BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-021L13
Chromosome1 (Build37)
Map Location 109,960,624 - 110,062,489
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneSerpinb3d, LOC100041276, Serpinb3b, EG666401, Serpinb3c, LOC666414, Serpinb11, Serpinb7, Serpinb2, Serpinb10, Serpinb8
Downstream geneLOC435640, EG626474
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-021L13.bB6Ng01-021L13.g
ACCDH854147DH854148
length8901,011
definitionDH854147|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021L13, 5' end.DH854148|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021L13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(109,960,624 - 109,961,517)(110,061,474 - 110,062,489)
sequence
gaattcccagaattgacttcaggattatatataatataattgttcctaga
acatttgcttcaagaaagtttaaacactttctaaagacaatcgcataaat
tctctaagtgtctgaaaatgtgacttctgattactgtttctgggaatcag
taactcctaagagcacattttcgctcatttaacttaagaatgaaatgata
tattataggtacttctctgtgagtcagttttatttttatcttttctagtg
gtttagagccattccaaaatgatcccttgttctattttaaatgtcttgaa
ttatctttcaaggttcaaataattttataacattatgtatattttctgaa
gtgtactaaattgtttggcatctaatatttacaaaatttttgggtactat
tatgaatcactttaagtaaccagacacagtaggtgaaaccctaacaaatt
ccaaggatactgttggtataaatgatggaggagaggctattgtcttactc
atggagagactacatggccagataatgtcttcaagagagcagatagacaa
acaaaaaacacttgacaggaggagaaaaataacatttagaaaacagtaac
actcaaaatttggtattttttatgacaaatttctcatttctgacattgta
gtgcaatgcattggaatatccagggatccatcccataatcagcttccaaa
cgctgacaccattgcatacactagcaagattttgctgaaaggacccagat
atagctgtctcttgtgagactatgccagggcctagcaaacacagaagtgg
atgctcacagtcagcttttgatggatcacagtgccccaatggaagagcta
gagaaagttcccaaggactaagggaactgcaaccctatag
gaattcagctaaaggcttacggcttcatcaatttgaatcctgctttactg
ttatcatcacatgcgagttccttatgtgtatgcataattctgcttaattt
attacctacgttagtacctgagaataagagataatgtggatgaaatttac
aagtatctgtcaattcctctccactcttacttttacgatacaagttctac
gctttagtcaatgaattttacaaaattgacagttctcatcctggcaaagc
attgtattgaggctaataaacaatcacacatcacaataaaagtaagaaag
agacacttaatgagcacctatgctcttgcctatgccatatttatgaagct
gaaacttaatatggagccatatttatacaatagggagaaatttgcatact
ttcttaaggagatgtgagatgaatttcattagtattataaaatattttca
gggtctctctgaaagagatcctttgaggattaatgtgttgactctaaagg
aattataacacataaatgcttcacagtgattcagtgaggctatgtggcag
aaaaaataattagctgacatttttagcatcatggtttaaagacaggttgt
taacttcaagattctaaaatagtagcttggatacataaaatcaaaagctt
tagtagtgagaaaaccctctaaagccttagctttaatgcaggactagatg
agcgacagaaaactataaagaaacaagtgttagagcaggatgggagttga
cgtgttcctaccgtagctatgtcttcattttatggagaggtcaagtttcc
ttcacaaaccccacagaaactcaagacaacctattctttgacttctagct
aagctctagtaaattcattttgtcctatcagctcatcagagtctagggtc
acatgtaatttttgattcttctttcagaaggtgtgtctcttgtgcacttg
acttcatctctagatgggctagacattagttgtgtgtataatgtggagat
gttgaaccaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_109960624_109961517
seq2: B6Ng01-021L13.b_40_929

seq1  GAATTCCCAGAATTGACTTCAGGATTATATATAATATAATTGTTCCTAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAGAATTGACTTCAGGATTATATATAATATAATTGTTCCTAGA  50

seq1  ACATTTGCTTCAAGAAAGTTTAAACACTTTCTAAAGACAATCGCATAAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTGCTTCAAGAAAGTTTAAACACTTTCTAAAGACAATCGCATAAAT  100

