BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-074B02
Chromosome1 (Build37)
Map Location 126,017,844 - 126,146,899
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC666983, Dpp10
Downstream geneLOC666998
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-074B02.bB6Ng01-074B02.g
ACCDH891019DH891020
length1,183272
definitionDH891019|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074B02, 5' end.DH891020|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074B02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,017,844 - 126,019,045)(126,146,628 - 126,146,899)
sequence
gaattcatctaaatcaggttaagcaataatcatgtcagtggaggattgta
ttaattaattgatgtgagaagacccaactctttgggggcagcactatccc
ttaggtaaaggatactgacttgaataagagtgggaaaattgggcagagcc
aaaatatgcatgcacacattccttctgtgttcttgtggatagaatgtggc
cagctctttcaagttcctgccattatatacatgaactataaccaggaatt
atgacctaaaataaacaaattctcttttaagttgcctttgtcatactaat
ttatcactgcaatgggaaagaaaaccaggtcaatgaccaagactcagact
atcctggttctggtagtatttttagacctgggtcaggtcctttctagagt
caaattaaggagagtatggtggcttggatgagaaatggcccccatagatt
catgtgtttggatacttgcatcccagttggagttactgtttaggaatatt
atgatacctttaagaggtatagccactctacaggaaatatatcactggtg
gtgggctttgacgatttatagcctgctcgcatttcctgttctaccctcaa
cactacctttgacctgtgtgtacatgaaatgtaatatgtttgctttcagc
tccagctgatatgccttccctctgcacccatgatggtctctatagttttg
gaaccacaaaccaaaatgaatgctttcatttatgagttgttttggtcatg
gtattttatcacagcataaaaaagtagctgacatacacagttgagacact
ttgtgttttccatgtgtctaatgattgacttgtgaattaagtatcaaatg
tcctccatacatgaatttgaacattgtttcctagttggtaatactttttg
tagagtacatggagcacataggaagtggagccttgtagaggagatacatc
attggaaatgggtttctaggtttattgtctcactcacttcctgttctctc
tggatcctggtgaagatggaatgtgatatttgtgttcatactctagaatg
ctatgtcttctcctatgtttcccatgaaagactgtaccaccaagccaaat
taataattgtttacaagtgatttgctctagtatttaatcacgcacagaaa
gtaacagtactgacctatgggagtcagtctatt
aatgttaactgagagtaggcaagcttagcttgtgaaagatgttgacagtg
ggagtaaacaaaggccaataagaaagcagaattgaaaataagaggggtaa
cttggggatgtctactgatggtagtgatgtgtatggagaggattttaggt
ttggatgtttatagacgcagagtaaaagtctaagcaaaggtgggaaggaa
cctttagtaaaatatgggagaatatatttaattaaatatataaatgtggg
gattattatagtagtgttgggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_126017844_126019045
seq2: B6Ng01-074B02.b_44_1226

seq1  GAATTCATCTAAATCAGGTTAAGCAATAATCATGTCAGTGGAGGATTGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCTAAATCAGGTTAAGCAATAATCATGTCAGTGGAGGATTGTA  50

seq1  TTAATTAATTGATGTGAGAAGACCCAACTCTTTGGGGGCAGCACTATCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTAATTGATGTGAGAAGACCCAACTCTTTGGGGGCAGCACTATCCC  100

seq1  TTAGGTAAAGGATACTGACTTGAATAAGAGTGGGAAAATTGGGCAGAGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGTAAAGGATACTGACTTGAATAAGAGTGGGAAAATTGGGCAGAGCC  150

seq1  AAAATATGCATGCACACATTCCTTCTGTGTTCTTGTGGATAGAATGTGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATGCATGCACACATTCCTTCTGTGTTCTTGTGGATAGAATGTGGC  200

seq1  CAGCTCTTTCAAGTTCCTGCCATTATATACATGAACTATAACCAGGAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTCTTTCAAGTTCCTGCCATTATATACATGAACTATAACCAGGAATT  250

seq1  ATGACCTAAAATAAACAAATTCTCTTTTAAGTTGCCTTTGTCATACTAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCTAAAATAAACAAATTCTCTTTTAAGTTGCCTTTGTCATACTAAT  300

seq1  TTATCACTGCAATGGGAAAGAAAACCAGGTCAATGACCAAGACTCAGACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCACTGCAATGGGAAAGAAAACCAGGTCAATGACCAAGACTCAGACT  350

seq1  ATCCTGGTTCTGGTAGTATTTTTAGACCTGGGTCAGGTCCTTTCTAGAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGGTTCTGGTAGTATTTTTAGACCTGGGTCAGGTCCTTTCTAGAGT  400

seq1  CAAATTAAGGAGAGTATGGTGGCTTGGATGAGAAATGGCCCCCATAGATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTAAGGAGAGTATGGTGGCTTGGATGAGAAATGGCCCCCATAGATT  450

