BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-031H11
Chromosome1 (Build37)
Map Location 132,547,253 - 132,620,693
singlet/doubletdoublet
Overlap geneC4bp, C4bp-ps1, Pfkfb2, Yod1
Upstream geneThsd7b, LOC100042745, LOC100042740, Daf2, Cd55, Zp3r
Downstream geneAA986860, Fcamr, Pigr, Faim3, Il24, Il20, Il19, Il10, Mapkapk2, Dyrk3, Lgtn, Rassf5, Ikbke, Srgap2, LOC100042826, LOC100042821, 2700049P18Rik, Avpr1b, LOC667238, Ctse, 5430435G22Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-031H11.bB6Ng01-031H11.g
ACCDH861074DH861075
length1,1421,089
definitionDH861074|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-031H11, 5' end.DH861075|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-031H11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(132,547,253 - 132,548,410)(132,619,601 - 132,620,693)
sequence
gaattctacattagcttctgaaggcagctagaagactaggctctgtgtag
ctaggatgagggtcttaacacccacacccacagtaacatatctactccaa
caaggccacaactacttcaacaagaccacatctccaaagattgccattct
ctgggctaagcatattcaaaccatgacactaacttaaaattttaattcaa
tttttactaagattatcatacattgtaaagaagtatttcataatacattt
aaagcaaaagttacaagcaatctacatatttaaattagtgtacatgtgaa
aattgtacattacttggtagcaaaaattggaccaaatgcttctataaaaa
caaataaagggactgatgtgatggctcagcaattaagagcatttccagag
gactggagtatggttcccagcacccactgcaagctcacagtcacttgtaa
ctctagttccaaaggtttcaacatcttctatttttttcagcaacagtcac
acacatccccccccacacacacacacatacagagagagagagagcgagag
agagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagag
agaagcacagataaaaattaaacatcttttaaaaagaaatcattaagggc
tagccacatggcatttgctgccaattctgacaacctgagtttgatcccag
ggacccacactgtggaaaaagcaaactgactcctgcaaaatgtgttcagt
tccacgtctgtatcatggcatgtatgcaccaatgtacatgcatacatata
cagattgcatacatacatgcatacatacatacatacacatattacataca
tatgtacacatacataaagttgactttttcaagagagtaagcactagttc
tagaggtctttacatatagtcccagcaaccttggagaattgactggaggc
ttttgagtctgagagcaacttgagccactaatgagatctgtctcaacaat
caagaaaacaacttcaagtaacccttggtttcacacataagaataatact
tcaagcagccaacaaaagctaagttatatataaaagaagaattgaggtag
cctcaatttctctatgacattcaccagcaagagaaaaaaaaa
gaattctttctgtttggcccccttttatacttttgaaattatgctctgag
ctctgtatttcaggctttattgatgattttcttatttaaggagctctgct
tccactgtgctagtacagccacaataagactatttttcattctgaacctt
tgacaaggcattcttaaagaaaacaaataatttggtacaaatgcatttcc
tgtggcaccttgaatggcacaaatgtgaacaggcaacccttgtcctttaa
gtaactgatgggttacactcaactaaacattctatatgcattctggagcc
aagccacatcagctcggtagaaatcctcagcctccttacctataactaaa
ccacgtcattcattcactatacttaaattactaattacaggttcatgtgt
ttcaaagcttgtgttcacggccgtatacatcttttcagtagtacccatcc
ttttcacttgaaaatgccatgggaaggctaacaccctgccttaaatcaaa
tgaatgtagacacaaacacttcataattcagtaaacataatactttgttt
tccaaataaaatagtcaaagcactgtaaacaaaatgttagctaatttttg
aagaaaaacaaaaaacaacaaaaacccaaacctttcccacaaccaaggca
gccttgtattcattgagttggatgtgctgcacattacaataggcactaag
aaaccatccggggtggaatgctgatcgctaagcacttacccttgcagcaa
aaagccctggttcgatgcttagcatgagtaacaaactagcttattcaaat
aaagtgttcctttagatttgcaaatactgcttgcatatcttactcaaaat
caatttcttccaaaataagtttgcttaaatgaatgaaaggtttgatgaat
cgactctttagaggatcacattacagacatcacattacagaagtattatt
ccttacgttaggacatagaccctggtcctacagggagggaaattagactg
tatcataagatacataaatactgatggcaatagcgtatggaagctgctgg
cttgcagctggctgggggttttatcattactgccctcga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_132547253_132548410
seq2: B6Ng01-031H11.b_44_1185

seq1  GAATTCTACATTAGCTTCTGAAGGCAGCTAGAAGACTAGGCTCTGTGTAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACATTAGCTTCTGAAGGCAGCTAGAAGACTAGGCTCTGTGTAG  50

seq1  CTAGGATGAGGGTCTTAACACCCACACCCACAGTAACATATCTACTCCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGATGAGGGTCTTAACACCCACACCCACAGTAACATATCTACTCCAA  100

