BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051F23
Chromosome1 (Build37)
Map Location 145,492,057 - 145,565,685
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCdc73, B3galt2, LOC623138
Upstream geneLOC545369
Downstream geneGlrx2, Trove2, Uchl5, Rgs2, Rgs13, Rbm6-ps2, Rgs1, EG639456, Rgs21
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051F23.bB6Ng01-051F23.g
ACCDH875037DH875038
length1,1961,133
definitionDH875037|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051F23, 5' end.DH875038|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051F23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(145,564,478 - 145,565,685)(145,492,057 - 145,493,197)
sequence
gaattcacacacacacacacacacacacacacacacacacacaccaaaac
actcttaaaaaaaaaaagaataatgaaacagttgattatacgtccctttg
atcccaacgttatcaacccaccactatcttaaaagggtcagatatgagcc
aaaaacctgtccagctattttctgtcaagggtaaattgaatagggcatcg
gaggccctctacctcctctcctgtgagcatctgaactggcaaaagcaacc
tgaccataatgttttcctgttaaataatttgacaccatcaacagtcagct
caaaacacactttgactttatggaacaagataaaacaaggcagttcaaac
agctaaatatagccactggagctcttacttcatttccaattacagtttca
ccttcatctatgtctttattcattcataccttctagagacagaaaacaat
aattctgtgggccaaatctatcctctttttttttccttttgcaaaatcta
tttttggtgctgacaaatgaacaattattacatatatgttctaacactta
agtatgctaaccagctcctctttttttgtacaatatttaggaaaagaata
gctttaacactttaaaataattttagaaatcaaacaagaatctgtgaatg
agcatatggaggccacaggtctccctaaatgttctatcacttctacacgt
caccccacagagaccatgccaccaacaaactcagaccaaagctgaaatta
taatgtttccccaaataatgtaacgcatatctcaaattgtattgattaac
tgattgatcaataaagacagggaccgatggtggcttcagtgatgcccttg
aacttgtgatcttgtacctctgcttcctgagtgctggagttgccactcgt
ccctgcttgtgctggactgaggatgcaaccctgagatgtgatcacactag
gggaggactctgctagccatgggaggactctgctagccaggggaaagctc
tgctaactgagttatattcttagctcataaatccaaatgagcaagtccga
gtacatctcttatggagattgttagtaggtattatcatagtcttctgtga
cataggacatgataggttcatgggcttgctggatagccaccagtaagtgg
acccaccatccttatttaggtaggtatacccaaaacagagtcaaag
gaattcaaactactgctatgaccctcagttctttatctatgaataggtaa
aaacaaggaaaaaattagcaaatacaaataagtttatgctatgctgaaaa
gcctcttgcaaaacagccagttttcactaagaggcatcactaatttcttg
tgaacttctgaacgatctagaactataagtgtaatgctactataaagtct
ttaaagttaaactaatttctggcattgcagatcatgcaaaaaagtgtaat
tcaagaatattttaaaatgtattttgtggaaagtgtaatttaaagcagtt
cacaatagtaggagctattgtctatatttttcaagaagtccagaaaaact
gcaaaatacacaccctttgcccaaagcattgacacataagactgatatcc
tagatatgtactatttagggtggatgggtaaaattagcaaagtactgtaa
attgttaattatttattgctatctaaaatctcacactgaactcactaaac
cctaaaaattaattttgacaggtgtatcttctcactgacttttttgacac
gggggtcagggggagagactggaaacatgccaagcagtgactgtgactaa
ctgaactctgccacagttaaacctgcaccttctgttccaaagccaataca
tgtccattttccaaaaaaggccactgactgtgcaccatatcgccatgcta
tgtcaaatcaattttaattaatgtcaataaatttgccatctgttctgaag
gccctctttccgagcctttgtcagaaatctaaaagcatttttcctgtcta
catggacacaacattaaaaccctttaggtcaaagggacagatgagcagag
ctatcgaaatcatcaagtaagtaaaataaaattaatctatcacttatctt
ccgagtgttcattacacacaagaatatcttttaaagacataaatcttgtg
tcagtattttatgtgccttatccagttttttctcagcttaaaaagtcttt
tatagctgactttttaaggcagtttgcaaatctgcatttttgtaatcata
tgcttccttcatctttattagaatgacattcgaggacattgtatctgaac
cagagacgatgatcaggcgcaagtattgactga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_145564478_145565685
seq2: B6Ng01-051F23.b_42_1237 (reverse)

