BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-014F02
Chromosome1 (Build37)
Map Location 124,459,516 - 124,660,019
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDdx18, LOC666971
Downstream geneLOC666983, Dpp10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-014F02.bB6Ng01-014F02.g
ACCDH848898DH848899
length6741,013
definitionDH848898|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-014F02, 5' end.DH848899|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-014F02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,659,346 - 124,660,019)(124,459,516 - 124,460,532)
sequence
gaattctttccctttatcattatctccaagcctctctccgccttccttca
gtacctaaagacccatccttcacagagcgaccatgtggaactatttcagc
tcatctattgaaaataccacagggatatctgctcacctgcagacaaaaca
atgagcatagatgatgagccccaccataagcttccctgaatagctcaagg
tcacgatcttaccacagcatgaccctaacacacaactgactccttacata
ccacccagtgtgaaaacaagtgtatttgtttctcgggaacctacactaca
tctgaagtcaagggacactcccaacaaagttagcgttggagaatgaattt
tagagtttgaactctgtgtatggcatttctatttcatgccctggatgcca
tgctggtattcttattccattcaccttgttgatcctgtgatctctaacag
ctctcaaaagcaacctgcagggcactttccaatagtacagaccattctct
ggaaagtacccaggcacttctgggtcaacaggacatcaaaaaacttatcc
tgtaacctcttcttttctttagatcattataggtttgtcttactgactat
atgatttagtagttttttttaattcccagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gaattcaaatgcagaaactggagtgaagttgcttactgtgtcacttgtgg
gttcatgcttcgctaactttcttttacaacccaacactaccttcctaggg
aaaaatgtcacctagtggactgcatcctcctatgacaatcatcaaggcaa
tgcctcacagatataggtacaggccaatctgattgagtcaatccctctca
gatagtcatgtcaagttgtcaatcaaggttaatcagggtattatgcataa
ttaatacatgttactaaaaacattttaaagactgtgtctttaaaatacag
gatttaattatttctacttctggacttctctttcttcaaattgaggaacc
tgcttgagatccctcaggacatttactgacatattctcagaatgtacttc
cctgtgaggtaatagctaggggaaacaatggcagaagatgtcacacgcag
aggttcctgaatttgaaaacagaagcatggggtgactttgacatctccaa
ttaccttatgaaaatgattactgatgaacaaaacctaatagtttacacct
ggggttcactcatcaagcatttccagagaagtaatttcttagccatttcc
accaccagcagcaagacattagctgaaaactgagggacaatctcacaaca
aatgtgtcataatggtcctgttagacaaaatttctaaatggcttcattta
cacattggctacagacagcaggatgctccttccaccgatgtgcaaatatc
tagctattcttccacatccagagcagtggtaatttgttagttttggccat
tgtgtagttttgatttcagattaagcaaaaaatacagcattatcccaatt
ctctgtaatttggggaaaaacaaaacagatgtatttttacattaagaaag
aggaccaaaaaaaggagctttcgcaactgaaaggtatgtgaggggcacat
gggtggtgagtgggaatccataggaatggagatgcagggtcgcaaattgc
ctcaactggtaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_124659346_124660019
seq2: B6Ng01-014F02.b_47_720 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTGGG  50

seq1  AATTAAAAAAAACTACTAAATCATATAGTCAGTAAGACAAACCTATAATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAAAAAAACTACTAAATCATATAGTCAGTAAGACAAACCTATAATG  100

seq1  ATCTAAAGAAAAGAAGAGGTTACAGGATAAGTTTTTTGATGTCCTGTTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAAGAAAAGAAGAGGTTACAGGATAAGTTTTTTGATGTCCTGTTGA  150

seq1  CCCAGAAGTGCCTGGGTACTTTCCAGAGAATGGTCTGTACTATTGGAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGAAGTGCCTGGGTACTTTCCAGAGAATGGTCTGTACTATTGGAAAG  200

seq1  TGCCCTGCAGGTTGCTTTTGAGAGCTGTTAGAGATCACAGGATCAACAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTGCAGGTTGCTTTTGAGAGCTGTTAGAGATCACAGGATCAACAAG  250

seq1  GTGAATGGAATAAGAATACCAGCATGGCATCCAGGGCATGAAATAGAAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATGGAATAAGAATACCAGCATGGCATCCAGGGCATGAAATAGAAAT  300

seq1  GCCATACACAGAGTTCAAACTCTAAAATTCATTCTCCAACGCTAACTTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATACACAGAGTTCAAACTCTAAAATTCATTCTCCAACGCTAACTTTG  350

seq1  TTGGGAGTGTCCCTTGACTTCAGATGTAGTGTAGGTTCCCGAGAAACAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGAGTGTCCCTTGACTTCAGATGTAGTGTAGGTTCCCGAGAAACAAA  400

seq1  TACACTTGTTTTCACACTGGGTGGTATGTAAGGAGTCAGTTGTGTGTTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTTGTTTTCACACTGGGTGGTATGTAAGGAGTCAGTTGTGTGTTAG  450

seq1  GGTCATGCTGTGGTAAGATCGTGACCTTGAGCTATTCAGGGAAGCTTATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCATGCTGTGGTAAGATCGTGACCTTGAGCTATTCAGGGAAGCTTATG  500

seq1  GTGGGGCTCATCATCTATGCTCATTGTTTTGTCTGCAGGTGAGCAGATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGCTCATCATCTATGCTCATTGTTTTGTCTGCAGGTGAGCAGATAT  550

