BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-061P05
Chromosome1 (Build37)
Map Location 49,040,353 - 49,183,174
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2900045O20Rik
Upstream geneLOC546734, LOC674566, LOC100041936, LOC666903, LOC666909
Downstream geneLOC666924, C230029F24Rik, LOC627430, LOC100041981, EG666962
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-061P05.bB6Ng01-061P05.g
ACCDH882486DH882487
length1,1521,017
definitionDH882486|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-061P05, 5' end.DH882487|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-061P05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(49,182,009 - 49,183,174)(49,040,353 - 49,041,371)
sequence
gaattctatattttcaaaactcacttcttactagaattttaaatttttat
ttagtatgatttcattagttacaattcttcactgtaaaatctctaaatgt
atattgacatatttatgatatagcttatttataaacttaattttataatc
ttcagaactttctaatagatatttcttcaaatatgtggctttgtgcttaa
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ttcatttttttcctgtcatgacgtataactcattcacaatcatttcttta
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caaataaatatttcaggaaaggttataggaatcggaaaactaacaccatt
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gaaatttgttttaagatgaaacctgggagctcttgtctttagctgcatag
gtatcaaaagatggcctagtggccatcactgcaaagagaggctcattgaa
cttgcaactttatatgccccagtacaggggaacgccagggccaaaggggg
agtggggtgggtaggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_49182009_49183174
seq2: B6Ng01-061P05.b_49_1200 (reverse)

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      |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||   |||||| |||| 
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      ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||
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      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GAAAATTGTTATGATCTGTACATAGCGGCTTCTAAATCATAGTATGGTAA  141

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      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
seq2  AAAT-TATAAGAAAAACCTATAATCATAGAAAATATCCAAGTAGTT-ATA  189

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      |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||
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      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACACACCCATGTGTGTATCCCAAAATTTCAAAGCAGCAGGATGAGT  586

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAATATATCAGATGATATTTTGATGACGTTTCATTGAAGTCAATCAG  736

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATCTCAGGTTAATACTACATATTCTTTTATTAATGTAAGTTTGTCCC  836

seq1  CAATGCCTGTTGATATTATTTGACTATACTATATAAGTTATTGTGAAGTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGCCTGTTGATATTATTTGACTATACTATATAAGTTATTGTGAAGTA  886

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGGGAAATTACATTATAGGGAAATTACATTAAATTTCATGAAGCAA  936

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAATCATACTAAATAAAAATTTAAAATTCTAGTAAGAAGTGAGTTT  1136

seq1  TGAAAATATAGAATTC  1166
      ||||||||||||||||
seq2  TGAAAATATAGAATTC  1152

seq1: chr1_49040353_49041371
seq2: B6Ng01-061P05.g_69_1084

seq1  GAATTCAAACCAATAAAAGTAATAAATATGTTATAATCTAAAATTACTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATATACATTAATATTAATAAACACAAACCTATGTGATAACCATAAT  100

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTATGGATATTTTAAAAGAAAAATTTTAACAAAAATTATTATTGTTA  150

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGATAGTGCAAAATTTACTTTCAAATTTTACATACTCAAGTATTTTA  250

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GCAAATCTCCCATTTTGCTTTGGGATTTACCTGTAAATTTCTATTTAATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAATCTCCCATTTTGCTTTGGGATTTACCTGTAAATTTCTATTTAATC  350

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTATTTGAACACCTAATCCTTTCTAGTAACAGTATTTTCTTAATAT  400

seq1  GTAATCTGCATTTTAGGTACATGTTCAAAATATTTGCATATCATTTGATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATCTGCATTTTAGGTACATGTTCAAAATATTTGCATATCATTTGATT  450

seq1  ATTCAGTGTTTCAATTTTTATTATTTATTTTAGCATTTTAAATCGTTTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGTGTTTCAATTTTTATTATTTATTTTAGCATTTTAAATCGTTTCA  500

seq1  AATTTTAAAATATGTAATGGGAAAGCTTACTTTATATATTAGTCTTGACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTAAAATATGTAATGGGAAAGCTTACTTTATATATTAGTCTTGACA  550

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GTATCAAAAGATGGCCTAG-TGGCCATCACTGCAAAGAGAGGCTCATTGA  949

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      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||
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seq1  GGGGAGT-GGGTGGGTAGGG  1019
      ||||||| ||||||||||||
seq2  GGGGAGTGGGGTGGGTAGGG  1016