BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-087O17
Chromosome1 (Build37)
Map Location 114,171,565 - 114,305,154
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC666615
Upstream geneEG666578, Dsel, LOC547247, EG626897
Downstream geneLOC666635
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-087O17.bB6Ng01-087O17.g
ACCDH900914DH900915
length1,206999
definitionDH900914|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087O17, 5' end.DH900915|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087O17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(114,303,946 - 114,305,154)(114,171,565 - 114,172,550)
sequence
gaattctctagtcatttgcttttaaaagtaggtgtatagattcagaggta
ctatgaatcagtaattttgtaataggaattcctttgactcttaagggatg
aagtctttaggactggcaaataagctacttaaggggaacttaaaagaaac
acgacaattctgggcttgataatgaatatgtcattgaacacctttgcatc
tgcctagagcaaatttaaaagaaaaacacttctctccacagaattagtaa
tttattctcaaggccttttacatatgcctctaaaacatttaatttttttt
ctcactcctaggacttagctgataacttctgtgtatttttagccattttc
atatatataatatgtcattaatccaaatgtcagaaagagaaaccaaatca
aagttcatttcaaaactgtgtgtggataaaatatgtttaagtgttaaaga
ttctcatgaatcttagcaaagctaatttgactgtgatagtgtgtgtaagg
cttcatataataatctttgatataaacttaaataattacagaaagcaatg
taaatattatattaatttatgaaagataataccttggtagcctaacttgt
agctagaagaatttgacttcgtacctcttctgatctaacactgacttaag
tagcttactagtaagtccttaagtcttaagtttgagacatgccagcattt
ggtaatcttggtgttgaatggtacaattaagtgttgccttaaaaatgcca
gtattttctgtcctctgtcccccactcccttccttctctgtcctcatggc
cctgctcttgtctgcctgcctctacccagtctgcaggtcctcacccctct
ctcttctcccaataaacctccttatacctgacctcttctatgtagtcatt
tctcaagagcacatcttggcatgtgtctgcagtaatacccccttgttgta
tatatttcagcctcatgtattacatttgttatcatgataatcagcccctt
atgatgtgttcttttaatgaacttcttggggggggagtacatttttgtta
tagaaaatgtgctatctgttgtgtgttttctttaatggcctagtatgaca
cagtgaaagagccattaagcctagaattgatgaaggcaatagttatagat
tgtttaactaatatgtaccaggtaactaatgactgttagtgatttatagg
atattt
gaattctgttagtagataaagacaatggtttaaaatccaagatttatgtg
actgaattaactttccactagactgtagaggacttgaagagatgtagaat
aagtaagccagtgacaaatccatgtctcatggtcaaagatggacagacaa
gaaaaccatctttgccttgttaacttttatttcttaaactccaatgacaa
attctttattgcctctcactgctttttttgcacctctctttaaaatcttg
cattagtcataggccctcttgctactaatattcaaattatgaatcctcaa
tccctattgctgactacttaaacccttaattattcaagccccaattttta
atccaaaaccaatttgttttagtctttccacaccaactccaaaatctgct
acaaatcacccataatactgtatacaatagcctctccaatcttttagatt
tctaaaataattgaatttcagaacacttgcacacaccaaaaaaagaggaa
acacaaaaatcccttaaagaattacaggaaaacacaaccaaaagagtgaa
ggaattgaacaaaatcatccagcatataaaagtggaagtagaaacaataa
aaaaaaaaaaagaatcacaaaaggagataactctggagatagaaaaccta
agaaagagatcaggagccatagatgcaagcatcaacaacagaatacaaga
gatagtagaaagaatctcaggtgcagaagattccatagaaaacatggaca
ctacaatgaaagaaaatctaaaatgcaaaaagatcttaactcaaaacata
caggaaatccaggacacagtgagaagcccaaaccaaaggttagtaggtat
aagattttcaacttaaaggaccagtaaagtatcttcaacaaaactataga
agaagatttccctaacctaagaaagatatggccatgacatacaggaagcc
aacagaaatccagatagtatggaccaaaatggatacctcccatcacaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_114303946_114305154
seq2: B6Ng01-087O17.b_50_1255 (reverse)

seq1  AAATAT-CTATAAATCCAACTAACAGTCATTTAGTTACTTGTTACCACTA  49
      |||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| || |   ||  
seq2  AAATATCCTATAAATC--ACTAACAGTCA-TTAGTTACCTGGT---ACAT  44

seq1  ATTAGTTAAACAATCTATTAAACTATTCCCTTCATCA--TCTAGCCTAAA  97
      ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||| ||  |
seq2  ATTAGTTAAACAATCTAT--AACTATTGCCTTCATCAATTCTAGGCT-TA  91