seq1  CTTTGACTCTTGTTTTTGGTGTATACTTA-CTAAATAGGGTATGTTGGGT  49
      ||||||||| ||||||  | |||||| || ||||||| || ||| |||||
seq2  CTTTGACTC-TGTTTT--GGGTATACCTACCTAAATAAGG-ATGGTGGGT  46

seq1  CCACTTACTGTGTGCTATCCAGCATAGGCCATGAACCTATCATGTGCCTA  99
      ||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||
seq2  CCACTTACTGGTGGCTATCCAGCA-AGCCCATGAACCTATCATGT-CCTA  94

seq1  TGTCAACAGGAAGACCTATTGTATATACCTACTAAC-ATCTCCATAAGAG  148
      |||| ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||||| 
seq2  TGTC-ACA-GAAGA-CTATGATA-ATACCTACTAACAATCTCCATAAGA-  139

seq1  GATGTTACCTCGGACTTGCTCAATTTGGATTTATGAGCTAAGAATATAAC  198
      |||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGT--ACTCGGACTTGCTC-ATTTGGATTTATGAGCTAAGAATATAAC  186

seq1  TCAGTTAGCAGAGCTTTCCCCTGGCTAGCAGAGTCCTCCCATGGCTAGCA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTAGCAGAGCTTTCCCCTGGCTAGCAGAGTCCTCCCATGGCTAGCA  236

seq1  GAGTCCTCCCCTAGTGTGATCACATCTCAGGGTTGCATCCTCAGTCCAGC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCCTCCCCTAGTGTGATCACATCTCAGGGTTGCATCCTCAGTCCAGC  286

seq1  ACAAGCAGGGACGAGTGGCAACTCCAGCACTCAGGAAGCAGAGGTACAAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCAGGGACGAGTGGCAACTCCAGCACTCAGGAAGCAGAGGTACAAG  336

seq1  ATCACAAGTTCAAGGGCATCACTGAAGCCACCATCGGTCCCTGTCTTTAT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAAGTTCAAGGGCATCACTGAAGCCACCATCGGTCCCTGTCTTTAT  386

seq1  TGATCAATCAGTTAATCAATACAATTTGAGATATGCGTTACATTATTTGG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCAATCAGTTAATCAATACAATTTGAGATATGCGTTACATTATTTGG  436

seq1  GGAAACATTATAATTTCAGCTTTGGTCTGAGTTTGTTGGTGGCATGGTCT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACATTATAATTTCAGCTTTGGTCTGAGTTTGTTGGTGGCATGGTCT  486

seq1  CTGTGGGGTGACGTGTAGAAGTGATAGAACATTTAGGGAGACCTGTGGCC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGGGTGACGTGTAGAAGTGATAGAACATTTAGGGAGACCTGTGGCC  536

seq1  TCCATATGCTCATTCACAGATTCTTGTTTGATTTCTAAAATTATTTTAAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATATGCTCATTCACAGATTCTTGTTTGATTTCTAAAATTATTTTAAA  586

seq1  GTGTTAAAGCTATTCTTTTCCTAAATATTGTACAAAAAAAGAGGAGCTGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTAAAGCTATTCTTTTCCTAAATATTGTACAAAAAAAGAGGAGCTGG  636

seq1  TTAGCATACTTAAGTGTTAGAACATATATGTAATAATTGTTCATTTGTCA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCATACTTAAGTGTTAGAACATATATGTAATAATTGTTCATTTGTCA  686

