BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-083L21
Chromosome1 (Build37)
Map Location 45,701,696 - 45,830,455
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG666819
Upstream geneGulp1, LOC100041738, LOC100041752, LOC383640, Col3a1, Col5a2, EG666799, LOC631429, LOC666814
Downstream geneWdr75, EG433297, LOC383644, Slc40a1, LOC670603, EG227054, LOC100042453, EG212225, Dnahc7b, LOC666855
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-083L21.bB6Ng01-083L21.g
ACCDH897917DH897918
length1,149847
definitionDH897917|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-083L21, 5' end.DH897918|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-083L21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(45,829,304 - 45,830,455)(45,701,696 - 45,702,421)
sequence
gaattctctgttttcgcggggtctatgtgtgtatagttatacacacatag
tcatacacacatagactccatgacctgttcaagaaatactgctgggcttt
taccgatttcctgcctagcatcatactgaaaccttggccaaattgttttt
aaaacctgctgaaagagcctggtggtaagtctggagatgttcccttcctt
cagccgtggtgaagtccaagtctgggtgggtttctctggggggggggcag
aaacttgtttcttggcgtctgtctgtggtgaagaaaacctgcaagagctt
tggctaggtgactgtacagagtacctaaggcacatggcaaagagtggtta
ttgcttctcagtgggctgaatgtggcaggatagtgtcagtggagaccctc
tcttcacaactccgataccacatctgctcaggcaaggagtgagcacttct
cctggcaagaagggtagccatttactgagcaaagtgagtgaccaggagtc
tgttccaagctctggtgagagatacatctgccaacttggggcctctcctg
cctagtctgtccagctaaggagccctgctctctgaaaactcacctcccca
ctcagggagagcccactcagggctgcaggaggccccagccttagactttt
ttttaaggggcgctggatgcctgtgtgcctacactagggagagggggagg
aggatgttgagaaaaaaggaagtcaccaagttgttgctggaaattgaact
caggaccaatttaatattagttagtattcttaagctctgctccatctctc
cagcctacttcttgttcccagctcaggtgcccctctcaaccctaaaactg
acagacaccactgggaaaggtggcagggctggagttggctgctgggcttg
gggctgtctttctgtcgttccttgtcattctgtggcttctccttgttaat
gaagagcatttagaagtgggcaggagaaagttttgaaacaagtttatctt
ctactgcccacacttggggggaatggaagggtcccctctggtgtctgtct
caactacaaagtcttgccctcaagcctgcaataaggggctcagccctaca
cttcccttaaattaatccaataagataaggtacagacaagtctgtctgt
gaattccaaagatggaacctttgctaatgaggagaacaccagagggccac
ttgcccaatgacagaaaacaaacaaacaaacaaacttacaacatttttct
cctggaaggaggcctaagactctctctccttgtgtgagctaggatcctgg
actcagattccaaattgttagaaataagtttgtggtcttaaagaaagaga
tcattattctaactaaagtgtttagatatggggcagtgaaccatgccagg
aaacctggtaaggtttagaagccctagaacccagtcagggatggtaggag
cttcacctgcttctgaccaggcccttgtcccctgtcacatgaccacagca
tcccatggagaagattgtgattatcagtcaagtagggacagctccttcaa
gcccctccacatgcagatgagacatccctaacatctaagaccaagctaat
agaaagcatctgctgtcagaccccaacccaacccaaaagtctatataaga
tcctatccagaaggaataaaagtgtgtgaaaatttcttcatcacctgaga
gcatctgtcatataagagtgtgaggagcaggagtggcagcagtcccaaga
tggcacccgggactgcagccaaatctaatgacttgcacctgacttcctta
tacaccctgattaagccatgtccactgggtgaactgcgcaggtacaccat
gatgcaagattggaccatatgacaagtggtgattctggccaatagactgc
tgttatgtggactgggctgatggggcgtggtagaggggttatataaggga
ttgcaattgggggctagagagattttttttcctgcatgcatggtgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_45829304_45830455
seq2: B6Ng01-083L21.b_49_1197 (reverse)

seq1  ACAGACAGACTTGTTTCTTACCTTAATCTTATTCTGACTCATTTTAAGGA  50
      |||||||||||||| |  |||||| ||||||||  || | |||| | |||
seq2  ACAGACAGACTTGTCT-GTACCTT-ATCTTATT-GGATTAATTTAAGGGA  47

