MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-063P11
Chromosome	1 (Build37)
Map Location	27,231,962 - 27,232,896
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	4931408C20Rik
Downstream gene	LOC677427, LOC100040952, EG433281
Link	Open Mouse BAC browser

no map image available.

Click to get alignment info.

BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-063P11.b
ACC	DH883898
length	952
definition	DH883898\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063P11, 5' end.
singlet/doublet	singlet	---
BLAST hit	unique	no hit data
sequence	gaattctcacataaatcttccatcatattccatcctgctgacttatattt gggacaaatttcgcagctgaattccaagataacaaaaaggaatcatacca ggttgttttacttgagtctggatagactaaagctttattgcatctaccag atggatacggggactacagaattataaaagtccacagctatctgaatgaa tatggaatttctcttcactaaattcctaccagttttaatcaccaaggacc actcttgtcagatgttaaggttaacttctggaaagaagacttgactttgg atggatgtttttaaagtagggtcctgtttatatagaatgcataaaggata tgagggttgacaaaatgctaaaggagacattaaatttagagaaaataaaa tggcagtcataagtaggatcataaaaggaagacacatatcaagaccaata cctaaacataataaaagcaatatacagcaaaccagtagccaatatcagaa taaatagagataaactcgaagcaatcccactaaaatcagggactagacaa ggctgtccactttctccctacctattcaacatagtacttgaagtcctagc cagagcaattcgacaacaaaaggaggtcaaggggatacaaattggaaagg aagaagtcaacatatcactatttgcagttgatatgatagtatatataagt gaccccggaaattccaccagagaactcctaaacctgataaacagcttcag tgtagtagctggatataaaattaactaaaacaaatcaatggcctttctct acataaaggataaatggactgagaagaaaattagggaaacaacactcttc acaatagtcacaaaaatataaacaccttgttgtgattataactaaggaag tgaaagatctgtatgaataaaaacttcaagtctctgaagaagaaattgaa gc
quality values	Open. Hide. 61 33 38 39 61 61 61 38 33 43 35 61 61 61 61 47 61 61 61 61 38 24 61 47 38 61 52 55 52 55 37 9 28 27 25 27 50 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 55 55 55 35 35 55 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 53 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 57 57 57 57 57 57 53 57 53 53 57 57 47 33 42 57 53 53 57 57 57 57 57 53 57 57 57 47 52 57 53 57 57 53 46 57 53 57 53 57 57 57 57 53 50 57 57 57 57 53 53 47 57 57 53 46 53 57 52 53 57 57 52 28 57 57 53 57 53 53 47 53 57 57 57 57 57 57 52 53 52 57 53 53 50 57 37 33 53 57 42 47 47 53 52 57 52 52 52 53 35 50 52 24 53 57 52 50 57 53 29 57 36 50 42 38 41 57 57 57 32 26 45 53 37 46 50 53 57 57 47 38 57 52 52 46 34 34 37 52 42 35 42 50 31 50 50 36 53 50 53 52 37 53 50 40 40 34 34 27 37 30 41 33 53 47 41 37 40 40 43 42 35 44 42 35 42 42 40 44 36 37 32 52 36 53 45 34 17 57 41 46 35 53 40 57 37 29 40 31 37 25 45 44 27 18 44 20 41 44 30 44 40 41 40 28 53 37 29 53 40 40 35 29 33 57 44 38 36 32 48 48 39 34 28 33 30 47 30 34 29 32 34 35 41 34 30 45 29 30 24 30 12 51 51 31 17 46 29 30 29 29 27 51 51 30 29 26 51 36 29 34 22 26 29 44 41 23 30 29 51 38 39 31 35 33 28 38 19 48 35 51 35 35 38 28 25 28 51 26 38 41 43 27 33 36 33 29 23 29 32 16 29 51 51 29 28 33 22 26 51 33 29 51 29 28 19 15 22 16 28 36 31 27 28 26 17 29 14 20 20 23 22 29 33 18 26 29 51 51 51 28 28 29 23 30 51 29 22 9 9 24 16 19 40 24 18 20 14 27 33 28 29 28 34 25 24 28 28 23 18 18 12 28 28 19 25 25 25 51 26 15 23 17 31 34 29 17 20 26 21 27 8 9 17 12 51 51 16 24 26 30 25 19 20 22 31 28 31 31 34 20 32 23 14 33 39 10 20 51 20 21 21 31 15 26 12 21

Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr1_27231962_27232896 seq2: B6Ng01-063P11.b_47_980 seq1 GAATTCTCACATAAATCTTCCATCATATTCCATCCTGCTGACTTATATTT 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATTCTCACATAAATCTTCCATCATATTCCATCCTGCTGACTTATATTT 50 seq1 GGGACAAATTTCGCAGCTGAATTCCAAGATAACAAAAAGGAATCATACCA 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGGACAAATTTCGCAGCTGAATTCCAAGATAACAAAAAGGAATCATACCA 100 seq1 GGTTGTTTTACTTGAGTCTGGATAGACTAAAGCTTTATTGCATCTACCAG 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGTTGTTTTACTTGAGTCTGGATAGACTAAAGCTTTATTGCATCTACCAG 150 seq1 ATGGATACGGGGACTACAGAATTATAAAAGTCCACAGCTATCTGAATGAA 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATGGATACGGGGACTACAGAATTATAAAAGTCCACAGCTATCTGAATGAA 200 seq1 TATGGAATTTCTCTTCACTAAATTCCTACCAGTTTTAATCACCAAGGACC 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TATGGAATTTCTCTTCACTAAATTCCTACCAGTTTTAATCACCAAGGACC 250 seq1 ACTCTTGTCAGATGTTAAGGTTAACTTCTGGAAAGAAGACTTGACTTTGG 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACTCTTGTCAGATGTTAAGGTTAACTTCTGGAAAGAAGACTTGACTTTGG 300 seq1 ATGGATGTTTTTAAAGTAGGGTCCTGTTTATATAGAATGCATAAAGGATA 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATGGATGTTTTTAAAGTAGGGTCCTGTTTATATAGAATGCATAAAGGATA 350 seq1 TGAGGGTTGACAAAATGCTAAAGGAGACATTAAATTTAGAGAAAATAAAA 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGAGGGTTGACAAAATGCTAAAGGAGACATTAAATTTAGAGAAAATAAAA 400 seq1 TGGCAGTCATAAGTAGGATCATAAAAGGAAGACACATATCAAGACCAATA 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGGCAGTCATAAGTAGGATCATAAAAGGAAGACACATATCAAGACCAATA 450 seq1 CCTAAACATAATAAAAGCAATATACAGCAAACCAGTAGCCAATATCAGAA 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCTAAACATAATAAAAGCAATATACAGCAAACCAGTAGCCAATATCAGAA 500 seq1 TAAATAGAGATAAACTCGAAGCAATCCCACTAAAATCAGGGACTAGACAA 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAAATAGAGATAAACTCGAAGCAATCCCACTAAAATCAGGGACTAGACAA 550 seq1 GGCTGTCCACTTTCTCCCTACCTATTCAACATAGTACTTGAAGTCCTAGC 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGCTGTCCACTTTCTCCCTACCTATTCAACATAGTACTTGAAGTCCTAGC 600 seq1 CAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGGTCAAGGGGATACAAATTGGAAAGG 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGGTCAAGGGGATACAAATTGGAAAGG 650 seq1 AAGAAGTCAACATATCACTATTTGCAGTTGATATGATAGTATATATAAGT 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAGAAGTCAACATATCACTATTTGCAGTTGATATGATAGTATATATAAGT 700 seq1 GACCCCGGAAATTCCACCAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCAG 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GACCCCGGAAATTCCACCAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCAG 750 seq1 TGTAGTAGCTGGATATAAAATTAACTAAAACAAATCAATGGCCTTTCTCT 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTAGTAGCTGGATATAAAATTAACTAAAACAAATCAATGGCCTTTCTCT 800 seq1 ACATAAAGGATAAATGGACTGAGAAGAAAATTAGGGAAACAACACTCTTC 850 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACATAAAGGATAAATGGACTGAGAAGAAAATTAGGGAAACAACACTCTTC 850 seq1 ACAATAGTCACAAAAAATATAAAACACCTTGTTGTGATTATAACTAAGGA 900 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACAATAGTCAC-AAAAATAT-AAACACCTTGTTGTGATTATAACTAAGGA 898 seq1 AGTGAAAGATCTGTATG-ATAAAAACTTCAAGTCTC 935 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGTGAAAGATCTGTATGAATAAAAACTTCAAGTCTC 934

