BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-036F10
Chromosome1 (Build37)
Map Location 184,340,991 - 184,428,018
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTrp53bp2, Capn2
Upstream geneCnih3, Ccdc121, A230079K17Rik, Lbr, EG433384, Enah, Srp9, EG625823, Degs1, 1700047M11Rik, Fbxo28, LOC435657, ENSMUSG00000073482
Downstream geneLOC666624, Capn8, 4922505E12Rik, Susd4, Tlr5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-036F10.bB6Ng01-036F10.g
ACCDH864545DH864546
length854827
definitionDH864545|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-036F10, 5' end.DH864546|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-036F10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(184,427,165 - 184,428,018)(184,340,991 - 184,341,816)
sequence
gaattccaggctgcaccatgactctgggcctcttttagatactgtcctct
ggctgtgcctcatgtttaatctcccctataaacttaggtgtcgactagat
tccaaattttaaaactcttttgctatttttattgggatcgtgttgtttat
aggccaatttaagagggaaagacatttttatgaaaatgaacctttgtagc
tgagaatatgggctactttaaaaaaaaagtctttaaaaacacaattgtct
cagtccccacaggctcctgtgcaactgtatcagtacacctcaactgctgc
ccagggctcttctctgaatctccttctgcaggttgggggcaattgacaga
attctagaactcccagtgggacttagtgccaccaagagagagccgttatc
agaggaagcaggggaaacatgctctggcctttgatctccaggtcccccag
tggctaaggcacaccagcagccatagcccctgggtctactgctcaggggg
cttctaagcagataccaggttggaggctacaaactaaaacacaggggcaa
gcagaggggatgggccaggcacctcacctcacctcaccacagtccagcgc
tcaggctccggagacaagtgtttctgggttgaggtaaacagagtaatttg
gggacccaaaaatagtccacagaagatggtgtgcaaagaagctttgtacc
tggtgtgacaacattgatggctaacgggagagaagacgggattgagttaa
ttcaagttataacacagagacagtcctttccccaaagtgggccgaggtct
gagtggacgtctgtcctccctcccttccaccagtgttgtctggttatgac
tgga
gaattcttgtaaaaagttattgaatcttgggactaaagtcacttcagcaa
gtctggtggctttgactgctttcctggtgtcagagtagacttactaggaa
aggtgtagtgtgcatgctattctagctttgaaatttgatgcgctttggaa
ttttgcacagcattagtgatcccagatgtttaagaaaaatctgtctctca
tcttcatcatctgtatcttgggggtgatacaatgccaattctcagggtgc
tttggaagattggagtcactgtttatgaaggaaggggttaatacgatgcc
tggcttggaatagttgctagaaaacaccctgaattagcaacagtgattaa
acatgagattcttagtctgtgatagataaaaatatgatacattttcattt
agcatccttgtgttctttttacaagagatttattttatgtatgcctgttt
accatgtgtgtgcctggtgcccacagagatcagaagaggtcatcagatcc
cctgaaaaataagttatgaatggtcttgagtggctaggtacgtgttggga
attgaacctgggacctctgtaagaaggaataacaaattctcttaatgatt
aagcatctttccagcacccaagccttagttttatatgcctttatacttgt
gttattagggtacttgaaaataaaacttcttgtgtgtgtgtggtactggg
gatccaaccaggattttgtatacatgctagacaagcacttcatcactaag
ctactaagcccgtaaagtacatttcggttcttttgagaagagggtcttgc
tgtgtatgatgaatctggctggtgtgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_184427165_184428018
seq2: B6Ng01-036F10.b_49_902 (reverse)

seq1  TCCAGTCATAACAGGACAACACTGGTGGGAGGGAGGGAGGACAAGACGTC  50
      ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
seq2  TCCAGTCATAACCAGACAACACTGGTGGAAGGGAGGGAGGAC-AGACGTC  49

seq1  CACTCAGACCTCGGCCCACTCTGGGGGAAAGGACTGTCTCTGTGTCATAA  100
      |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CACTCAGACCTCGGCCCACT-TTGGGGAAAGGACTGTCTCTGTGTTATAA  98

seq1  CTTGAATT-ACTCAAATCCCGTCTTCCTCTCCCGTTAGCCATCAATGTTG  149
      |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAATTAACTC-AATCCCGTCTT-CTCTCCCGTTAGCCATCAATGTTG  146

seq1  TCACA-CAGGTACAAAGCTTCTTTGCACACCATCTTCTGTGGACTATTTT  198
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACCAGGTACAAAGCTTCTTTGCACACCATCTTCTGTGGACTATTTT  196

seq1  TGGGTCCCCAAATTACTCTGTTTACCTCAA-CCAGAAACACTTGTCTCCG  247
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TGGGTCCCCAAATTACTCTGTTTACCTCAACCCAGAAACACTTGTCTCCG  246

seq1  GAGCCTGAGCGCTGGACTGTGGTGAGGTGAGGTGAGGTGCCTGGCCCATC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCTGAGCGCTGGACTGTGGTGAGGTGAGGTGAGGTGCCTGGCCCATC  296

seq1  CCCTCTGCTTGCCCCTGTG-TTTAGTTTGTAGCCTCCAACCTGGTATCTG  346
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTGCTTGCCCCTGTGTTTTAGTTTGTAGCCTCCAACCTGGTATCTG  346

seq1  CTTAGAAGCCCCCTGAGCAGTAGACCCAGGGGCTATGGCTGCTGGTGTGC  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAAGCCCCCTGAGCAGTAGACCCAGGGGCTATGGCTGCTGGTGTGC  396

seq1  CTTAGCCACTGGGGGACCTGGAGATCAAAGGCCAGAGCATGTTTCCCCTG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCCACTGGGGGACCTGGAGATCAAAGGCCAGAGCATGTTTCCCCTG  446

seq1  CTTCCTCTGATAACGGCTCTCTCTTGGTGGCACTAAGTCCCACTGGGAGT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTCTGATAACGGCTCTCTCTTGGTGGCACTAAGTCCCACTGGGAGT  496

seq1  TCTAGAATTCTGTCAATTGCCCCCAACCTGCAGAAGGAGATTCAGAGAAG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGAATTCTGTCAATTGCCCCCAACCTGCAGAAGGAGATTCAGAGAAG  546

seq1  AGCCCTGGGCAGCAGTTGAGGTGTACTGATACAGTTGCACAGGAGCCTGT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTGGGCAGCAGTTGAGGTGTACTGATACAGTTGCACAGGAGCCTGT  596

seq1  GGGGACTGAGACAATTGTGTTTTTAAAGACTTTTTTTTTAAAGTAGCCCA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGACTGAGACAATTGTGTTTTTAAAGACTTTTTTTTTAAAGTAGCCCA  646

seq1  TATTCTCAGCTACAAAGGTTCATTTTCATAAAAATGTCTTTCCCTCTTAA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTCAGCTACAAAGGTTCATTTTCATAAAAATGTCTTTCCCTCTTAA  696

seq1  ATTGGCCTATAAACAACACGATCCCAATAAAAATAGCAAAAGAGTTTTAA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGCCTATAAACAACACGATCCCAATAAAAATAGCAAAAGAGTTTTAA  746

seq1  AATTTGGAATCTAGTCGACACCTAAGTTTATAGGGGAGATTAAACATGAG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGGAATCTAGTCGACACCTAAGTTTATAGGGGAGATTAAACATGAG  796

seq1  GCACAGCCAGAGGACAGTATCTAAAAGAGGCCCAGAGTCATGGTGCAGCC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGCCAGAGGACAGTATCTAAAAGAGGCCCAGAGTCATGGTGCAGCC  846

