BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-031L20
Chromosome1 (Build37)
Map Location 125,458,861 - 125,565,155
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDpp10
Upstream geneLOC666983
Downstream geneLOC666998
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-031L20.bB6Ng01-031L20.g
ACCDH861269DH861270
length920954
definitionDH861269|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-031L20, 5' end.DH861270|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-031L20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,564,232 - 125,565,155)(125,458,861 - 125,459,819)
sequence
gaattcactatatatccctcatgttcatgccaaatatcctacctcagcct
cccaagtgttgggaaaatacataatataacatgtctctacatttaattat
ttgtatgtgtgcatgtgtccaatgtgttaatgtgtgtggtgtttgtgtgt
tatatgtacatgcttgcatgcacatgacacatattagtcagaagatgaca
tctgggtcttagttcttccattctgaaagtcctacatatcaaagcaaagt
agttagcattaacacccttttctgttgaaacattacagtggcccactagc
aataggttaagttagattaaggtaaatcaacttaaatacctacttcagta
gtacacaaaatgtatcctgccattctcccaatagatccattaacactgta
tggtggcttccatctggattatatatgtatagagatggctttttgtgtaa
ttagtcagctgttattcttacagggatcccatagatatggcattagtttc
tctttctattctcatgatttctttttgttaaattctttctatttgactct
catgaatctattttaggatttctttgattttgctcaattctcaatttatt
gaacctcttgaataagataaatatattctttaaagatgaaatatttttca
caagttttgaaatttctgctccttttctttgtcatttctatctttagatt
ttcagtctattttctattctataatatactttaataaaatagaagtttag
tttttcatctctataactcaatattgatgttttctgtatagtcagtacat
ccatatttccactcttaaataaaatcacttagatgttgtcaacttgagtg
ctgggtatcatctccatcatcaccatcatttagctttagcagtagtagta
gtagtagtagtagagtagta
gaattccccatagtaatggaccataacctgagactgtgattcaaataaat
acttttacccataagttacttccatcagggtatttaatgacaacaaaaga
aaacaaatctaagcataagggctttacctactgatccatcatttcagcac
aagattctgattttttatttccccaaaccctgaaggcttccacaccacta
atggctaggaaaaaaaaacaaaaaaacaaaaaacaaacaaacaaacaaaa
aaaaaacaacaacaacaacaaaaaaaaaccctatcctgattgtcaggaaa
ctaactagttgtgacttggactcatattcacagacaatcatctgcttgag
aaggaagtgtgtcaatgaagaaaaccatgaacagatatagcaagtggagc
tgtaccccatgtctggtaagatgatagagagcacctgtgtgtgaatatga
tcagggtgctggatcaatgaagacttggacaaaggcaggtaggatctatc
agagctatttagcatgcacatctagctgatgctatttagcctaactgatg
catatactctcagaggaccagagagatatagggaaatcctggattgtaag
gaattgtccacaccacatctcaactggttcagaaggcatataaccacaga
gacctaaatattagtatcaatgtttgagaaggatttttaagataactatt
ttaacaggcctctgtgccaggtcaaaccccaaaggaagccaccatagtaa
aaggcttacattaagtcaaatgaaaataaacaaacaaaactgaaagatcc
tcatccccaaatatgtataaattacaatgtggaaataatgctattttttt
aaatcaaggtaatctaactcctctacctacttataacttcccatgaccaa
agcaaatatatatagtagtaaataccagaaaaataacttagaaaaagaat
ggaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_125564232_125565155
seq2: B6Ng01-031L20.b_46_965 (reverse)

seq1  TACTACTACTCCTACTACTACTACTACTACTACTGCTAAAGCTAAATGAT  50
         ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ---TACTACT-CTACTACTACTACTACTACTACTGCTAAAGCTAAATGAT  46

seq1  GGTGATGATGGAGATGATACCCAGCACTCAAGTTGACAACATCTAAGTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATGATGGAGATGATACCCAGCACTCAAGTTGACAACATCTAAGTGA  96

