BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-012D01
Chromosome1 (Build37)
Map Location 186,856,993 - 186,997,563
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene1700056E22Rik, Dusp10, EG433387, EG629032, LOC666714, Hlx1, Mosc1, Mosc2, LOC100039079, C130074G19Rik, Mark1
Downstream geneIars2, Bpnt1, Eprs, 9630028B13Rik, LOC100039138, Slc30a10, 5033404E19Rik, LOC677785, Lyplal1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-012D01.bB6Ng01-012D01.g
ACCDH847348DH847349
length1,0701,093
definitionDH847348|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-012D01, 5' end.DH847349|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-012D01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(186,996,487 - 186,997,563)(186,856,993 - 186,858,090)
sequence
gaattcctcagaagaagatactaggcaaactgtgaggactgacagcaagc
tttgtcatttggaacatcctattcttagtaaaattaggcatgtttcaaaa
caggaaggagaaaatgccagaaaatttccaggtacatatctctatagttc
tcgtgaccatgatgaggactggtactgttggtgttcaacgtggagttaca
gaggacagtcatgtggtccttggatacagttaacttggccatcctgttat
gaagtttgggttgaaactctgattgtttgctctctcttctttctttttgg
ataccatcttatccagagaatcatgggtcatttggatgacagactgacct
caggtctctgtccatgtctatgttttatggcttaggattcaatgatacag
aggcaattgagaaggaattcctattacacattcagaagacattaagtgga
gattcccgagcagaactggaatactgtgttaagtacctgtgagctagtta
atgtaccacattagtttccaattccccttccaagtagtttgtgacctttg
ggcaatatagagagaccctgtctcaaaaatccaagcaaatcagagcaatc
gaacaacatcaatgcgggcccactaaaaatcttttataaaataactttcc
cgctgtgtgcattggtatgtatgaaacacatttgatttcatgtttaattg
aatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgttagcacatgcctg
gatactgaggacaactctttggagtttgtttcctcttccatctttgtgta
tgttctggagataaaactttgtgtaagttctagtatcgtttggcttgcat
gtcaagtgtttttacctgctgagccatctctctgtgatgactcaaatttg
tgtttagacaggtgcaatgtccaccttttaaattatgtatgtacatacac
atatgcatgaatgtgtattatacacgaatgtatatgtacatacatgaatg
aatatacatgacagcttcctaaactctggaaagacctaaactactccaat
gcaggcttcacatagagaat
gaattcactcaatgaagcttgaatgaggctgtatacaggaacatggctga
cttgggcagctgcagcacggagacgctcatcatacaagagggactcggga
aaacagtctcactgctcccctgcacacttccaggctgctgcaccactaag
gactttttccacaagttcaaggccagcctggccctatatagtgaattcca
gacccaccagggactatagaaagggggggccttagacaaattccttccaa
ggctattatgatgttccagggaggttttcagatttctccagcttcacgtc
tcataggtcagaacttggacacatgcccacagagagctaagtggaggctg
tggctgggaaatggcatattttgttgaacacccatgaatctcgtcaaaac
tcaggattggggtctctcattaacaaagaggagtgaatagaaaggaggag
gttacaggggggctcctctgcagtgactaagaatgggtggaaagtttaat
ttgttattttcaggttgtcccagtgttccatagttataatcagcaacctg
acaaggtacggtctcacatgcagcagtggcatggatgtcatgggaataac
caatggctttccagttgtattaaaagctctcttcccataaagaggttcat
tcctattactgtcagtcttgccaagaaacaaacacgtggctaagggcatg
atagaacctaggggagaaaccgctactttttcattatttttataactggg
atgattatctagaaaatgatatacacgagaagactgggtggcaaacaata
gatgaacaatttttctacttgattaaaatattactttgagcaatcaatta
aatcatttaagtcagtcaattaaaatattgggttacacaagtgtgtgtaa
cttgtctataattttaacagttgagagtgaaagcagaaagagtaggaatt
caactcagggttaatctcagctacatagtgagttcaaggctatctcgggc
tagatgaagcctctgttctaagacacacaacacaacacattatatattca
attatatcaatgtccaaaataaataatattgtatgttctagtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_186996487_186997563
seq2: B6Ng01-012D01.b_47_1116 (reverse)

seq1  ATTCTCTATGCGAAAGGCCTGGCATTGTGAGTAGTTTAGGTTCTTTTCAG  50
      |||||||||| |||  |||| |||||| |||||||||||| ||||| |||
seq2  ATTCTCTATGTGAA--GCCT-GCATTG-GAGTAGTTTAGG-TCTTTCCAG  45

seq1  AGTTTAGGATGCTGTCATGTATATACATTCATGTATGTACATATACATTC  100
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTAGGAAGCTGTCATGTATATTCATTCATGTATGTACATATACATTC  95