seq1  TCTCTAAGTGTCTGAAAATGTGACTTCTGATTACTGTTTCTGGGAATCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAAGTGTCTGAAAATGTGACTTCTGATTACTGTTTCTGGGAATCAG  150

seq1  TAACTCCTAAGAGCACATTTTCGCTCATTTAACTTAAGAATGAAATGATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTCCTAAGAGCACATTTTCGCTCATTTAACTTAAGAATGAAATGATA  200

seq1  TATTATAGGTACTTCTCTGTGAGTCAGTTTTATTTTTATCTTTTCTAGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATAGGTACTTCTCTGTGAGTCAGTTTTATTTTTATCTTTTCTAGTG  250

seq1  GTTTAGAGCCATTCCAAAATGATCCCTTGTTCTATTTTAAATGTCTTGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAGAGCCATTCCAAAATGATCCCTTGTTCTATTTTAAATGTCTTGAA  300

seq1  TTATCTTTCAAGGTTCAAATAATTTTATAACATTATGTATATTTTCTGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTTTCAAGGTTCAAATAATTTTATAACATTATGTATATTTTCTGAA  350

seq1  GTGTACTAAATTGTTTGGCATCTAATATTTACAAAATTTTTGGGTACTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTACTAAATTGTTTGGCATCTAATATTTACAAAATTTTTGGGTACTAT  400

seq1  TATGAATCACTTTAAGTAACCAGACACAGTAGGTGAAACCCTAACAAATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAATCACTTTAAGTAACCAGACACAGTAGGTGAAACCCTAACAAATT  450

seq1  CCAAGGATACTGTTGGTATAAATGATGGAGGAGAGGCTATTGTCTTACTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGATACTGTTGGTATAAATGATGGAGGAGAGGCTATTGTCTTACTC  500

seq1  ATGGAGAGACTACATGGCCAGATAATGTCTTCAAGAGAGCAGATAGACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGAGACTACATGGCCAGATAATGTCTTCAAGAGAGCAGATAGACAA  550

seq1  ACAAAAAACACTTGACAGGAGGAGAAAAATAACATTTAGAAAACAGTAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAAACACTTGACAGGAGGAGAAAAATAACATTTAGAAAACAGTAAC  600

seq1  ACTCAAAATTTGGTATTTTTTATGACAAATTTCTCATTTCTGACATTGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAAAATTTGGTATTTTTTATGACAAATTTCTCATTTCTGACATTGTA  650

seq1  GTGCAATGCATTGGAATATCCAGGGATCCATCCCATAATCAGCTTCCAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAATGCATTGGAATATCCAGGGATCCATCCCATAATCAGCTTCCAAA  700

seq1  CGCTGACACCATTGCATACACTAGCAAGATTTTGCTGAAAGGACCCAGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTGACACCATTGCATACACTAGCAAGATTTTGCTGAAAGGACCCAGAT  750

seq1  ATAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCCAGGGCCTAGCAAACACAGAAGTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCCAGGGCCTAGCAAACACAGAAGTGG  800

seq1  ATGCTCACAGTCAGCTTTTGAATGGATCACAGGGCCCCCAATGGAAGAGC  850
      |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||
seq2  ATGCTCACAGTCAGCTTTTG-ATGGATCACAGTG-CCCCAATGGAAGAGC  848

seq1  TAGAGAAAGTACCCAAGGAACTAAAGGGAACTGCAACCCTATAG  894
      |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAAAGTTCCCAAGG-ACT-AAGGGAACTGCAACCCTATAG  890

seq1: chr1_110061474_110062489
seq2: B6Ng01-021L13.g_68_1078 (reverse)

seq1  TGTGTGTTCAACATCTCCACATTATACACACAACTAATGTCTAGCCCATC  50
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTG-GTTCAACATCTCCACATTATACACACAACTAATGTCTAGCCCATC  49

seq1  TAGAGGATGAAGTCAAAGTGCACAAGAGACACACCCTTCTGAAAGAAGAA  100
      |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TAGA-GATGAAGTC-AAGTGCACAAGAGACACA-CCTTCTGAAAGAAGAA  96

