BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-021L20
Chromosome1 (Build37)
Map Location 124,683,360 - 124,812,517
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC666971
Downstream geneLOC666983, Dpp10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-021L20.bB6Ng01-021L20.g
ACCDH854159DH854160
length1,0401,035
definitionDH854159|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021L20, 5' end.DH854160|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021L20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,811,470 - 124,812,517)(124,683,360 - 124,684,400)
sequence
gaattctttgcctatcctacagaatgaagtcaggtaacctcacaccctaa
gacaatgatgacatcatagaaagaagttgtaaatcagagactcttggact
gtaaccaccattcttgcttcattggtgaatcctcaaaagaccaaaagtct
gtgtcttcaaattatttcaaatatcaaaacagtaagagatcctggctctg
ccattaaatggcaacctttgagcactggtcctcttcttgccctcctattc
taagaaactgtgacagccaccagaaaagaacaggcccagagtgatcaaaa
tggaggaagttcccctcccatacctgagctgtgcaaggggagtggtctgc
tggagagattggtatatccttgcttttggaaactatcttgcattggacaa
aattggaatgaggggaggaaagtgttggaccaaattaagagggttcagat
tggtgtgatagatcaatatgtactatgaggatgtacaaaattgtcaaaga
tcaaatattaattaaaatgttttctaacaggttgaaagtgaagaggtaca
acactaactacatataccatgtctacatccatgtacacatttccatcttc
cccatctaaagtcctggaaatctggaaaacagaagacaaagaaagtatga
caaaaaatttcaggggttgattcattatataatgtggtttctggggactg
aactcctaggcctttatgcactgagctatgttaccagctcaaatattata
aatgttacaaattttaatatgtttaggatacttggaaataactttgatgc
atgcacatatatggttgcctgtgcacatgtatgaacatgtgtgtggaatt
tgggagtcaacctccatagatgccattcctcttggtttttcagacacttt
cattggcctggggctctgagttaggctagggtggttggacagaacaccta
tgattctgcctatgttcacccttgattgctggatttataagtatgcatta
ccatcttattctttatatcatggttatgatacggttctgg
gaattcagtgaaattgagtattgaaaaagcataaagatgattaacttcta
ggctggagagcctagtcatgaattcccagacacctggaaagctaatacaa
gaggatcacaaagcaatggccttccttggctatacagagtgagttcaagt
ccaacttgacaaacttggagagatcctgtctcaaaatcctggagatgctg
ttttagaaataaaaagcagaaaaaagaaagctaaagacaaggtcacattg
cagaatgtctggagagcatcaagcctcatgtttaacaccagtaccatgaa
taaatgtgagaattataatgcactatttgagacgtaaattgaaatgatat
gcctctataaaaaactgattacaaagtgtcaagacaaagttctaacaaca
gaactaattttctggaatcaagaaccactatgggacttctattagtagct
gttacatccagtatcttagaagagtgaacaaatcatgctaaaaccacaat
tattaaaattcatttaaggagcaattacgggagagaagctgaacagttaa
gaaaggctgatgcttttccagaggactcaatttcttaatactcatgtcag
atggcttacaactgcctataatgctaactccaggggattcagtgctctct
ttctgctctctgtggacccccagtacacacacacacacacacacacacac
acacacacacacacacacacacacacatattttgggggggttaatctcct
tgtttactgtgtaaaatagtctattattcaaatgccaatatctgcactgg
agagttgagtacaggctagaattttggtgttgttattttcttctccatct
tctctgatggtcaataaagagctgatcatccaatagctgagcagaagatt
atggcaggacttctagcttcaaacagagggtacacagaagaagagagtac
tgagagaaagagaagagaaggtgtgaaagacaatttggaggaagaggagg
aggatttgccattattgcataagaggtgccatgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_124811470_124812517
seq2: B6Ng01-021L20.b_45_1084 (reverse)

seq1  CCAGAACCCGTATCATAAACAATGATAATAAAAGAATAAGAATGGTAATG  50
      |||||| ||||||||| ||| ||||||   |||||||||| |||||||||
seq2  CCAGAA-CCGTATCAT-AACCATGATA--TAAAGAATAAG-ATGGTAATG  45

seq1  CATACTTATAAATCCAGCAATCAAGGGGTGAACATAGGCAGATTCTTAGG  100
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |
seq2  CATACTTATAAATCCAGCAATCAA-GGGTGAACATAGGCAGAATCATA-G  93

