141, Serpinb12, Serpinb13, LOC666394, Serpinb3a, Serpinb3d, LOC100041276, Serpinb3b, EG666401, Serpinb3c, LOC666414
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-008D14.bB6Ng01-008D14.g
ACCDH844554DH844555
length3651,056
definitionDH844554|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-008D14, 5' end.DH844555|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-008D14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(108,092,267 - 108,092,631)(108,210,219 - 108,211,285)
sequence
tttaatttactttatagctatgttaacacactgctggtgtgaacaaggaa
ggacatagagctaacatttgaagatagtttaagaagtgtgtttgggggct
ggagagatggctcagtgattaagagcactgactgctcttccagaggtcct
gagttcaattccacagtaaccacatggtggcttctggtgtgtctgaagac
agctacagtgtactcataaacattaaataaataaataaataaataaataa
atcttaaaaatacaagaagtgtgcttggtaaattgtgatatgtatgtgtg
catgtaagtatgcatatacggagacaaggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtg
gaattctgcacataaacgagaagacggttgtgacttagcatgagtcacta
acagctctggtccaaccttgagtgctttaggaaatgatgtccctggctaa
ggagacagcctctgtgagttcactcggctttgggaaggatgctcaacttc
agctcatctagttctaacacccctacccatcaatgctttggaaaagtagg
agcagaataaaacttgttaatcattctcagacattctaatacttttcttg
ttccagctttacactcagcagcgccatctctgctaattcccactgcttca
tgacatgcaatcatttctttcctcacactgtatgaaatgtatttgcccca
gaactttcacagtgacattaaattactcaatgctaattctcactttataa
attctgcgtaactacagatagagaataaagttaattaaaagacttttgtg
tgaatgttactgtttctttttcttttcttttccttttttcttttcttttc
tttttttttttttttgagaaagtctcactgtgtcctaataaaagtagcat
tttaagctactagttttagatgaagcaaattttacatagaatttaaatac
tttaacattcctttcctttaaaaggttcaatgatttggagtcatatgaga
aataaagtatgtaatttatcctccattctaaattattagcagttatggca
tgtaaaagcaatgaaggcaatagcaaaatccagagacacagagagacaac
atacaaaaattagagatctgcagctggagctgacactgtcacacagccct
ctatacccaaatcccacagggacagagctggtctcccaagattgctgaca
aaacctgagaacacaggtaagatcaccacttctgctcaaatacttagccc
aagagggacccgcccagaggcctcaggacacaagaatggaggagcagcat
ttgcaccctgagattaccctgtgtcacagctctcataaccaagctcgggg
ctgaaacaccaagtagaacaaaagactatacaagatcacaaaccagagct
gttttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_108092267_108092631
seq2: B6Ng01-008D14.b_49_413

seq1  TTTAATTTACTTTATAGCTATGTTAACACACTGCTGGTGTGAACAAGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATTTACTTTATAGCTATGTTAACACACTGCTGGTGTGAACAAGGAA  50

seq1  GGACATAGAGCTAACATTTGAAGATAGTTTAAGAAGTGTGTTTGGGGGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACATAGAGCTAACATTTGAAGATAGTTTAAGAAGTGTGTTTGGGGGCT  100

seq1  GGAGAGATGGCTCAGTGATTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCAGAGGTCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGATGGCTCAGTGATTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCAGAGGTCCT  150

seq1  GAGTTCAATTCCACAGTAACCACATGGTGGCTTCTGGTGTGTCTGAAGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCAATTCCACAGTAACCACATGGTGGCTTCTGGTGTGTCTGAAGAC  200

seq1  AGCTACAGTGTACTCATAAACATTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTACAGTGTACTCATAAACATTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA  250

seq1  ATCTTAAAAATACAAGAAGTGTGCTTGGTAAATTGTGATATGTATGTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTAAAAATACAAGAAGTGTGCTTGGTAAATTGTGATATGTATGTGTG  300

seq1  CATGTAAGTATGCATATACGGAGACAAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTAAGTATGCATATACGGAGACAAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  350

seq1  GTGTGTGTGTGTGTG  365
      |||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTG  365

seq1: chr1_108210219_108211285
seq2: B6Ng01-008D14.g_66_1121 (reverse)

seq1  AAAAACAGCTCCTGGTTTTGTTGATTCTTTGTATAGTTCTTTTTGTTTCT  50
      |||||||||| |||||||   ||||   |||||||| ||||||   ||||
seq2  AAAAACAGCT-CTGGTTT--GTGAT--CTTGTATAG-TCTTTT--GTTCT  42