seq1  TTTTATTTAAGAGTGGAAATATGGATGTACTGACTATACAGAAAACATCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTTAAGAGTGGAAATATGGATGTACTGACTATACAGAAAACATCA  146

seq1  ATATTGAGTTATAGAGATGAAAAACTAAACTTCTATTTTATTAAAGTATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGAGTTATAGAGATGAAAAACTAAACTTCTATTTTATTAAAGTATA  196

seq1  TTATAGAATAGAAAATAGACTGAAAATCTAAAGATAGAAATGACAAAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGAATAGAAAATAGACTGAAAATCTAAAGATAGAAATGACAAAGAA  246

seq1  AAGGAGCAGAAATTTCAAAACTTGTGAAAAATATTTCATCTTTAAAGAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGCAGAAATTTCAAAACTTGTGAAAAATATTTCATCTTTAAAGAAT  296

seq1  ATATTTATCTTATTCAAGAGGTTCAATAAATTGAGAATTGAGCAAAATCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTATCTTATTCAAGAGGTTCAATAAATTGAGAATTGAGCAAAATCA  346

seq1  AAGAAATCCTAAAATAGATTCATGAGAGTCAAATAGAAAGAATTTAACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAATCCTAAAATAGATTCATGAGAGTCAAATAGAAAGAATTTAACAA  396

seq1  AAAGAAATCATGAGAATAGAAAGAGAAACTAATGCCATATCTATGGGATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAATCATGAGAATAGAAAGAGAAACTAATGCCATATCTATGGGATC  446

seq1  CCTGTAAGAATAACAGCTGACTAATTACACAAAAAGCCATCTCTATACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTAAGAATAACAGCTGACTAATTACACAAAAAGCCATCTCTATACAT  496

seq1  ATATAATCCAGATGGAAGCCACCATACAGTGTTAATGGATCTATTGGGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAATCCAGATGGAAGCCACCATACAGTGTTAATGGATCTATTGGGAG  546

seq1  AATGGCAGGATACATTTTGTGTACTACTGAAGTAGGTATTTAAGTTGATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGCAGGATACATTTTGTGTACTACTGAAGTAGGTATTTAAGTTGATT  596

seq1  TACCTTAATCTAACTTAACCTATTGCTAGTGGGCCACTGTAATGTTTCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTTAATCTAACTTAACCTATTGCTAGTGGGCCACTGTAATGTTTCAA  646

seq1  CAGAAAAGGGTGTTAATGCTAACTACTTTGCTTTGATATGTAGGACTTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAAGGGTGTTAATGCTAACTACTTTGCTTTGATATGTAGGACTTTC  696

seq1  AGAATGGAAGAACTAAGACCCAGATGTCATCTTCTGACTAATATGTGTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGGAAGAACTAAGACCCAGATGTCATCTTCTGACTAATATGTGTCA  746

seq1  TGTGCATGCAAGCATGTACATATAACACACAAACACCACACACATTAACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCATGCAAGCATGTACATATAACACACAAACACCACACACATTAACA  796

seq1  CATTGGACACATGCACACATACAAATAATTAAATGTAGAGACATGTTATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGACACATGCACACATACAAATAATTAAATGTAGAGACATGTTATA  846

seq1  TTATGTATTTTCCCAACACTTGGGAGGCTGAGGTAGGATATTTGGCATGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTATTTTCCCAACACTTGGGAGGCTGAGGTAGGATATTTGGCATGA  896

seq1  ACATGAGGGATATATAGTGAATTC  924
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAGGGATATATAGTGAATTC  920

seq1: chr1_125458861_125459819
seq2: B6Ng01-031L20.g_66_1019

seq1  GAATTCCCCATAGTAATGGACCATAACCTGAGACTGTGATTCAAATAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCCATAGTAATGGACCATAACCTGAGACTGTGATTCAAATAAAT  50