seq1  GTGTATATATACACATTTATGCATATGTGTATGTACATACATAATTTAAA  150
      ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATA-ATACACATTCATGCATATGTGTATGTACATACATAATTTAAA  144

seq1  AGGTGGACATTGCACCATGTCTAAACACAAATTTGAGTCATCACAGAGAG  200
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGACATTGCACC-TGTCTAAACACAAATTTGAGTCATCACAGAGAG  193

seq1  ATGGCTCAGCAGGTAAAAACACTTGACATGCAAGCCAAACGATACTAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTCAGCAGGTAAAAACACTTGACATGCAAGCCAAACGATACTAGAA  243

seq1  CCTACACAAAGTTTTATCTCCAGAACCTACACAAAGATGGAAGAGGAAAC  300
      | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACACAAAGTTTTATCTCCAGAACATACACAAAGATGGAAGAGGAAAC  293

seq1  AAACTCCAAAGAGTTGTCCTCAGTATCCAGGCATGTGCTATGATACACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
seq2  AAACTCCAAAGAGTTGTCCTCAGTATCCAGGCATGTGCTAACATACACAC  343

seq1  ACACACACACACACACACACACACATTCAATTAAACATGAAATCAAATGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACATTCAATTAAACATGAAATCAAATGT  393

seq1  GTTTCATACATACCAATGCACACAGCGGGAAAGTTATTTTATAAAAGATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCATACATACCAATGCACACAGCGGGAAAGTTATTTTATAAAAGATT  443

seq1  TTTAGTGGGCCCGCATTGATGTTGTTCGATTGCTCTGATTTGCTTGGATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTGGGCCCGCATTGATGTTGTTCGATTGCTCTGATTTGCTTGGATT  493

seq1  TTTGAGACAGGGTCTCTCTATATTGCCCAAAGGTCACAAACTACTTGGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGACAGGGTCTCTCTATATTGCCCAAAGGTCACAAACTACTTGGAA  543

seq1  GGGGAATTGGAAACTAATGTGGTACATTAACTAGCTCACAGGTACTTAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAATTGGAAACTAATGTGGTACATTAACTAGCTCACAGGTACTTAAC  593

seq1  ACAGTATTCCAGTTCTGCTCGGGAATCTCCACTTAATGTCTTCTGAATGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTATTCCAGTTCTGCTCGGGAATCTCCACTTAATGTCTTCTGAATGT  643

seq1  GTAATAGGAATTCCTTCTCAATTGCCTCTGTATCATTGAATCCTAAGCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATAGGAATTCCTTCTCAATTGCCTCTGTATCATTGAATCCTAAGCCA  693

seq1  TAAAACATAGACATGGACAGAGACCTGAGGTCAGTCTGTCATCCAAATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACATAGACATGGACAGAGACCTGAGGTCAGTCTGTCATCCAAATGA  743

seq1  CCCATGATTCTCTGGATAAGATGGTATCCAAAAAGAAAGAAGAGAGAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGATTCTCTGGATAAGATGGTATCCAAAAAGAAAGAAGAGAGAGCA  793

seq1  AACAATCAGAGTTTCAACCCAAACTTCATAACAGGATGGCCAAGTTAACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATCAGAGTTTCAACCCAAACTTCATAACAGGATGGCCAAGTTAACT  843

seq1  GTATCCAAGGACCACATGACTGTCCTCTGTAACTCCACGTTGAACACCAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCCAAGGACCACATGACTGTCCTCTGTAACTCCACGTTGAACACCAA  893

seq1  CAGTACCAGTCCTCATCATGGTCACGAGAACTATAGAGATATGTACCTGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACCAGTCCTCATCATGGTCACGAGAACTATAGAGATATGTACCTGG  943

seq1  AAATTTTCTGGCATTTTCTCCTTCCTGTTTTGAAACATGCCTAATTTTAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTCTGGCATTTTCTCCTTCCTGTTTTGAAACATGCCTAATTTTAC  993

seq1  TAAGAATAGGATGTTCCAAATGACAAAGCTTGCTGTCAGTCCTCACAGTT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAATAGGATGTTCCAAATGACAAAGCTTGCTGTCAGTCCTCACAGTT  1043

seq1  TGCCTAGTATCTTCTTCTGAGGAATTC  1077
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTAGTATCTTCTTCTGAGGAATTC  1070

seq1: chr1_186856993_186858090
seq2: B6Ng01-012D01.g_63_1155

seq1  GAATTCACTCAATGAAGCTTGAATGAGGCTGTATACAGGAACATGGCTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCAATGAAGCTTGAATGAGGCTGTATACAGGAACATGGCTGA  50

seq1  CTTGGGCAGCTGCAGCACGGAGACGCTCATCATACAAGAGGGACTCGGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGCAGCTGCAGCACGGAGACGCTCATCATACAAGAGGGACTCGGGA  100