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr1_27231962_27232896
seq2: B6Ng01-063P11.b_47_980

seq1  GAATTCTCACATAAATCTTCCATCATATTCCATCCTGCTGACTTATATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCACATAAATCTTCCATCATATTCCATCCTGCTGACTTATATTT  50

seq1  GGGACAAATTTCGCAGCTGAATTCCAAGATAACAAAAAGGAATCATACCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACAAATTTCGCAGCTGAATTCCAAGATAACAAAAAGGAATCATACCA  100

seq1  GGTTGTTTTACTTGAGTCTGGATAGACTAAAGCTTTATTGCATCTACCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTTTTACTTGAGTCTGGATAGACTAAAGCTTTATTGCATCTACCAG  150

seq1  ATGGATACGGGGACTACAGAATTATAAAAGTCCACAGCTATCTGAATGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATACGGGGACTACAGAATTATAAAAGTCCACAGCTATCTGAATGAA  200

seq1  TATGGAATTTCTCTTCACTAAATTCCTACCAGTTTTAATCACCAAGGACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAATTTCTCTTCACTAAATTCCTACCAGTTTTAATCACCAAGGACC  250

seq1  ACTCTTGTCAGATGTTAAGGTTAACTTCTGGAAAGAAGACTTGACTTTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTGTCAGATGTTAAGGTTAACTTCTGGAAAGAAGACTTGACTTTGG  300

seq1  ATGGATGTTTTTAAAGTAGGGTCCTGTTTATATAGAATGCATAAAGGATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATGTTTTTAAAGTAGGGTCCTGTTTATATAGAATGCATAAAGGATA  350

seq1  TGAGGGTTGACAAAATGCTAAAGGAGACATTAAATTTAGAGAAAATAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGTTGACAAAATGCTAAAGGAGACATTAAATTTAGAGAAAATAAAA  400

seq1  TGGCAGTCATAAGTAGGATCATAAAAGGAAGACACATATCAAGACCAATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGTCATAAGTAGGATCATAAAAGGAAGACACATATCAAGACCAATA  450

seq1  CCTAAACATAATAAAAGCAATATACAGCAAACCAGTAGCCAATATCAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAACATAATAAAAGCAATATACAGCAAACCAGTAGCCAATATCAGAA  500

seq1  TAAATAGAGATAAACTCGAAGCAATCCCACTAAAATCAGGGACTAGACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATAGAGATAAACTCGAAGCAATCCCACTAAAATCAGGGACTAGACAA  550

seq1  GGCTGTCCACTTTCTCCCTACCTATTCAACATAGTACTTGAAGTCCTAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTCCACTTTCTCCCTACCTATTCAACATAGTACTTGAAGTCCTAGC  600

seq1  CAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGGTCAAGGGGATACAAATTGGAAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGGTCAAGGGGATACAAATTGGAAAGG  650

seq1  AAGAAGTCAACATATCACTATTTGCAGTTGATATGATAGTATATATAAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGTCAACATATCACTATTTGCAGTTGATATGATAGTATATATAAGT  700

seq1  GACCCCGGAAATTCCACCAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCCGGAAATTCCACCAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCAG  750

seq1  TGTAGTAGCTGGATATAAAATTAACTAAAACAAATCAATGGCCTTTCTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGTAGCTGGATATAAAATTAACTAAAACAAATCAATGGCCTTTCTCT  800

seq1  ACATAAAGGATAAATGGACTGAGAAGAAAATTAGGGAAACAACACTCTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAAGGATAAATGGACTGAGAAGAAAATTAGGGAAACAACACTCTTC  850

seq1  ACAATAGTCACAAAAAATATAAAACACCTTGTTGTGATTATAACTAAGGA  900
      ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATAGTCAC-AAAAATAT-AAACACCTTGTTGTGATTATAACTAAGGA  898

seq1  AGTGAAAGATCTGTATG-ATAAAAACTTCAAGTCTC  935
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AGTGAAAGATCTGTATGAATAAAAACTTCAAGTCTC  934

BAC Information

Search Parameter

Search Result

BAC

no map image available.

BAC End Information

Alignment Information