BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-085K23
Chromosome1 (Build37)
Map Location 151,553,003 - 151,713,787
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042813, Pla2g4a
Upstream geneLOC100042792, LOC435647
Downstream genePtgs2, LOC676712, LOC100043257, LOC100043261, Pdc, BC003331, Tpr, EG625534
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-085K23.bB6Ng01-085K23.g
ACCDH899293DH899294
length1,068823
definitionDH899293|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-085K23, 5' end.DH899294|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-085K23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,712,720 - 151,713,787)(151,553,003 - 151,553,816)
sequence
gaattcctaataacggcatcaaagtcaggattgaaagaagccatgtaatt
gcagaagggaacagtgagtagaggaccctgtggaaacggccttgatttcc
aaggaatagcaagagagtttgcatgattagggtgtgtgatggcagagttg
atgggagactgctcaaactgggcagatggagagtaggctgcctttcaatt
cagagcctaagaaggcagccttagaaggctttcaattggtatcagtgttc
tgtgatttctattttcctatgtttattttgaaactagtaggtgggaatca
gaatgggggatgctgagggaaagaagagggttgagacattttaggaagtc
accatggagatccagggagagggcggagcactctgtgtagtgtggtgatg
gtttctgtggtgatgatgctatatggaagcatgtctgatgatcgacccta
tagcacttgagttttcagatgtgaactattatgtcaagggaggcagtcac
aaaagatgttaaagtaagattaatgctgtgaacagtggtgctaagaaggg
aagccaaaaggaacagtacgtatagcaagcaagagtcagatcccagacat
tctcactaaagtgaagatcacgattagacacagtgatgccataggcagac
cacaaatattgcaatggctgctattaactgagctattgagatgtgtcatg
gctttcccgatgcttcctacatttcttagctcactggggcttaatcttac
aaaccatctactgactttattcatgctaagattagggcattaagaccgga
ggagatagttgatttagtcagatgagcacagttagcgagccccagcttag
ggatggatcccagactgtctggctccactgcttctgttgggcagtgtacc
ttcctattccgggcttggtgtattgctaagaaatcagaattcacaatttg
gcattatgggtgggacttagaacaatgactaacagataatagttggatta
aaggtactgaaaattcttccccatcttgtagagggttggaatttactata
aggagctttgatttcttt
gaattctgagtcttaaaaagatttccacagcctttcccacaatggtctgt
gagccttgggtgcaagaactatgatgtagctgggtaccccacaatccttg
gatctctccattgtctccaattgtggtttaccatttgctgtgaagaaaag
cttctctgatgaggaataatagttccacttatctgtgggaataagcccac
gatttagaatgtacttgagaaccatgctggtctggaaatgttgttgtaat
agacccttcgaagaagtatgaactcattgttcttgggagattgggaatgt
ggctaccaccagggatgatttccattttgttgaataggttttaagtccaa
tttagacagctgttggttaccaacgtatgagtgccacttatgtaccttcc
tggatattttgtcatgctggtcactgttgtggttaataggagtcactgct
gggaatgaagaggggatgggtgggaagattttcagagccagcatgccaga
atatctgctggggaaaaagtctctcagagaaacagcagcataaacaagat
ctaaaataagtagcaatatcgataaacatgctagcacagaagaggaaaaa
atttcacagggtccccaaccctggacaaagaactataggcaacaaaaagc
ctgcagaaagagggggtaattagcctttccaggggattagccacctaatt
tatttatccaattacaaagggcttagcactgaaatcaaatacacacaatc
aacaaaaatgggactagggaggtcgtagttatgtattttctgcttaactg
tgcacacatgcattatgtgtgta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_151712720_151713787
seq2: B6Ng01-085K23.b_48_1115 (reverse)

seq1  AAAGAAATCAAA-CTCCTTATAGTAAAT--CAAACCTCTAACAAAATGGG  47
      |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||
seq2  AAAGAAATCAAAGCTCCTTATAGTAAATTCCAACCCTCT-ACAAGATGGG  49

seq1  GAAGAATTTTCAGTACCTTT-ATTCAACTTTTATTCTGTTAGTCATTTGT  96
      |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||
seq2  GAAGAATTTTCAGTACCTTTAATCCAACTATTA-TCTGTTAGTCA-TTGT  97