seq1  ACTTTTACCCATAAGTTACTTCCATCAGGGTATTTAATGACAACAAAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTACCCATAAGTTACTTCCATCAGGGTATTTAATGACAACAAAAGA  100

seq1  AAACAAATCTAAGCATAAGGGCTTTACCTACTGATCCATCATTTCAGCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAATCTAAGCATAAGGGCTTTACCTACTGATCCATCATTTCAGCAC  150

seq1  AAGATTCTGATTTTTTATTTCCCCAAACCCTGAAGGCTTCCACACCACTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTCTGATTTTTTATTTCCCCAAACCCTGAAGGCTTCCACACCACTA  200

seq1  ATGGCTAGGAAAAAAAAACAAAAAAACAAAAAACAAACAAACAAACAAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTAGGAAAAAAAAACAAAAAAACAAAAAACAAACAAACAAACAAAA  250

seq1  AAAAAACAACAACAACAACAAAAAAAAACCCTATCCTGATTGTCAGGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACAACAACAACAACAAAAAAAAACCCTATCCTGATTGTCAGGAAA  300

seq1  CTAACTAGTTGTGACTTGGACTCATATTCACAGACAATCATCTGCTTGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTAGTTGTGACTTGGACTCATATTCACAGACAATCATCTGCTTGAG  350

seq1  AAGGAAGTGTGTCAATGAAGAAAACCATGAACAGATATAGCAAGTGGAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAGTGTGTCAATGAAGAAAACCATGAACAGATATAGCAAGTGGAGC  400

seq1  TGTACCCCATGTCTGGTAAGATGATAGAGAGCACCTGTGTGTGAATATGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACCCCATGTCTGGTAAGATGATAGAGAGCACCTGTGTGTGAATATGA  450

seq1  TCAGGGTGCTGGATCAATGAAGACTTGGACAAAGGCAGGTAGGATCTATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGTGCTGGATCAATGAAGACTTGGACAAAGGCAGGTAGGATCTATC  500

seq1  AGAGCTATTTAGCATGCACATCTAGCTGATGCTATTTAGCCTAACTGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTATTTAGCATGCACATCTAGCTGATGCTATTTAGCCTAACTGATG  550

seq1  CATATACTCTCAGAGGACCAGAGAGATATAGGGAAATCCTGGATTGTAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATACTCTCAGAGGACCAGAGAGATATAGGGAAATCCTGGATTGTAAG  600

seq1  GAATTGTCCACACCACATCTCAACTGGTTCAGAAGGCATATAACCACAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGTCCACACCACATCTCAACTGGTTCAGAAGGCATATAACCACAGA  650

seq1  GACCTAAATATTAGTATCAATGTTTGAGAAGGATTTTTAAGATAACTATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTAAATATTAGTATCAATGTTTGAGAAGGATTTTTAAGATAACTATT  700

seq1  TTAACAGGCCTCTGTGCCAGGTCAAACCCCAAAGGAAGCCACCATAGTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACAGGCCTCTGTGCCAGGTCAAACCCCAAAGGAAGCCACCATAGTAA  750

seq1  AAGGCTTACATTAAGTCAAATGAAAATAAACAAACAAAACTGAAAGATCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTTACATTAAGTCAAATGAAAATAAACAAACAAAACTGAAAGATCC  800

seq1  TCATCCCCAAATATGTATAAATTACAATGTGGAAATAATGCTATTTTTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TCATCCCCAAATATGTATAAATTACAATGTGGAAATAATGCTA-TTTTTT  849

seq1  TAAATCAAGGTAATCTAACTCCTCTACCTACTTATAACTTCCCAATGACC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TAAATCAAGGTAATCTAACTCCTCTACCTACTTATAACTTCCC-ATGACC  898

seq1  AAAGCAAATATATATAAGTAGTAAAATACCAGAAAAATAACTTAGAAAAA  950
      ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAAATATATAT-AGTAGT-AAATACCAGAAAAATAACTTAGAAAAA  946

seq1  GAAATGGAA  959
      | |||||||
seq2  G-AATGGAA  954