BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-012L18
Chromosome1 (Build37)
Map Location 70,738,932 - 70,942,352
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSpag16, A830006F12Rik, LOC100043210
Upstream genenone
Downstream geneEG667884, EG666083, LOC100042804, LOC100042809, Bard1, LOC667900, Abca12, LOC629101, Atic, Fn1, LOC100042814, Gabarapl2-ps1_652.1, LOC383528, LOC675667, EG667931
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-012L18.bB6Ng01-012L18.g
ACCDH847742DH847743
length1,0201,060
definitionDH847742|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-012L18, 5' end.DH847743|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-012L18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,738,932 - 70,739,956)(70,941,292 - 70,942,352)
sequence
gaattctttctggttaacactgaggaaggaaaagttcagcttctcatcat
tatctaccttgataaactgatccaggtccatcccaggaccttcccttgag
aactgcctataataagggcagatgcctgcacaaacctcggttctgtggag
agagaaagaggatgcatgtcaggtagagcattagcaatacctgtctgtga
ttaagaggatgacactctgcccttagtctcaggtctaagaagcaagcaca
ttccagcttttccttggcaaggcttcccactgctgggtaaggacagttgt
ataatagaaggaacagttaatataatctcacgacttgctctgccaggctt
tggcaattagtctggactttctccacctggggaatggcagtgtgcccagc
acattggctcatcagactacagtctggcatacctgctgcaggtcactgaa
ctctagattagactgacagcagatagtctcatgcaaatcacccctcagtg
tggcacatttcctttgaaaacagacaaccgccatttctgtctatgcatca
ctgcatttctcttttatttaaatctgatttctggtatctgttctacaagt
atctgatatgatagtcctaagggaaagtccaacccacccaacactgtaac
agagcaaggtaatacagggagaaaggagtcacggagcacagactttaatg
ggatgtttatacgtatgaagttggctgcacagttatgatatttcatttat
tctctagtccccagtacattattccctatcattttacagaagacaatact
taagtgctaagccaggcttgtagatatcagagctttaggccgtatgattc
ccaagtgtttgttcttccttggtactatcaggataccccaatagttgagt
atctaggtagggctgaccttccaggctgccctgatttcagtttatcccaa
gccttataggaattttcatccagagaagaaatctgaaaacaacccaaatt
tgcccaacatttgcttgaat
gaattcttaatgacatgctctccatgtcaaccataggttagaaacaggca
gtgagtacaaccattatgttaacaattcctgatggagacacatcaaagca
aaatgtgaaaattttaagatagagaacaccagtttatgggaaccagttaa
aatcccaggattgtatgatttattgctgtcatacataataataagtgcta
taaatatgcttgatgtattagacatgtaaatttatgtgtagattattact
aataactaatgactgtcagatcaagtcattcacagtctccatagtgaacc
ccattccaattttggaatctctctcataagaaagaaatttcttaagaaaa
atgcactgagctagagagatggctcagtgattgaagaacttgatgccaag
tgtgggaacaggggtttcagatgcacagaagttacacacaatggcaggtg
aatatgataacctgattgcaattctagcctcaaaagtggagacagggcat
ctccatagcaagctttctggtaagactaaccatataggtatggccctatc
tcagtgaatgaagtggacaggtcattgcggataattcctaacatctacct
tatatttccacacgcacaaccccccacacacactcacacacaacatacaa
gtggaaaacaagaaagatgtaccataggatgctgagtggtcatctatatc
tgcaagcactggggctcatcatgcatctatcagcatcacttaggaagaaa
cccaaattctgtgaatgagtgtttctcctttgatcattctaagaatctca
aaagcacagctaaaagtagtccaatttctctgaagaaatagtaagtgaaa
ataaaaataacaaatgtaaacctgcctatcttatttcctctctctgccaa
ctgattcatcctagaaggactcacttaaagagatgtgaaggaaagtctac
acaatgcaatttttataaaattgtcactttgatagacttctttggaccat
ttgcccgggatgtatagtatgcatcttttttggtcatgtggtgcctgctt
tgagaccttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_70738932_70739956
seq2: B6Ng01-012L18.b_47_1066

seq1  GAATTCTTTCTGGTTAACACTGAGGAAGGAAAAGTTCAGCTTCTCATCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCTGGTTAACACTGAGGAAGGAAAAGTTCAGCTTCTCATCAT  50

seq1  TATCTACCTTGATAAACTGATCCAGGTCCATCCCAGGACCTTCCCTTGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTACCTTGATAAACTGATCCAGGTCCATCCCAGGACCTTCCCTTGAG  100