seq1  TCTAAAGTCCCAACCATAATGCCAAATTGTG-ATTCTGATTTCTTAGCAA  145
      ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCT-AAGTCCCACCCATAATGCCAAATTGTGAATTCTGATTTCTTAGCAA  146

seq1  TACACCAAGCCCGGAATAGGAAGGTACACTGCCCAACAGAAGCAGTGGAG  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACCAAGCCCGGAATAGGAAGGTACACTGCCCAACAGAAGCAGTGGAG  196

seq1  CCAGACAGTCTGGGATCCATCCCTAAGCTGGGGCTCGCTAACTGTGCTCA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGACAGTCTGGGATCCATCCCTAAGCTGGGGCTCGCTAACTGTGCTCA  246

seq1  TCTGACTAAATCAACTATCTCCTCCGGTCTTAATGCCCTAATCTTAGCAT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACTAAATCAACTATCTCCTCCGGTCTTAATGCCCTAATCTTAGCAT  296

seq1  GAATAAAGTCAGTAGATGGTTTGTAAGATTAAAGCCCCAGTGAGCTAAGA  345
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GAATAAAGTCAGTAGATGGTTTGTAAGATT-AAGCCCCAGTGAGCTAAGA  345

seq1  AATGTAGGAAGCATCGGGAAAGCCATGACACATCTCAATAGCTCAGTTAA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTAGGAAGCATCGGGAAAGCCATGACACATCTCAATAGCTCAGTTAA  395

seq1  TAGCAGCCATTGCAATATTTGTGGTCTGCCTATGGCATCACTGTGTCTAA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGCCATTGCAATATTTGTGGTCTGCCTATGGCATCACTGTGTCTAA  445

seq1  TCGTGATCTTCACTTTAGTGAGAATGTCTGGGATCTGACTCTTGCTTGCT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTGATCTTCACTTTAGTGAGAATGTCTGGGATCTGACTCTTGCTTGCT  495

seq1  ATACGTACTGTTCCTTTTGGCTTCCCTTCTTAGCACCACTGTTCACAGCA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACGTACTGTTCCTTTTGGCTTCCCTTCTTAGCACCACTGTTCACAGCA  545

seq1  TTAATCTTACTTTAACATCTTTTGTGACTGCCTCCCTTGACATAATAGTT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCTTACTTTAACATCTTTTGTGACTGCCTCCCTTGACATAATAGTT  595

seq1  CACATCTGAAAACTCAAGTGCTATAGGGTCGATCATCAGACATGCTTCCA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCTGAAAACTCAAGTGCTATAGGGTCGATCATCAGACATGCTTCCA  645

seq1  TATAGCATCATCACCACAGAAACCATCACCACACTACACAGAGTGCTCCG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGCATCATCACCACAGAAACCATCACCACACTACACAGAGTGCTCCG  695

seq1  CCCTCTCCCTGGATCTCCATGGTGACTTCCTAAAATGTCTCAACCCTCTT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTCCCTGGATCTCCATGGTGACTTCCTAAAATGTCTCAACCCTCTT  745

seq1  CTTTCCCTCAGCATCCCCCATTCTGATTCCCACCTACTAGTTTCAAAATA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCCTCAGCATCCCCCATTCTGATTCCCACCTACTAGTTTCAAAATA  795

seq1  AACATAGGAAAATAGAAATCACAGAACACTGATACCAATTGAAAGCCTTC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATAGGAAAATAGAAATCACAGAACACTGATACCAATTGAAAGCCTTC  845

seq1  TAAGGCTGCCTTCTTAGGCTCTGAATTGAAAGGCAGCCTACTCTCCATCT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGCTGCCTTCTTAGGCTCTGAATTGAAAGGCAGCCTACTCTCCATCT  895

seq1  GCCCAGTTTGAGCAGTCTCCCATCAACTCTGCCATCACACACCCTAATCA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGTTTGAGCAGTCTCCCATCAACTCTGCCATCACACACCCTAATCA  945

seq1  TGCAAACTCTCTTGCTATTCCTTGGAAATCAAGGCCGTTTCCACAGGGTC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAACTCTCTTGCTATTCCTTGGAAATCAAGGCCGTTTCCACAGGGTC  995

