MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-078N05
Chromosome	1 (Build37)
Map Location	54,205,531 - 54,206,682
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	Hecw2
Upstream gene	1700019A02Rik, Pms1, LOC671024, Ormdl1, Osgepl1, Asnsd1, EG627858, EG627866, LOC100042162, Dnahc7, Stk17b
Downstream gene	4930511H11Rik, Gtf3c3, EG627915, D230012E17Rik, Ankrd44, Sf3b1, Coq10b, Hspd1, Hspe1, LOC381258, Prei3
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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-078N05.b	B6Ng01-078N05.g
ACC	DH894419	DH894420
length	1,144	737
definition	DH894419\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-078N05, 5' end.	DH894420\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-078N05, 3' end.
singlet/doublet	singlet	---
BLAST hit	unique	no hit data
sequence	gaattcaaagttatcctctgttacacagagagtttaagttcaccatgcac tacatgagaccctgtgaattgcttagagacccatcaggagcgccttatct ttccatgaagggctataacaggcacattcacacggctggatactgtactc agatgtaattggtttgcaagattttggctgtccaatgtcaagtgtaactt tacctgaattctatctgtacaatgattttgtcttttaagcaagcaaagaa cagctatcaactttctctactatcaaattcacaaactaagctgtagatct atttttatacactcttacaaggaagacttacttttacatatagggcaaga tcattgctgtgagatttttagtcttcgcctatccctaattacagccattg atagtttgaagtataaactcagggatccattacacaaactaaaaggtcaa gagcttgaataaggatattttaatatttcacatttaatagcacagacatt agaaatccagggttcaaaggcttcccttctaattccacatccttaattct ggctcttactacagcagggagaaagagtaatggagaacacgccctttacc accagctggactttatcatgtaatcaggactagtttcaaaagaaataagt ctctatgccaatgagagaggtacaagaggatggaaattatgccatcatat accatctggggtcttctttcccagcacttgtggaaagttgaatggagtct gccttcagaccttggatgaaagcaacaatatcaagaagagatatgatatg atgccttacataaaacaaaggtttacaaaacaaagggggggaaagacact ggcaaagctctgaaagatcattaggtaactaattattaaacaattaatta atactaattaattaattgataagagctagatggcctgagaataaaccata tcatagctcctagtcttcttcaatcaacttaaaattcttcaatccattaa aaattcctgaattcttgtgaggaaagtagtcacctgcctccacttgaaaa gccccaccaggcactctgatagtaaaaacatggaataaaagatgaagaac atccctcttcagtctccgacctctagcttaatatagctcataaa	gaattctctatttagctctgtaccccattttttaatggggttattcgaat ttctggagtccagcttcttgagcactttgtatatattgggtattagttct ctatcaggtttagaattggtaaaaatcctttcccaatctgttggtggcct ttttgtcttattgacagtgtcttttgccttacagaagctttgcaatttta tgaggttccatttgtcgattctcgatcttacagcacaagccattgctgtc ctgtttaggaatttttcccctgtgcccatatcttcgagggttttccccac tttctcttctattaatttcagtgtctctggttttatgtggacttccttga tccacttagacttgagctttgtacaaagagataagaatggatcctatcga aaggacccagatgtagctgtctcttgtgagactatgccggggcctagcaa acacataagtggatgctcacagtcagctaatagatggatcacagggctcc caatggaggagctagagaaagtacccaaggagctaaagggatctgcaacc ctataggtggaacaacattatgaactaaccagtaccccggagctcttgac tctagctgcatatgtatcaaaagacggcctagtcggccatcactggaaag agaggcccattggacttgcaaactttatatgccccagtacaggggaacgc cagggccaaaaagggggagtgggtgggtaggggagtg
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr1_54205531_54206682 seq2: B6Ng01-078N05.b_46_1189 seq1 GAATTCAAAGTTATCCTCTGTTACACAGAGAGTTTAAGTTCACCATGCAC 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATTCAAAGTTATCCTCTGTTACACAGAGAGTTTAAGTTCACCATGCAC 50 seq1 TACATGAGACCCTGTGAATTGCTTAGAGACCCATCAGGAGCGCCTTATCT 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TACATGAGACCCTGTGAATTGCTTAGAGACCCATCAGGAGCGCCTTATCT 100 seq1 TTCCATGAAGGGCTATAACAGGCACATTCACACGGCTGGATACTGTACTC 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTCCATGAAGGGCTATAACAGGCACATTCACACGGCTGGATACTGTACTC 150 seq1 