BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-025F17
Chromosome1 (Build37)
Map Location 148,497,106 - 148,652,637
singlet/doubletdoublet
Overlap geneB830045N13Rik, LOC100043240
Upstream geneLOC383571
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-025F17.bB6Ng01-025F17.g
ACCDH856731DH856732
length1,1211,106
definitionDH856731|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-025F17, 5' end.DH856732|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-025F17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(148,497,106 - 148,498,236)(148,651,506 - 148,652,637)
sequence
gaattcattgtttataatagatgaatagtaatccattgtgtaaatgtgcc
acattttctatatccattcctctgttgaagaacatctgggttctttccag
cttctggctattataaataaggctgctatgaacatagtggagtatgtatt
ttaaattacaaagtaagaatattgcattgttagtcccaacttaagatctc
gattttgagaagcatattttatataaggttagataatatgtatattatta
tactcatactatatattagtatatataatatgctaatatatactactata
ttatatatagtagtatatattagatatttgatatcttattctcaaaatat
tcttggtcaataaagtttgtgtgcatacttgtaaatatggataaaatatg
ccaggctattactgaacttataagaaaacaatgttacttcatttcaaagc
tctaatctgtatctgtagataatgatcctatgaaaatccatatcctctaa
actgagaagaccttagcaggtataagcacttaagatatgagtgtgaaaac
acaagtgtgacatttaaaatatgcaaagatagaaagggagattcataata
ttttctgtgtgaaatgtaatgacttctacttgtatgaacatcatgagata
atgaaagtatttttaaagcaattattgattatataatcttattttaagat
aaagctactatgcagtatacatcatgtggtggaatgtagagcaaaataca
atacaaaatttataaaattaatgtctccttgaatcttataagttttgaga
attgcacgatctattttttgtagttataataaatatttcaggcagaattg
tttttaagttccattgtgatagttaccacgttttgattatctccttgtgt
cttgagtctcaattttttgatttacatagcccttatgactaaggaggttc
aaaaaatgtttaagtattcattgccatttactttctttctttgagtactg
tctttttaaactatagctcatgactgactggaatattgggtctttgttgt
ttgaattggtaattactttaaatcctgaatattgctccccaactgtctgt
gtaaagctgactaccatattt
gaattcaaactgctacatgttgcaacagtgtggaaagatcaacagaaaag
gaggtaccccagtctccatctcatggcccttggagagaaaccttaaataa
aatctcccagttactagcatacatatggttgcacaatgaaagtatgaaaa
cagaatgtaaggatttagagctaccctgcctaaaattcccatctcaagtt
tccagtatgtttttttttaaacaattgaggatgccattgaaattctattt
gagtattttttatagaaaattactatatcaaattcagtgtctgtttagta
ttgaatgcaaaacaagattcttagacaattctcatataaattcttttagg
aaataatgatattttattaaccaaaaattgtctcaagatatcaatattat
tttatactctgacaaaccattttattgtatgatttaaggcaaatatatac
tggccatgttttctgctgtattaactatattgtgaaatacaaaacaatgt
accttctacagatttgtactgcatttttgaaatggatatgaaaatcaagg
tgtctaagtccttcagattgctgaggcttcaactaagaagccttatacaa
gtatttcaggtgtcatcaggttcccaatgatgtatgtgatagtttgtata
tgcttggcccagggagtggcactatttggagttgtggccttattggacta
agtgtgtcactgtgggcatgatcttcattaccctcatcctaactgcctgg
gaggcagtcctttcctagcagcctctagatgaagatgtagaactctcaac
tcctcctgcaccatgcttgcttgcactctgtcatgcttcaaccttggtga
taatggactgaagccccagttaaacgttattctcataagagttgccatgg
tcatgttgtctgttcacagcagtaaaatcatgtgacttagactgctctga
tacagaagtggatgctcacagtcatctattggatgaccaggtccctaatg
atgagctagagaagtacccagagcttaagggtctacagccctatagagga
caaaatttgaactaacagtactaccgaccagctgtgtctctagtgcattg
tagaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_148497106_148498236
seq2: B6Ng01-025F17.b_45_1165

seq1  GAATTCATTGTTTATAATAGATGAATAGTAATCCATTGTGTAAATGTGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGTTTATAATAGATGAATAGTAATCCATTGTGTAAATGTGCC  50

seq1  ACATTTTCTATATCCATTCCTCTGTTGAAGAACATCTGGGTTCTTTCCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTTCTATATCCATTCCTCTGTTGAAGAACATCTGGGTTCTTTCCAG  100

seq1  CTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAACATAGTGGAGTATGTATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAACATAGTGGAGTATGTATT  150

seq1  TTAAATTACAAAGTAAGAATATTGCATTGTTAGTCCCAACTTAAGATCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATTACAAAGTAAGAATATTGCATTGTTAGTCCCAACTTAAGATCTC  200

