BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-017K02
Chromosome1 (Build37)
Map Location 151,674,681 - 151,816,296
singlet/doubletdoublet
Overlap genePla2g4a
Upstream geneLOC100042792, LOC435647, LOC100042813
Downstream genePtgs2, LOC676712, LOC100043257, LOC100043261, Pdc, BC003331, Tpr, EG625534, EG545370
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-017K02.bB6Ng01-017K02.g
ACCDH851260DH851261
length558968
definitionDH851260|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-017K02, 5' end.DH851261|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-017K02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,674,681 - 151,675,244)(151,815,330 - 151,816,296)
sequence
acacacaatgatctttcatatttcaccacattcacctccatagatagtga
cataaagaccacacaccagatgaccccaggtctgatattatcttgaggaa
ttttagctaagtttagtgactatcttgcttggatccttcacagggatatt
cagaataaaagaaacacaaacagctgtattgtcctgatgtgatttctagc
accataatatttattagaaataaacagtattgtcaagttttctatgcttg
gccttcagcctctgtgctatgctcaatttccttcaggaatgctcttgtca
cacccttgctttcctgtaattttacattgttactccccaaagcccattta
aagtctcacatgtccagcagctctcagatcttgtccattctttacttgcc
atgctttgtcacactaacttgtttattgttggtgaaaaaactaattatgt
ttcagatatgaagcatctgactaaagggctcacatattataaggataatt
tacagctgatgacctatttttggagactctggaactgttagagggggtgg
gtggagaa
gaattcaattcctgtgccttatcttataaaaagtgtttaatcaaaattag
agaacactactaagctacacaacaggaagcagtttaggaacacacattgt
gtgttacatgcagaagagagggctcctggcttttgggatattggtccatc
ttcatgtcccattttcaattagttgatgtgagctgttgattcaaaatatc
aaaactacaagttaatagagaattttgctagttggatattattgtcagtt
tcatacaatttagagtcatttgaaaagagggaaccacagtggagaaattg
atagttgatgtgggagggcccagtccactctgggtggcagaactgatttt
tgagatagtccaaggaatgataaaggatgccaagcttccaatctgaagct
agcaagtaaaggaataacaagagtctgttatacagcaaataatgcgcgcg
cgcgcacacacacacacacacacacacacataccagtaatagtgtgctaa
gttatgtccatagctcctcaaattactttgttgacaagacatgtgtcttg
gttagcgtttgctttactgtgaacagacaccatcaccaaggcaactcata
taaaggacatttatttggggctcgcttacaggttcagaggtttactccat
tattatcatagccgtaagcatggcagcaggcaggcagacacgatgatgga
ggagctgagagttctacattttgattcaaagccaaccaggaaaagacttt
cttccagaagctagcaggagggtctcaagataacacacacaaatgacaca
ctcccgccaacaagaccacacctactccaacagggccacacctcctaata
ctgccaattcctgggccaaaccatcacaacatgggataaagcttggtgtg
atatggggaaatgatttctttcctggtcattttaccaaaacaagaaatag
agaaacaagaagctttcg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_151674681_151675244
seq2: B6Ng01-017K02.b_37_600

seq1  GAATTCACACACAATGATCTTTCATATTTCACCACATTCACCTCCATAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACACACAATGATCTTTCATATTTCACCACATTCACCTCCATAGA  50

seq1  TAGTGACATAAAGACCACACACCAGATGACCCCAGGTCTGATATTATCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGACATAAAGACCACACACCAGATGACCCCAGGTCTGATATTATCTT  100

seq1  GAGGAATTTTAGCTAAGTTTAGTGACTATCTTGCTTGGATCCTTCACAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAATTTTAGCTAAGTTTAGTGACTATCTTGCTTGGATCCTTCACAGG  150

seq1  GATATTCAGAATAAAAGAAACACAAACAGCTGTATTGTCCTGATGTGATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTCAGAATAAAAGAAACACAAACAGCTGTATTGTCCTGATGTGATT  200

seq1  TCTAGCACCATAATATTTATTAGAAATAAACAGTATTGTCAAGTTTTCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGCACCATAATATTTATTAGAAATAAACAGTATTGTCAAGTTTTCTA  250

seq1  TGCTTGGCCTTCAGCCTCTGTGCTATGCTCAATTTCCTTCAGGAATGCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGGCCTTCAGCCTCTGTGCTATGCTCAATTTCCTTCAGGAATGCTC  300

seq1  TTGTCACACCCTTGCTTTCCTGTAATTTTACATTGTTACTCCCCAAAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCACACCCTTGCTTTCCTGTAATTTTACATTGTTACTCCCCAAAGCC  350

seq1  CATTTAAAGTCTCACATGTCCAGCAGCTCTCAGATCTTGTCCATTCTTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTAAAGTCTCACATGTCCAGCAGCTCTCAGATCTTGTCCATTCTTTA  400

seq1  CTTGCCATGCTTTGTCACACTAACTTGTTTATTGTTGGTGAAAAAACTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCCATGCTTTGTCACACTAACTTGTTTATTGTTGGTGAAAAAACTAA  450

seq1  TTATGTTTCAGATATGAAGCATCTGACTAAAGGGCTCACATATTATAAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTTTCAGATATGAAGCATCTGACTAAAGGGCTCACATATTATAAGG  500

seq1  ATAATTTACAGCTGATGACCTATTTTTGGAGACTCTGGAACTGTTAGAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTTACAGCTGATGACCTATTTTTGGAGACTCTGGAACTGTTAGAGG  550

seq1  GGGTGGGTGGAGAA  564
      ||||||||||||||
seq2  GGGTGGGTGGAGAA  564

seq1: chr1_151815330_151816296
seq2: B6Ng01-017K02.g_64_1031 (reverse)

seq1  CGAATGCTTCTTGTTT-TCT-TCTCTTGTTATGGAAAAATGACAAGGAAA  48
      |||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||
seq2  CGAAAGCTTCTTGTTTCTCTATTTCTTGTTTTGGTAAAATGACCAGGAAA  50

seq1  GCAATCACTTCCCCTAATCACACCAAGCTTTATCCCATGTTGTGATGGTT  98
      | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCATTTCCCCATATCACACCAAGCTTTATCCCATGTTGTGATGGTT  100

seq1  TGGCCCAGGAATTGGCAGTATTAGGAGGTGTGGCCTTGTTGGAGTAGGTG  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TGGCCCAGGAATTGGCAGTATTAGGAGGTGTGGCCCTGTTGGAGTAGGTG  150

seq1  TGGTCTTGTTGGCGGAAGTGTGTCATTTGTGTGTGTTATCTTTGAGACCC  198
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TGGTCTTGTTGGCGGGAGTGTGTCATTTGTGTGTGTTATC-TTGAGACCC  199

seq1  TCCTGCTAGCTTCTGGAAGAAAGTCTTTTCCTGGTTGGCTTTGAATCAAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCTAGCTTCTGGAAGAAAGTCTTTTCCTGGTTGGCTTTGAATCAAA  249

seq1  ATGTAGAACTCTCAGCTCCTCCATCATCGTGTCTGCCTGCCTGCTGCCAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGAACTCTCAGCTCCTCCATCATCGTGTCTGCCTGCCTGCTGCCAT  299

seq1  GCTTACGGCTATGATAATAATGGAGTAAACCTCTGAACCTGTAAGCGAGC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTACGGCTATGATAATAATGGAGTAAACCTCTGAACCTGTAAGCGAGC  349

seq1  CCCAAATAAATGTCCTTTATATGAGTTGCCTTGGTGATGGTGTCTGTTCA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAATAAATGTCCTTTATATGAGTTGCCTTGGTGATGGTGTCTGTTCA  399

seq1  CAGTAAAGCAAACGCTAACCAAGACACATGTCTTGTCAACAAAGTAATTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAAGCAAACGCTAACCAAGACACATGTCTTGTCAACAAAGTAATTT  449

seq1  GAGGAGCTATGGACATAACTTAGCACACTATTACTGGTATGTGTGTGTGT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGCTATGGACATAACTTAGCACACTATTACTGGTATGTGTGTGTGT  499

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCGCGCATTATTTGCTGTATAACAGACTCT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCGCGCATTATTTGCTGTATAACAGACTCT  549

seq1  TGTTATTCCTTTACTTGCTAGCTTCAGATTGGAAGCTTGGCATCCTTTAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATTCCTTTACTTGCTAGCTTCAGATTGGAAGCTTGGCATCCTTTAT  599

seq1  CATTCCTTGGACTATCTCAAAAATCAGTTCTGCCACCCAGAGTGGACTGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCTTGGACTATCTCAAAAATCAGTTCTGCCACCCAGAGTGGACTGG  649

seq1  GCCCTCCCACATCAACTATCAATTTCTCCACTGTGGTTCCCTCTTTTCAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCCCACATCAACTATCAATTTCTCCACTGTGGTTCCCTCTTTTCAA  699

seq1  ATGACTCTAAATTGTATGAAACTGACAATAATATCCAACTAGCAAAATTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTCTAAATTGTATGAAACTGACAATAATATCCAACTAGCAAAATTC  749

seq1  TCTATTAACTTGTAGTTTTGATATTTTGAATCAACAGCTCACATCAACTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTAACTTGTAGTTTTGATATTTTGAATCAACAGCTCACATCAACTA  799

seq1  ATTGAAAATGGGACATGAAGATGGACCAATATCCCAAAAGCCAGGAGCCC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAAAATGGGACATGAAGATGGACCAATATCCCAAAAGCCAGGAGCCC  849

seq1  TCTCTTCTGCATGTAACACACAATGTGTGTTCCTAAACTGCTTCCTGTTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTCTGCATGTAACACACAATGTGTGTTCCTAAACTGCTTCCTGTTG  899

seq1  TGTAGCTTAGTAGTGTTCTCTAATTTTGATTAAACACTTTTTATAAGATA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGCTTAGTAGTGTTCTCTAATTTTGATTAAACACTTTTTATAAGATA  949

seq1  AGGCACAGGAATTGAATTC  967
      |||||||||||||||||||
seq2  AGGCACAGGAATTGAATTC  968