seq1  ATGGCTCTTCAACTGTGTCATACTA-GCCATTAAAGAAAACACACACAGG  146
      |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |
seq2  ATGGCTCTTTCACTGTGTCATACTAGGCCATTAAAGAAAACACACAACAG  141

seq1  ATAGCACATTTTCTATA--CAAAATGTACT-CCCCCCCAAGAAGTTCATT  193
      |||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  ATAGCACATTTTCTATAACAAAAATGTACTCCCCCCCCAAGAAGTTCATT  191

seq1  AAAAGAACACATCATAAGGGGCTGATTATCATGATAACAAATGTAATACA  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAACACATCATAAGGGGCTGATTATCATGATAACAAATGTAATACA  241

seq1  TGAGGCTGAAATATAATACAACAAGGGGGTATTACTGCAGACACATGCCA  293
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCTGAAATAT-ATACAACAAGGGGGTATTACTGCAGACACATGCCA  290

seq1  AGATGTGCTCTTGAGAAATGACTACATAGAAGAGGTCAGGTATAAGGAGG  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTGCTCTTGAGAAATGACTACATAGAAGAGGTCAGGTATAAGGAGG  340

seq1  TTTATTGGGAGAAGAGAGAGGGGTGAGGACCTGCAGACTGGGTAGAGGCA  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTGGGAGAAGAGAGAGGGGTGAGGACCTGCAGACTGGGTAGAGGCA  390

seq1  GGCAGACAAGAGCAGGGCCATGAGGACAGAGAAGGAAGGGAGTGGGGGAC  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGACAAGAGCAGGGCCATGAGGACAGAGAAGGAAGGGAGTGGGGGAC  440

seq1  AGAGGACAGAAAATACTGGCATTTTTAAGGCAACACTTAATTGTACCATT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGACAGAAAATACTGGCATTTTTAAGGCAACACTTAATTGTACCATT  490

seq1  CAACACCAAGATTACCAAATGCTGGCATGTCTCAAACTTAAGACTTAAGG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACACCAAGATTACCAAATGCTGGCATGTCTCAAACTTAAGACTTAAGG  540

seq1  ACTTACTAGTAAGCTACTTAAGTCAGTGTTAGATCAGAAGAGGTACGAAG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTACTAGTAAGCTACTTAAGTCAGTGTTAGATCAGAAGAGGTACGAAG  590

seq1  TCAAATTCTTCTAGCTACAAGTTAGGCTACCAAGGTATTATCTTTCATAA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATTCTTCTAGCTACAAGTTAGGCTACCAAGGTATTATCTTTCATAA  640

seq1  ATTAATATAATATTTACATTGCTTTCTGTAATTATTTAAGTTTATATCAA  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATATAATATTTACATTGCTTTCTGTAATTATTTAAGTTTATATCAA  690

seq1  AGATTATTATATGAAGCCTTACACACACTATCACAGTCAAATTAGCTTTG  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTATTATATGAAGCCTTACACACACTATCACAGTCAAATTAGCTTTG  740

seq1  CTAAGATTCATGAGAATCTTTAACACTTAAACATATTTTATCCACACACA  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGATTCATGAGAATCTTTAACACTTAAACATATTTTATCCACACACA  790

seq1  GTTTTGAAATGAACTTTGATTTGGTTTCTCTTTCTGACATTTGGATTAAT  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGAAATGAACTTTGATTTGGTTTCTCTTTCTGACATTTGGATTAAT  840

seq1  GACATATTATATATATGAAAATGGCTAAAAATACACAGAAGTTATCAGCT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATATTATATATATGAAAATGGCTAAAAATACACAGAAGTTATCAGCT  890

seq1  AAGTCCTAGGAGTGAGAAAAAAAATTAAATGTTTTAGAGGCATATGTAAA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCTAGGAGTGAGAAAAAAAATTAAATGTTTTAGAGGCATATGTAAA  940

seq1  AGGCCTTGAGAATAAATTACTAATTCTGTGGAGAGAAGTGTTTTTCTTTT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTTGAGAATAAATTACTAATTCTGTGGAGAGAAGTGTTTTTCTTTT  990

seq1  AAATTTGCTCTAGGCAGATGCAAAGGTGTTCAATGACATATTCATTATCA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTGCTCTAGGCAGATGCAAAGGTGTTCAATGACATATTCATTATCA  1040

seq1  AGCCCAGAATTGTCGTGTTTCTTTTAAGTTCCCCTTAAGTAGCTTATTTG  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAGAATTGTCGTGTTTCTTTTAAGTTCCCCTTAAGTAGCTTATTTG  1090

seq1  CCAGTCCTAAAGACTTCATCCCTTAAGAGTCAAAGGAATTCCTATTACAA  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCCTAAAGACTTCATCCCTTAAGAGTCAAAGGAATTCCTATTACAA  1140

seq1  AATTACTGATTCATAGTACCTCTGAATCTATACACCTACTTTTAAAAGCA  1193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACTGATTCATAGTACCTCTGAATCTATACACCTACTTTTAAAAGCA  1190

seq1  AATGACTAGAGAATTC  1209
      ||||||||||||||||
seq2  AATGACTAGAGAATTC  1206

seq1: chr1_114171565_114172550
seq2: B6Ng01-087O17.g_69_1051

seq1  GAATTCTGTTAGTAGATAAAGACAATGGTTTAAAATCCAAGATTTATGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTTAGTAGATAAAGACAATGGTTTAAAATCCAAGATTTATGTG  50

seq1  ACTGAATTAACTTTCCACTAGACTGTAGAGGACTTGAAGAGATGTAGAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAATTAACTTTCCACTAGACTGTAGAGGACTTGAAGAGATGTAGAAT  100

seq1  AAGTAAGCCAGTGACAAATCCATGTCTCATGGTCAAAGATGGACAGACAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAAGCCAGTGACAAATCCATGTCTCATGGTCAAAGATGGACAGACAA  150

seq1  GAAAACCATCTTTGCCTTGTTAACTTTTATTTCTTAAACTCCAATGACAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACCATCTTTGCCTTGTTAACTTTTATTTCTTAAACTCCAATGACAA  200

seq1  ATTCTTTATTGCCTCTCACTGCTTTTTTTGCACCTCTCTTTAAAATCTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTTATTGCCTCTCACTGCTTTTTTTGCACCTCTCTTTAAAATCTTG  250

seq1  CATTAGTCATAGGCCCTCTTGCTACTAATATTCAAATTATGAATCCTCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAGTCATAGGCCCTCTTGCTACTAATATTCAAATTATGAATCCTCAA  300

seq1  TCCCTATTGCTGACTACTTAAACCCTTAATTATTCAAGCCCCAATTTTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTATTGCTGACTACTTAAACCCTTAATTATTCAAGCCCCAATTTTTA  350

seq1  ATCCAAAACCAATTTGTTTTAGTCTTTCCACACCAACTCCAAAATCTGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAAAACCAATTTGTTTTAGTCTTTCCACACCAACTCCAAAATCTGCT  400

seq1  ACAAATCACCCATAATACTGTATACAATAGCCTCTCCAATCTTTTAGATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATCACCCATAATACTGTATACAATAGCCTCTCCAATCTTTTAGATT  450

seq1  TCTAAAATAATTGAATTTCAGAACACTTGCACACACCAAAAAAAGAGGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAATAATTGAATTTCAGAACACTTGCACACACCAAAAAAAGAGGAA  500

seq1  ACACAAAAATCCCTTAAAGAATTACAGGAAAACACAACCAAAAGAGTGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAAAATCCCTTAAAGAATTACAGGAAAACACAACCAAAAGAGTGAA  550

seq1  GGAATTGAACAAAATCATCCAGCATATAAAAGTGGAAGTAGAAACAATAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTGAACAAAATCATCCAGCATATAAAAGTGGAAGTAGAAACAATAA  600

seq1  AAAAAAAAAAAGAATCACAAAAGGAGATAACTCTGGAGATAGAAAACCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAAGAATCACAAAAGGAGATAACTCTGGAGATAGAAAACCTA  650

seq1  AGAAAGAGATCAGGAGCCATAGATGCAAGCATCAACAACAGAATACAAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGAGATCAGGAGCCATAGATGCAAGCATCAACAACAGAATACAAGA  700

seq1  GATAGTAGAAAGAATCTCAGGTGCAGAAGATTCCATAGAAAACATGGACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGTAGAAAGAATCTCAGGTGCAGAAGATTCCATAGAAAACATGGACA  750

seq1  CTACAATGAAAGAAAATCTAAAATGCAAAAAGATCTTAACTCAAAACATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAATGAAAGAAAATCTAAAATGCAAAAAGATCTTAACTCAAAACATA  800

seq1  CAGGAAATCCAGGACACAGTGAGAAGCCCAAACCAAAGGTTAGTAGGTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAATCCAGGACACAGTGAGAAGCCCAAACCAAAGGTTAGTAGGTAT  850

seq1  AAGATTTTCAACTTAAAGGACCAGTAAAGTATCTTCAACAAAACTATAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTTTCAACTTAAAGGACCAGTAAAGTATCTTCAACAAAACTATAGA  900

seq1  AGAAGATTTCCCTAACCTAAAGAAAGATATGGCCATGAACATACAGGAAG  950
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AGAAGATTTCCCTAACCT-AAGAAAGATATGGCCATG-ACATACAGGAAG  948

seq1  CCAACAGAAATCCAGATAGTATGGACCAAAAATGGA  986
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CCAACAGAAATCCAGATAGTATGGACC-AAAATGGA  983