seq1  GATTTTGAGAAGCATATTTTATATAAGGTTAGATAATATGTATATTATTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTGAGAAGCATATTTTATATAAGGTTAGATAATATGTATATTATTA  250

seq1  TACTCATACTATATATTAGTATATATAATATGCTAATATATACTACTATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCATACTATATATTAGTATATATAATATGCTAATATATACTACTATA  300

seq1  TTATATATAGTAGTATATATTAGATATTTGATATCTTATTCTCAAAATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATATAGTAGTATATATTAGATATTTGATATCTTATTCTCAAAATAT  350

seq1  TCTTGGTCAATAAAGTTTGTGTGCATACTTGTAAATATGGATAAAATATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGTCAATAAAGTTTGTGTGCATACTTGTAAATATGGATAAAATATG  400

seq1  CCAGGCTATTACTGAACTTATAAGAAAACAATGTTACTTCATTTCAAAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTATTACTGAACTTATAAGAAAACAATGTTACTTCATTTCAAAGC  450

seq1  TCTAATCTGTATCTGTAGATAATGATCCTATGAAAATCCATATCCTCTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATCTGTATCTGTAGATAATGATCCTATGAAAATCCATATCCTCTAA  500

seq1  ACTGAGAAGACCTTAGCAGGTATAAGCACTTAAGATATGAGTGTGAAAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGAAGACCTTAGCAGGTATAAGCACTTAAGATATGAGTGTGAAAAC  550

seq1  ACAAGTGTGACATTTAAAATATGCAAAGATAGAAAGGGAGATTCATAATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTGTGACATTTAAAATATGCAAAGATAGAAAGGGAGATTCATAATA  600

seq1  TTTTCTGTGTGAAATGTAATGACTTCTACTTGTATGAACATCATGAGATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTGTGTGAAATGTAATGACTTCTACTTGTATGAACATCATGAGATA  650

seq1  ATGAAAGTATTTTTAAAGCAATTATTGATTATATAATCTTATTTTAAGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAGTATTTTTAAAGCAATTATTGATTATATAATCTTATTTTAAGAT  700

seq1  AAAGCTACTATGCAGTATACATCATGTGGTGGAATGTAGAGCAAAATACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTACTATGCAGTATACATCATGTGGTGGAATGTAGAGCAAAATACA  750

seq1  ATACAAAATTTATAAAATTAATGTCTCCTTGAATCTTATAAGTTTTGAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAAATTTATAAAATTAATGTCTCCTTGAATCTTATAAGTTTTGAGA  800

seq1  ATTGCACGATCTATTTTTTGTAGTTATAATAAATATTTCAGGCAGAATGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  ATTGCACGATCTATTTTTTGTAGTTATAATAAATATTTCAGGCAGAATTG  850

seq1  TTTTTAAGTTCCATTGTGATTAGTTACCACGTTTTGATTATCTCCTTGTG  900
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAGTTCCATTGTGA-TAGTTACCACGTTTTGATTATCTCCTTGTG  899

seq1  TCTTGAGTCTCAATTTTTTTGAATTTACATAGCCCTTATGACTAAGGAGG  950
      |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGAGTCTCAATTTTTT--GATTTACATAGCCCTTATGACTAAGGAGG  947

seq1  TTCAAAAAATGTTTAAGTATTCATTGGCCATTTACTTTCTTTCTTTTGAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
seq2  TTCAAAAAATGTTTAAGTATTCATT-GCCATTTACTTTCTTTC-TTTGAG  995

seq1  TACTGTCTTTTTAAACTATAGCTCATTGACTGACTGGAATATTTGGTCTT  1050
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
seq2  TACTGTCTTTTTAAACTATAGCTCA-TGACTGACTGGAATATTGGGTC-T  1043

seq1  TTGTTGTTTGAATTGTGTAATTCACTTTACATTCCTG-ATATTGCTCCAC  1099
      ||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| |||||||||| |
seq2  TTGTTGTTTGAATTG-GTAATT-ACTTTA-AATCCTGAATATTGCTCCCC  1090

seq1  AACTGTCTGTTGTAAAGCTGACTTACATATTT  1131
      ||||||||| |||||||||||||  |||||||
seq2  AACTGTCTG-TGTAAAGCTGACTACCATATTT  1121

seq1: chr1_148651506_148652637
seq2: B6Ng01-025F17.g_69_1174 (reverse)

seq1  CTTCTACATATGCAACTAGAGACACAGCTTGGGGTCGGGGTAAGGTACTG  50
      |||||||| |||| |||||||||||||||   ||||  ||||  ||||| 
seq2  CTTCTACA-ATGC-ACTAGAGACACAGCT---GGTC--GGTA--GTACT-  40

seq1  GTTAGTTCATATTTTTGTTCCTCCTATAGGGCTGTAGACCCCTTTAGCTC  100
      ||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||| ||||| |||||
seq2  GTTAGTTCAAATTTT--GTCCT-CTATAGGGCTGTAGA-CCCTTAAGCTC  86