seq1  CAAGGCCACAACTACTTCAACAAGACCACATCTCCAAAGATTGCCATTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGCCACAACTACTTCAACAAGACCACATCTCCAAAGATTGCCATTCT  150

seq1  CTGGGCTAAGCATATTCAAACCATGACACTAACTTAAAATTTTAATTCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCTAAGCATATTCAAACCATGACACTAACTTAAAATTTTAATTCAA  200

seq1  TTTTTACTAAGATTATCATACATTGTAAAGAAGTATTTCATAATACATTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTACTAAGATTATCATACATTGTAAAGAAGTATTTCATAATACATTT  250

seq1  AAAGCAAAAGTTACAAGCAATCTACATATTTAAATTAGTGTACATGTGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAAAAGTTACAAGCAATCTACATATTTAAATTAGTGTACATGTGAA  300

seq1  AATTGTACATTACTTGGTAGCAAAAATTGGACCAAATGCTTCTATAAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTACATTACTTGGTAGCAAAAATTGGACCAAATGCTTCTATAAAAA  350

seq1  CAAATAAAGGGACTGATGTGATGGCTCAGCAATTAAGAGCATTTCCAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAAAGGGACTGATGTGATGGCTCAGCAATTAAGAGCATTTCCAGAG  400

seq1  GACTGGAGTATGGTTCCCAGCACCCACTGCAAGCTCACAGTCACTTGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGGAGTATGGTTCCCAGCACCCACTGCAAGCTCACAGTCACTTGTAA  450

seq1  CTCTAGTTCCAAAGGTTTCAACATCTTCTATTTTTTTCAGCAACAGTCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGTTCCAAAGGTTTCAACATCTTCTATTTTTTTCAGCAACAGTCAC  500

seq1  ACACATCCCCCCCCACACACACACACATACAGAGAGAGAGAGAGCGAGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATCCCCCCCCACACACACACACATACAGAGAGAGAGAGAGCGAGAG  550

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  600

seq1  AGAAGCACAGATAAAAATTAAACATCTTTTAAAAAGAAATCATTAAGGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCACAGATAAAAATTAAACATCTTTTAAAAAGAAATCATTAAGGGC  650

seq1  TAGCCACATGGCATTTGCTGCCAATTCTGACAACCTGAGTTTGATCCCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCACATGGCATTTGCTGCCAATTCTGACAACCTGAGTTTGATCCCAG  700

seq1  GGACCCACACTGTGGAAAAAGCAAACTGACTCCTGCAAAATGTGTTCAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCCACACTGTGGAAAAAGCAAACTGACTCCTGCAAAATGTGTTCAGT  750

seq1  TCCACGTCTGTATCATGGCATGTATGCACCAATGTACATGCATACATATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACGTCTGTATCATGGCATGTATGCACCAATGTACATGCATACATATA  800

seq1  CAGATTGCATACATACATGCATACATACATACATACACATATTACATACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTGCATACATACATGCATACATACATACATACACATATTACATACA  850

seq1  TATGTACACATACATAAAGTTGACTTTTTCAAGAGAGTAAGCACTAGTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTACACATACATAAAGTTGACTTTTTCAAGAGAGTAAGCACTAGTTC  900

seq1  TAGAGGTCTTTACATATAGTCCCAGCAACCTTGGAGAATTGACTGGAGGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGTCTTTACATATAGTCCCAGCAACCTTGGAGAATTGACTGGAGGC  950

seq1  TTTTGAGTCTGAGAGCAACTTGAGCCACTTAATGAGATCTTGTCTCAAAC  1000
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  
seq2  TTTTGAGTCTGAGAGCAACTTGAGCCAC-TAATGAGATC-TGTCTCAA--  996

seq1  AAATCAAGAAAACAACTTCAAGTAACCCTTGGGTTTCACACATAAAGAAT  1050
       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
seq2  CAATCAAGAAAACAACTTCAAGTAACCCTT-GGTTTCACACAT-AAGAAT  1044

seq1  ATTACCTTCAGGCAGCCAAACAAGAGCTAAGTTATATATAAAAGAAGGAA  1100
      | || ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |
seq2  AATA-CTTCAAGCAGCC-AACAAAAGCTAAGTTATATATAAAAGAAG--A  1090

seq1  ATTGAGGTTAGCTTCAACATTCTCTATAGCACCATCCACCAGCAAAGAGA  1150
      ||||||| |||| ||||  ||||||||     ||| ||||||| ||||||
seq2  ATTGAGG-TAGCCTCAA-TTTCTCTAT---GACATTCACCAGC-AAGAGA  1134

seq1  AAAAAAAA  1158
      ||||||||
seq2  AAAAAAAA  1142

seq1: chr1_132619601_132620693
seq2: B6Ng01-031H11.g_67_1155 (reverse)

seq1  TCGAGGGCAGTAATGATACAACCCCAAGCCAGCTGCTAGCCAGCAGCTCT  50
      |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  
seq2  TCGAGGGCAGTAATGATAAAACCCCCAGCCAGCTGCAAGCCAGCAGCTTC  50

