BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-029K14
Chromosome1 (Build37)
Map Location 183,045,118 - 183,046,230
singlet/doubletsinglet
Overlap geneNvl
Upstream geneCdc42bpa, Cabc1, Psen2, EG277333, Itpkb, 6330403A02Rik, Gm821, Parp1, Lin9, Mixl1, LOC666431, Acbd3, H3f3a, BC031781, Lefty2, Pycr2, Lefty1, Tmem63a, Ephx1, 9130409I23Rik, EG625597, Fgfr3-ps
Downstream geneCnih4, Wdr26, LOC100042363, LOC666519, Cnih3, Ccdc121, A230079K17Rik, Lbr, EG433384, Enah
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-029K14.b
ACCDH859802
length1,104
definitionDH859802|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-029K14, 5' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcttctaagtgccagctatagcaatgagaaatcgggctctgcattt
aaacatcttagagtgagactataaggacaaataaaagagagctctataaa
tatcagaatttctcagataatattttcacaaggcatggtattgctttgat
tttaaaatgtattttatgtgtactcgtgtttgcctgagttatgtctgtgc
agtacatgcatgcctgctgtctgaggaggccagaattagatctgttggaa
ttggagttacacacagctgtaagttgccatgtggatgctgggagttgaac
ttggctcctctggaatcacaggcagtgcttaccatctctttagttctgtt
atgatggttttaatggcagctgtttgctacgttatttttttttaagattt
atttatttcatgtatgtgtgtacactgttgccgtcttcagacacaccaga
gagggcatcagatcccagtacagatggttgtgagccaccatgtggttgct
gagaattgaactcagaacctctagaagagcagtcagtgctcttaacctct
gagccatctctccagccccctgctacataatcttatcaatcttgataatt
tgcccaagtccaatacaggttcttttatcttaatctttgtttatagtatt
aactttcctagcagaaagcatgcagtaaatatatcagtatccatctatat
atgtagatgttggtttcagaatgattaaagagataaaacgggctggagag
atggctcactggtatgagctctggctgctagtacttctagaggatctggg
tacaaattccagcacccacgtgacaactctcaactgctatcacttcagtc
cttgaggatccaacacctattctcgcctctgtaggcattagacacatata
tgggacacacatatatgcaggcagaacacctatccacgtgatttatttaa
agacgttttgccaggtggtgatagtacatgcctctaatcctcaggagcag
agcagtagatatctgtaagtccaaagcagcctggtctacagattgagtac
agcatagcagggttaatagagaaactctgttttggaatggggttgtgtgt
gtgt
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_183045118_183046230
seq2: B6Ng01-029K14.b_47_1150 (reverse)

seq1  ACACACACACACACCCCATCCCCAAGACAGAGTTTCTCTATGTAACCCTG  50
      ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| 
seq2  ACACACACACA-ACCCCAT-TCCAAAACAGAGTTTCTCTAT-TAACCCT-  46

seq1  GCTATGCTGTAACTCAATCTGTAGACCAGGCTGGCTTTGGACTTACAGAT  100
      |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GCTATGCTGT-ACTCAATCTGTAGACCAGGCT-GCTTTGGACTTACAGAT  94

seq1  ATCTACCTGCCTCTGCCTCCTGAGGATTAGAGGCATGTACTATCACCACC  150
      ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTA-CTG-CTCTG-CTCCTGAGGATTAGAGGCATGTACTATCACCACC  141

seq1  TGGCAAAACGTCTTTAATTAATTCACGTGGATAGGTGTTCTGCCTGCATA  200
      ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAAAACGTCTTTAAATAAATCACGTGGATAGGTGTTCTGCCTGCATA  191

seq1  TATGTGTGTCCCATATATGTGTCTAATGCCTACAGAGGCGAGAATAGGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGTGTCCCATATATGTGTCTAATGCCTACAGAGGCGAGAATAGGTG  241

seq1  TTGGATCCTCAAGGACTGAAGTGATAGCAGTTGAGAGTTGTCACGTGGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATCCTCAAGGACTGAAGTGATAGCAGTTGAGAGTTGTCACGTGGGT  291

seq1  GCTGGAATTTGTACCCAGATCCTCTAGAAGTACTAGCAGCCAGAGCTCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAATTTGTACCCAGATCCTCTAGAAGTACTAGCAGCCAGAGCTCAT  341

seq1  ACCAGTGAGCCATCTCTCCAGCCCGTTTTATCTCTTTAATCATTCTGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTGAGCCATCTCTCCAGCCCGTTTTATCTCTTTAATCATTCTGAAA  391

seq1  CCAACATCTACATATATAGATGGATACTGATATATTTACTGCATGCTTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACATCTACATATATAGATGGATACTGATATATTTACTGCATGCTTTC  441

seq1  TGCTAGGAAAGTTAATACTATAAACAAAGATTAAGATAAAAGAACCTGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAGGAAAGTTAATACTATAAACAAAGATTAAGATAAAAGAACCTGTA  491

seq1  TTGGACTTGGGCAAATTATCAAGATTGATAAGATTATGTAGCAGGGGGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGACTTGGGCAAATTATCAAGATTGATAAGATTATGTAGCAGGGGGCT  541

seq1  GGAGAGATGGCTCAGAGGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCTAGAGGTTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGATGGCTCAGAGGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCTAGAGGTTCT  591

seq1  GAGTTCAATTCTCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTACTGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCAATTCTCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTACTGGG  641

seq1  ATCTGATGCCCTCTCTGGTGTGTCTGAAGACGGCAACAGTGTACACACAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGATGCCCTCTCTGGTGTGTCTGAAGACGGCAACAGTGTACACACAT  691

seq1  ACATGAAATAAATAAATCTTAAAAAAAAATAACGTAGCAAACAGCTGCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAAATAAATAAATCTTAAAAAAAAATAACGTAGCAAACAGCTGCCA  741

seq1  TTAAAACCATCATAACAGAACTAAAGAGATGGTAAGCACTGCCTGTGATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAACCATCATAACAGAACTAAAGAGATGGTAAGCACTGCCTGTGATT  791

seq1  CCAGAGGAGCCAAGTTCAACTCCCAGCATCCACATGGCAACTTACAGCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGGAGCCAAGTTCAACTCCCAGCATCCACATGGCAACTTACAGCTG  841

seq1  TGTGTAACTCCAATTCCAACAGATCTAATTCTGGCCTCCTCAGACAGCAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAACTCCAATTCCAACAGATCTAATTCTGGCCTCCTCAGACAGCAG  891

seq1  GCATGCATGTACTGCACAGACATAACTCAGGCAAACACGAGTACACATAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGCATGTACTGCACAGACATAACTCAGGCAAACACGAGTACACATAA  941

seq1  AATACATTTTAAAATCAAAGCAATACCATGCCTTGTGAAAATATTATCTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACATTTTAAAATCAAAGCAATACCATGCCTTGTGAAAATATTATCTG  991

seq1  AGAAATTCTGATATTTATAGAGCTCTCTTTTATTTGTCCTTATAGTCTCA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATTCTGATATTTATAGAGCTCTCTTTTATTTGTCCTTATAGTCTCA  1041

seq1  CTCTAAGATGTTTAAATGCAGAGCCCGATTTCTCATTGCTATAGCTGGCA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAAGATGTTTAAATGCAGAGCCCGATTTCTCATTGCTATAGCTGGCA  1091

seq1  CTTAGAAGAATTC  1113
      |||||||||||||
seq2  CTTAGAAGAATTC  1104