BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-111P15
Chromosome1 (Build37)
Map Location 102,185,490 - 102,313,391
singlet/doubletdoublet
Overlap geneC230078M14Rik
Upstream geneLOC633295, EG666200
Downstream geneLOC100041909, LOC100040993, LOC383650
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-111P15.bB6Ng01-111P15.g
ACCDH918169DH918170
length8931,112
definitionDH918169|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-111P15, 5' end.DH918170|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-111P15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(102,185,490 - 102,186,096)(102,312,271 - 102,313,391)
sequence
gaattcctacaggcaacaaattagaatctgtctgtaacaatgataatgat
agtagatggtcctaggactgccctcaataaagatgggcgaatgggaccag
gaacagagagcaagagagttgttttttaaaatgccagttaaatggccatg
taaagatattgtttgctgtgtagctgaatactatgaattagtcctagaga
tgtcctactaagtagggatacaaaggtgatgaccttccctttgagtgagg
gccattattaaaatgtttctacttgtgccccaagaacaaaataataatga
taatgagcacccaagcctagacttaccaggtcatatgtggaagctggtgg
ttgagaggatcccgagcctatgggtgaacagtttacctaagtttaagatt
tttctaaagcatcagaaaaaaccacttgggagagggacggggaagtgttc
gaggtcctagaacaaggatcaaggaaaagaccagtcataatggctgaatg
tctccatcctcggggagagcacaggaggtggctgggagctcaacaaccct
cccttgggaccagaggatatttatggtgaccagtggaagattttactagt
tctcctccaagttcaggtagataagtctgttgatctggtggctgcccagg
tggcagggagagatataaacctacaactatctaaatctagagtcttggca
ccaatcttatcttatatcttataaaaaagagaaagatgccagagatatgt
ttggtgaagacacagtatggtgtgggggactgggttgcctctgtggccca
tgctgagtcatttttttcccatgagaaacggcaatgagacagtatagtgt
agaaatagggtttattcggacatggggagggggagttgaggaa
gaattcattcttcagatgaagtacagctggtgagatgaaacaacagagcc
aattgtctccaatttcatcattagggggaattggtgaatgtttgtgtata
tgcatgtctgttagagaggctcatttgtgtcagaggtattacaggccaaa
cactttcctgatccaatcagacctaaattatgtaatacagtgaccgtgaa
cacagattttaaagagaaagacagctgaatagctgtgatttatacccatc
tccacctttgagacaagatctcatcttgtggtccattatggtctcacact
ccatatatacacaaggatagccttgaatttctgatatttaggcttccatt
tgccaactgctgggcaaagcagcagctttaaagcttataccacaatgcct
agtgtatgtgatatgggggaataaaaccagggcttgacataggcaatata
aggactttgccaacctgagagaaaatttatttatacccacattgccttaa
tttctttcaatattatctgggatggcactgataatattgaccacatataa
ttacaggcctaaaatgatagcaagtgcaatgtgaccatgttacctgctaa
gtctctgttaacgtataaagcaagtacttagacaattcctaagctaatag
gcatattataagatagaagctatttctcagacacattaatctgcactttc
acaagtcagcagacttaactttttgtttcagtgtaaaactgctttccttg
gtgtggcattttgttctttaccaaatggtcttttgtagataaatctggct
tcaaactcactatgcctctatctgttaccccctccccccctcacacacac
acaacaagtgtcaaggcttatagccatgtcacaccacagctgggttttat
gtggaccaatccaggaaactcccccaccacaaaactacatcactgtccct
aaattcttttcttacttgtcacattaagagaaacaatataactgatcagg
tgtcatgtgataatctttgcacatgtcttgtgtacttggcttatctgtac
cacattgatcgatatatttatttaatttaacactggtgtgccatgaattt
cattatttttac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_102185490_102186096
seq2: B6Ng01-111P15.b_47_653

seq1  GAATTCCTACAGGCAACAAATTAGAATCTGTCTGTAACAATGATAATGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTACAGGCAACAAATTAGAATCTGTCTGTAACAATGATAATGAT  50

