BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-056G18
Chromosome1 (Build37)
Map Location 129,441,019 - 129,564,028
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmem163
Upstream geneE030049G20Rik, LOC383559, Mgat5, LOC667090
Downstream geneAcmsd, Ccnt2, Ysk4, Rab3gap1, Zranb3, LOC666778, LOC100042670, EG666784, R3hdm1, LOC667109, LOC100042111, Ubxd2, Lct, Mcm6, Dars, LOC620659, Cxcr4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-056G18.bB6Ng01-056G18.g
ACCDH878583DH878584
length1,005857
definitionDH878583|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056G18, 5' end.DH878584|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056G18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(129,441,019 - 129,442,028)(129,563,172 - 129,564,028)
sequence
gaattcatttgaccaagggtgagccaaagtacgagttcttcgtgtctctc
tttgtgccttgtgtcttgcagttcctggcttgtctatactctgtctctca
cgtgtatgtctgtcttcattgcctgtgtccctaacaaagtcctttgctct
gtattaactgaacggcatagaaagaatcccatggggaaggagtaaggcac
cccatagacatctttaaaaagaattgtgttgttgtttacatatctgttta
tgtttacatgtgggtgttttgctttcatgcgtgtataagcaccatgagta
cctggtgcctttgaagattagaaaagggagtcaggtcccctgaaactgga
attacagacagttgtgatctgccatgtgagtcctgggaatcaaacccagg
tcctctggaagagcagctggtgctctttgacagaattttctaagggatta
aatcataaactccaactgtttaaccccaaagcacccagaaacaaaatatt
acttcaaatataagttatcagctatatccatgttattttcaacatttatg
gtagatatttgttttataagattgcttccaacctggtggttgttctcagc
aaatgattaccataacacacacacacacacacacacacacacacacacac
actgctttaagtcagtggcattgaagagtacataatttaagattaaagct
atgaattagctcatgtaataaaagttgattacatggaaaatcccaggaaa
atgaggttggttataatgttgttctcttaacgcaagttaaacaaacagat
tgagtataccacaggatggcaggccaagtcttaagtgacctcaaggtgat
cattaatgtagccatgaggtctagtctctttgaaagtaagggatatttca
taaaatgctatcactccctgagcagccatcttcacaatccaggcagctta
gccctctatcatacagatagctactgttggactaccagctcatactacat
gagtc
gaattctgacttttggaaatataatagcccctctctcctctcacctccct
cctctttataatgagaccaaaataacaaggcagtggctgtcccttgaggg
taatttggttgttgtggctggtagggggactggagatcagacatggcaat
ttacatatgtgaggaaaagagaaagggtaggaaggggtgatttacacacc
agataatgttcctcagacatgtctctgcgccctgaaaagctgttggagca
ccattctctggtgtttaagtaggggctgagtaagaagggttgtgaatggg
tctttcctttggagtaatagtgttacatccgatgtgcttaagccatgtaa
tagagaaaagatatggagaaaattcagcttcacttgtcatacccaaccag
gtggataacgctaaaaatatttcatttccttcaatggaaaacgtccacat
aaggccagagcatggctgtgtggaagggcttcttgttctttttcttttga
aaaccaccttacttctttatggcagaactactgaacttaaaccctttaac
ttccttttaaaagatttatctttattgattatctatatagatgcatgtgt
ttgtccatttggcatctgaacatctcaggaggcccgaagagggcatggag
ctgcctggagtttacaagcagttgtgggacataaacactgggaactgaac
tcagctcctttgcaaaagcagcaagagtacttaacctctggccatctctc
taggctaacttctttgctatagcttgtggatgatattatatttatcatga
cctgtgtatgttctatatgggttttgtttcatttgtgaattgcttctaac
tgcttct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_129441019_129442028
seq2: B6Ng01-056G18.b_41_1045

seq1  GAATTCATTTGACCAAGGGTGAGCCAAAGTACGAGTTCTTCGTGTCTCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTGACCAAGGGTGAGCCAAAGTACGAGTTCTTCGTGTCTCTC  50

seq1  TTTGTGCCTTGTGTCTTGCAGTTCCTGGCTTGTCTATACTCTGTCTCTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGCCTTGTGTCTTGCAGTTCCTGGCTTGTCTATACTCTGTCTCTCA  100

