BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-048B22
Chromosome1 (Build37)
Map Location 80,991,409 - 81,134,569
singlet/doubletdoublet
Overlap gene9430031J16Rik
Upstream geneLOC100039325, A830043J08Rik, 2310015K22Rik, Cul3, EG620899, 1700016L21Rik, Dock10, LOC665092
Downstream geneEG621020, LOC433328, EG665145
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-048B22.bB6Ng01-048B22.g
ACCDH872779DH872780
length1,020841
definitionDH872779|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-048B22, 5' end.DH872780|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-048B22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,133,552 - 81,134,569)(80,991,409 - 80,992,249)
sequence
gaattcatttgcctatgaaaagtgttgttttccccctggtggcctttaat
acagaaaagcaaatgtttcattaggcgttgcctttttttctacctgcctg
gcatatgacctttggtcttaattaacatgaaaatgaattgaatttatctc
tgtgtatttactaatgcactcctggggccagtgaaatggcatatggcata
attgagtccataattattattagctaaacatactcatgctggtggaaatt
gacaagagtccatcttgttccacagacctccaggtgaagatgtttctgtt
acttgttgtgggattcattgcattgagaattttaacactatgtacggaag
tgatctctacagttccaggattagaatctgtgtaataagattttaaatga
tggaataagctgagggtgtgatttttctcttctatcaacaaaaggagtga
atgttgaaggaccagtagattcttcagtgtcttactcataaacctcagtg
tctttttaccaagaaagctgggagctttttaaaagagttattgtacattt
aactatatgttactttatgtgtgtttgagtgtgtatgtctgtgatgtgtg
gttattgtgagctgccagggaccagacacaggacctcaatagaaccagta
tggaattgatgagctattttcaagcccaaataaatttttcttagtataat
aaaatttaaacctattttatttttggtattataagtaaataattatatct
ttttccttcttccctttcttccttctaagcttttcatacccatatgtaag
ccttacatactcctttctctttttcaaaatcatggcctctttttcattaa
ttgttattgtgtaacacacacacacacacacacacacacacatatacata
tatgtattcctatatatgaagtcctcattctgtaaaatgtcactggtatg
atggttaaagtcctggcaatttgttatgagggaactaagtaatgtgcttt
ttctgtgggaagaatctctt
gaattcaatctagtttatctccagaaactggttgttggctcagtcacatc
ctattaccttggacttttaaattacttgatgcagaagggtccagtagaag
aatatgacacagatgaatctaacagatatgaaaaaaataattatatttac
attgtgaactcttggtaatgtaaccaactgacacgaagaaacccacctgt
tactcttttggaaaacatatttctctaaaaagctaactcacaaaaacaac
ataacacctaaatggctttactatacttccttattagttaatatgtttgt
attcggttgtggtgttagttatgctataaatacagtatcaattatagaaa
aagtgtcgatgcaaatgagagtatgtatttttagaattttggcatattct
tgtagcttgcttagattaaataataacaatcatgattgtaaactaaatta
ttactctgtaaacatgttatgtgggcttatacaggattaaggttctccag
tgatttatttaagaatgtgaaagcatattactttatttaaaatattttta
gttagatatattttctccaaaagaaaactgtgatattttctcatgcaaag
aagatcaaagtggaggactcctaatgagattactataattctctaatgat
ttgaaactaattggaacaacaatatgaactaaccagtatccgcagagctc
atgtctctagctgcatatgtagcagaagatggcctagtcggccatcactg
ggaagagaggccccatggtattgcaaactttatatgccccagtacagggg
aatgccagggccaagaagagggagtgggtgggtaggggagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_81133552_81134569
seq2: B6Ng01-048B22.b_38_1057 (reverse)

seq1  AAGAGAGTCTTCCCACAG-AAAAGCACATTAACTAGTTACCTCATAACAA  49
      |||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||
seq2  AAGAGATTCTTCCCACAGAAAAAGCACATTACTTAGTTCCCTCATAACAA  50