seq1  AGTAGATGGTCCTAGGACTGCCCTCAATAAAGATGGGCGAATGGGACCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGATGGTCCTAGGACTGCCCTCAATAAAGATGGGCGAATGGGACCAG  100

seq1  GAACAGAGAGCAAGAGAGTTGTTTTTTAAAATGCCAGTTAAATGGCCATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGAGAGCAAGAGAGTTGTTTTTTAAAATGCCAGTTAAATGGCCATG  150

seq1  TAAAGATATTGTTTGCTGTGTAGCTGAATACTATGAATTAGTCCTAGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGATATTGTTTGCTGTGTAGCTGAATACTATGAATTAGTCCTAGAGA  200

seq1  TGTCCTACTAAGTAGGGATACAAAGGTGATGACCTTCCCTTTGAGTGAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTACTAAGTAGGGATACAAAGGTGATGACCTTCCCTTTGAGTGAGG  250

seq1  GCCATTATTAAAATGTTTCTACTTGTGCCCCAAGAACAAAATAATAATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATTATTAAAATGTTTCTACTTGTGCCCCAAGAACAAAATAATAATGA  300

seq1  TAATGAGCACCCAAGCCTAGACTTACCAGGTCATATGTGGAAGCTGGTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGAGCACCCAAGCCTAGACTTACCAGGTCATATGTGGAAGCTGGTGG  350

seq1  TTGAGAGGATCCCGAGCCTATGGGTGAACAGTTTACCTAAGTTTAAGATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAGGATCCCGAGCCTATGGGTGAACAGTTTACCTAAGTTTAAGATT  400

seq1  TTTCTAAAGCATCAGAAAAAACCACTTGGGAGAGGGACGGGGAAGTGTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTAAAGCATCAGAAAAAACCACTTGGGAGAGGGACGGGGAAGTGTTC  450

seq1  GAGGTCCTAGAACAAGGATCAAGGAAAAGACCAGTCATAATGGCTGAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTCCTAGAACAAGGATCAAGGAAAAGACCAGTCATAATGGCTGAATG  500

seq1  TCTCCATCCTCGGGGAGAGCACAGGAGGTGGCTGGGAGCTCAACAACCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCATCCTCGGGGAGAGCACAGGAGGTGGCTGGGAGCTCAACAACCCT  550

seq1  CCCTTGGGACCAGAGGATATTTATGGTGACCAGTGGAAGATTTTACTAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTGGGACCAGAGGATATTTATGGTGACCAGTGGAAGATTTTACTAGT  600

seq1  TCTCCTC  607
      |||||||
seq2  TCTCCTC  607

seq1: chr1_102312271_102313391
seq2: B6Ng01-111P15.g_70_1181 (reverse)

seq1  GTAAAAATAAATGAAATATCATGGGACA-CAGTGTTAAAATAAATAAAAT  49
      |||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||  
seq2  GTAAAAAT-AATGAAAT-TCATGGCACACCAGTGTTAAATTAAATAAA--  46

seq1  ATTATA-CGATACAATGT-GTACAGAT-AGGCAAGTACCACAAGAAACAA  96
        |||| |||| |||||| |||||||| || |||||| |||||||    |
seq2  --TATATCGAT-CAATGTGGTACAGATAAGCCAAGTA-CACAAGA---CA  89

seq1  TGTGCAAAGATGTATCACATGACACCTGATTCAGTGTATATTGTTTCTCT  146
      ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| 
seq2  TGTGCAAAGAT-TATCACATGACACCTGA-TCAGT-TATATTGTTTCTC-  135

seq1  TTAATGTGACAAGT-AGAAAAGAATTTTAGGGACAGTGATGTAGTTTTGT  195
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTAATGTGACAAGTAAGAAAAGAA-TTTAGGGACAGTGATGTAGTTTTG-  183

seq1  TGGTGGGGGAGTATCCTGGATTGGTCCACATAAAA-CCAGCTGTGGTGTG  244
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TGGTGGGGGAGTTTCCTGGATTGGTCCACATAAAACCCAGCTGTGGTGTG  233

seq1  ACATGGCTATAAGCC-TGACACTTGTTGTGTGTGTGTGA-GGGGGGAGGG  292
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  ACATGGCTATAAGCCTTGACACTTGTTGTGTGTGTGTGAGGGGGGGAGGG  283

seq1  GGTAACAGATAGAGGCATAGTGAGTTTGAAGCCAGATTTATCTACAAAAG  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAACAGATAGAGGCATAGTGAGTTTGAAGCCAGATTTATCTACAAAAG  333

seq1  ACCATTTGGTAAAGAACAAAATGCCACACCAAGGAAAGCAGTTTTACACT  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATTTGGTAAAGAACAAAATGCCACACCAAGGAAAGCAGTTTTACACT  383

seq1  GAAACAAAAAGTTAAGTCTGCTGACTTGTGAAAGTGCAGATTAATGTGTC  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAAAAAGTTAAGTCTGCTGACTTGTGAAAGTGCAGATTAATGTGTC  433

seq1  TGAGAAATAGCTTCTATCTTATAATATGCCTATTAGCTTAGGAATTGTCT  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAATAGCTTCTATCTTATAATATGCCTATTAGCTTAGGAATTGTCT  483

seq1  AAGTACTTGCTTTATACGTTAACAGAGACTTAGCAGGTAACATGGTCACA  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTACTTGCTTTATACGTTAACAGAGACTTAGCAGGTAACATGGTCACA  533

seq1  TTGCACTTGCTATCATTTTAGGCCTGTAATTATATGTGGTCAATATTATC  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCACTTGCTATCATTTTAGGCCTGTAATTATATGTGGTCAATATTATC  583

seq1  AGTGCCATCCCAGATAATATTGAAAGAAATTAAGGCAATGTGGGTATAAA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCCATCCCAGATAATATTGAAAGAAATTAAGGCAATGTGGGTATAAA  633

seq1  TAAATTTTCTCTCAGGTTGGCAAAGTCCTTATATTGCCTATGTCAAGCCC  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTTTCTCTCAGGTTGGCAAAGTCCTTATATTGCCTATGTCAAGCCC  683

seq1  TGGTTTTATTCCCCCATATCACATACACTAGGCATTGTGGTATAAGCTTT  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTTATTCCCCCATATCACATACACTAGGCATTGTGGTATAAGCTTT  733

seq1  AAAGCTGCTGCTTTGCCCAGCAGTTGGCAAATGGAAGCCTAAATATCAGA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTGCTGCTTTGCCCAGCAGTTGGCAAATGGAAGCCTAAATATCAGA  783

seq1  AATTCAAGGCTATCCTTGTGTATATATGGAGTGTGAGACCATAATGGACC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCAAGGCTATCCTTGTGTATATATGGAGTGTGAGACCATAATGGACC  833

seq1  ACAAGATGAGATCTTGTCTCAAAGGTGGAGATGGGTATAAATCACAGCTA  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGATGAGATCTTGTCTCAAAGGTGGAGATGGGTATAAATCACAGCTA  883

seq1  TTCAGCTGTCTTTCTCTTTAAAATCTGTGTTCACGGTCACTGTATTACAT  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCTGTCTTTCTCTTTAAAATCTGTGTTCACGGTCACTGTATTACAT  933

seq1  AATTTAGGTCTGATTGGATCAGGAAAGTGTTTGGCCTGTAATACCTCTGA  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAGGTCTGATTGGATCAGGAAAGTGTTTGGCCTGTAATACCTCTGA  983

seq1  CACAAATGAGCCTCTCTAACAGACATGCATATACACAAACATTCACCAAT  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAATGAGCCTCTCTAACAGACATGCATATACACAAACATTCACCAAT  1033

seq1  TCCCCCTAATGATGAAATTGGAGACAATTGGCTCTGTTGTTTCATCTCAC  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCTAATGATGAAATTGGAGACAATTGGCTCTGTTGTTTCATCTCAC  1083

seq1  CAGCTGTACTTCATCTGAAGAATGAATTC  1121
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGTACTTCATCTGAAGAATGAATTC  1112