seq1  AAACAGTCTCACTGCTCCCCTGCACACTTCCAGGCTGCTGCACCACTAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGTCTCACTGCTCCCCTGCACACTTCCAGGCTGCTGCACCACTAAG  150

seq1  GACTTTTTCCACAAGTTCAAGGCCAGCCTGGCCCTATATAGTGAATTCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTTTCCACAAGTTCAAGGCCAGCCTGGCCCTATATAGTGAATTCCA  200

seq1  GACCCACCAGGGACTATAGAAAGGGGGGGCCTTAGACAAATTCCTTCCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCACCAGGGACTATAGAAAGGGGGGGCCTTAGACAAATTCCTTCCAA  250

seq1  GGCTATTATGATGTTCCAGGGAGGTTTTCAGATTTCTCCAGCTTCACGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTATTATGATGTTCCAGGGAGGTTTTCAGATTTCTCCAGCTTCACGTC  300

seq1  TCATAGGTCAGAACTTGGACACATGCCCACAGAGAGCTAAGTGGAGGCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAGGTCAGAACTTGGACACATGCCCACAGAGAGCTAAGTGGAGGCTG  350

seq1  TGGCTGGGAAATGGCATATTTTGTTGAACACCCATGAATCTCGTCAAAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGGGAAATGGCATATTTTGTTGAACACCCATGAATCTCGTCAAAAC  400

seq1  TCAGGATTGGGGTCTCTCATTAACAAAGAGGAGTGAATAGAAAGGAGGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGATTGGGGTCTCTCATTAACAAAGAGGAGTGAATAGAAAGGAGGAG  450

seq1  GTTACAGGGGGGCTCCTCTGCAGTGACTAAGAATGGGTGGAAAGTTTAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACAGGGGGGCTCCTCTGCAGTGACTAAGAATGGGTGGAAAGTTTAAT  500

seq1  TTGTTATTTTCAGGTTGTCCCAGTGTTCCATAGTTATAATCAGCAACCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTATTTTCAGGTTGTCCCAGTGTTCCATAGTTATAATCAGCAACCTG  550

seq1  ACAAGGTACGGTCTCACATGCAGCAGTGGCATGGATGTCATGGGAATAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGTACGGTCTCACATGCAGCAGTGGCATGGATGTCATGGGAATAAC  600

seq1  CAATGGCTTTCCAGTTGTATTAAAAGCTCTCTTCCCATAAAGAGGTTCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGGCTTTCCAGTTGTATTAAAAGCTCTCTTCCCATAAAGAGGTTCAT  650

seq1  TCCTATTACTGTCAGTCTTGCCAAGAAACAAACACGTGGCTAAGGGCATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATTACTGTCAGTCTTGCCAAGAAACAAACACGTGGCTAAGGGCATG  700

seq1  ATAGAACCTAGGGGAGAAACCGCTAC-TTTTCATTATTTTTATAACTGGG  749
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAACCTAGGGGAGAAACCGCTACTTTTTCATTATTTTTATAACTGGG  750

seq1  ATGATTATCTAGAAAATGATATACACGAGAAGACTGGGTGGCAAACAATA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTATCTAGAAAATGATATACACGAGAAGACTGGGTGGCAAACAATA  800

seq1  GATGAACAA-TTTTCTACTTGATTAAAATATTACTTTGAGCAATCAATTA  848
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAACAATTTTTCTACTTGATTAAAATATTACTTTGAGCAATCAATTA  850

seq1  AATCAATTAAAGTCAGTCAATTAAAATATTGGGTTACACAAGTGTGGTGT  898
      |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AATC-ATTTAAGTCAGTCAATTAAAATATTGGGTTACACAAGTGT-GTGT  898

seq1  AACTTGTCTATAATTTTAACAGTTGAGAGGTGAAAGCAGAAAGAGTAGGA  948
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGTCTATAATTTTAACAGTTGAGA-GTGAAAGCAGAAAGAGTAGGA  947

seq1  ATCCAAC-CAGGGGTAATCTCAGCTACATAGTGAGTTCAAGGCTATCCTG  997
      || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |
seq2  ATTCAACTCAGGGTTAATCTCAGCTACATAGTGAGTTCAAGGCTATCTCG  997

seq1  GGCTAGATGAAGCC-CTGTCCTAAGACACACACACACACACACACAATTA  1046
      |||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| |||| ||||
seq2  GGCTAGATGAAGCCTCTGTTCTAAGACACACA---ACACA-ACAC-ATTA  1042

seq1  TATA-TCATATATATCATATGCCAAAAATATAATAAATATGTATGTTCTA  1095
      |||| |||  ||||||| ||| | |||||| |||||   |||||||||||
seq2  TATATTCAATTATATCA-ATGTCCAAAATA-AATAATATTGTATGTTCTA  1090

seq1  GTT  1098
      |||
seq2  GTT  1093