BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010O13
Chromosome1 (Build37)
Map Location 124,463,604 - 124,646,288
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDdx18, LOC666971
Downstream geneLOC666983, Dpp10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010O13.bB6Ng01-010O13.g
ACCDH846442DH846443
length983779
definitionDH846442|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010O13, 5' end.DH846443|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010O13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,463,604 - 124,464,591)(124,645,511 - 124,646,288)
sequence
gaattctcttctgacccagcactgtgatttggcatctgacagatttattt
tatgctggattttgaacagtttgacagaatctgtgtcttgcttgaaaacc
tcagagggtagccagtcttttgatgatatagctgaagcttgtgtctgggg
gagcatggtaggatctaacctaaatctagatgtctgtctgcagtggagcc
tacacgtgggacaaagacatgaatgaattctggcaaggggtccagaaagg
aagcaggatacccagccttctggaagcctgagtagaattgtatagtagtc
caaaaaattaataattctcatgaagggaggctactgatttccaactcaac
cagtaacgtttctcctgctgtccaacattcatccaaagagtcttctggat
gatgggtatgcaggttttagaaaattctgtgtgttaaaggataggaaaga
ttattttgtaatacgtccttatatggaaacagaaaagaaggttatagaga
tagttcagctgttatggtgggtactggccggctttatgtgtcaacttgac
acaggctggggttatcacagagaaaggagtttcagttggggaagtgcctc
catgagatccagctgtaaggcattttttcaattagtgatcaagggggaaa
ggccccttgtgggtggtgccatctctggactggtagtcttgggttctata
agagagcatgctgagcaagccaggagaagcaagccagtaatgagcatccc
tccatggcctctgcatcagctcctgctttctgacctgcatgagttccagt
cctgacttcccttggtgataaagagcagtgtgcaaagtataagctgaaga
aaccctttccaccccagcttgcttcctggtcatgatgtttgtgcaggaat
aaaaaccctgactagacacggtggttgcgttgcagcatgagactggattt
atctcagaatctacactacaatgccaggagtga
gaattctgttcatgtgactagggtgtatttcccctccttgtgttggagtt
ttccatttattatcctttgaaggcctggatttttgtaaagatattgtgta
aatttggttttttcattgaataccctgctttctccatcaatggcaactga
gattttgctggttatagtatcctgggctggcatttgtgttctcttagggt
ctgtatggcatcttcccaggatcttcttacattcatagtctctggcaaga
agtctgtgtggtaggtttgtatctgaaagagagggtcatatatatgggga
ggtatgagtgaagttaagaagacaatcttgggtgttggcattctgcttcc
atcctgttagagacagactttctcatccagtggtgcatatgccaagctac
ctggacatgagtaggcagttgaattcctgctgtttatggcacagctttca
aatcataggcattgaattctatggccatttttaaatggattttagggatt
tgaacccaggtaaacatgcttgcctgggaagactttagctcattgagcta
tctacccagcatagagatagcatgactgtatataatttaaagcttcttct
tttattttttctgctaaccatctattttctttgcatagggctctacgaga
tatctaacaacttaacattaaacatactaatttctgtcatgttaatgaat
tcaaatctttagatcttaagttataaaatcattatctaccagtatatggt
catatttacagctgacctgagatgcatgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_124463604_124464591
seq2: B6Ng01-010O13.b_46_1028

seq1  GAATTCTCTTCTGACCCAGCACTGTGATTTGGCATCTGACAGATTTATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTCTGACCCAGCACTGTGATTTGGCATCTGACAGATTTATTT  50

seq1  TATGCTGGATTTTGAACAGTTTGACAGAATCTGTGTCTTGCTTGAAAACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTGGATTTTGAACAGTTTGACAGAATCTGTGTCTTGCTTGAAAACC  100

seq1  TCAGAGGGTAGCCAGTCTTTTGATGATATAGCTGAAGCTTGTGTCTGGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGGGTAGCCAGTCTTTTGATGATATAGCTGAAGCTTGTGTCTGGGG  150

seq1  GAGCATGGTAGGATCTAACCTAAATCTAGATGTCTGTCTGCAGTGGAGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCATGGTAGGATCTAACCTAAATCTAGATGTCTGTCTGCAGTGGAGCC  200

seq1  TACACGTGGGACAAAGACATGAATGAATTCTGGCAAGGGGTCCAGAAAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACGTGGGACAAAGACATGAATGAATTCTGGCAAGGGGTCCAGAAAGG  250

seq1  AAGCAGGATACCCAGCCTTCTGGAAGCCTGAGTAGAATTGTATAGTAGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGGATACCCAGCCTTCTGGAAGCCTGAGTAGAATTGTATAGTAGTC  300

seq1  CAAAAAATTAATAATTCTCATGAAGGGAGGCTACTGATTTCCAACTCAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAATTAATAATTCTCATGAAGGGAGGCTACTGATTTCCAACTCAAC  350

seq1  CAGTAACGTTTCTCCTGCTGTCCAACATTCATCCAAAGAGTCTTCTGGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAACGTTTCTCCTGCTGTCCAACATTCATCCAAAGAGTCTTCTGGAT  400

seq1  GATGGGTATGCAGGTTTTAGAAAATTCTGTGTGTTAAAGGATAGGAAAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGTATGCAGGTTTTAGAAAATTCTGTGTGTTAAAGGATAGGAAAGA  450

seq1  TTATTTTGTAATACGTCCTTATATGGAAACAGAAAAGAAGGTTATAGAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTGTAATACGTCCTTATATGGAAACAGAAAAGAAGGTTATAGAGA  500

seq1  TAGTTCAGCTGTTATGGTGGGTACTGGCCGGCTTTATGTGTCAACTTGAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTCAGCTGTTATGGTGGGTACTGGCCGGCTTTATGTGTCAACTTGAC  550

seq1  ACAGGCTGGGGTTATCACAGAGAAAGGAGTTTCAGTTGGGGAAGTGCCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCTGGGGTTATCACAGAGAAAGGAGTTTCAGTTGGGGAAGTGCCTC  600

seq1  CATGAGATCCAGCTGTAAGGCATTTTTTCAATTAGTGATCAAGGGGGAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGATCCAGCTGTAAGGCATTTTTTCAATTAGTGATCAAGGGGGAAA  650

seq1  GGCCCCTTGTGGGTGGTGCCATCTCTGGACTGGTAGTCTTGGGTTCTATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCCTTGTGGGTGGTGCCATCTCTGGACTGGTAGTCTTGGGTTCTATA  700

seq1  AGAGAGCAGGCTGAGCAAGCCAGGAGAAGCAAGCCAGTAATGAGCATCCC  750
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGCATGCTGAGCAAGCCAGGAGAAGCAAGCCAGTAATGAGCATCCC  750

seq1  TCCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCTTTCTGACCTGCATGAGTTCCAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCTTTCTGACCTGCATGAGTTCCAGT  800

seq1  CCTGACTTCCCTTGGTGATAAAGAGCAGTGTGCAAAGTATAAGCTGAAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACTTCCCTTGGTGATAAAGAGCAGTGTGCAAAGTATAAGCTGAAGA  850

seq1  AACCCTTTCCACCCCAGCTTGCTTCCTGGTCATGATGTTTGTGCAGGAAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTTTCCACCCCAGCTTGCTTCCTGGTCATGATGTTTGTGCAGGAAT  900

seq1  AAAAACCCTGACTAAGACACGGTGGTTGCGTTGCAAGCATGAGGACTGGA  950
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
seq2  AAAAACCCTGACT-AGACACGGTGGTTGCGTTGC-AGCATGA-GACTGGA  947

seq1  TTTATCTTCAGAATCTACACTACAAATGCCAGGAGTGA  988
      |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTTATC-TCAGAATCTACACTAC-AATGCCAGGAGTGA  983

seq1: chr1_124645511_124646288
seq2: B6Ng01-010O13.g_66_844 (reverse)

seq1  GCATGCATCTCAGGATAGCTATAAATATGCCAATATATTGGTAGATAATG  50
      ||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||
seq2  GCATGCATCTCAGGTCAGCTGTAAATATGACCATATACTGGTAGATAATG  50

seq1  ATTTTATAACTTAAGATCTAAAGATTGGAATTCATTAACATTACAGAAAA  100
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| 
seq2  ATTTTATAACTTAAGATCTAAAGATTTGAATTCATTAACATGACAGAAAT  100

seq1  TAGTATGTTTAATGTTAAGTTGTTAGATATCTTGTAGAGCCCTATGCAAA  150
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TAGTATGTTTAATGTTAAGTTGTTAGATATCTCGTAGAGCCCTATGCAAA  150

seq1  GAAAATAGATGGTTAGCAGAAAAAATAAAAGAAGAAGCTTT-AATTATAT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GAAAATAGATGGTTAGCAGAAAAAATAAAAGAAGAAGCTTTAAATTATAT  200

seq1  ACAGTCATGCTATCTCTATGCTGGGTAGATAGCTCAATGAGCTAAAGTCT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCATGCTATCTCTATGCTGGGTAGATAGCTCAATGAGCTAAAGTCT  250

seq1  TCCCAGGCAAGCATGTTTACCTGGGTTCAAATCCCTAAAATCCATTTAAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGGCAAGCATGTTTACCTGGGTTCAAATCCCTAAAATCCATTTAAA  300

seq1  AATGGCCATAGAATTCAATGCCTATGATTTGAAAGCTGTGCCATAAACAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGCCATAGAATTCAATGCCTATGATTTGAAAGCTGTGCCATAAACAG  350

seq1  CAGGAATTCAACTGCCTACTCATGTCCAGGTAGCTTGGCATATGCACCAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAATTCAACTGCCTACTCATGTCCAGGTAGCTTGGCATATGCACCAC  400

seq1  TGGATGAGAAAGTCTGTCTCTAACAGGATGGAAGCAGAATGCCAACACCC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGAGAAAGTCTGTCTCTAACAGGATGGAAGCAGAATGCCAACACCC  450

seq1  AAGATTGTCTTCTTAACTTCACTCATACCTCCCCATATATATGACCCTCT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTGTCTTCTTAACTTCACTCATACCTCCCCATATATATGACCCTCT  500

seq1  CTTTCAGATACAAACCTACCACACAGACTTCTTGCCAGAGACTATGAATG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAGATACAAACCTACCACACAGACTTCTTGCCAGAGACTATGAATG  550

seq1  TAAGAAGATCCTGGGAAGATGCCATACAGACCCTAAGAGAACACAAATGC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAGATCCTGGGAAGATGCCATACAGACCCTAAGAGAACACAAATGC  600

seq1  CAGCCCAGGATACTATAACCAGCAAAATCTCAGTTGCCATTGATGGAGAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCAGGATACTATAACCAGCAAAATCTCAGTTGCCATTGATGGAGAA  650

seq1  AGCAGGGTATTCAATGAAAAAACCAAATTTACACAATATCTTTACAAAAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGGTATTCAATGAAAAAACCAAATTTACACAATATCTTTACAAAAA  700

seq1  TCCAGGCCTTCAAAGGATAATAAATGGAAAACTCCAACACAAGGAGGGGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGCCTTCAAAGGATAATAAATGGAAAACTCCAACACAAGGAGGGGA  750

seq1  AATACACCCTAGTCACATGAACAGAATTC  778
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACACCCTAGTCACATGAACAGAATTC  779