seq1  CATGTGTTTGGATACTTGCATCCCAGTTGGAGTTACTGTTTAGGAATATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTTTGGATACTTGCATCCCAGTTGGAGTTACTGTTTAGGAATATT  500

seq1  ATGATACCTTTAAGAGGTATAGCCACTCTACAGGAAATATATCACTGGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATACCTTTAAGAGGTATAGCCACTCTACAGGAAATATATCACTGGTG  550

seq1  GTGGGCTTTGACGATTTATAGCCTGCTCGCATTTCCTGTTCTACCCTCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGCTTTGACGATTTATAGCCTGCTCGCATTTCCTGTTCTACCCTCAA  600

seq1  CACTACCTTTGACCTGTGTGTACATGAAATGTAATATGTTTGCTTTCAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTACCTTTGACCTGTGTGTACATGAAATGTAATATGTTTGCTTTCAGC  650

seq1  TCCAGCTGATATGCCTTCCCTCTGCACCCATGATGGTCTCTATAGTTTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTGATATGCCTTCCCTCTGCACCCATGATGGTCTCTATAGTTTTG  700

seq1  GAACCACAAACCAAAATGAATGCTTTCATTTATGAGTTGTTTTGGTCATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCACAAACCAAAATGAATGCTTTCATTTATGAGTTGTTTTGGTCATG  750

seq1  GTATTTTATCACAGCATAAAAAAGTAGCTGACATACACAGTTGAGACACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTTATCACAGCATAAAAAAGTAGCTGACATACACAGTTGAGACACT  800

seq1  TTGTGTTTTCCATGTGTCTAATGATTGACTTGTGAATTAAGTATCAAATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTTTTCCATGTGTCTAATGATTGACTTGTGAATTAAGTATCAAATG  850

seq1  TCCTCCATACATGAATTTGAACATTGTTTCCTAGTTGGTAATACTTTTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCATACATGAATTTGAACATTGTTTCCTAGTTGGTAATACTTTTTG  900

seq1  TAGAGTACATGGAGCACATAGGAAGTGGAGCCTTGTAAGAGGAGATACAT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TAGAGTACATGGAGCACATAGGAAGTGGAGCCTTGT-AGAGGAGATACAT  949

seq1  CATTGGAAATGGGTTTCTAGGTTTATTGTCTCACCTCACTTCCTGTTCTC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CATTGGAAATGGGTTTCTAGGTTTATTGTCTCA-CTCACTTCCTGTTCTC  998

seq1  TCTGGATCCTGGGTGAAGATGGAATGTGATATTTGTGTTTCATACTCTAG  1050
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TCTGGATCCT-GGTGAAGATGGAATGTGATATTTGTG-TTCATACTCTAG  1046

seq1  -ATGCTATGTCTTCTTCCTATG-TTCCCATGATAGACTGTAACCACAAGC  1098
       ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||
seq2  AATGCTATGTCTTC-TCCTATGTTTCCCATGAAAGACTGTACCACCAAGC  1095

seq1  CAAAATTAATAATTTGGTTTACAAGTTGATTTTGGTCTTAGTATTTTATC  1148
      | ||||||||||||  ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||
seq2  C-AAATTAATAATT--GTTTACAAG-TGA-TTTGCTC-TAGTATTTAATC  1139

seq1  ACAGCAACAGGAAAGTAACCAGTACTGACTAGTGGGAGGGTATAAATGTC  1198
      || || ||| |||||||| ||||||||||   ||||||    | |  |||
seq2  AC-GC-ACA-GAAAGTAA-CAGTACTGACCTATGGGAG----TCA--GTC  1179

seq1  TATT  1202
      ||||
seq2  TATT  1183

seq1: chr1_126146628_126146899
seq2: B6Ng01-074B02.g_78_349 (reverse)

seq1  ACCCAACACTACTATAATAATCCCCACATTTATATATTTAATTAAATATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAACACTACTATAATAATCCCCACATTTATATATTTAATTAAATATA  50

seq1  TTCTCCCATATTTTACTAAAGGTTCCTTCCCACCTTTGCTTAGACTTTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCCATATTTTACTAAAGGTTCCTTCCCACCTTTGCTTAGACTTTTA  100

seq1  CTCTGCGTCTATAAACATCCAAACCTAAAATCCTCTCCATACACATCACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCGTCTATAAACATCCAAACCTAAAATCCTCTCCATACACATCACT  150

seq1  ACCATCAGTAGACATCCCCAAGTTACCCCTCTTATTTTCAATTCTGCTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATCAGTAGACATCCCCAAGTTACCCCTCTTATTTTCAATTCTGCTTT  200

seq1  CTTATTGGCCTTTGTTTACTCCCACTGTCAACATCTTTCACAAGCTAAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTGGCCTTTGTTTACTCCCACTGTCAACATCTTTCACAAGCTAAGC  250

seq1  TTGCCTACTCTCAGTTAACATT  272
      ||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTACTCTCAGTTAACATT  272