BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051N08
Chromosome1 (Build37)
Map Location 128,274,914 - 128,383,297
singlet/doubletdoublet
Overlap geneE030049G20Rik
Upstream geneActr3, Slc35f5, Lypd1
Downstream geneLOC383559, Mgat5, LOC667090, Tmem163
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051N08.bB6Ng01-051N08.g
ACCDH875360DH875361
length1,1361,088
definitionDH875360|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051N08, 5' end.DH875361|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051N08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,274,914 - 128,276,058)(128,382,199 - 128,383,297)
sequence
gaattcactagattgtttcctaaggaaccaagtcggatgtgcaaatcatg
cacggctgtgtttgatatcagtactctaaggacttgctgctttcttcatg
aattgcttcctcaaaaagaaaaaaaaaaaagtcccatattgaaaggtaat
atacccacccattggaggagattgccctgctaacactcctccaggtgagt
ccagtgaggcgcaaacacttattcgaggtgaagaggctgggccttagcct
accaccatctttaactaggaggagaatttctgccctaagctctgtctaca
ccactaagtttggctaactgtataagcacacattgagcaagtagctaaaa
gagtggagagggtaagaacaattatgggatttttcagcattaacctctca
taaaatatgttcagtcatgtatgtggcccaccaggcaacagcttaaatgc
catcacattaggaaaatatccttgagtgtgtaaccacacatgagaggcag
ccctgcaatattgcctgccccccccgccccccggagagctcactgtttga
ggggctccctcatgttcaggagtggactgataggaaaactcccatcttta
ctactgtgtactctactaagtgatagaattgtggtgagcatatttgtcaa
accttctaccttctgagggaatctagggtgtggcttctatgagggaggct
gtttttcttttgtcagctttcttggaaatcaacctcatgaacttgatgta
aaaattaacaccagcccacgggggaagtggagaaataacctcatgcctcc
gttaattaacacatataaagagaactgccaatccatgtggagaaagataa
cattgcgaatataaagtttaaatttgagggttgcagggagagctctgcag
ttaacggcaaggagtgatcttgttgaagaccttgaaatcagttccgagga
ttgaagctggtgccctgaacagtctctaactccagctccagaggattcaa
acgtttttcagtctccccaggcactgcgttcatggtgccatacccccaca
cagaaacaacatagaggtaaataattcctttctaggttaaatgtccatat
aatacttggatggacattgtaaatcactaggatgac
gaattctttgcctgtttggagctggcagagagaggcagcttctgagattg
tttgctctgcccttggaaacctgtgctggaaaatgaggtgagtgaactca
catccacagaggggtaggaaaatgtgtttcatttttcgcctaaattggtg
gcagggcagaagaaacatgtcactaaaggccaaaggagacgactcccagg
agaaatgttccctgcaaaacccctgtggtctgacagttcctgagctgcag
aggtggcccagcttcagtaggaatgagggcgaggggcaggcatgtggctt
gccagtgtccttgctgtggtgactgcttggtggtgacagaaagaggtccc
tgaaaatggaagtgcaccatctctccttcctatgctgctcactggcatgg
tcacattcgcacagatgaaagcggtgggcatacatgtccgtgtgtgtgtc
tgagagcagaggaggacatcaggtggtctgctccatcccattccaaccgt
cttactgaatctggggataggctgttggctggcaaaccctaggagtaatc
ctcctgtctctaccctgcacagcactgggatcccagcagtgaaagtactc
acacctggctttgtacatacagggtggggattcacactcaggtcccatgg
tacttgcacaccagtagtttcccacactgagccaactctccaaccccagg
gcccatgaaatatcttcttcctaaataaaacgttgtactggattatggtt
agacatcatgcggcttgctgatcctttaatctggatatgagaaaaccatt
caaacacagaaagtgcagtttattgtttatgcaaccaaaatacacatgtg
tagcatgcctggtcttttattgtatgaaaaagcaatggcctctgaaaagg
gtaagttaagcacacagctttcagagctggggagatggctcggtgggcaa
acctgcgacatagttcagatactcagtgcccaggtaaagtagcacattcc
tgtacatggggctgtgggggaagagaggcaaggctctgctgactgccatt
catctagctaaaaagtggcttagttcaggctcactgac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_128274914_128276058
seq2: B6Ng01-051N08.b_46_1181

seq1  GAATTCACTAGATTGTTTCCTAAGGAACCAAGTCGGATGTGCAAATCATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTAGATTGTTTCCTAAGGAACCAAGTCGGATGTGCAAATCATG  50

seq1  CACGGCTGTGTTTGATATCAGTACTCTAAGGACTTGCTGCTTTCTTCATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGGCTGTGTTTGATATCAGTACTCTAAGGACTTGCTGCTTTCTTCATG  100

seq1  AATTGCTTCCTCAAAAAGAAAAAAAAAAAAGTCCCATATTGAAAGGTAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCTTCCTCAAAAAGAAAAAAAAAAAAGTCCCATATTGAAAGGTAAT  150

seq1  ATACCCACCCATTGGAGGAGATTGCCCTGCTAACACTCCTCCAGGTGAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCCACCCATTGGAGGAGATTGCCCTGCTAACACTCCTCCAGGTGAGT  200

seq1  CCAGTGAGGCGCAAACACTTATTCGAGGTGAAGAGGCTGGGCCTTAGCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGAGGCGCAAACACTTATTCGAGGTGAAGAGGCTGGGCCTTAGCCT  250

seq1  ACCACCATCTTTAACTAGGAGGAGAATTTCTGCCCTAAGCTCTGTCTACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCATCTTTAACTAGGAGGAGAATTTCTGCCCTAAGCTCTGTCTACA  300

seq1  CCACTAAGTTTGGCTAACTGTATAAGCACACATTGAGCAAGTAGCTAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTAAGTTTGGCTAACTGTATAAGCACACATTGAGCAAGTAGCTAAAA  350

seq1  GAGTGGAGAGGGTAAGAACAATTATGGGATTTTTCAGCATTAACCTCTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGAGAGGGTAAGAACAATTATGGGATTTTTCAGCATTAACCTCTCA  400

seq1  TAAAATATGTTCAGTCATGTATGTGGCCCACCAGGCAACAGCTTAAATGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATATGTTCAGTCATGTATGTGGCCCACCAGGCAACAGCTTAAATGC  450

seq1  CATCACATTAGGAAAATATCCTTGAGTGTGTAACCACACATGAGAGGCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACATTAGGAAAATATCCTTGAGTGTGTAACCACACATGAGAGGCAG  500

seq1  CCCTGCAATATTGCCTGCCCCCCCCGCCCCCCGGAGAGCTCACTGTTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGCAATATTGCCTGCCCCCCCCGCCCCCCGGAGAGCTCACTGTTTGA  550

seq1  GGGGCTCCCTCATGTTCAGGAGTGGACTGATAGGAAAACTCCCATCTTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCTCCCTCATGTTCAGGAGTGGACTGATAGGAAAACTCCCATCTTTA  600

seq1  CTACTGTGTACTCTACTAAGTGATAGAATTGTGGTGAGCATATTTGTCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGTGTACTCTACTAAGTGATAGAATTGTGGTGAGCATATTTGTCAA  650

seq1  ACCTTCTACCTTCTGAGGGAATCTAGGGTGTGGCTTCTATGAGGGAGGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCTACCTTCTGAGGGAATCTAGGGTGTGGCTTCTATGAGGGAGGCT  700

seq1  GTTTTTCTTTTGTCAGCTTTCTTGGAAATCAACCTCATGAACTTGATGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTCTTTTGTCAGCTTTCTTGGAAATCAACCTCATGAACTTGATGTA  750

seq1  AAAATTAACACCAGCCCACGGGGGAAGTGGAGAAATAACCTCATGCCTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTAACACCAGCCCACGGGGGAAGTGGAGAAATAACCTCATGCCTCC  800

seq1  GTTAATTAACACATATAAAGAGAACTGCCAATCCATGTGGAGAAAGATAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATTAACACATATAAAGAGAACTGCCAATCCATGTGGAGAAAGATAA  850

seq1  CATTGCGAATATAAAAGTTTTAAATTTGAGGGTTGCAGGGAGAGCTCTGC  900
      |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCGAATATAAA--GTTTAAATTTGAGGGTTGCAGGGAGAGCTCTGC  898

seq1  AGTTAACGGCAAGGAGTGATCTTGTAGAAGACC-TGAAATCAGTTCCGAG  949
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||
seq2  AGTTAACGGCAAGGAGTGATCTTGTTGAAGACCTTGAAATCAGTTCCGAG  948

seq1  GATTTGAAGCTGGTGCCCTGAAACAGTCTCTAACTCCAGCTCCAGAGGAT  999
      || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GA-TTGAAGCTGGTGCCCTG-AACAGTCTCTAACTCCAGCTCCAGAGGAT  996

seq1  TCAAAACGTTTTTCAGGTCTCCCCAGGCACTGCGTTCATGTGCCCATACC  1049
      || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||
seq2  TC-AAACGTTTTTCA-GTCTCCCCAGGCACTGCGTTCATGGTGCCATACC  1044

seq1  CACACACAGACACATACATAGAGGTAAAATAAATCTCTTTCTAAGTTTAA  1099
      | |||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||||| || ||||
seq2  CCCACACAGAAACA-ACATAGAGGT-AAATAATTC-CTTTCT-AGGTTAA  1090

seq1  ATGTTCCACATAATACTTTGGAT-GACTATGTAAATCACTA-GATGAC  1145
      ||| |||| ||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||
seq2  ATG-TCCATATAATAC-TTGGATGGACATTGTAAATCACTAGGATGAC  1136

seq1: chr1_128382199_128383297
seq2: B6Ng01-051N08.g_67_1154 (reverse)

seq1  GTCAGTGAGCCTGAAGCTAAAGCACATTTTTTAGGCTAGAATGAATGGCC  50
      ||||||||||||||| ||||  |||  |||||| ||||| |||||||| |
seq2  GTCAGTGAGCCTGAA-CTAAGCCAC--TTTTTA-GCTAG-ATGAATGG-C  44

seq1  AGTCAGCAAGAGGCCTCTGCCTCTC-TCCCCCACAGCCCCATGGTTACAG  99
      ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||
seq2  AGTCAGC-AGA-GCCT-TGCCTCTCTTCCCCCACAGCCCCATG--TACAG  89

seq1  GAATGTGCTACTTTACCTGGGCACTGAGTATCTGAACTTATGTCGGCAGG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
seq2  GAATGTGCTACTTTACCTGGGCACTGAGTATCTGAAC-TATGTC-GCAGG  137

seq1  TTTGCCCACCGAGCCATCTCCCCAGCTCTGAAAGCTGTGTGCTTAACTTA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCCACCGAGCCATCTCCCCAGCTCTGAAAGCTGTGTGCTTAACTTA  187

seq1  CCCTTTTCAGAGGCCATTGCTTTTTCATACAAT-AAAGACCAGGCATGCT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CCCTTTTCAGAGGCCATTGCTTTTTCATACAATAAAAGACCAGGCATGCT  237

seq1  ACACATGTGTATTTTGGTTGCATAAACAATAAACTGCACTTTCTGTGTTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATGTGTATTTTGGTTGCATAAACAATAAACTGCACTTTCTGTGTTT  287

seq1  GAATGGTTTTCTCATATCCAGATTAAAGGATCAGCAAGCCGCATGATGTC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGTTTTCTCATATCCAGATTAAAGGATCAGCAAGCCGCATGATGTC  337

seq1  TAACCATAATCCAGTACAACGTTTTATTTAGGAAGAAGATATTTCATGGG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCATAATCCAGTACAACGTTTTATTTAGGAAGAAGATATTTCATGGG  387

seq1  CCCTGGGGTTGGAGAGTTGGCTCAGTGTGGGAAACTACTGGTGTGCAAGT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGGGTTGGAGAGTTGGCTCAGTGTGGGAAACTACTGGTGTGCAAGT  437

seq1  ACCATGGGACCTGAGTGTGAATCCCCACCCTGTATGTACAAAGCCAGGTG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGGGACCTGAGTGTGAATCCCCACCCTGTATGTACAAAGCCAGGTG  487

seq1  TGAGTACTTTCACTGCTGGGATCCCAGTGCTGTGCAGGGTAGAGACAGGA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTACTTTCACTGCTGGGATCCCAGTGCTGTGCAGGGTAGAGACAGGA  537

seq1  GGATTACTCCTAGGGTTTGCCAGCCAACAGCCTATCCCCAGATTCAGTAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTACTCCTAGGGTTTGCCAGCCAACAGCCTATCCCCAGATTCAGTAA  587

seq1  GACGGTTGGAATGGGATGGAGCAGACCACCTGATGTCCTCCTCTGCTCTC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGGTTGGAATGGGATGGAGCAGACCACCTGATGTCCTCCTCTGCTCTC  637

seq1  AGACACACACACGGACATGTATGCCCACCGCTTTCATCTGTGCGAATGTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACACACACGGACATGTATGCCCACCGCTTTCATCTGTGCGAATGTG  687

seq1  ACCATGCCAGTGAGCAGCATAGGAAGGAGAGATGGTGCACTTCCATTTTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGCCAGTGAGCAGCATAGGAAGGAGAGATGGTGCACTTCCATTTTC  737

seq1  AGGGACCTCTTTCTGTCACCACCAAGCAGTCACCACAGCAAGGACACTGG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACCTCTTTCTGTCACCACCAAGCAGTCACCACAGCAAGGACACTGG  787

seq1  CAAGCCACATGCCTGCCCCTCGCCCTCATTCCTACTGAAGCTGGGCCACC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCACATGCCTGCCCCTCGCCCTCATTCCTACTGAAGCTGGGCCACC  837

seq1  TCTGCAGCTCAGGAACTGTCAGACCACAGGGGTTTTGCAGGGAACATTTC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAGCTCAGGAACTGTCAGACCACAGGGGTTTTGCAGGGAACATTTC  887

seq1  TCCTGGGAGTCGTCTCCTTTGGCCTTTAGTGACATGTTTCTTCTGCCCTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGGAGTCGTCTCCTTTGGCCTTTAGTGACATGTTTCTTCTGCCCTG  937

seq1  CCACCAATTTAGGCGAAAAATGAAACACATTTTCCTACCCCTCTGTGGAT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCAATTTAGGCGAAAAATGAAACACATTTTCCTACCCCTCTGTGGAT  987

seq1  GTGAGTTCACTCACCTCATTTTCCAGCACAGGTTTCCAAGGGCAGAGCAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTTCACTCACCTCATTTTCCAGCACAGGTTTCCAAGGGCAGAGCAA  1037

seq1  ACAATCTCAGAAGCTGCCTCTCTCTGCCAGCTCCAAACAGGCAAAGAATT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCTCAGAAGCTGCCTCTCTCTGCCAGCTCCAAACAGGCAAAGAATT  1087

seq1  C  1099
      |
seq2  C  1088