seq1  ACTTGGTTGTTTTCAGCCCCGAGCTTGGTTATGGAGAGCTGTGACACAGG  100
      |||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ACTTGGT--GTTTCAGCCCCGAGCTTGGTTAT-GAGAGCTGTGACACAGG  89

seq1  GTAATCTCAGGGTGCAAATGCTGCTCCTCCATTCTTGTGTCCTGAGGCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATCTCAGGGTGCAAATGCTGCTCCTCCATTCTTGTGTCCTGAGGCCT  139

seq1  CTGGGCGGGTCCCTCTTGGGCTAAGTATTTGAGCAGAAGTGGTGATCTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCGGGTCCCTCTTGGGCTAAGTATTTGAGCAGAAGTGGTGATCTTA  189

seq1  CCTGTGTTCTCAGGTTTTGTCAGCAATCTTGGGAGACCAGCTCTGTCCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGTTCTCAGGTTTTGTCAGCAATCTTGGGAGACCAGCTCTGTCCCT  239

seq1  GTGGGATTTGGGTATAGAGGGCTGTGTGACAGTGTCAGCTCCAGCTGCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGATTTGGGTATAGAGGGCTGTGTGACAGTGTCAGCTCCAGCTGCAG  289

seq1  ATCTCTAATTTTTGTATGTTGTCTCTCTGTGTCTCTGGATTTTGCTATTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTAATTTTTGTATGTTGTCTCTCTGTGTCTCTGGATTTTGCTATTG  339

seq1  CCTTCATTGCTTTTACATGCCATAACTGCTAATAATTTAGAATGGAGGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCATTGCTTTTACATGCCATAACTGCTAATAATTTAGAATGGAGGAT  389

seq1  AAATTACATACTTTATTTCTCATATGACTCCAAATCATTGAACCTTTTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTACATACTTTATTTCTCATATGACTCCAAATCATTGAACCTTTTAA  439

seq1  AGGAAAGGAATGTTAAAGTATTTAAATTCTATGTAAAATTTGCTTCATCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGGAATGTTAAAGTATTTAAATTCTATGTAAAATTTGCTTCATCT  489

seq1  AAAACTAGTAGCTTAAAATGCTACTTTTATTAGGACACAGTGAGACTTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTAGTAGCTTAAAATGCTACTTTTATTAGGACACAGTGAGACTTTC  539

seq1  TCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAGGAAAAGAAAAGAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAGGAAAAGAAAAGAAAA  589

seq1  AGAAACAGTAACATTCACACAAAAGTCTTTTAATTAACTTTATTCTCTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACAGTAACATTCACACAAAAGTCTTTTAATTAACTTTATTCTCTAT  639

seq1  CTGTAGTTACGCAGAATTTATAAAGTGAGAATTAGCATTGAGTAATTTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGTTACGCAGAATTTATAAAGTGAGAATTAGCATTGAGTAATTTAA  689

seq1  TGTCACTGTGAAAGTTCTGGGGCAAATACATTTCATACAGTGTGAGGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACTGTGAAAGTTCTGGGGCAAATACATTTCATACAGTGTGAGGAAA  739

seq1  GAAATGATTGCATGTCATGAAGCAGTGGGAATTAGCAGAGATGGCGCTGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGATTGCATGTCATGAAGCAGTGGGAATTAGCAGAGATGGCGCTGC  789

seq1  TGAGTGTAAAGCTGGAACAAGAAAAGTATTAGAATGTCTGAGAATGATTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGTAAAGCTGGAACAAGAAAAGTATTAGAATGTCTGAGAATGATTA  839

seq1  ACAAGTTTTATTCTGCTCCTACTTTTCCAAAGCATTGATGGGTAGGGGTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTTTTATTCTGCTCCTACTTTTCCAAAGCATTGATGGGTAGGGGTG  889

seq1  TTAGAACTAGATGAGCTGAAGTTGAGCATCCTTCCCAAAGCCGAGTGAAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAACTAGATGAGCTGAAGTTGAGCATCCTTCCCAAAGCCGAGTGAAC  939

seq1  TCACAGAGGCTGTCTCCTTAGCCAGGGACATCATTTCCTAAAGCACTCAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGAGGCTGTCTCCTTAGCCAGGGACATCATTTCCTAAAGCACTCAA  989

seq1  GGTTGGACCAGAGCTGTTAGTGACTCATGCTAAGTCACAACCGTCTTCTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGGACCAGAGCTGTTAGTGACTCATGCTAAGTCACAACCGTCTTCTC  1039

seq1  GTTTATGTGCAGAATTC  1067
      |||||||||||||||||
seq2  GTTTATGTGCAGAATTC  1056