seq1  GTGTTCTGTCCAACCACCCTAGCCTAACTCATGAGCCCCAGGCCACTGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  GTGTTCTGTCCAACCACCCTAGCCTAACTCA-GAGCCCCAGGCCAATGAA  142

seq1  AGTGTCTGAAAAACCAAGAGGAATGGCATCTATGGAGGTTGACTCCCAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCTGAAAAACCAAGAGGAATGGCATCTATGGAGGTTGACTCCCAAA  192

seq1  TTCCACACACATGTTCATACATGTGCACAGGCAACCATATATGTGCATGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACACACATGTTCATACATGTGCACAGGCAACCATATATGTGCATGC  242

seq1  ATCAAAGTTATTTCCAAGTATCCTAAACATATTAAAATTTGTAACATTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAGTTATTTCCAAGTATCCTAAACATATTAAAATTTGTAACATTTA  292

seq1  TAATATTTGAGCTGGTAACATAGCTCAGTGCATAAAGGCCTAGGAGTTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATTTGAGCTGGTAACATAGCTCAGTGCATAAAGGCCTAGGAGTTCA  342

seq1  GTCCCCAGAAACCACATTATATAATGAATCAACCCCTGAAATTTTTTGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCCAGAAACCACATTATATAATGAATCAACCCCTGAAATTTTTTGTC  392

seq1  ATACTTTCTTTGTCTTCTGTTTTCCAGATTTCCAGGACTTTAGATGGGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTTCTTTGTCTTCTGTTTTCCAGATTTCCAGGACTTTAGATGGGGA  442

seq1  AGATGGAAATGTGTACATGGATGTAGACATGGTATATGTAGTTAGTGTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGAAATGTGTACATGGATGTAGACATGGTATATGTAGTTAGTGTTG  492

seq1  TACCTCTTCACTTTCAACCTGTTAGAAAACATTTTAATTAATATTTGATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCTTCACTTTCAACCTGTTAGAAAACATTTTAATTAATATTTGATC  542

seq1  TTTGACAATTTTGTACATCCTCATAGTACATATTGATCTATCACACCAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACAATTTTGTACATCCTCATAGTACATATTGATCTATCACACCAAT  592

seq1  CTGAACCCTCTTAATTTGGTCCAACACTTTCCTCCCCTCATTCCAATTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACCCTCTTAATTTGGTCCAACACTTTCCTCCCCTCATTCCAATTTT  642

seq1  GTCCAATGCAAGATAGTTTCCAAAAGCAAGGATATACCAATCTCTCCAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAATGCAAGATAGTTTCCAAAAGCAAGGATATACCAATCTCTCCAGC  692

seq1  AGACCACTCCCCTTGCACAGCTCAGGTATGGGAGGGGAACTTCCTCCATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCACTCCCCTTGCACAGCTCAGGTATGGGAGGGGAACTTCCTCCATT  742

seq1  TTGATCACTCTGGGCCTGTTCTTTTCTGGTGGCTGTCACAGTTTCTTAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCACTCTGGGCCTGTTCTTTTCTGGTGGCTGTCACAGTTTCTTAGA  792

seq1  ATAGGAGGGCAAGAAGAGGACCAGTGCTCAAAGGTTGCCATTTAATGGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGAGGGCAAGAAGAGGACCAGTGCTCAAAGGTTGCCATTTAATGGCA  842

seq1  GAGCCAGGATCTCTTACTGTTTTGATATTTGAAATAATTTGAAGACACAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCAGGATCTCTTACTGTTTTGATATTTGAAATAATTTGAAGACACAG  892

seq1  ACTTTTGGTCTTTTGAGGATTCACCAATGAAGCAAGAATGGTGGTTACAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTGGTCTTTTGAGGATTCACCAATGAAGCAAGAATGGTGGTTACAG  942

seq1  TCCAAGAGTCTCTGATTTACAACTTCTTTCTATGATGTCATCATTGTCTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAGAGTCTCTGATTTACAACTTCTTTCTATGATGTCATCATTGTCTT  992

seq1  AGGGTGTGAGGTTACCTGACTTCATTCTGTAGGATAGGCAAAGAATTC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGTGAGGTTACCTGACTTCATTCTGTAGGATAGGCAAAGAATTC  1040

seq1: chr1_124683360_124684400
seq2: B6Ng01-021L20.g_69_1102

seq1  GAATTCAGTGAAATTGAGTATTGAAAAAGCATAAAGATGATTAACTTCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGAAATTGAGTATTGAAAAAGCATAAAGATGATTAACTTCTA  50