seq1  CGTGTATGTCTGTCTTCATTGCCTGTGTCCCTAACAAAGTCCTTTGCTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTATGTCTGTCTTCATTGCCTGTGTCCCTAACAAAGTCCTTTGCTCT  150

seq1  GTATTAACTGAACGGCATAGAAAGAATCCCATGGGGAAGGAGTAAGGCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTAACTGAACGGCATAGAAAGAATCCCATGGGGAAGGAGTAAGGCAC  200

seq1  CCCATAGACATCTTTAAAAAGAATTGTGTTGTTGTTTACATATCTGTTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATAGACATCTTTAAAAAGAATTGTGTTGTTGTTTACATATCTGTTTA  250

seq1  TGTTTACATGTGGGTGTTTTGCTTTCATGCGTGTATAAGCACCATGAGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTACATGTGGGTGTTTTGCTTTCATGCGTGTATAAGCACCATGAGTA  300

seq1  CCTGGTGCCTTTGAAGATTAGAAAAGGGAGTCAGGTCCCCTGAAACTGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTGCCTTTGAAGATTAGAAAAGGGAGTCAGGTCCCCTGAAACTGGA  350

seq1  ATTACAGACAGTTGTGATCTGCCATGTGAGTCCTGGGAATCAAACCCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAGACAGTTGTGATCTGCCATGTGAGTCCTGGGAATCAAACCCAGG  400

seq1  TCCTCTGGAAGAGCAGCTGGTGCTCTTTGACAGAATTTTCTAAGGGATTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTGGAAGAGCAGCTGGTGCTCTTTGACAGAATTTTCTAAGGGATTA  450

seq1  AATCATAAACTCCAACTGTTTAACCCCAAAGCACCCAGAAACAAAATATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCATAAACTCCAACTGTTTAACCCCAAAGCACCCAGAAACAAAATATT  500

seq1  ACTTCAAATATAAGTTATCAGCTATATCCATGTTATTTTCAACATTTATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCAAATATAAGTTATCAGCTATATCCATGTTATTTTCAACATTTATG  550

seq1  GTAGATATTTGTTTTATAAGATTGCTTCCAACCTGGTGGTTGTTCTCAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGATATTTGTTTTATAAGATTGCTTCCAACCTGGTGGTTGTTCTCAGC  600

seq1  AAATGATTACCATAACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGATTACCATAACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  650

seq1  ACTGCTTTAAGTCAGTGGCATTGAAGAGTACATAATTTAAGATTAAAGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTTTAAGTCAGTGGCATTGAAGAGTACATAATTTAAGATTAAAGCT  700

seq1  ATGAATTAGCTCAGGTAATAAAAGTTGATTACATGGAAAATCCCAGGAAA  750
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATTAGCTCATGTAATAAAAGTTGATTACATGGAAAATCCCAGGAAA  750

seq1  ATGAGGTTGGTTATAATGTTGTTCTCTTAAACGCAAGTTAAACAAACAGA  800
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGTTGGTTATAATGTTGTTCTCTT-AACGCAAGTTAAACAAACAGA  799

seq1  TTGAGTATACCACAGGATGGCAGGCCAAGTCTTAAGTGACCTCAAGGTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTGAGTATACCACAGGATGGCAGGCCAAGTCTTAAGTGACCTCAAGGTG-  848

seq1  ATCATTAATGTAGCCATGAGGTCTAGTCTCTTTGAAAGTAAGGGATATTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTAATGTAGCCATGAGGTCTAGTCTCTTTGAAAGTAAGGGATATTT  898

seq1  CATAAAAATGCTATCACCTCCCTGAGCAGCCATCTTCACAAACCAGGCAG  950
      ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CAT-AAAATGCTATCA-CTCCCTGAGCAGCCATCTTCACAATCCAGGCAG  946

seq1  CTTAGCCCTCTAGCATACAGATAGCTACTGTTGGACTACCCAGCTCATAC  1000
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CTTAGCCCTCTATCATACAGATAGCTACTGTTGGACTA-CCAGCTCATAC  995

seq1  TACATGAGTC  1010
      ||||||||||
seq2  TACATGAGTC  1005

seq1: chr1_129563172_129564028
seq2: B6Ng01-056G18.g_68_924 (reverse)

seq1  AGAAGCAGTTAGAAGCAATTCACAAATGAAACAAAAACCATATAGAACAT  50
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AGAAGCAGTTAGAAGCAATTCACAAATGAAACAAAACCCATATAGAACAT  50

seq1  AACACAGGTCATGATAAATATAATATCATCCACAAGCTATAAGCAAGAAG  100
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||
seq2  -ACACAGGTCATGATAAATATAATATCATCCACAAGCTATAGCAAAGAAG  99

seq1  TTAGCCTAGAGAGATGGCCAGGGGTTAAGTACTCTTGCTGCTTTTGCAAA  150
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCCTAGAGAGATGGCCAGAGGTTAAGTACTCTTGCTGCTTTTGCAAA  149

seq1  GGAGCTGAGTTCAGTTCCCAGTGTTTATGTCCCACAACTGCTTGT-AACT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGAGCTGAGTTCAGTTCCCAGTGTTTATGTCCCACAACTGCTTGTAAACT  199

seq1  CCAGGCAGCTCCATGCCCTCTTCGGGCCTCCTGAGATGTTCAGATGCCAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCAGCTCCATGCCCTCTTCGGGCCTCCTGAGATGTTCAGATGCCAA  249

seq1  ATGGACAAACACATGCATCTATATAGATAATCAATAAAGATAAATCTTTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGACAAACACATGCATCTATATAGATAATCAATAAAGATAAATCTTTT  299

seq1  AAAAGGAAGTTAAAGGGTTTAAGTTCAGTAGTTCTGCCATAAAGAAGTAA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGAAGTTAAAGGGTTTAAGTTCAGTAGTTCTGCCATAAAGAAGTAA  349

seq1  GGTGGTTTTCAAAAGAAAAAGAACAAGAAGCCCTTCCACACAGCCATGCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTTTTCAAAAGAAAAAGAACAAGAAGCCCTTCCACACAGCCATGCT  399

seq1  CTGGCCTTATGTGGACGTTTTCCATTGAAGGAAATGAAATATTTTTAGCG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCTTATGTGGACGTTTTCCATTGAAGGAAATGAAATATTTTTAGCG  449

seq1  TTATCCACCTGGTTGGGTATGACAAGTGAAGCTGAATTTTCTCCATATCT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCACCTGGTTGGGTATGACAAGTGAAGCTGAATTTTCTCCATATCT  499

seq1  TTTCTCTATTACATGGCTTAAGCACATCGGATGTAACACTATTACTCCAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCTATTACATGGCTTAAGCACATCGGATGTAACACTATTACTCCAA  549

seq1  AGGAAAGACCCATTCACAACCCTTCTTACTCAGCCCCTACTTAAACACCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGACCCATTCACAACCCTTCTTACTCAGCCCCTACTTAAACACCA  599

seq1  GAGAATGGTGCTCCAACAGCTTTTCAGGGCGCAGAGACATGTCTGAGGAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATGGTGCTCCAACAGCTTTTCAGGGCGCAGAGACATGTCTGAGGAA  649

seq1  CATTATCTGGTGTGTAAATCACCCCTTCCTACCCTTTCTCTTTTCCTCAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATCTGGTGTGTAAATCACCCCTTCCTACCCTTTCTCTTTTCCTCAC  699

seq1  ATATGTAAATTGCCATGTCTGATCTCCAGTCCCCCTACCAGCCACAACAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTAAATTGCCATGTCTGATCTCCAGTCCCCCTACCAGCCACAACAA  749

seq1  CCAAATTACCCTCAAGGGACAGCCACTGCCTTGTTATTTTGGTCTCATTA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATTACCCTCAAGGGACAGCCACTGCCTTGTTATTTTGGTCTCATTA  799

seq1  TAAAGAGGAGGGAGGTGAGAGGAGAGAGGGGCTATTATATTTCCAAAAGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAGGAGGGAGGTGAGAGGAGAGAGGGGCTATTATATTTCCAAAAGT  849

seq1  CAGAATTC  857
      ||||||||
seq2  CAGAATTC  857