BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-018C02
Chromosome1 (Build37)
Map Location 151,487,784 - 151,551,611
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042792, LOC435647
Downstream geneLOC100042813, Pla2g4a, Ptgs2, LOC676712, LOC100043257, LOC100043261, Pdc, BC003331, Tpr, EG625534
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-018C02.bB6Ng01-018C02.g
ACCDH851617DH851618
length1,074907
definitionDH851617|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018C02, 5' end.DH851618|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018C02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,550,520 - 151,551,611)(151,487,784 - 151,488,686)
sequence
gaattcacacttagtatcaattctgcttcattgtttaacaatatgatatc
tcaagttattatttcctctagggaacaaattgttttgaacaggcttcata
ggtgcaaatcatacactgatgtcagtataatgggtttccctcttttttac
tttgtgtttgcagacataaaactgcaatgtcattacatttatgtaactga
atcttataatttgaataaatatgaattcaggaccctttatattttgagtt
ctaaaaggttaagtatttcagagtctgggagcattgtggaggccccattg
tgtctgtaagtagagaagaggccatacacaaagtctggaagaagagcctt
acccatggaggagtgttcagtgctaggttgcagactcagaactgagggtc
agaagtcatgcaacaccatttggtgcctttgaaaggatcttgggttagtt
tgtgataaagcctgggcacactgggctcccagggagcttgagtgccaaga
gcctggagtttttggatatgttgaaatgcaaaagggttgtgaaaacatat
atgaccttcagttttatacacatttgagtcaacgttagaacaaccacata
tagggtaaaagttaagggatgttcatgtttgaagagtctttaaatttatg
aataatttttgccaagagatgatgcacatgtatttgttaaagctcttttt
agggagtgaataggatgaggtcagaagataagaaaaccaagactacagaa
taaaggcaatatagtttcatttttaccatcttgcatttgaaatggtgact
atttaaaaatccacttctctgaaaatgcattattaaatagcagcctttca
caggagggttaacacaccagattaatctgcatatgaaacagctgttcata
tgttgttgctttttattccctctatcccaacatcaagacagaatggaagt
gtaagatgccataaaaagttcttgttaggaaatgatggtttagtgattag
tggtgtagatctcctcagtgatgggtcttcctgtactgagagtagctggt
tccactacaggcttgttcccctct
gaattctgctgcatgttaaatccaccaaagaacaagtacagacacactta
aagcctaatagaacatctgtattgctgggcaactgctgcacagggaactt
ccccaaatcatgcagttctaagcctcactgttctttgtcttttataaaga
aaatcacatcctagttgtgcagttagcagtaaagggaacttaagattcta
aaaggcaaggttagtgcatttaaggactttcctgaatcctggaactatgg
actaggtcttggatggattaggtctttgtttccattttgcaattattgag
gcccatgtgctgaattttaaagttggaatgtttcctttaacattgtgttg
gttgttctatggtgtgggaaactattgtgtaccctactgactctacaagc
aggaaccaaaacatgaattcatcatggagcagacggttatattgtgaccc
tcaacaataaaaatttatcagagtttactctctgttttacatagttaagt
aagtgcctaagcagcatggtcctatagtgagggctcagaaattaaagata
agcatccccacccactgctgtatttatttagaatagttaactagagtcac
caggagaacaaggtctgatatgagttggcaaactcttgatttttttttct
gtttagttggttggttgttttttaaggttatttttttcttacttttccat
ataatgtcattttttcttgtattgaatgtagatacatttttctcagataa
tattacttgatcatggggtttctctacctctatacttctcagtttcctta
ccacctcctctcccaccaagatccactctctgtcagtgggaaaacagtcc
ttctagaagatatgatatgatatgatatgatagatatgatatgatatgat
atgatat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_151550520_151551611
seq2: B6Ng01-018C02.b_47_1120 (reverse)

seq1  AGAGGGAGAACATGCCTGGTAGTGGAAACCTAGCTAACTACTCAGTACCA  50
      |||||| ||||| |||| |||||||||  | |||| ||| ||||||| ||
seq2  AGAGGG-GAACAAGCCT-GTAGTGGAA--CCAGCT-ACT-CTCAGTA-CA  43

seq1  GTGAAGACACCATCACTGGAGGAGAATCTACAACCACTAATTCACTAAAC  100
      | |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||
seq2  G-GAAGAC-CCATCACT-GAGGAG-ATCTAC-ACCACTAA-TCACTAAAC  87

seq1  CATCATTTTCCCTAACAAGAACCTTTTTATGGCATTCTTACACTTCCATT  150
      ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CATCATTT--CCTAACAAGAA-CTTTTTATGGCA-TCTTACACTTCCATT  133

seq1  CTGTCTTTGATGTTGGGATAGAGGGAATAAAAAGCAACAACATATGAACA  200
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTC-TTGATGTTGGGATAGAGGGAATAAAAAGCAACAACATATGAACA  182

seq1  GCTGTTTCATATGCAGATTAATCTGGTGTGTTAACCCTCCTGTGAAAGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTTTCATATGCAGATTAATCTGGTGTGTTAACCCTCCTGTGAAAGGC  232

seq1  TGCTATTTAATAATGCATTTTCAGAGAAGTGGATTTTTAAATAGTCACCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATTTAATAATGCATTTTCAGAGAAGTGGATTTTTAAATAGTCACCA  282

seq1  TTTCAAATGCAAGATGGTAAAAATGAAACTATATTGCCTTTATTCTGTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAATGCAAGATGGTAAAAATGAAACTATATTGCCTTTATTCTGTAG  332

seq1  TCTTGGTTTTCTTATCTTCTGACCTCATCCTATTCACTCCCTAAAAAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGTTTTCTTATCTTCTGACCTCATCCTATTCACTCCCTAAAAAGAG  382

seq1  CTTTAACAAATACATGTGCATCATCTCTTGGCAAAAATTATTCATAAATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAACAAATACATGTGCATCATCTCTTGGCAAAAATTATTCATAAATT  432

seq1  TAAAGACTCTTCAAACATGAACATCCCTTAACTTTTACCCTATATGTGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGACTCTTCAAACATGAACATCCCTTAACTTTTACCCTATATGTGGT  482

seq1  TGTTCTAACGTTGACTCAAATGTGTATAAAACTGAAGGTCATATATGTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTAACGTTGACTCAAATGTGTATAAAACTGAAGGTCATATATGTTT  532

seq1  TCACAACCCTTTTGCATTTCAACATATCCAAAAACTCCAGGCTCTTGGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAACCCTTTTGCATTTCAACATATCCAAAAACTCCAGGCTCTTGGCA  582

seq1  CTCAAGCTCCCTGGGAGCCCAGTGTGCCCAGGCTTTATCACAAACTAACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGCTCCCTGGGAGCCCAGTGTGCCCAGGCTTTATCACAAACTAACC  632

seq1  CAAGATCCTTTCAAAGGCACCAAATGGTGTTGCATGACTTCTGACCCTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGATCCTTTCAAAGGCACCAAATGGTGTTGCATGACTTCTGACCCTCA  682

seq1  GTTCTGAGTCTGCAACCTAGCACTGAACACTCCTCCATGGGTAAGGCTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGAGTCTGCAACCTAGCACTGAACACTCCTCCATGGGTAAGGCTCT  732

seq1  TCTTCCAGACTTTGTGTATGGCCTCTTCTCTACTTACAGACACAATGGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCAGACTTTGTGTATGGCCTCTTCTCTACTTACAGACACAATGGGG  782

seq1  CCTCCACAATGCTCCCAGACTCTGAAATACTTAACCTTTTAGAACTCAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCACAATGCTCCCAGACTCTGAAATACTTAACCTTTTAGAACTCAAA  832

seq1  ATATAAAGGGTCCTGAATTCATATTTATTCAAATTATAAGATTCAGTTAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAAGGGTCCTGAATTCATATTTATTCAAATTATAAGATTCAGTTAC  882

seq1  ATAAATGTAATGACATTGCAGTTTTATGTCTGCAAACACAAAGTAAAAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATGTAATGACATTGCAGTTTTATGTCTGCAAACACAAAGTAAAAAA  932

seq1  GAGGGAAACCCATTATACTGACATCAGTGTATGATTTGCACCTATGAAGC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGAAACCCATTATACTGACATCAGTGTATGATTTGCACCTATGAAGC  982

seq1  CTGTTCAAAACAATTTGTTCCCTAGAGGAAATAATAACTTGAGATATCAT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCAAAACAATTTGTTCCCTAGAGGAAATAATAACTTGAGATATCAT  1032