seq1  AACTGCCTATAATAAGGGCAGATGCCTGCACAAACCTCGGTTCTGTGGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGCCTATAATAAGGGCAGATGCCTGCACAAACCTCGGTTCTGTGGAG  150

seq1  AGAGAAAGAGGATGCATGTCAGGTAGAGCATTAGCAATACCTGTCTGTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAGAGGATGCATGTCAGGTAGAGCATTAGCAATACCTGTCTGTGA  200

seq1  TTAAGAGGATGACACTCTGCCCTTAGTCTCAGGTCTAAGAAGCAAGCACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAGGATGACACTCTGCCCTTAGTCTCAGGTCTAAGAAGCAAGCACA  250

seq1  TTCCAGCTTTTCCTTGGCAAGGCTTCCCACTGCTGGGTAAGGACAGTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGCTTTTCCTTGGCAAGGCTTCCCACTGCTGGGTAAGGACAGTTGT  300

seq1  ATAATAGAAGGAACAGTTAATATAATCTCACGACTTGCTCTGCCAGGCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAGAAGGAACAGTTAATATAATCTCACGACTTGCTCTGCCAGGCTT  350

seq1  TGGCAATTAGTCTGGACTTTCTCCACCTGGGGAATGGCAGTGTGCCCAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAATTAGTCTGGACTTTCTCCACCTGGGGAATGGCAGTGTGCCCAGC  400

seq1  ACATTGGCTCATCAGACTACAGTCTGGCATACCTGCTGCAGGTCACTGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGGCTCATCAGACTACAGTCTGGCATACCTGCTGCAGGTCACTGAA  450

seq1  CTCTAGATTAGACTGACAGCAGATAGTCTCATGCAAATCACCCCTCAGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGATTAGACTGACAGCAGATAGTCTCATGCAAATCACCCCTCAGTG  500

seq1  TGGCACATTTCCTTTGAAAACAGACAACCGCCATTTCTGTCTATGCATCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACATTTCCTTTGAAAACAGACAACCGCCATTTCTGTCTATGCATCA  550

seq1  CTGCATTTCTCTTTTATTTAAATCTGATTTCTGGTATCTGTTCTACAAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATTTCTCTTTTATTTAAATCTGATTTCTGGTATCTGTTCTACAAGT  600

seq1  ATCTGATATGATAGTCCTAAGGGAAAGTCCAACCCACCCAACACTGTAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGATATGATAGTCCTAAGGGAAAGTCCAACCCACCCAACACTGTAAC  650

seq1  AGAGCAAGGTAATACAGGGAGAAAGGAGTCACGGAGCACAGACTTTAATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAAGGTAATACAGGGAGAAAGGAGTCACGGAGCACAGACTTTAATG  700

seq1  GGATGTTTATACGTATGAAGTTGGCTGCACAGTTATGATATTTCATTTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTTTATACGTATGAAGTTGGCTGCACAGTTATGATATTTCATTTAT  750

seq1  TCTCTAGTCCCCAGTACATTATTCCCTATCATTTTACAGAAGACAATACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAGTCCCCAGTACATTATTCCCTATCATTTTACAGAAGACAATACT  800

seq1  TAAGTGCTAAGCCAGGCTTGTAGATATCAGAGCTTTAGGCCGTATGATTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGCTAAGCCAGGCTTGTAGATATCAGAGCTTTAGGCCGTATGATTC  850

seq1  CCAAGTGTTTGTTCTTCCTTGGTACTATCAGGGATACCCCAATAGTTGAG  900
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTGTTTGTTCTTCCTTGGTACTATCA-GGATACCCCAATAGTTGAG  899

seq1  TATCTAGGTAGGGCTGACCTTCCAGGCTGCCCCTGATTTCAAGTTTATCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||
seq2  TATCTAGGTAGGGCTGACCTTCCAGGCTG-CCCTGATTTC-AGTTTATCC  947

seq1  CAAGCCTTATAGGAAATTTTCATCCAAGGAAGAGAAATCTGAAAACAA-C  999
      ||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |
seq2  CAAGCCTTATAGG-AATTTTCATCCA--GAGAAGAAATCTGAAAACAACC  994

seq1  CAAATTTGCCCAACATTTGCTTGAAT  1025
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTTGCCCAACATTTGCTTGAAT  1020

seq1: chr1_70941292_70942352
seq2: B6Ng01-012L18.g_67_1126 (reverse)

seq1  GAAGGTCTACAAAGCAGGCA-CACATGACC-AGAAAGATGCATACTAATA  48
      |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||
seq2  GAAGGTCT-CAAAGCAGGCACCACATGACCAAAAAAGATGCATACT-ATA  48