AGATGTAATTGGTTTGCAAGATTTTGGCTGTCCAATGTCAAGTGTAACTT 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGATGTAATTGGTTTGCAAGATTTTGGCTGTCCAATGTCAAGTGTAACTT 200 seq1 TACCTGAATTCTATCTGTACAATGATTTTGTCTTTTAAGCAAGCAAAGAA 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TACCTGAATTCTATCTGTACAATGATTTTGTCTTTTAAGCAAGCAAAGAA 250 seq1 CAGCTATCAACTTTCTCTACTATCAAATTCACAAACTAAGCTGTAGATCT 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAGCTATCAACTTTCTCTACTATCAAATTCACAAACTAAGCTGTAGATCT 300 seq1 ATTTTTATACACTCTTACAAGGAAGACTTACTTTTACATATAGGGCAAGA 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTTTTATACACTCTTACAAGGAAGACTTACTTTTACATATAGGGCAAGA 350 seq1 TCATTGCTGTGAGATTTTTAGTCTTCGCCTATCCCTAATTACAGCCATTG 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCATTGCTGTGAGATTTTTAGTCTTCGCCTATCCCTAATTACAGCCATTG 400 seq1 ATAGTTTGAAGTATAAACTCAGGGATCCATTACACAAACTAAAAGGTCAA 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATAGTTTGAAGTATAAACTCAGGGATCCATTACACAAACTAAAAGGTCAA 450 seq1 GAGCTTGAATAAGGATATTTTAATATTTCACATTTAATAGCACAGACATT 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAGCTTGAATAAGGATATTTTAATATTTCACATTTAATAGCACAGACATT 500 seq1 AGAAATCCAGGGTTCAAAGGCTTCCCTTCTAATTCCACATCCTTAATTCT 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGAAATCCAGGGTTCAAAGGCTTCCCTTCTAATTCCACATCCTTAATTCT 550 seq1 GGCTCTTACTACAGCAGGGAGAAAGAGTAATGGAGAACACGCCCTTTACC 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGCTCTTACTACAGCAGGGAGAAAGAGTAATGGAGAACACGCCCTTTACC 600 seq1 ACCAGCTGGACTTTATCATGTAATCAGGACTAGTTTCAAAAGAAATAAGT 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACCAGCTGGACTTTATCATGTAATCAGGACTAGTTTCAAAAGAAATAAGT 650 seq1 CTCTATGCCAATGAGAGAGGTACAAGAGGATGGAAATTATGCCATCATAT 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTCTATGCCAATGAGAGAGGTACAAGAGGATGGAAATTATGCCATCATAT 700 seq1 ACCATCTGGGGTCTTCTTTCCCAGCACTTGTGGAAAGTTGAATGGAGTCT 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACCATCTGGGGTCTTCTTTCCCAGCACTTGTGGAAAGTTGAATGGAGTCT 750 seq1 GCCTTCAGACCTTGGATGAAAGCAACAATATCAAGAAGAGATATGATATG 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCCTTCAGACCTTGGATGAAAGCAACAATATCAAGAAGAGATATGATATG 800 seq1 ATGCCTTACATAAAACAAAGGTTTACAAAACAAGGGGGGGGAAAGACACT 850 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATGCCTTACATAAAACAAAGGTTTACAAAACAAAGGGGGGGAAAGACACT 850 seq1 GGCAAAGCTCTGAAAGATCATTAGGTAACTAATTATTAAACAATTAATTA 900 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGCAAAGCTCTGAAAGATCATTAGGTAACTAATTATTAAACAATTAATTA 900 seq1 ATACTAATTAATTAATTGATAAGAGCTAGATGGCCTGAGAATAAACCATA 950 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATACTAATTAATTAATTGATAAGAGCTAGATGGCCTGAGAATAAACCATA 950 seq1 TCATAGCTCCTAGTCTTCTTCAATCAACTTAAAAATTCTTCAATCCATTA 1000 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCATAGCTCCTAGTCTTCTTCAATCAACTT-AAAATTCTTCAATCCATTA 999 seq1 AAAATTCCTGAATTCTTGTGAGGAAAGTAGTCACCTG-CTCCACTTTGAA 1049 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| seq2 AAAATTCCTGAATTCTTGTGAGGAAAGTAGTCACCTGCCTCCAC-TTGAA 1048 seq1 AAGCCCCAACCAGGGCACTCTGATAAGTAAAGACATGGATTAAAAGATGA 1099 \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAGCCCC-ACCA-GGCACTCTGAT-AGTAAAAACATGGAATAAAAGATGA 1095 seq1 AGGAACATCCCTC-TCAGTCTTCCAGACTCTAGCTTTATTATAGCTTCCA 1148 \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| seq2 A-GAACATCCCTCTTCAGTC-TCCGACCTCTAGC-TTAATATAGCT--CA 1140 seq1 TAAA 1152 \|\|\|\| seq2 TAAA 1144

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr1_54205531_54206682
seq2: B6Ng01-078N05.b_46_1189

seq1  GAATTCAAAGTTATCCTCTGTTACACAGAGAGTTTAAGTTCACCATGCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGTTATCCTCTGTTACACAGAGAGTTTAAGTTCACCATGCAC  50

seq1  TACATGAGACCCTGTGAATTGCTTAGAGACCCATCAGGAGCGCCTTATCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGAGACCCTGTGAATTGCTTAGAGACCCATCAGGAGCGCCTTATCT  100

seq1  TTCCATGAAGGGCTATAACAGGCACATTCACACGGCTGGATACTGTACTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATGAAGGGCTATAACAGGCACATTCACACGGCTGGATACTGTACTC  150

seq1  AGATGTAATTGGTTTGCAAGATTTTGGCTGTCCAATGTCAAGTGTAACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTAATTGGTTTGCAAGATTTTGGCTGTCCAATGTCAAGTGTAACTT  200

seq1  TACCTGAATTCTATCTGTACAATGATTTTGTCTTTTAAGCAAGCAAAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGAATTCTATCTGTACAATGATTTTGTCTTTTAAGCAAGCAAAGAA  250

seq1  CAGCTATCAACTTTCTCTACTATCAAATTCACAAACTAAGCTGTAGATCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTATCAACTTTCTCTACTATCAAATTCACAAACTAAGCTGTAGATCT  300

seq1  ATTTTTATACACTCTTACAAGGAAGACTTACTTTTACATATAGGGCAAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTATACACTCTTACAAGGAAGACTTACTTTTACATATAGGGCAAGA  350

seq1  TCATTGCTGTGAGATTTTTAGTCTTCGCCTATCCCTAATTACAGCCATTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGCTGTGAGATTTTTAGTCTTCGCCTATCCCTAATTACAGCCATTG  400

seq1  ATAGTTTGAAGTATAAACTCAGGGATCCATTACACAAACTAAAAGGTCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTTGAAGTATAAACTCAGGGATCCATTACACAAACTAAAAGGTCAA  450

seq1  GAGCTTGAATAAGGATATTTTAATATTTCACATTTAATAGCACAGACATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTTGAATAAGGATATTTTAATATTTCACATTTAATAGCACAGACATT  500

seq1  AGAAATCCAGGGTTCAAAGGCTTCCCTTCTAATTCCACATCCTTAATTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATCCAGGGTTCAAAGGCTTCCCTTCTAATTCCACATCCTTAATTCT  550

seq1  GGCTCTTACTACAGCAGGGAGAAAGAGTAATGGAGAACACGCCCTTTACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCTTACTACAGCAGGGAGAAAGAGTAATGGAGAACACGCCCTTTACC  600

seq1  ACCAGCTGGACTTTATCATGTAATCAGGACTAGTTTCAAAAGAAATAAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCTGGACTTTATCATGTAATCAGGACTAGTTTCAAAAGAAATAAGT  650

seq1  CTCTATGCCAATGAGAGAGGTACAAGAGGATGGAAATTATGCCATCATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATGCCAATGAGAGAGGTACAAGAGGATGGAAATTATGCCATCATAT  700

seq1  ACCATCTGGGGTCTTCTTTCCCAGCACTTGTGGAAAGTTGAATGGAGTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATCTGGGGTCTTCTTTCCCAGCACTTGTGGAAAGTTGAATGGAGTCT  750

seq1  GCCTTCAGACCTTGGATGAAAGCAACAATATCAAGAAGAGATATGATATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCAGACCTTGGATGAAAGCAACAATATCAAGAAGAGATATGATATG  800

seq1  ATGCCTTACATAAAACAAAGGTTTACAAAACAAGGGGGGGGAAAGACACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ATGCCTTACATAAAACAAAGGTTTACAAAACAAAGGGGGGGAAAGACACT  850

seq1  GGCAAAGCTCTGAAAGATCATTAGGTAACTAATTATTAAACAATTAATTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAAGCTCTGAAAGATCATTAGGTAACTAATTATTAAACAATTAATTA  900

seq1  ATACTAATTAATTAATTGATAAGAGCTAGATGGCCTGAGAATAAACCATA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTAATTAATTAATTGATAAGAGCTAGATGGCCTGAGAATAAACCATA  950

seq1  TCATAGCTCCTAGTCTTCTTCAATCAACTTAAAAATTCTTCAATCCATTA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TCATAGCTCCTAGTCTTCTTCAATCAACTT-AAAATTCTTCAATCCATTA  999

seq1  AAAATTCCTGAATTCTTGTGAGGAAAGTAGTCACCTG-CTCCACTTTGAA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
seq2  AAAATTCCTGAATTCTTGTGAGGAAAGTAGTCACCTGCCTCCAC-TTGAA  1048

seq1  AAGCCCCAACCAGGGCACTCTGATAAGTAAAGACATGGATTAAAAGATGA  1099
      ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||
seq2  AAGCCCC-ACCA-GGCACTCTGAT-AGTAAAAACATGGAATAAAAGATGA  1095

seq1  AGGAACATCCCTC-TCAGTCTTCCAGACTCTAGCTTTATTATAGCTTCCA  1148
      | ||||||||||| |||||| |||   ||||||| ||| |||||||  ||
seq2  A-GAACATCCCTCTTCAGTC-TCCGACCTCTAGC-TTAATATAGCT--CA  1140

seq1  TAAA  1152
      ||||
seq2  TAAA  1144

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