seq1  GCACCAAAAATAGATTTTGCAAAAGGAAAAAAAAAGAGGATAGATTTGGC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCAAAAATAGATTTTGCAAAAGGAAAAAAAAAGAGGATAGATTTGGC  736

seq1  CCACAGAATTATTGTTTTCTGTCTCTAGAAGGTATGAATGAATAAAGACA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGAATTATTGTTTTCTGTCTCTAGAAGGTATGAATGAATAAAGACA  786

seq1  TAGATGAAGGTGAAACTGTAATTGGAAATGAAGTAAGAGCTCCAGTGGCT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGAAGGTGAAACTGTAATTGGAAATGAAGTAAGAGCTCCAGTGGCT  836

seq1  ATATTTAGCTGTTTGAACTGCCTTGTTTTATCTTGTTCCATAAAGTCAAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTAGCTGTTTGAACTGCCTTGTTTTATCTTGTTCCATAAAGTCAAA  886

seq1  GTGTGTTTTGAGCTGACTGTTGATGGTGTCAAATTATTTAACAGGAAAAC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTTTTGAGCTGACTGTTGATGGTGTCAAATTATTTAACAGGAAAAC  936

seq1  ATTATGGTCAGGTTGCTTTTGCCAGTTCAGATGCTCACAGGAGAGGAGGT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGGTCAGGTTGCTTTTGCCAGTTCAGATGCTCACAGGAGAGGAGGT  986

seq1  AGAGGGCCTCCGATGCCCTATTCAATTTACCCTTGACAGAAAATAGCTGG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGCCTCCGATGCCCTATTCAATTTACCCTTGACAGAAAATAGCTGG  1036

seq1  ACAGGTTTTTGGCTCATATCTGACCCTTTTAAGATAGTGGTGGGTTGATA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGTTTTTGGCTCATATCTGACCCTTTTAAGATAGTGGTGGGTTGATA  1086

seq1  ACGTTGGGATCAAAGGGACGTATAATCAACTGTTTCATTATTCTTTTTTT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTGGGATCAAAGGGACGTATAATCAACTGTTTCATTATTCTTTTTTT  1136

seq1  TTTTAAGAGTGTTTTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  1198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGAGTGTTTTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  1186

seq1  GTGTGAATTC  1208
      ||||||||||
seq2  GTGTGAATTC  1196

seq1: chr1_145492057_145493197
seq2: B6Ng01-051F23.g_66_1198

seq1  GAATTCAAACTACTGCTATGACCCTCAGTTCTTTATCTATGAATAGGTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAACTACTGCTATGACCCTCAGTTCTTTATCTATGAATAGGTAA  50

seq1  AAACAAGGAAAAAATTAGCAAATACAAATAAGTTTATGCTATGCTGAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAGGAAAAAATTAGCAAATACAAATAAGTTTATGCTATGCTGAAAA  100

seq1  GCCTCTTGCAAAACAGCCAGTTTTCACTAAGAGGCATCACTAATTTCTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTTGCAAAACAGCCAGTTTTCACTAAGAGGCATCACTAATTTCTTG  150

seq1  TGAACTTCTGAACGATCTAGAACTATAAGTGTAATGCTACTATAAAGTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTTCTGAACGATCTAGAACTATAAGTGTAATGCTACTATAAAGTCT  200

seq1  TTAAAGTTAAACTAATTTCTGGCATTGCAGATCATGCAAAAAAGTGTAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGTTAAACTAATTTCTGGCATTGCAGATCATGCAAAAAAGTGTAAT  250

seq1  TCAAGAATATTTTAAAATGTATTTTGTGGAAAGTGTAATTTAAAGCAGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGAATATTTTAAAATGTATTTTGTGGAAAGTGTAATTTAAAGCAGTT  300

seq1  CACAATAGTAGGAGCTATTGTCTATATTTTTCAAGAAGTCCAGAAAAACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATAGTAGGAGCTATTGTCTATATTTTTCAAGAAGTCCAGAAAAACT  350

seq1  GCAAAATACACACCCTTTGCCCAAAGCATTGACACATAAGACTGATATCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAATACACACCCTTTGCCCAAAGCATTGACACATAAGACTGATATCC  400

seq1  TAGATATGTACTATTTAGGGTGGATGGGTAAAATTAGCAAAGTACTGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATATGTACTATTTAGGGTGGATGGGTAAAATTAGCAAAGTACTGTAA  450

seq1  ATTGTTAATTATTTATTGCTATCTAAAATCTCACACTGAACTCACTAAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTAATTATTTATTGCTATCTAAAATCTCACACTGAACTCACTAAAC  500

seq1  CCTAAAAATTAATTTTGACAGGTGTATCTTCTCACTGACTTTTTTGACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAAAATTAATTTTGACAGGTGTATCTTCTCACTGACTTTTTTGACAC  550

seq1  GGGGGTCAGGGGGAGAGACTGGAAACATGCCAAGCAGTGACTGTGACTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTCAGGGGGAGAGACTGGAAACATGCCAAGCAGTGACTGTGACTAA  600

seq1  CTGAACTCTGCCACAGTTAAACCTGCACCTTCTGTTCCAAAGCCAATACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACTCTGCCACAGTTAAACCTGCACCTTCTGTTCCAAAGCCAATACA  650

seq1  TGTCCATTTTCCAAAAAAGGCCACTGACTGTGCACCATATCGCCATGCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCATTTTCCAAAAAAGGCCACTGACTGTGCACCATATCGCCATGCTA  700

seq1  TGTCAAATCAATTTTAATTAATGTCAATAAATTTGCCATCTGTTCTGAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAAATCAATTTTAATTAATGTCAATAAATTTGCCATCTGTTCTGAAG  750

seq1  GCCCTCTTTCCGAGCCTTTGTCAGAAATCTAAAAGCATTTTTCCTGTCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCTTTCCGAGCCTTTGTCAGAAATCTAAAAGCATTTTTCCTGTCTA  800

seq1  CATGGACACAACATTAAAACCCTTTAGGTCAAAGGGACAGATGAGCAGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGACACAACATTAAAACCCTTTAGGTCAAAGGGACAGATGAGCAGAG  850

seq1  CTATCGAAATCATCAAGTAAGTAAAATAAAATTAATCTATCACTTATCTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCGAAATCATCAAGTAAGTAAAATAAAATTAATCTATCACTTATCTT  900

seq1  CCGAGTGTTCATTACACACAAGAATATCTTTTAAAGACATAAATCTTGTT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CCGAGTGTTCATTACACACAAGAATATCTTTTAAAGACATAAATCTTG-T  949

seq1  GTCAGTAATTTTATGTTGCCTTATCCAGTTTTTTCTCAGCTTAAAAAGGT  1000
      |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  GTCAGT-ATTTTATG-TGCCTTATCCAGTTTTTTCTCAGCTTAAAAAG--  995

seq1  CCTTTTATTAGCTGACTTTTTAAGGCAGTTTGCAAAATTCTGCATTTTGT  1050
       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  
seq2  TCTTTTA-TAGCTGACTTTTTAAGGCAGTTTGCAAA--TCTGCATTTTTG  1042

seq1  AAATCATTATGCTTCCTTCATCTTTA-TAGAATGACA-TCGAGGGACA-T  1097
       ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |
seq2  TAATCA-TATGCTTCCTTCATCTTTATTAGAATGACATTCGA-GGACATT  1090

seq1  GTACCTGAACCAGAAGACGATGAATCAAGCGC-AGTATTGACTGA  1141
      ||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||
seq2  GTATCTGAACCAG-AGACGATG-ATCAGGCGCAAGTATTGACTGA  1133