seq1  CTCTACTCACTGTTCCCTTCTGCAATTACATGGCTTCTTTCAATCCTGAC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTACTCACTGTTCCCTTCTGCAATTACATGGCTTCTTTCAATCCTGAC  1045

seq1  TTTGATGCCGTTATTAGGAATTC  1068
      |||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATGCCGTTATTAGGAATTC  1068

seq1: chr1_151553003_151553816
seq2: B6Ng01-085K23.g_71_893

seq1  GAATTCTGAGTCTTAAAAAGATTTCCACAGCCTTTCCCACAATGGTCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGAGTCTTAAAAAGATTTCCACAGCCTTTCCCACAATGGTCTGT  50

seq1  GAGCCTTGGGTGCAAGAACTATGATGTAGCTGGGTACCCCACAATCCTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCTTGGGTGCAAGAACTATGATGTAGCTGGGTACCCCACAATCCTTG  100

seq1  GATCTCTCCATTGTCTCCAATTGTGGTTTACCATTTGCTGTGAAGAAAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCTCCATTGTCTCCAATTGTGGTTTACCATTTGCTGTGAAGAAAAG  150

seq1  CTTCTCTGATGAGGAATAATAGTTCCACTTATCTGTGGGAATAAGCCCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTGATGAGGAATAATAGTTCCACTTATCTGTGGGAATAAGCCCAC  200

seq1  GATTTAGAATGTACTTGAGAACCATGCTGGTCTGGAAATGTTGTTGTAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTAGAATGTACTTGAGAACCATGCTGGTCTGGAAATGTTGTTGTAAT  250

seq1  AGACCCTTCGAAGAAGTATGAACTCATTGTTCTTGGGAGATTGGGAATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCTTCGAAGAAGTATGAACTCATTGTTCTTGGGAGATTGGGAATGT  300

seq1  GGCTACCACCAGGGATGATTTCCATTTTGTTGAATAGGTTTTAAGTCCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACCACCAGGGATGATTTCCATTTTGTTGAATAGGTTTTAAGTCCAA  350

seq1  TTTAGACAGCTGTTGGTTACCAACGTATGAGTGCCACTTATGTACCTTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGACAGCTGTTGGTTACCAACGTATGAGTGCCACTTATGTACCTTCC  400

seq1  TGGATATTTTGTCATGCTGGTCACTGTTGTGGTTAATAGGAGTCACTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATATTTTGTCATGCTGGTCACTGTTGTGGTTAATAGGAGTCACTGCT  450

seq1  GGGAATGAAGAGGGGATGGGTGGGAAGATTTTCAGAGCCAGCATGCCAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAATGAAGAGGGGATGGGTGGGAAGATTTTCAGAGCCAGCATGCCAGA  500

seq1  ATATCTGCTGGGGAAAAAGTCTCTCAGAGAAACAGCAGCATAAACAAGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTGCTGGGGAAAAAGTCTCTCAGAGAAACAGCAGCATAAACAAGAT  550

seq1  CTAAAATAAGTAGCAATATCGATAAACATGCTAGCACAGAAGAGG-AAAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CTAAAATAAGTAGCAATATCGATAAACATGCTAGCACAGAAGAGGAAAAA  600

seq1  ATTTCACAGGGT-CCCAACCCTGGACAAAGAACTATAGGCAAC-AAAAGC  647
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ATTTCACAGGGTCCCCAACCCTGGACAAAGAACTATAGGCAACAAAAAGC  650

seq1  CTGCAGAAAGA-GGGGTAATTAGCCTTTCCAGGGGATTAGCCACCTAA-T  695
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CTGCAGAAAGAGGGGGTAATTAGCCTTTCCAGGGGATTAGCCACCTAATT  700

seq1  TATTTATCCAA-TACAAAGGGCTTAGCACTGAAATCAAATACACACAAAC  744
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TATTTATCCAATTACAAAGGGCTTAGCACTGAAATCAAATACACACAATC  750

seq1  AACAAAAAT-GGACTAGGGAGGTCGTAGTTATGTA-TTTCTGCATAACTG  792
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
seq2  AACAAAAATGGGACTAGGGAGGTCGTAGTTATGTATTTTCTGCTTAACTG  800

seq1  TGCACACATGCA-TATGTGTGTA  814
      |||||||||||| ||||||||||
seq2  TGCACACATGCATTATGTGTGTA  823