seq1  CATACGCTATTGCCATCAGTATTTATGTATCTTATGATACAGTCTAATTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACGCTATTGCCATCAGTATTTATGTATCTTATGATACAGTCTAATTT  100

seq1  CACTCACTGTTAGGACCAGGGTCTATGTCCTAACGTAAGGAATAATACTT  150
      | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCCTG-TAGGACCAGGGTCTATGTCCTAACGTAAGGAATAATACTT  149

seq1  CTGTAATGTGATTGTTCTGTAATGTGAT-CTCTAAAGAGTCGATTCATCA  199
      ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAATGTGAT--GTCTGTAATGTGATCCTCTAAAGAGTCGATTCATCA  197

seq1  AACCTTTCATTCATTTTAAGCAAACTTATTTTGGAAGAAATTGATTTTTG  249
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AACCTTTCATTCA-TTTAAGCAAACTTATTTTGGAAGAAATTGA-TTTTG  245

seq1  AGTAAGATATGCAAGCAGTATTTGCAAATCTAAAGGAACACTTTATTTGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAGATATGCAAGCAGTATTTGCAAATCTAAAGGAACACTTTATTTGA  295

seq1  ATAAGCTAGTTTGTTACTCATGCTAAGCATCGAACCAGGGCTTTTTGCTG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCTAGTTTGTTACTCATGCTAAGCATCGAACCAGGGCTTTTTGCTG  345

seq1  CAAGGGTAAGTGCTTAGCGATCAGCATTCCACCCCGGATGGTTTCTTAGT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGTAAGTGCTTAGCGATCAGCATTCCACCCCGGATGGTTTCTTAGT  395

seq1  GCCTATTGTAATGTGCAGCACATCCAACTCAATGAATACAAGGCTGCCTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTATTGTAATGTGCAGCACATCCAACTCAATGAATACAAGGCTGCCTT  445

seq1  GGTTGTGGGAAAGGTTTGGGTTTTTGTTGTTTTTTGTTTTTCTTCAAAAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTGGGAAAGGTTTGGGTTTTTGTTGTTTTTTGTTTTTCTTCAAAAA  495

seq1  TTAGCTAACATTTTGTTTACAGTGCTTTGACTATTTTATTTGGAAAACAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTAACATTTTGTTTACAGTGCTTTGACTATTTTATTTGGAAAACAA  545

seq1  AGTATTATGTTTACTGAATTATGAAGTGTTTGTGTCTACATTCATTTGAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTATGTTTACTGAATTATGAAGTGTTTGTGTCTACATTCATTTGAT  595

seq1  TTAAGGCAGGGTGTTAGCCTTCCCATGGCATTTTCAAGTGAAAAGGATGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGCAGGGTGTTAGCCTTCCCATGGCATTTTCAAGTGAAAAGGATGG  645

seq1  GTACTACTGAAAAGATGTATACGGCCGTGAACACAAGCTTTGAAACACAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTACTGAAAAGATGTATACGGCCGTGAACACAAGCTTTGAAACACAT  695

seq1  GAACCTGTAATTAGTAATTTAAGTATAGTGAATGAATGACGTGGTTTAGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTGTAATTAGTAATTTAAGTATAGTGAATGAATGACGTGGTTTAGT  745

seq1  TATAGGTAAGGAGGCTGAGGATTTCTACCGAGCTGATGTGGCTTGGCTCC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGGTAAGGAGGCTGAGGATTTCTACCGAGCTGATGTGGCTTGGCTCC  795

seq1  AGAATGCATATAGAATGTTTAGTTGAGTGTAACCCATCAGTTACTTAAAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGCATATAGAATGTTTAGTTGAGTGTAACCCATCAGTTACTTAAAG  845

seq1  GACAAGGGTTGCCTGTTCACATTTGTGCCATTCAAGGTGCCACAGGAAAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGGGTTGCCTGTTCACATTTGTGCCATTCAAGGTGCCACAGGAAAT  895

seq1  GCATTTGTACCAAATTATTTGTTTTCTTTAAGAATGCCTTGTCAAAGGTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTGTACCAAATTATTTGTTTTCTTTAAGAATGCCTTGTCAAAGGTT  945

seq1  CAGAATGAAAAATAGTCTTATTGTGGCTGTACTAGCACAGTGGAAGCAGA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATGAAAAATAGTCTTATTGTGGCTGTACTAGCACAGTGGAAGCAGA  995

seq1  GCTCCTTAAATAAGAAAATCATCAATAAAGCCTGAAATACAGAGCTCAGA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTTAAATAAGAAAATCATCAATAAAGCCTGAAATACAGAGCTCAGA  1045

seq1  GCATAATTTCAAAAGTATAAAAGGGGGCCAAACAGAAAGAATTC  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAATTTCAAAAGTATAAAAGGGGGCCAAACAGAAAGAATTC  1089