BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-024L03
Chromosome1 (Build37)
Map Location 101,629,077 - 101,630,189
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneC230078M14Rik, LOC633295, EG666200
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-024L03.g
ACCDH856251
length1,087
definitionDH856251|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024L03, 3' end.
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattcactgagtggaaggagagaactgaatcccccaaatgcacactata
acatgctcgtcctcatacacagagtatgtttgaagtctgcagctctgctt
tataacttatttgcaagactctgaagataccttaaaggatattacagcag
tctccttacactgaaaaactggtattgttcatttgtcccttcggcaacat
gcagagaccactaatctgtgttctgtctctttgcatataggccctcacta
aggaaaagctgtataaagagcatccatttaaattgcatttcattgaattt
ttgtgcctgacttacactcagcctagcattaaatattaatgaccatccca
gcatgcatcagtggctcattgtattttgcactgaatgtgataccacatcc
cttagtacttattctacaatttatgactcatcttgagaaattagtcttat
ctacaaggctcatacatgtaaaatcttctataacgtgaatgcatatttta
agatgtgtacttgtttattattctacttttaaaattattttctttatgta
tatgattgtgtgtaattcatatcacatgtgttctagtgttcatgagggcc
aaatgttgacaattagcatcttccttgataatctccaccttaaatattga
agcagggtccctcacttgagtctaagcacactattttgtatagactatcg
tgacaacttgttctgctgttgccctgtctctgccttctatccactgggat
tacaggtaggctgacatacctagcagacatttacaaaggtttttgagatc
tagacttgaggttcttgtactatgatgctgctaaacagctgagagtcacc
ttccatgtatgaatgcacatattgttaaatttttatttaagttgggagtg
ttctataactaataaattcctgtgcccaatcagagattcacttatctgtt
ctattctatgtgtaagatacaatactgcaagtcatggtttttaatactaa
gtgcactgcattggttaatggtaaacatttctgcctcatcccactgttga
gggagctagggtgcttccagctcccggttatgtaagt
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_101629077_101630189
seq2: B6Ng01-024L03.g_66_1152 (reverse)

seq1  ACTTATAATAACCAGGAGCTGGAAACAACCCAGACGTCCCTCAACAGAGG  50
      |||||  |||||| |||||||||| || || ||   ||||||||||| ||
seq2  ACTTA-CATAACCGGGAGCTGGAAGCACCCTAG--CTCCCTCAACAGTGG  47

seq1  AATGGATGCAGAAAATGTTGTACATTTACACAATGGAGTACTACTTAGTT  100
       || || |||| ||||||| |||  |||  ||||| ||| | |||||| |
seq2  GAT-GAGGCAG-AAATGTT-TACCATTAACCAATGCAGTGC-ACTTAG-T  92

seq1  ATTAAAAACAATGACTTACAGTATTGTTATCTTTACACAATAGAAATATG  150
      ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||| |
seq2  ATTAAAAACCATGACTTGCAGTATTG-TATC-TTACAC-ATAG-AATA-G  137

seq1  AACAGAATAAGTAAAATCTCTTATTTGGGCACAAGGAAATTTATTAAGTT  200
      ||||| ||||||  ||||||| | |||||||||  | |||||||||   |
seq2  AACAG-ATAAGT-GAATCTCTGA-TTGGGCACA--GGAATTTATTA--GT  180

seq1  TATAGAAACACTGCCAAACATAAATAAAAATTTAACAAATATGTGCATTC  250
      ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TATAG-AACACT-CCCAACTTAAATAAAAATTTAAC-AATATGTGCATTC  227

seq1  ATAGATTGGAAGGTGACTCTCTGCTGGTTTAGCAGCATCATAGTTACAAG  300
      ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||
seq2  ATACA-TGGAAGGTGACTCTCAGCT-GTTTAGCAGCATCATAG-TACAAG  274

seq1  AACCTAAAGTCTAGATCCCAAAAACCTTTGTAAATGTTTGCTAGGTATGT  350
      ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AACCTCAAGTCTAGATCTCAAAAACCTTTGTAAATGTCTGCTAGGTATGT  324

seq1  CAGCCTACCTGTAATCCCAGTGGATAGAAGGCAGAGACAGGGCAACAGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTACCTGTAATCCCAGTGGATAGAAGGCAGAGACAGGGCAACAGCA  374

seq1  GAACAAGTTGTCAGGATAGGCTATACAAAATAGTGTGCTTAGACTCAAGT  450
      ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAAGTTGTCACGATAGTCTATACAAAATAGTGTGCTTAGACTCAAGT  424

seq1  GAGGGACCCTGCTTCAATATTTAAGGTGGAGATTATCAAGGAAGATGCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGACCCTGCTTCAATATTTAAGGTGGAGATTATCAAGGAAGATGCTA  474

seq1  ATTGTCAACATTTGGCCCTCATGAACACTAGAACACATGTGATATGAATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCAACATTTGGCCCTCATGAACACTAGAACACATGTGATATGAATT  524

seq1  ACACACAATCATATACATAAAGAAAATAATTTTAAAAGTAGAATAATAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACAATCATATACATAAAGAAAATAATTTTAAAAGTAGAATAATAAA  574

seq1  CAAGTACACATCTTAAAATATGCATTCACGTTATAGAAGATTTTACATGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTACACATCTTAAAATATGCATTCACGTTATAGAAGATTTTACATGT  624

seq1  ATGAGCCTTGTAGATAAGACTAATTTCTCAAGATGAGTCATAAATTGTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCCTTGTAGATAAGACTAATTTCTCAAGATGAGTCATAAATTGTAG  674

seq1  AATAAGTACTAAGGGATGTGGTATCACATTCAGTGCAAAATACAATGAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGTACTAAGGGATGTGGTATCACATTCAGTGCAAAATACAATGAGC  724

seq1  CACTGATGCATGCTGGGATGGTCATTAATATTTAATGCTAGGCTGAGTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGATGCATGCTGGGATGGTCATTAATATTTAATGCTAGGCTGAGTGT  774

seq1  AAGTCAGGCACAAAAATTCAATGAAATGCAATTTAAATGGATGCTCTTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCAGGCACAAAAATTCAATGAAATGCAATTTAAATGGATGCTCTTTA  824

seq1  TACAGCTTTTCCTTAGTGAGGGCCTATATGCAAAGAGACAGAACACAGAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGCTTTTCCTTAGTGAGGGCCTATATGCAAAGAGACAGAACACAGAT  874

seq1  TAGTGGTCTCTGCATGTTGCCGAAGGGACAAATGAACAATACCAGTTTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGGTCTCTGCATGTTGCCGAAGGGACAAATGAACAATACCAGTTTTT  924

seq1  CAGTGTAAGGAGACTGCTGTAATATCCTTTAAGGTATCTTCAGAGTCTTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTAAGGAGACTGCTGTAATATCCTTTAAGGTATCTTCAGAGTCTTG  974

seq1  CAAATAAGTTATAAAGCAGAGCTGCAGACTTCAAACATACTCTGTGTATG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAAGTTATAAAGCAGAGCTGCAGACTTCAAACATACTCTGTGTATG  1024

seq1  AGGACGAGCATGTTATAGTGTGCATTTGGGGGATTCAGTTCTCTCCTTCC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACGAGCATGTTATAGTGTGCATTTGGGGGATTCAGTTCTCTCCTTCC  1074

seq1  ACTCAGTGAATTC  1113
      |||||||||||||
seq2  ACTCAGTGAATTC  1087