seq1  CTTGGGTACTTTCTCTAGCTCCTTCATTAGGGACCCTGTGTTCCATCCAA  150
        ||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||    |||||||
seq2  --TGGGTAC-TTCTCTAGCT-CATCATTAGGGACCTGGT----CATCCAA  128

seq1  TAGATGACTGTGAGCATCCACTTCTGTATTCAGAGCAGTTCTTAAGTCAC  200
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||
seq2  TAGATGACTGTGAGCATCCACTTCTGTA-TCAGAGCAGT--CTAAGTCAC  175

seq1  ATTGATTTTACTGCTGTGAACAGACAACATGACCATGGCAACTCTTATGA  250
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-TGATTTTACTGCTGTGAACAGACAACATGACCATGGCAACTCTTATGA  224

seq1  GAATAACGTTTAACTGGGGCTTCAGTCCATTATCACCAAGGTTGAAGCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAACGTTTAACTGGGGCTTCAGTCCATTATCACCAAGGTTGAAGCAT  274

seq1  GACAGAGTGCAAGCAAGCATGGTGCAGGAGGAGTTGAGAGTTCTACATCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAGTGCAAGCAAGCATGGTGCAGGAGGAGTTGAGAGTTCTACATCT  324

seq1  TCATCTAGAGGCTGCTAGGAAAGGACTGCCTCCCAGGCAGTTAGGATGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTAGAGGCTGCTAGGAAAGGACTGCCTCCCAGGCAGTTAGGATGAG  374

seq1  GGTAATGAAGATCATGCCCACAGTGACACACTTAGTCCAATAAGGCCACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAATGAAGATCATGCCCACAGTGACACACTTAGTCCAATAAGGCCACA  424

seq1  ACTCCAAATAGTGCCACTCCCTGGGCCAAGCATATACAAACTATCACATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAAATAGTGCCACTCCCTGGGCCAAGCATATACAAACTATCACATA  474

seq1  CATCATTGGGAACCTGATGACACCTGAAATACTTGTATAAGGCTTCTTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATTGGGAACCTGATGACACCTGAAATACTTGTATAAGGCTTCTTAG  524

seq1  TTGAAGCCTCAGCAATCTGAAGGACTTAGACACCTTGATTTTCATATCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGCCTCAGCAATCTGAAGGACTTAGACACCTTGATTTTCATATCCA  574

seq1  TTTCAAAAATGCAGTACAAATCTGTAGAAGGTACATTGTTTTGTATTTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAAAATGCAGTACAAATCTGTAGAAGGTACATTGTTTTGTATTTCA  624

seq1  CAATATAGTTAATACAGCAGAAAACATGGCCAGTATATATTTGCCTTAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATAGTTAATACAGCAGAAAACATGGCCAGTATATATTTGCCTTAAA  674

seq1  TCATACAATAAAATGGTTTGTCAGAGTATAAAATAATATTGATATCTTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATACAATAAAATGGTTTGTCAGAGTATAAAATAATATTGATATCTTGA  724

seq1  GACAATTTTTGGTTAATAAAATATCATTATTTCCTAAAAGAATTTATATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATTTTTGGTTAATAAAATATCATTATTTCCTAAAAGAATTTATATG  774

seq1  AGAATTGTCTAAGAATCTTGTTTTGCATTCAATACTAAACAGACACTGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTGTCTAAGAATCTTGTTTTGCATTCAATACTAAACAGACACTGAA  824

seq1  TTTGATATAGTAATTTTCTATAAAAAATACTCAAATAGAATTTCAATGGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATATAGTAATTTTCTATAAAAAATACTCAAATAGAATTTCAATGGC  874

seq1  ATCCTCAATTGTTTAAAAAAAAACATACTGGAAACTTGAGATGGGAATTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTCAATTGTTTAAAAAAAAACATACTGGAAACTTGAGATGGGAATTT  924

seq1  TAGGCAGGGTAGCTCTAAATCCTTACATTCTGTTTTCATACTTTCATTGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCAGGGTAGCTCTAAATCCTTACATTCTGTTTTCATACTTTCATTGT  974

seq1  GCAACCATATGTATGCTAGTAACTGGGAGATTTTATTTAAGGTTTCTCTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACCATATGTATGCTAGTAACTGGGAGATTTTATTTAAGGTTTCTCTC  1024

seq1  CAAGGGCCATGAGATGGAGACTGGGGTACCTCCTTTTCTGTTGATCTTTC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGCCATGAGATGGAGACTGGGGTACCTCCTTTTCTGTTGATCTTTC  1074

seq1  CACACTGTTGCAACATGTAGCAGTTTGAATTC  1132
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTGTTGCAACATGTAGCAGTTTGAATTC  1106