seq1: chr1_4187930_4188181
seq2: B6Ng01-015I04.b_53_304
seq1 CTATAAAGCCTACTCACTGCTCTGTATTCCACGCAATAGCCTAACATCAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTATAAAGCCTACTCACTGCTCTGTATTCCACGCAATAGCCTAACATCAC 50
seq1 AATATGAATCAAATGACTTATTCAAGATGTTTTCTTTACCGATTCTAAAT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATATGAATCAAATGACTTATTCAAGATGTTTTCTTTACCGATTCTAAAT 100
seq1 GAGAGCTACTTGAGTAATCTGCTGCTTTGCCTTTCTCAAAAGAAGAAACA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGAGCTACTTGAGTAATCTGCTGCTTTGCCTTTCTCAAAAGAAGAAACA 150
seq1 GCCTAAAGCATCATTCAAAGAGAACTTCACTATATCTTACTAGGATATGA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCCTAAAGCATCATTCAAAGAGAACTTCACTATATCTTACTAGGATATGA 200
seq1 AAACCAATGAATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAACCAATGAATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTG 250
seq1 TG 252
||
seq2 TG 252
| seq1: chr1_4316744_4317563
seq2: B6Ng01-015I04.g_69_889 (reverse)
seq1 GCTTTTCGTTCCTGAGTAACTGAAGCACTCCCTCAGGCAGTGAAGAACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTTTTCGTTCCTGAGTAACTGAAGCACTCCCTCAGGCAGTGAAGAACTC 50
seq1 AGTCTACTTCTGTATCTGTGTTCTTTAGAAGTCAGTGAAGCATACAAAAG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTCTACTTCTGTATCTGTGTTCTTTAGAAGTCAGTGAAGCATACAAAAG 100
seq1 C-TTGGCAGGACAATTGGTCTCAGATATTAATCTTGTGTACCTTCTATAG 149
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2 CTTTGGCAGGACAATTGGTCTCAGATA-TAATCTTGTGTACCTTCTATAG 149
seq1 CTTGTAAGCATCATTGTATCCTGGAAACTACCATTGTACGGATCCTGGCA 199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTGTAAGCATCATTGTATCCTGGAAACTACCATTGTACGGATCCTGGCA 199
seq1 ACAGCCATTATATTTTG-TTTCTTTTAAAGGGATTAAAAAGCCTGGTTGC 248
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACAGCCATTATATTTTGTTTTCTTTTAAAGGGATTAAAAAGCCTGGTTGC 249
seq1 TTGCAATTAACTTGTCACAGCCTCAATCTTGCTGTGGTTCCTCCAAGCTG 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGCAATTAACTTGTCACAGCCTCAATCTTGCTGTGGTTCCTCCAAGCTG 299
seq1 GCCTGATAAACATTCATTTCTCATTGGTCATATAAGGTAACTTTGGCCCA 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCCTGATAAACATTCATTTCTCATTGGTCATATAAGGTAACTTTGGCCCA 349
seq1 GTGAGTAAGTGCTGACACTTACACAAATCCACCCTATATCTCTCAGCTTC 398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGAGTAAGTGCTGACACTTACACAAATCCACCCTATATCTCTCAGCTTC 399
seq1 AACAAACAGGATACCAAAAGCAACTGCAATCCTCCTATAAGTGCCCTAAG 448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AACAAACAGGATACCAAAAGCAACTGCAATCCTCCTATAAGTGCCCTAAG 449
seq1 GCTGTAGAGGCCATGGGGCCCTTTACTGACTAAGAGCACCAAGAGAAAAG 498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTGTAGAGGCCATGGGGCCCTTTACTGACTAAGAGCACCAAGAGAAAAG 499
seq1 AAAAGCTGATCACACAGGGGAGTCTCTCTGTGGAAGAGATAAAATCAAAT 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAAAGCTGATCACACAGGGGAGTCTCTCTGTGGAAGAGATAAAATCAAAT 549
seq1 ACCTGCATGCCATCCAGAACACAGAGGAGTGTCTCCTCAATGGAAGAGAT 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACCTGCATGCCATCCAGAACACAGAGGAGTGTCTCCTCAATGGAAGAGAT 599
seq1 AATGTAAAGCACTTGCATTCCATCTGGAAAGCTGAGAGCAGAAGTTGTAA 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATGTAAAGCACTTGCATTCCATCTGGAAAGCTGAGAGCAGAAGTTGTAA 649
seq1 ATGACCTGGTGGCCTTTTTGCTATCTGTGGAAACAGACCTCACCCTAATT 698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGACCTGGTGGCCTTTTTGCTATCTGTGGAAACAGACCTCACCCTAATT 699
seq1 CCCCAGAATTATTATTCCAGACTCTTCCCTCCCTAGATCACTACCCATCT 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCCAGAATTATTATTCCAGACTCTTCCCTCCCTAGATCACTACCCATCT 749
seq1 TTAGTGTAATTGTCACAAATGCTTTAAGGCCTGCTGATCTCTACATTAGG 798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTAGTGTAATTGTCACAAATGCTTTAAGGCCTGCTGATCTCTACATTAGG 799
seq1 GGTGAGAGACTACACTGAATTC 820
||||||||||||||||||||||
seq2 GGTGAGAGACTACACTGAATTC 821
|