BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-034P21
Chromosome1 (Build37)
Map Location 95,394,046 - 95,514,767
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSept2, Farp2
Upstream geneOlfr1414, Olfr1413, Olfr1412, Olfr1411, Olfr1410, Olfr12, Myeov2, Otos, Gpc1, Ankmy1, Dusp28, LOC100040511, Rnpepl1, Capn10, Gpr35, Aqp12, Kif1a, Agxt, 2310007B03Rik, E030010N08Rik, Sned1, Mterfd2, LOC665966, Pask, Ppp1r7, Tmem16g, Hdlbp
Downstream geneStk25, Bok, Thap4, Atg4b, Dtymk, Ing5, D2hgdh, Gal3st2, LOC100041596, EG666009, EG619597, Neu4, Pdcd1, LOC666012, LOC666025
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-034P21.bB6Ng01-034P21.g
ACCDH863583DH863584
length924692
definitionDH863583|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-034P21, 5' end.DH863584|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-034P21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,394,046 - 95,394,977)(95,514,077 - 95,514,767)
sequence
gaattcacagagggtgcagagccctcaaagggtcaattactctgcatttg
ttttcatttacttaatgtatttacattgtagacaatgttagcaacactta
aagttgccggatctaatcatttcaagtttaaatattgcctctctcaaaac
aaggtctcactatttaattcaggctggccttgaactcagaattctcctgc
ttttccttcctattttgaatatgagccactgtgtccactctaatgagacc
tgagattgaaaagttaattgtctacaaactgctaacataaacaaagcact
gtaatacagactgcagccagaggacaggttgctctttctatgtctgtccc
ttccttagagacatattacttgtaaacgactgctctttgccatcattttc
acaagtaagggatttcagagggtagaatactccgttgccctcattgtgca
gaaaaatcttacttttgtacctactatttttttgtcctaaccctgccaag
aaaaagtatcaaatttgcagcactaaatgagaaaaggaaggcagggtaat
ggtgcttgtttacccttcttctacattaagaatgcctcccttctcaccat
cccatgaacttgctgtcctgatggcacctttcataatcctgccttggact
gcatgctttctggtactgccctgtttcttggcctcttgtgaagcagttgt
aagtctggaaaagtgttggcagccttccaggttcatagaccacctatcac
gaacttggtaatctgtgtacttaggttattgattcccattgattcattaa
aactacttaatatttgccatagtttaaaacaaaacacatgccttcatatg
cctagattgacagagagtcaatctctgtatgggttgttttagtatatatg
ggaaagggaagagaaatgggtttc
gaattcactggtctggaaaggagaaaacctccatttgctcttgggctgtg
acccccaagttggctttcaccatgatcctaatactacttgcctgagggct
ggagtgctggtgctattaagagaccaggtgagggggctggagagatggct
cagtggttaagagcactgactgctcttccagaggtcctgagttcaaatcc
cagcaaccacatggtggctcacaaccatctgtaaagggatctggtgtttc
tgaagacagctacagcgtactcatataaataaacaaacaaacaaataaga
ccagttgacatgaactaactgtacaggcatcttctcagaagcaccctggt
tgatttcttgaaaacacaaatgtcaacaatccttccctgtctacaagggg
aaagatactccttcctgactacaaaggggaaaatagtcctttgcctgcat
aacctggaaacagctgagtcccatgagggaggtagagtccagaggttggt
actgaagtcctcatccctgcagcaggccctgctgtgaatcatgaagaggc
ccttacctggctgctaccacaattgtttttctgagctgcatagatggtga
agcaatgaggaacagaccattcattctcactttcttctacctgtatgtga
gagaagaggtgacatcctatgggctaggagaatgttagttta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_95394046_95394977
seq2: B6Ng01-034P21.b_47_969

seq1  GAATTCACAGAGGGTGCAGAGCCCTCAAAGGGTCAATTACTCTGCATTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGAGGGTGCAGAGCCCTCAAAGGGTCAATTACTCTGCATTTG  50

seq1  TTTTCATTTACTTAATGTATTTACATTGTAGACAATGTTAGCAACACTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCATTTACTTAATGTATTTACATTGTAGACAATGTTAGCAACACTTA  100

seq1  AAGTTGCCGGATCTAATCATTTCAAGTTTAAATATTGCCTCTCTCAAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGCCGGATCTAATCATTTCAAGTTTAAATATTGCCTCTCTCAAAAC  150

seq1  AAGGTCTCACTATTTAATTCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAATTCTCCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCTCACTATTTAATTCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAATTCTCCTGC  200

seq1  TTTTCCTTCCTATTTTGAATATGAGCCACTGTGTCCACTCTAATGAGACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTTCCTATTTTGAATATGAGCCACTGTGTCCACTCTAATGAGACC  250

seq1  TGAGATTGAAAAGTTAATTGTCTACAAACTGCTAACATAAACAAAGCACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATTGAAAAGTTAATTGTCTACAAACTGCTAACATAAACAAAGCACT  300

seq1  GTAATACAGACTGCAGCCAGAGGACAGGTTGCTCTTTCTATGTCTGTCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATACAGACTGCAGCCAGAGGACAGGTTGCTCTTTCTATGTCTGTCCC  350

seq1  TTCCTTAGAGACATATTACTTGTAAACGACTGCTCTTTGCCATCATTTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTAGAGACATATTACTTGTAAACGACTGCTCTTTGCCATCATTTTC  400