seq1  GGCTGGAGAGCCTAGTCATGAATTCCCAGACACCTGGAAAGCTAATACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGAGAGCCTAGTCATGAATTCCCAGACACCTGGAAAGCTAATACAA  100

seq1  GAGGATCACAAAGCAATGGCCTTCCTTGGCTATACAGAGTGAGTTCAAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATCACAAAGCAATGGCCTTCCTTGGCTATACAGAGTGAGTTCAAGT  150

seq1  CCAACTTGACAAACTTGGAGAGATCCTGTCTCAAAATCCTGGAGATGCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTTGACAAACTTGGAGAGATCCTGTCTCAAAATCCTGGAGATGCTG  200

seq1  TTTTAGAAATAAAAAGCAGAAAAAAGAAAGCTAAAGACAAGGTCACATTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGAAATAAAAAGCAGAAAAAAGAAAGCTAAAGACAAGGTCACATTG  250

seq1  CAGAATGTCTGGAGAGCATCAAGCCTCATGTTTAACACCAGTACCATGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATGTCTGGAGAGCATCAAGCCTCATGTTTAACACCAGTACCATGAA  300

seq1  TAAATGTGAGAATTATAATGCACTATTTGAGACGTAAATTGAAATGATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGTGAGAATTATAATGCACTATTTGAGACGTAAATTGAAATGATAT  350

seq1  GCCTCTATAAAAAACTGATTACAAAGTGTCAAGACAAAGTTCTAACAACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTATAAAAAACTGATTACAAAGTGTCAAGACAAAGTTCTAACAACA  400

seq1  GAACTAATTTTCTGGAATCAAGAACCACTATGGGACTTCTATTAGTAGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTAATTTTCTGGAATCAAGAACCACTATGGGACTTCTATTAGTAGCT  450

seq1  GTTACATCCAGTATCTTAGAAGAGTGAACAAATCATGCTAAAACCACAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACATCCAGTATCTTAGAAGAGTGAACAAATCATGCTAAAACCACAAT  500

seq1  TATTAAAATTCATTTAAGGAGCAATTACGGGAGAGAAGCTGAACAGTTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAAAATTCATTTAAGGAGCAATTACGGGAGAGAAGCTGAACAGTTAA  550

seq1  GAAAGGCTGATGCTTTTCCAGAGGACTCAATTTCTTAATACTCATGTCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGCTGATGCTTTTCCAGAGGACTCAATTTCTTAATACTCATGTCAG  600

seq1  ATGGCTTACAACTGCCTATAATGCTAACTCCAGGGGATTCAGTGCTCTC-  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATGGCTTACAACTGCCTATAATGCTAACTCCAGGGGATTCAGTGCTCTCT  650

seq1  TTCTGCTCTCTGTGGA-CCCCAGTACACACACACACACACACACACACAC  698
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCTCTCTGTGGACCCCCAGTACACACACACACACACACACACACAC  700

seq1  ACACACACACACACACACACACACACATATTTTGGGGGGGTTAATCTCCT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACATATTTTGGGGGGGTTAATCTCCT  750

seq1  TGTTTACTGTGTAAAATAGTCTATTATTCAAATGCCAATATCTGCACTGG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTACTGTGTAAAATAGTCTATTATTCAAATGCCAATATCTGCACTGG  800

seq1  AGAGTTGAGTACAGGCTAGAATTTTGGTGTTGTTATTTTTCTTCTCCATC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AGAGTTGAGTACAGGCTAGAATTTTGGTGTTGTTA-TTTTCTTCTCCATC  849

seq1  TTCTCTGATTGGTCAATAAAGAGCTGATCATCCAATAGCTGAGCAGAAGA  898
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTGA-TGGTCAATAAAGAGCTGATCATCCAATAGCTGAGCAGAAGA  898

seq1  TTATGGCAGGACTTCTAGCTTCAAACAGAGGGTACCACAG-AGAAGAGAG  947
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
seq2  TTATGGCAGGACTTCTAGCTTCAAACAGAGGGTA-CACAGAAGAAGAGAG  947

seq1  TACTGAGAGAAAGAGAAGAGAAGGTGTGGAGAGACAATTTGGAGGGAAGA  997
      ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||
seq2  TACTGAGAGAAAGAGAAGAGAAGGTGT-GAAAGACAATTTGGA-GGAAGA  995

seq1  GGAGGAGGATTTGCCATGTAATTGCAATAAGAGAGTAGCCATGA  1041
      ||||||||||||||||  | ||||| ||||||| || |||||||
seq2  GGAGGAGGATTTGCCA--TTATTGC-ATAAGAG-GT-GCCATGA  1034