seq1  ATTGTTAAACAATGAAGCAGAATTGATACTAAGTGTGAATTC  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTAAACAATGAAGCAGAATTGATACTAAGTGTGAATTC  1074

seq1: chr1_151487784_151488686
seq2: B6Ng01-018C02.g_66_972

seq1  GAATTCTGCTGCATGTTAAATCCACCAAAGAACAAGTACAGACACACTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCTGCATGTTAAATCCACCAAAGAACAAGTACAGACACACTTA  50

seq1  AAGCCTAATAGAACATCTGTATTGCTGGGCAACTGCTGCACAGGGAACTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTAATAGAACATCTGTATTGCTGGGCAACTGCTGCACAGGGAACTT  100

seq1  CCCCAAATCATGCAGTTCTAAGCCTCACTGTTCTTTGTCTTTTATAAAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAAATCATGCAGTTCTAAGCCTCACTGTTCTTTGTCTTTTATAAAGA  150

seq1  AAATCACATCCTAGTTGTGCAGTTAGCAGTAAAGGGAACTTAAGATTCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCACATCCTAGTTGTGCAGTTAGCAGTAAAGGGAACTTAAGATTCTA  200

seq1  AAAGGCAAGGTTAGTGCATTTAAGGACTTTCCTGAATCCTGGAACTATGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCAAGGTTAGTGCATTTAAGGACTTTCCTGAATCCTGGAACTATGG  250

seq1  ACTAGGTCTTGGATGGATTAGGTCTTTGTTTCCATTTTGCAATTATTGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGGTCTTGGATGGATTAGGTCTTTGTTTCCATTTTGCAATTATTGAG  300

seq1  GCCCATGTGCTGAATTTTAAAGTTGGAATGTTTCCTTTAACATTGTGTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCATGTGCTGAATTTTAAAGTTGGAATGTTTCCTTTAACATTGTGTTG  350

seq1  GTTGTTCTATGGTGTGGGAAACTATTGTGTACCCTACTGACTCTACAAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTCTATGGTGTGGGAAACTATTGTGTACCCTACTGACTCTACAAGC  400

seq1  AGGAACCAAAACATGAATTCATCATGGAGCAGACGGTTATATTGTGACCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAACCAAAACATGAATTCATCATGGAGCAGACGGTTATATTGTGACCC  450

seq1  TCAACAATAAAAATTTATCAGAGTTTACTCTCTGTTTTACATAGTTAAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACAATAAAAATTTATCAGAGTTTACTCTCTGTTTTACATAGTTAAGT  500

seq1  AAGTGCCTAAGCAGCATGGTCCTATAGTGAGGGCTCAGAAATTAAAGATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCCTAAGCAGCATGGTCCTATAGTGAGGGCTCAGAAATTAAAGATA  550

seq1  AGCATCCCCACCCACTGCTGTATTTATTTAGAATAGTTAACTAGAGTCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCCCCACCCACTGCTGTATTTATTTAGAATAGTTAACTAGAGTCAC  600

seq1  CAGGAGAACAAGGTCTGATATGAGTTGGCAAACTCTTGATTTTTTTTTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGAACAAGGTCTGATATGAGTTGGCAAACTCTTGATTTTTTTTTCT  650

seq1  GTTTAGTTGGTTGGTTGTTTTTTAAGGTTATTTTTTTCTTACTTTTCCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAGTTGGTTGGTTGTTTTTTAAGGTTATTTTTTTCTTACTTTTCCAT  700

seq1  ATAATGTCATTTTTTCTTGTATTGAATGTAGATACATTTTTCTCAGATAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGTCATTTTTTCTTGTATTGAATGTAGATACATTTTTCTCAGATAA  750

seq1  TATTACTTGATCAT-GGGTTTCTCTACCTCTATACTTCTCAG-TTCCTTA  798
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TATTACTTGATCATGGGGTTTCTCTACCTCTATACTTCTCAGTTTCCTTA  800

seq1  CCACCTCCTCTCCCACCAAGATCCACTCCCTGTCAGT-GGAAAACAGT-C  846
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
seq2  CCACCTCCTCTCCCACCAAGATCCACTCTCTGTCAGTGGGAAAACAGTCC  850

seq1  TTCTAGAAGATATGATATGATATGATATGATAGATATGATATGATATGAT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGAAGATATGATATGATATGATATGATAGATATGATATGATATGAT  900

seq1  ATGATAT  903
      |||||||
seq2  ATGATAT  907