seq1  CCCTGTGGTATTTTCAATAGATGAGCTGAAATAGTTCCACATGGTCGCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTGGTATTTTCAATAGATGAGCTGAAATAGTTCCACATGGTCGCTC  600

seq1  TGTGAAGGATGGGTCTTTAGGTACTGAAGGAAGGCGGAGAGAGGCTTGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAGGATGGGTCTTTAGGTACTGAAGGAAGGCGGAGAGAGGCTTGGA  650

seq1  GATAATGATAAAGGGAAAGAATTC  674
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAATGATAAAGGGAAAGAATTC  674

seq1: chr1_124459516_124460532
seq2: B6Ng01-014F02.g_64_1076

seq1  GAATTCAAATGCAGAAACTGGAGTGAAGTTGCTTACTGTGTCACTTGTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATGCAGAAACTGGAGTGAAGTTGCTTACTGTGTCACTTGTGG  50

seq1  GTTCATGCTTCGCTAACTTTCTTTTACAACCCAACACTACCTTCCTAGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATGCTTCGCTAACTTTCTTTTACAACCCAACACTACCTTCCTAGGG  100

seq1  AAAAATGTCACCTAGTGGACTGCATCCTCCTATGACAATCATCAAGGCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATGTCACCTAGTGGACTGCATCCTCCTATGACAATCATCAAGGCAA  150

seq1  TGCCTCACAGATATAGGTACAGGCCAATCTGATTGAGTCAATCCCTCTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCACAGATATAGGTACAGGCCAATCTGATTGAGTCAATCCCTCTCA  200

seq1  GATAGTCATGTCAAGTTGTCAATCAAGGTTAATCAGGGTATTATGCATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGTCATGTCAAGTTGTCAATCAAGGTTAATCAGGGTATTATGCATAA  250

seq1  TTAATACATGTTACTAAAAACATTTTAAAGACTGTGTCTTTAAAATACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATACATGTTACTAAAAACATTTTAAAGACTGTGTCTTTAAAATACAG  300

seq1  GATTTAATTATTTCTACTTCTGGACTTCTCTTTCTTCAAATTGAGGAACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTAATTATTTCTACTTCTGGACTTCTCTTTCTTCAAATTGAGGAACC  350

seq1  TGCTTGAGATCCCTCAGGACATTTACTGACATATTCTCAGAATGTACTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGAGATCCCTCAGGACATTTACTGACATATTCTCAGAATGTACTTC  400

seq1  CCTGTGAGGTAATAGCTAGGGGAAACAATGGCAGAAGATGTCACACGCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGAGGTAATAGCTAGGGGAAACAATGGCAGAAGATGTCACACGCAG  450

seq1  AGGTTCCTGAATTTGAAAACAGAAGCATGGGGTGACTTTGACATCTCCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCCTGAATTTGAAAACAGAAGCATGGGGTGACTTTGACATCTCCAA  500

seq1  TTACCTTATGAAAATGATTACTGATGAACAAAACCTAATAGTTTACACCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTTATGAAAATGATTACTGATGAACAAAACCTAATAGTTTACACCT  550

seq1  GGGGTTCACTCATCAAGCATTTCCAGAGAAGTAATTTCTTAGCCATTTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTTCACTCATCAAGCATTTCCAGAGAAGTAATTTCTTAGCCATTTCC  600

seq1  ACCACCAGCAGCAAGACATTAGCTGAAAACTGAGGGACAATCTCACAACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCAGCAGCAAGACATTAGCTGAAAACTGAGGGACAATCTCACAACA  650

seq1  AATGTGTCATAATGGTCCTGTTAGACAAAATTTCTAAATGGCTTCATTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGTCATAATGGTCCTGTTAGACAAAATTTCTAAATGGCTTCATTTA  700

seq1  CACATTGGCTACAGACAGCAGGATGCTCCTTCCACCGATGTGCAAATATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTGGCTACAGACAGCAGGATGCTCCTTCCACCGATGTGCAAATATC  750

seq1  TAGCTATTCTTCCACATCCAGAGCAGTGGTAATTTGTTAGTTTTGGCCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTATTCTTCCACATCCAGAGCAGTGGTAATTTGTTAGTTTTGGCCAT  800

seq1  TGTGTAG-TTTGATTTCAGATTAAGCAAAAAAATACAGCATTATCCCAAT  849
      ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAGTTTTGATTTCAGATTAAGC-AAAAAATACAGCATTATCCCAAT  849

seq1  TCTCTGTAATTTGGGGAAAAACAAAACAGATGTATTTTAACATTAGGAAA  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||
seq2  TCTCTGTAATTTGGGGAAAAACAAAACAGATGTATTTTTACATTAAGAAA  899

seq1  GAGGACCAAAAAAAGGAGCTTTCGCAACTGAAAGGTAATGTGAGGGGGCA  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
seq2  GAGGACCAAAAAAAGGAGCTTTCGCAACTGAAAGGT-ATGTGA-GGGGCA  947

seq1  CATGGGTGGTGAGTGGGATTCCATAGGAATGGAAGATGCAGGGCTGCAAA  999
      |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||
seq2  CATGGGTGGTGAGTGGGAATCCATAGGAATGG-AGATGCAGGGTCGC-AA  995

seq1  AATGCCTCAACTGTTAAG  1017
      | ||||||||||| ||||
seq2  ATTGCCTCAACTGGTAAG  1013