seq1  ATTGCCAGGACTTAAACATACATACAAGTGACATTATACAGAATGAGGAC  99
      ||||||||||||| |||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||
seq2  ATTGCCAGGACTTTAACCATCATACCAGTGACATTTTACAGAATGAGGAC  100

seq1  TTCATATATAGGAATACATATATGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATATATAGGAATACATATATGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  150

seq1  TGTGTGTTACACAATAACAATTAATGAAAAAGAGGCCATGATTTTGAAAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTTACACAATAACAATTAATGAAAAAGAGGCCATGATTTTGAAAA  200

seq1  AGAGAAAGGAGTATGTAAGGCTTACATATGGGTATGAAAAGCTTAGAAGG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAGGAGTATGTAAGGCTTACATATGGGTATGAAAAGCTTAGAAGG  250

seq1  AAGAAAGGGAAGAAGG-AAAAGATATAATTATTTACTTATAATACCAAAA  298
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGGGAAGAAGGAAAAAGATATAATTATTTACTTATAATACCAAAA  300

seq1  ATAAAATAGGTTTAAATTTTATTATACTAAGAAAAATTTATTTGGGCTTG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATAGGTTTAAATTTTATTATACTAAGAAAAATTTATTTGGGCTTG  350

seq1  AAAATAGCTCATCAATTCCATACTGGTTCTATTGAGGTCCTGTGTCTGGT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAGCTCATCAATTCCATACTGGTTCTATTGAGGTCCTGTGTCTGGT  400

seq1  CCCTGGCAGCTCACAATAACCACACATCACAGACATACACACTCAAACAC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGCAGCTCACAATAACCACACATCACAGACATACACACTCAAACAC  450

seq1  ACATAAAGTAACATATAGTTAAATGTACAATAACTCTTTTAAAAAGCTCC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAAGTAACATATAGTTAAATGTACAATAACTCTTTTAAAAAGCTCC  500

seq1  CAGCTTTCTTGGTAAAAAGACACTGAGGTTTATGAGTAAGACACTGAAGA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTTCTTGGTAAAAAGACACTGAGGTTTATGAGTAAGACACTGAAGA  550

seq1  ATCTACTGGTCCTTCAACATTCACTCCTTTTGTTGATAGAAGAGAAAAAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTACTGGTCCTTCAACATTCACTCCTTTTGTTGATAGAAGAGAAAAAT  600

seq1  CACACCCTCAGCTTATTCCATCATTTAAAATCTTATTACACAGATTCTAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCCTCAGCTTATTCCATCATTTAAAATCTTATTACACAGATTCTAA  650

seq1  TCCTGGAACTGTAGAGATCACTTCCGTACATAGTGTTAAAATTCTCAATG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGAACTGTAGAGATCACTTCCGTACATAGTGTTAAAATTCTCAATG  700

seq1  CAATGAATCCCACAACAAGTAACAGAAACATCTTCACCTGGAGGTCTGTG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAATCCCACAACAAGTAACAGAAACATCTTCACCTGGAGGTCTGTG  750

seq1  GAACAAGATGGACTCTTGTCAATTTCCACCAGCATGAGTATGTTTAGCTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAAGATGGACTCTTGTCAATTTCCACCAGCATGAGTATGTTTAGCTA  800

seq1  ATAATAATTATGGACTCAATTATGCCATATGCCATTTCACTGGCCCCAGG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAATTATGGACTCAATTATGCCATATGCCATTTCACTGGCCCCAGG  850

seq1  AGTGCATTAGTAAATACACAGAGATAAATTCAATTCATTTTCATGTTAAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCATTAGTAAATACACAGAGATAAATTCAATTCATTTTCATGTTAAT  900