seq1  AGT-TAGGGCTAGGGACCACTTATTGCAGCTTGGAGTGGCCAG-CTTTGA  98
      ||| |||||||  |  || ||||||||||  | ||| ||| || ||||| 
seq2  AGTGTAGGGCT--GAGCCCCTTATTGCAGGCTTGAG-GGCAAGACTTTGT  94

seq1  TGTTG-GACAGACACCAGAGGGGGACCTTCCATCCCCCCAAGGTGTGGGC  147
       |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||
seq2  AGTTGAGACAGACACCAGAGGGGACCCTTCCATTCCCCCCAAGTGTGGGC  144

seq1  AGTAGAAGATAAAC-TGTTTCAAAAACTTTTTCTCCCTGCCCACTTCT-A  195
      |||||||||||||| ||||||||||    ||||| ||||||||||||| |
seq2  AGTAGAAGATAAACTTGTTTCAAAA---CTTTCT-CCTGCCCACTTCTAA  190

seq1  ATGCTTCTTCATTAAC-AGGAGAAGCCACAGAATGACAAGGAACGACAG-  243
      |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATGC-TCTTCATTAACAAGGAGAAGCCACAGAATGACAAGGAACGACAGA  239

seq1  AAGACAGCCCC-AGCCCAGCAGCCAACTCCAGCCCTGCCACCCTTCCCAG  292
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AAGACAGCCCCAAGCCCAGCAGCCAACTCCAGCCCTGCCACCTTTCCCAG  289

seq1  TGGTGTCTGTCAGTTTTAGGGTTGAGAGGGGCACCTGAGCTGGGAACAAG  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTCTGTCAGTTTTAGGGTTGAGAGGGGCACCTGAGCTGGGAACAAG  339

seq1  AAGTAGGCTGGAGAGATGGAGCAGAGCTTAAGAATACTAACTAATATTAA  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGGCTGGAGAGATGGAGCAGAGCTTAAGAATACTAACTAATATTAA  389

seq1  ATTGGTCCTGAGTTCAATTTCCAGCAACAACTTGGTGACTTCCTTTTTTC  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTCCTGAGTTCAATTTCCAGCAACAACTTGGTGACTTCCTTTTTTC  439

seq1  TCAACATCCTCCTCCCCCTCTCCCTAGTGTAGGCACACAGGCATCCAGCG  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACATCCTCCTCCCCCTCTCCCTAGTGTAGGCACACAGGCATCCAGCG  489

seq1  CCCCTTAAAAAAAAGTCTAAGGCTGGGGCCTCCTGCAGCCCTGAGTGGGC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTTAAAAAAAAGTCTAAGGCTGGGGCCTCCTGCAGCCCTGAGTGGGC  539

seq1  TCTCCCTGAGTGGGGAGGTGAGTTTTCAGAGAGCAGGGCTCCTTAGCTGG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCTGAGTGGGGAGGTGAGTTTTCAGAGAGCAGGGCTCCTTAGCTGG  589

seq1  ACAGACTAGGCAGGAGAGGCCCCAAGTTGGCAGATGTATCTCTCACCAGA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACTAGGCAGGAGAGGCCCCAAGTTGGCAGATGTATCTCTCACCAGA  639

seq1  GCTTGGAACAGACTCCTGGTCACTCACTTTGCTCAGTAAATGGCTACCCT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGAACAGACTCCTGGTCACTCACTTTGCTCAGTAAATGGCTACCCT  689

seq1  TCTTGCCAGGAGAAGTGCTCACTCCTTGCCTGAGCAGATGTGGTATCGGA  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCCAGGAGAAGTGCTCACTCCTTGCCTGAGCAGATGTGGTATCGGA  739

seq1  GTTGTGAAGAGAGGGTCTCCACTGACACTATCCTGCCACATTCAGCCCAC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTGAAGAGAGGGTCTCCACTGACACTATCCTGCCACATTCAGCCCAC  789

seq1  TGAGAAGCAATAACCACTCTTTGCCATGTGCCTTAGGTACTCTGTACAGT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAGCAATAACCACTCTTTGCCATGTGCCTTAGGTACTCTGTACAGT  839

seq1  CACCTAGCCAAAGCTCTTGCAGGTTTTCTTCACCACAGACAGACGCCAAG  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTAGCCAAAGCTCTTGCAGGTTTTCTTCACCACAGACAGACGCCAAG  889

seq1  AAACAAGTTTCTGCCCCCCCCCCAGAGAAACCCACCCAGACTTGGACTTC  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAGTTTCTGCCCCCCCCCCAGAGAAACCCACCCAGACTTGGACTTC  939