seq1  TGGAATTC  854
      ||||||||
seq2  TGGAATTC  854

seq1: chr1_184340991_184341816
seq2: B6Ng01-036F10.g_68_894

seq1  GAATTCTTGTAAAAAGTTATTGAATCTTGGGACTAAAGTCACTTCAGCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGTAAAAAGTTATTGAATCTTGGGACTAAAGTCACTTCAGCAA  50

seq1  GTCTGGTGGCTTTGACTGCTTTCCTGGTGTCAGAGTAGACTTACTAGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGGTGGCTTTGACTGCTTTCCTGGTGTCAGAGTAGACTTACTAGGAA  100

seq1  AGGTGTAGTGTGCATGCTATTCTAGCTTTGAAATTTGATGCGCTTTGGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTAGTGTGCATGCTATTCTAGCTTTGAAATTTGATGCGCTTTGGAA  150

seq1  TTTTGCACAGCATTAGTGATCCCAGATGTTTAAGAAAAATCTGTCTCTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCACAGCATTAGTGATCCCAGATGTTTAAGAAAAATCTGTCTCTCA  200

seq1  TCTTCATCATCTGTATCTTGGGGGTGATACAATGCCAATTCTCAGGGTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCATCATCTGTATCTTGGGGGTGATACAATGCCAATTCTCAGGGTGC  250

seq1  TTTGGAAGATTGGAGTCACTGTTTATGAAGGAAGGGGTTAATACGATGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAAGATTGGAGTCACTGTTTATGAAGGAAGGGGTTAATACGATGCC  300

seq1  TGGCTTGGAATAGTTGCTAGAAAACACCCTGAATTAGCAACAGTGATTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTGGAATAGTTGCTAGAAAACACCCTGAATTAGCAACAGTGATTAA  350

seq1  ACATGAGATTCTTAGTCTGTGATAGATAAAAATATGATACATTTTCATTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAGATTCTTAGTCTGTGATAGATAAAAATATGATACATTTTCATTT  400

seq1  AGCATCCTTGTGTTCTTTTTACAAGAGATTTATTTTATGTATGCCTGTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCCTTGTGTTCTTTTTACAAGAGATTTATTTTATGTATGCCTGTTT  450

seq1  ACCATGTGTGTGCCTGGTGCCCACAGAGATCAGAAGAGGTCATCAGATCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGTGTGTGCCTGGTGCCCACAGAGATCAGAAGAGGTCATCAGATCC  500

seq1  CCTGAAAAATAAGTTATGAATGGTCTTGAGTGGCTAGGTACGTGTTGGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAAAATAAGTTATGAATGGTCTTGAGTGGCTAGGTACGTGTTGGGA  550

seq1  ATTGAACCTGGGACCTCTGTAAGAAGGAATAACAAATTCTCTTAATGATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAACCTGGGACCTCTGTAAGAAGGAATAACAAATTCTCTTAATGATT  600

seq1  AAGCCATCTTTCCAGCACCCAAGCCTTAGTTTTATATGCCTTTATACTTG  650
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAG-CATCTTTCCAGCACCCAAGCCTTAGTTTTATATGCCTTTATACTTG  649

seq1  TGTTATTAGGGTACTTGAAAATAAAACTTC-TGTGTGTGTGTGGTACTTG  699
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
seq2  TGTTATTAGGGTACTTGAAAATAAAACTTCTTGTGTGTGTGTGGTACTGG  699

seq1  GGATCCAACCAGGATCTTGTATACATGCTAGACAAGCACTTCATCACTAA  749
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCCAACCAGGATTTTGTATACATGCTAGACAAGCACTTCATCACTAA  749

seq1  GCTACTAAGCCCGTAAAAGTACATTTCGGTTC-TTTGAG-AGAGGGTCTT  797
      |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
seq2  GCTACTAAGCCCGT-AAAGTACATTTCGGTTCTTTTGAGAAGAGGGTCTT  798

seq1  GCTGTGTATGTAGTATCTGGCTGGTGTGG  826
      ||||||||||  | |||||||||||||||
seq2  GCTGTGTATGATGAATCTGGCTGGTGTGG  827