seq1  ACAAGTAAGGGATTTCAGAGGGTAGAATACTCCGTTGCCCTCATTGTGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTAAGGGATTTCAGAGGGTAGAATACTCCGTTGCCCTCATTGTGCA  450

seq1  GAAAAATCTTACTTTTGTACCTACTATTTTTTTGTCCTAACCCTGCCAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAATCTTACTTTTGTACCTACTATTTTTTTGTCCTAACCCTGCCAAG  500

seq1  AAAAAGTATCAAATTTGCAGCACTAAATGAGAAAAGGAAGGCAGGGTAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGTATCAAATTTGCAGCACTAAATGAGAAAAGGAAGGCAGGGTAAT  550

seq1  GGTGCTTGTTTACCCTTCTTCTACATTAAGAATGCCTCCCTTCTCACCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTTGTTTACCCTTCTTCTACATTAAGAATGCCTCCCTTCTCACCAT  600

seq1  CCCATGAACTTGCTGTCCTGATGGCACCTTTCATAATCCTGCCTTGGACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGAACTTGCTGTCCTGATGGCACCTTTCATAATCCTGCCTTGGACT  650

seq1  GCATGCTTTCTGGTACTGCCCTGTTTCTTGGCCTCTTGTGAAGCAGTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGCTTTCTGGTACTGCCCTGTTTCTTGGCCTCTTGTGAAGCAGTTGT  700

seq1  AAGTCTGGAAAAGTGTTGGCAGCCTTCCAGGTTCATAGACCACCTATCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AAGTCTGGAAAAGTGTTGGCAGCCTTCCAGGTTCATAGACCACCTATCAC  750

seq1  GAACTTGGTAATCTGTTGTACTTAGGTTATTGATTCCCATTGATTCATTA  800
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTGGTAATCTG-TGTACTTAGGTTATTGATTCCCATTGATTCATTA  799

seq1  AAACTACTTAATATTTGCCATAGTTTAAAAACAAAAACACATGCCTTCAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| 
seq2  AAACTACTTAATATTTGCCATAGTTTAAAA--CAAAACACATGCCTTCA-  846

seq1  TATGCCTAAGATTGACAGAGAGTCAATCTTCTGTTATGGGTTGTTTTAAG  900
      ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||
seq2  TATGCCT-AGATTGACAGAGAGTCAATC-TCTG-TATGGGTTGTTTT-AG  892

seq1  TATTATATGGGAAAGGGAAGAGAAATGGGTTT  932
      || |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TA-TATATGGGAAAGGGAAGAGAAATGGGTTT  923

seq1: chr1_95514077_95514767
seq2: B6Ng01-034P21.g_70_761 (reverse)

seq1  TAAACTAACATTCTCCTAGCCCATAGGATGTCACCTCTTCTCTCACCTAC  50
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TAAACTAACATTCTCCTAGCCCATAGGATGTCACCTCTTCTCTCACATAC  50

seq1  AGGTAGAAGAAAGTGAGAATGAATGGTCTGTTCCTCATTGCTTCACCATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGAAGAAAGTGAGAATGAATGGTCTGTTCCTCATTGCTTCACCATC  100

seq1  TATGCAGCTCAG-AAAACAATTGTGGTAGCAGCCAGGTAAGGGCCTCTTC  149
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAGCTCAGAAAAACAATTGTGGTAGCAGCCAGGTAAGGGCCTCTTC  150

seq1  CTGATTCACAGCAGGGCCTGCTGCAGGGATGAGGACTTCAGTACCAACCT  199
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTCACAGCAGGGCCTGCTGCAGGGATGAGGACTTCAGTACCAACCT  200

seq1  CTGGACTCTACCTCCCTCATGGGACTCAGCTGTTTCCAGGTTATGCAGGC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACTCTACCTCCCTCATGGGACTCAGCTGTTTCCAGGTTATGCAGGC  250

seq1  AAAGGACTATTTTCCCCTTTGTAGTCAGGAAGGAGTATCTTTCCCCTTGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGACTATTTTCCCCTTTGTAGTCAGGAAGGAGTATCTTTCCCCTTGT  300

seq1  AGACAGGGAAGGATTGTTGACATTTGTGTTTTCAAGAAATCAACCAGGGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGGGAAGGATTGTTGACATTTGTGTTTTCAAGAAATCAACCAGGGT  350

seq1  GCTTCTGAGAAGATGCCTGTACAGTTAGTTCATGTCAACTGGTCTTATTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTGAGAAGATGCCTGTACAGTTAGTTCATGTCAACTGGTCTTATTT  400

seq1  GTTTGTTTGTTTATTTATATGAGTACGCTGTAGCTGTCTTCAGAAACACC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTTGTTTATTTATATGAGTACGCTGTAGCTGTCTTCAGAAACACC  450

seq1  AGATCCCTTTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCCCTTTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGA  500

seq1  ACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCACTGAGCCATCT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCACTGAGCCATCT  550

seq1  CTCCAGCCCCCTCACCTGGTCTCTTAATAGCACCAGCACTCCAGCCCTCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGCCCCCTCACCTGGTCTCTTAATAGCACCAGCACTCCAGCCCTCA  600

seq1  GGCAAGTAGTATTAGGATCATGGTGAAAGCCAACTTGGGGGTCACAGCCC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGTAGTATTAGGATCATGGTGAAAGCCAACTTGGGGGTCACAGCCC  650

seq1  AAGAGCAAATGGAGGTTTTCTCCTTTCCAGACCAGTGAATTC  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCAAATGGAGGTTTTCTCCTTTCCAGACCAGTGAATTC  692