seq1  ACCACGGCTGAAGGAAGGGAACATCTCCAGACTTACCACCAGGCTCTTTC  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACGGCTGAAGGAAGGGAACATCTCCAGACTTACCACCAGGCTCTTTC  989

seq1  AGCAGGTTTTAAAAACAATTTGGCCAAGGTTTCAGTATGATGCTAGGCAG  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGTTTTAAAAACAATTTGGCCAAGGTTTCAGTATGATGCTAGGCAG  1039

seq1  GAAATCGGTAAAAGCCCAGCAGTATTTCTTGAACAGGTCATGGAGTCTAT  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCGGTAAAAGCCCAGCAGTATTTCTTGAACAGGTCATGGAGTCTAT  1089

seq1  GTGTGTATGACTATGTGTGTATAACTATACACACATAGACCCCGCGAAAA  1142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTATGACTATGTGTGTATAACTATACACACATAGACCCCGCGAAAA  1139

seq1  CAGAGAATTC  1152
      ||||||||||
seq2  CAGAGAATTC  1149

seq1: chr1_45701696_45702421
seq2: B6Ng01-083L21.g_69_794

seq1  GAATTCCAAAGATGGAACCTTTGCTAATGAGGAGAACACCAGAGGGCCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAAGATGGAACCTTTGCTAATGAGGAGAACACCAGAGGGCCAC  50

seq1  TTGCCCAATGACAGAAAACAAACAAACAAACAAACTTACAACATTTTTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCCAATGACAGAAAACAAACAAACAAACAAACTTACAACATTTTTCT  100

seq1  CCTGGAAGGAGGCCTAAGACTCTCTCTCCTTGTGTGAGCTAGGATCCTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGAAGGAGGCCTAAGACTCTCTCTCCTTGTGTGAGCTAGGATCCTGG  150

seq1  ACTCAGATTCCAAATTGTTAGAAATAAGTTTGTGGTCTTAAAGAAAGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGATTCCAAATTGTTAGAAATAAGTTTGTGGTCTTAAAGAAAGAGA  200

seq1  TCATTATTCTAACTAAAGTGTTTAGATATGGGGCAGTGAACCATGCCAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTATTCTAACTAAAGTGTTTAGATATGGGGCAGTGAACCATGCCAGG  250

seq1  AAACCTGGTAAGGTTTAGAAGCCCTAGAACCCAGTCAGGGATGGTAGGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTGGTAAGGTTTAGAAGCCCTAGAACCCAGTCAGGGATGGTAGGAG  300

seq1  CTTCACCTGCTTCTGACCAGGCCCTTGTCCCCTGTCACATGACCACAGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACCTGCTTCTGACCAGGCCCTTGTCCCCTGTCACATGACCACAGCA  350

seq1  TCCCATGGAGAAGATTGTGATTATCAGTCAAGTAGGGACAGCTCCTTCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATGGAGAAGATTGTGATTATCAGTCAAGTAGGGACAGCTCCTTCAA  400

seq1  GCCCCTCCACATGCAGATGAGACATCCCTAACATCTAAGACCAAGCTAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTCCACATGCAGATGAGACATCCCTAACATCTAAGACCAAGCTAAT  450

seq1  AGAAAGCATCTGCTGTCAGACCCCAACCCAACCCAAAAGTCTATATAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGCATCTGCTGTCAGACCCCAACCCAACCCAAAAGTCTATATAAGA  500

seq1  TCCTATCCAGAAGGAATAAAAGTGTGTGAAAATTTCTTCATCACCTGAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATCCAGAAGGAATAAAAGTGTGTGAAAATTTCTTCATCACCTGAGA  550

seq1  GCATCTGTCATATAAGAGTGTGAGGAGCAGGAGTGGCAGCAGTCCCAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCTGTCATATAAGAGTGTGAGGAGCAGGAGTGGCAGCAGTCCCAAGA  600

seq1  TGGCACCCGGGACTGCAGCCAAATCTAATGACTTGCACCTGACTTCCTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACCCGGGACTGCAGCCAAATCTAATGACTTGCACCTGACTTCCTTA  650

seq1  TACACCCTGATTAAGCCATGTCCACTGGGTGAACTGCGCAGGTACACCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACCCTGATTAAGCCATGTCCACTGGGTGAACTGCGCAGGTACACCAT  700

seq1  GATGCAAGATTGGACCATATGACAAG  726
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCAAGATTGGACCATATGACAAG  726