BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-067E18
Chromosome1 (Build37)
Map Location 83,889,758 - 84,038,527
singlet/doubletdoublet
Overlap gene5033414K04Rik
Upstream geneHrb, A030005L19Rik, A030014E15Rik, EG621362, A030003K21Rik, LOC665225, LOC100039524, EG665236, LOC665246, Slc19a3, LOC665196, LOC621495, A030005K14Rik, 5530401N06Rik, EG665272, Ccl20, LOC100039575, 4930563E19Rik, EG621614, 4930544G21Rik, EG622958
Downstream geneLOC100039638, Dner, Trip12, Fbxo36, Slc16a14, LOC100039695, EG665317
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-067E18.bB6Ng01-067E18.g
ACCDH886228DH886229
length784719
definitionDH886228|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067E18, 5' end.DH886229|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067E18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,037,745 - 84,038,527)(83,889,758 - 83,890,476)
sequence
gaattctctgtataacttttagaaagaagtgtgtgtgtgtgtgtgcatat
gagagaaagctgaaaatatatccaaagaattccccttctaccagactacc
tttctctcacatataaacttgattatttctagtttcaaaaagtagaatga
atgaatatactttgtattttccctttaggtacccaaattagttgtttcct
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtatgtacatacatagaatac
atagaatacatacaacaggatgctccagcaccctcacctccactgagcca
cttaactcttacaggattctaaaacagacactcagaatcccccaagcaag
agcagccaatcattgtgcctcaagcttccatctcccaccaatctagtttt
tgtctctgtgattgtgactgttttaatgtgataaattacagtcttcatct
actttgtgactgacttattatgttgaacattaacagtctcagattttatc
catgtggtagcacatgcaagtgtttcctccccttggcactaaataatatt
tcactgtatatgcatattcacttggatgatgctgggcattgggttctttc
catactttaactgtttaggctcagtgggtcctttgatcttgaacatgtaa
attatctcattaagatgcagcaatttgctcttttgagaaggacaaatgag
tcatgtgaatcaaaatcagttttgactttttgatgaactactgtagtgtt
tgtataggttcaatgaacccacaattaaaggcca
gaattcatgggagagcacaatacgaaggtgaagatgatgtaattaaacaa
ctttgtttaattaaaacaaaaaagtattaagataattttcaaaaatttca
atacactttcctatcaactactagtataaaagtatttcaagcacgtcaat
ggagctgagcacttctgcttgcatgagcaagtgttattagtgagatatac
attaagaatcttgccacatgagggctggagagatgtcttagcagttaaga
gcactggctgctcttccaaaggacctgagaaattcagttcctagcaccca
catggcagctaggaaccatctgtaattccagttccagagtactggatgcc
ctcatctggcatctgtaggcactacttctattactactactactactact
actactactactactagtactactactactactactgctactactactac
tactcacacacacacacacacacacacacacacacacacaaatacacaca
cacacacaaatacacacacacagttgacagacatacatgcaggcaaatac
ccacttgcaattaatacctgctgggaacggaaagtcagttttctccaatg
aaataacactgtgtatagtatatatcaaccagatttcagggcaggtccca
cgctcagaaatagttggccagcacaaaccaaattgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtaatgtttttgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_84037745_84038527
seq2: B6Ng01-067E18.b_46_829 (reverse)

seq1  TGGCCTCTAATTGTGGGTTCATTGAACCTATACAAACACTACAGTAGTTC  50
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTTTAATTGTGGGTTCATTGAACCTATACAAACACTACAGTAGTTC  50

seq1  ATCAAAAAGTCAAAACTGATTTTGATTCACATGACTCATTTGTCCTTCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAAAGTCAAAACTGATTTTGATTCACATGACTCATTTGTCCTTCTC  100

seq1  AAAAGAGCAAATTGCTGCATCTTAATGAGATAATTTACATGTTCAAGATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAGCAAATTGCTGCATCTTAATGAGATAATTTACATGTTCAAGATC  150

seq1  AAAGGACCCACTGAGCCT-AACAGTTAAAGTATGGAAAGAACCCAATGCC  199
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGACCCACTGAGCCTAAACAGTTAAAGTATGGAAAGAACCCAATGCC  200

seq1  CAGCATCATCCAAGTGAATATGCATATACAGTGAAATATTATTTAGTGCC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATCATCCAAGTGAATATGCATATACAGTGAAATATTATTTAGTGCC  250

seq1  AAGGGGAGGAAACACTTGCATGTGCTACCACATGGATAAAATCTGAGACT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGGAGGAAACACTTGCATGTGCTACCACATGGATAAAATCTGAGACT  300

seq1  GTTAATGTTCAACATAATAAGTCAGTCACAAAGTAGATGAAGACTGTAAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATGTTCAACATAATAAGTCAGTCACAAAGTAGATGAAGACTGTAAT  350

seq1  TTATCACATTAAAACAGTCACAATCACAGAGACAAAAACTAGATTGGTGG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCACATTAAAACAGTCACAATCACAGAGACAAAAACTAGATTGGTGG  400

seq1  GAGATGGAAGCTTGAGGCACAATGATTGGCTGCTCTTGCTTGGGGGATTC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGGAAGCTTGAGGCACAATGATTGGCTGCTCTTGCTTGGGGGATTC  450

seq1  TGAGTGTCTGTTTTAGAATCCTGTAAGAGTTAAGTGGCTCAGTGGAGGTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGTCTGTTTTAGAATCCTGTAAGAGTTAAGTGGCTCAGTGGAGGTG  500

seq1  AGGGTGCTGGAGCATCCTGTTGTATGTATTCTATGTATTCTATGTATGTA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGCTGGAGCATCCTGTTGTATGTATTCTATGTATTCTATGTATGTA  550

seq1  CATACAAACACACACACACACACACACACACACAAGGAAACAACTAATTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACAAACACACACACACACACACACACACACAAGGAAACAACTAATTT  600

seq1  GGGTACCTAAAGGGAAAATACAAAGTATATTCATTCATTCTACTTTTTGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTACCTAAAGGGAAAATACAAAGTATATTCATTCATTCTACTTTTTGA  650

seq1  AACTAGAAATAATCAAGTTTATATGTGAGAGAAAGGTAGTCTGGTAGAAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAGAAATAATCAAGTTTATATGTGAGAGAAAGGTAGTCTGGTAGAAG  700

seq1  GGGAATTCTTTGGATATATTTTCAGCTTTCTCTCATATGCACACACACAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAATTCTTTGGATATATTTTCAGCTTTCTCTCATATGCACACACACAC  750

seq1  ACACACTTCTTTCTAAAAGTTATACAGAGAATTC  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTTCTTTCTAAAAGTTATACAGAGAATTC  784

seq1: chr1_83889758_83890476
seq2: B6Ng01-067E18.g_67_785

seq1  GAATTCATGGGAGAGCACAATACGAAGGTGAAGATGATGTAATTAAACAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGGGAGAGCACAATACGAAGGTGAAGATGATGTAATTAAACAA  50

seq1  CTTTGTTTAATTAAAACAAAAAAGTATTAAGATAATTTTCAAAAATTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTTTAATTAAAACAAAAAAGTATTAAGATAATTTTCAAAAATTTCA  100

seq1  ATACACTTTCCTATCAACTACTAGTATAAAAGTATTTCAAGCACGTCAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACTTTCCTATCAACTACTAGTATAAAAGTATTTCAAGCACGTCAAT  150

seq1  GGAGCTGAGCACTTCTGCTTGCATGAGCAAGTGTTATTAGTGAGATATAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTGAGCACTTCTGCTTGCATGAGCAAGTGTTATTAGTGAGATATAC  200

seq1  ATTAAGAATCTTGCCACATGAGGGCTGGAGAGATGTCTTAGCAGTTAAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGAATCTTGCCACATGAGGGCTGGAGAGATGTCTTAGCAGTTAAGA  250

seq1  GCACTGGCTGCTCTTCCAAAGGACCTGAGAAATTCAGTTCCTAGCACCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGGCTGCTCTTCCAAAGGACCTGAGAAATTCAGTTCCTAGCACCCA  300

seq1  CATGGCAGCTAGGAACCATCTGTAATTCCAGTTCCAGAGTACTGGATGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCAGCTAGGAACCATCTGTAATTCCAGTTCCAGAGTACTGGATGCC  350

seq1  CTCATCTGGCATCTGTAGGCACTACTTCTATTACTACTACTACTACTACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATCTGGCATCTGTAGGCACTACTTCTATTACTACTACTACTACTACT  400

seq1  ACTACTACTACTACTAGTACTACTACTACTACTACTGCTACTACTACTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTACTACTACTAGTACTACTACTACTACTACTGCTACTACTACTAC  450

seq1  TACTCACACACACACACACACACACACACACACACACACAAATACACACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCACACACACACACACACACACACACACACACACACAAATACACACA  500

seq1  CACACACAAATACACACACACAGTTGACAGACATACATGCAGGCAAATAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACAAATACACACACACAGTTGACAGACATACATGCAGGCAAATAC  550

seq1  CCACTTGCAATTAATACCTGCTGGGAACGGAAAGTCAGTTTTCTCCAATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTGCAATTAATACCTGCTGGGAACGGAAAGTCAGTTTTCTCCAATG  600

seq1  AAATAACACTGTGTATAGTATATATCAACCAGATTTCAGGGCAGGTCCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAACACTGTGTATAGTATATATCAACCAGATTTCAGGGCAGGTCCCA  650

seq1  CGCTCAGAAATAGTTGGCCAGCACAAACCAAATTGTGTGTGTGTGTGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTCAGAAATAGTTGGCCAGCACAAACCAAATTGTGTGTGTGTGTGTGT  700

seq1  GTGTGTGTAATGTTTTTGG  719
      |||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTAATGTTTTTGG  719