seq1  CATCCCGGGCAAATGGTCCAAAGGAGTCTATCAAAGTGAC-ATTTTATAA  97
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||
seq2  CATCCCGGGCAAATGGTCCAAAGAAGTCTATCAAAGTGACAATTTTATAA  98

seq1  AAATTTGCATTGTGTAGACTTTCCTTCACATCTCTTTTTAAGTGAGTCCT  147
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
seq2  AAA-TTGCATTGTGTAGACTTTCCTTCACATCTC--TTTAAGTGAGTCCT  145

seq1  TCTAGGATGAATCAGTTGGCAGAGAGAGGAAGTAAGATAGGCAGGTTTAC  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGATGAATCAGTTGGCAGAGAGAGGAAATAAGATAGGCAGGTTTAC  195

seq1  ATTTGTTATTTTTATTTTCACCTACTGTTTCTTCAGAGAAATTGGACTAC  247
      ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTTATTTTTATTTTCACTTACTATTTCTTCAGAGAAATTGGACTAC  245

seq1  TTTTAGCTGTGCTTTTGAGATTCTTAGAATGATCAAAGGAG-AACACTCA  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TTTTAGCTGTGCTTTTGAGATTCTTAGAATGATCAAAGGAGAAACACTCA  295

seq1  TTCACAGAATTTTGGGTTTCTTCCTAAGTGATGCTGATAGATGCATGATG  346
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACAGAA-TTTGGGTTTCTTCCTAAGTGATGCTGATAGATGCATGATG  344

seq1  AG-CCCAGTGCTTGCAGATATAGATGACCACTCAGCATCCTATGGTACAT  395
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCAGTGCTTGCAGATATAGATGACCACTCAGCATCCTATGGTACAT  394

seq1  CTTTCTTGTTTTCCACTTGTATGTTGTGTGTGAGTGTGTGTGGGGGGTTG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTTGTTTTCCACTTGTATGTTGTGTGTGAGTGTGTGTGGGGGGTTG  444

seq1  TGCGTGTGGAAATATAAGGTAGATGTTAGGAATTATCCGCAATGACCTGT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGTGTGGAAATATAAGGTAGATGTTAGGAATTATCCGCAATGACCTGT  494

seq1  CCACTTCATTCACTGAGATAGGGCCATACCTATATGGTTAGTCTTACCAG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTCATTCACTGAGATAGGGCCATACCTATATGGTTAGTCTTACCAG  544

seq1  AAAGCTTGCTATGGAGATGCCCTGTCTCCACTTTTGAGGCTAGAATTGCA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTTGCTATGGAGATGCCCTGTCTCCACTTTTGAGGCTAGAATTGCA  594

seq1  ATCAGGTTATCATATTCACCTGCCATTGTGTGTAACTTCTGTGCATCTGA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGTTATCATATTCACCTGCCATTGTGTGTAACTTCTGTGCATCTGA  644

seq1  AACCCCTGTTCCCACACTTGGCATCAAGTTCTTCAATCACTGAGCCATCT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCCTGTTCCCACACTTGGCATCAAGTTCTTCAATCACTGAGCCATCT  694

seq1  CTCTAGCTCAGTGCATTTTTCTTAAGAAATTTCTTTCTTATGAGAGAGAT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGCTCAGTGCATTTTTCTTAAGAAATTTCTTTCTTATGAGAGAGAT  744

seq1  TCCAAAATTGGAATGGGGTTCACTATGGAGACTGTGAATGACTTGATCTG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAATTGGAATGGGGTTCACTATGGAGACTGTGAATGACTTGATCTG  794

seq1  ACAGTCATTAGTTATTAGTAATAATCTACACATAAATTTACATGTCTAAT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCATTAGTTATTAGTAATAATCTACACATAAATTTACATGTCTAAT  844

seq1  ACATCAAGCATATTTATAGCACTTATTATTATGTATGACAGCAATAAATC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCAAGCATATTTATAGCACTTATTATTATGTATGACAGCAATAAATC  894

seq1  ATACAATCCTGGGATTTTAACTGGTTCCCATAAACTGGTGTTCTCTATCT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAATCCTGGGATTTTAACTGGTTCCCATAAACTGGTGTTCTCTATCT  944

seq1  TAAAATTTTCACATTTTGCTTTGATGTGTCTCCATCAGGAATTGTTAACA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTTTCACATTTTGCTTTGATGTGTCTCCATCAGGAATTGTTAACA  994

seq1  TAATGGTTGTACTCACTGCCTGTTTCTAACCTATGGTTGACATGGAGAGC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGGTTGTACTCACTGCCTGTTTCTAACCTATGGTTGACATGGAGAGC  1044

seq1  ATGTCATTAAGAATTC  1061
      ||||||||||||||||
seq2  ATGTCATTAAGAATTC  1060