seq1  TCAAAAATTACATGTGACCCTAGACTCTGATGAGCTGATAGGACAAAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAATTACATGTGACCCTAGACTCTGATGAGCTGATAGGACAAAATG  146

seq1  AATTTTACTAGAGCTTAGCTAGAAGTCAAAGAATAGGTTGTCTTGAGTTT  200
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AA-TTTACTAGAGCTTAGCTAGAAGTCAAAGAATAGGTTGTCTTGAGTTT  195

seq1  CTGTGGGGTTTGTGAAGGAAACTTGACCTCTCCATAAAATGAAGACATAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGGGTTTGTGAAGGAAACTTGACCTCTCCATAAAATGAAGACATAG  245

seq1  CTACGGTAGGAACACGTCAACTCCCATCCTGCTCTAACACTTGTTTCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACGGTAGGAACACGTCAACTCCCATCCTGCTCTAACACTTGTTTCTTT  295

seq1  ATAGTTTTCTGTCGCTCATCTAGTCCTGCATTAAAGCTAAGGCTTTAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTTTCTGTCGCTCATCTAGTCCTGCATTAAAGCTAAGGCTTTAGAG  345

seq1  GGTTTTCTCACTACTAAAGCTTTTGATTTTATGTATCCAAGCTACTATTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTCTCACTACTAAAGCTTTTGATTTTATGTATCCAAGCTACTATTT  395

seq1  TAGAATCTTGAAGTTAACAACCTGTCTTTAAACCATGATGCTAAAAATGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATCTTGAAGTTAACAACCTGTCTTTAAACCATGATGCTAAAAATGT  445

seq1  CAGCTAATTATTTTTTCTGCCACATAGCCTCACTGAATCACTGTGAAGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTAATTATTTTTTCTGCCACATAGCCTCACTGAATCACTGTGAAGCA  495

seq1  TTTATGTGTTATAATTCCTTTAGAGTCAACACATTAATCCTCAAAGGATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGTGTTATAATTCCTTTAGAGTCAACACATTAATCCTCAAAGGATC  545

seq1  TCTTTCAGAGAGACCCTGAAAATATTTTATAATACTAATGAAATTCATCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCAGAGAGACCCTGAAAATATTTTATAATACTAATGAAATTCATCT  595

seq1  CACATCTCCTTAAGAAAGTATGCAAATTTCTCCCTATTGTATAAATATGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCTCCTTAAGAAAGTATGCAAATTTCTCCCTATTGTATAAATATGG  645

seq1  CTCCATATTAAGTTTCAGCTTCATAAATATGGCATAGGCAAGAGCATAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATATTAAGTTTCAGCTTCATAAATATGGCATAGGCAAGAGCATAGG  695

seq1  TGCTCATTAAGTGTCTCTTTCTTACTTTTATTGTGATGTGTGATTGTTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCATTAAGTGTCTCTTTCTTACTTTTATTGTGATGTGTGATTGTTTA  745

seq1  TTAGCCTCAATACAATGCTTTGCCAGGATGAGAACTGTCAATTTTGTAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCCTCAATACAATGCTTTGCCAGGATGAGAACTGTCAATTTTGTAAA  795

seq1  ATTCATTGACTAAAGCGTAGAACTTGTATCGTAAAAGTAAGAGTGGAGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATTGACTAAAGCGTAGAACTTGTATCGTAAAAGTAAGAGTGGAGAG  845

seq1  GAATTGACAGATACTTGTAAATTTCATCCACATTATCTCTTATTCTCAGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGACAGATACTTGTAAATTTCATCCACATTATCTCTTATTCTCAGG  895

seq1  TACTAACGTAGGTAATAAATTAAGCAGAATTATGCATACACATAAGGAAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAACGTAGGTAATAAATTAAGCAGAATTATGCATACACATAAGGAAC  945

seq1  TCGCATGTGATGATAACAGTAAAGCAGGATTCAAATTGATGAAGCCGTAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCATGTGATGATAACAGTAAAGCAGGATTCAAATTGATGAAGCCGTAA  995

seq1  GCCTTTAGCTGAATTC  1016
      ||||||||||||||||
seq2  GCCTTTAGCTGAATTC  1011