seq1  TAAGACCAAAGGTCATATGCCAGGCAGGTAGAAAAAAAGGCAACGCCTAA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACCAAAGGTCATATGCCAGGCAGGTAGAAAAAAAGGCAACGCCTAA  950

seq1  TGAAACATTTGCTTTTCTGTATTAAAGGCCACCAGGGGGAAAACAACACT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACATTTGCTTTTCTGTATTAAAGGCCACCAGGGGGAAAACAACACT  1000

seq1  TTTCATAGGCAAATGAATTC  1018
      ||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATAGGCAAATGAATTC  1020

seq1: chr1_80991409_80992249
seq2: B6Ng01-048B22.g_65_905

seq1  GAATTCAATCTAGTTTATCTCCAGAAACTGGTTGTTGGCTCAGTCACATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATCTAGTTTATCTCCAGAAACTGGTTGTTGGCTCAGTCACATC  50

seq1  CTATTACCTTGGACTTTTAAATTACTTGATGCAGAAGGGTCCAGTAGAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTACCTTGGACTTTTAAATTACTTGATGCAGAAGGGTCCAGTAGAAG  100

seq1  AATATGACACAGATGAATCTAACAGATATGAAAAAAATAATTATATTTAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGACACAGATGAATCTAACAGATATGAAAAAAATAATTATATTTAC  150

seq1  ATTGTGAACTCTTGGTAATGTAACCAACTGACACGAAGAAACCCACCTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTGAACTCTTGGTAATGTAACCAACTGACACGAAGAAACCCACCTGT  200

seq1  TACTCTTTTGGAAAACATATTTCTCTAAAAAGCTAACTCACAAAAACAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTTTTGGAAAACATATTTCTCTAAAAAGCTAACTCACAAAAACAAC  250

seq1  ATAACACCTAAATGGCTTTACTATACTTCCTTATTAGTTAATATGTTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACACCTAAATGGCTTTACTATACTTCCTTATTAGTTAATATGTTTGT  300

seq1  ATTCGGTTGTGGTGTTAGTTATGCTATAAATACAGTATCAATTATAGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCGGTTGTGGTGTTAGTTATGCTATAAATACAGTATCAATTATAGAAA  350

seq1  AAGTGTCGATGCAAATGAGAGTATGTATTTTTAGAATTTTGGCATATTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTCGATGCAAATGAGAGTATGTATTTTTAGAATTTTGGCATATTCT  400

seq1  TGTAGCTTGCTTAGATTAAATAATAACAATCATGATTGTAAACTAAATTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGCTTGCTTAGATTAAATAATAACAATCATGATTGTAAACTAAATTA  450

seq1  TTACTCTGTAAACATGTTATGTGGGCTTATACAGGATTAAGGTTCTCCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCTGTAAACATGTTATGTGGGCTTATACAGGATTAAGGTTCTCCAG  500

seq1  TGATTTATTTAAGAATGTGAAAGCATATTACTTTATTTAAAATATTTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTATTTAAGAATGTGAAAGCATATTACTTTATTTAAAATATTTTTA  550

seq1  GTTAGATATATTTTCTCCAAAAGAAAACTGTGATATTTTCTCATGCAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGATATATTTTCTCCAAAAGAAAACTGTGATATTTTCTCATGCAAAG  600

seq1  AAGATCAAAGTGGAGGACTCCTAATGAGATTACTATAATTCTCTAATGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCAAAGTGGAGGACTCCTAATGAGATTACTATAATTCTCTAATGAT  650

seq1  TTGAAACTAATTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTATCCGCAGAGCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAACTAATTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTATCCGCAGAGCTC  700

seq1  ATGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTG  750

seq1  GGAAGAGAGGCCCCATGGTATTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAGAGGCCCCATGGTATTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGG  800

seq1  AATGCCAGGGCCAAGAAGAGGGAGTGGGTGGGTAGGGGAGC  841
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCAGGGCCAAGAAGAGGGAGTGGGTGGGTAGGGGAGC  841