BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-113I04
Chromosome1 (Build37)
Map Location 67,341,482 - 67,517,798
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMtap2, C030018G13Rik, Rpe, 1110028C15Rik, Acadl, Myl1, LOC100043192, Lancl1, Cps1
Downstream geneKif22-ps, Erbb4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-113I04.bB6Ng01-113I04.g
ACCDH919286DH919287
length4951,026
definitionDH919286|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113I04, 5' end.DH919287|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113I04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,341,482 - 67,341,982)(67,516,779 - 67,517,798)
sequence
aaacactctcttctgactctgtgggcaccagaaataccacacacacagat
acatacatatatatacatacatacatacatacatacatacacatataaaa
cctatgatcatctaatttacattgatctatttaagaaagatcagaagatg
aagatcatgcccactctgatagaaattcacagtaagacagccctgtaaca
tcttttaaagtggattcgtctattgtaaagtctcatattgccttttcctc
tgatgtaatcattaggtcatctacaagtgaaaagtaccacaggaatcttt
tgttaatcggatgagtagttggttactggatatattatgcccacaaagag
gaaaaagtaaactgctgttgagagacagagacagagagacagagagacac
aggacagagagacacagagaaagacagggagagggagagagagacaggga
gagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagag
gaattccaagctcatcagcttcaaggattttctaggacattggtacactg
gcaaaggcttagctatgtcaaaaaatcaaatcttaaaggcatttataata
aacaatactgaaagagagcatgtggaaccatacaccagactaacaatggg
atagggtttgagtattcgggctatgagaatgccaaggttccaggaggcat
agtttccttgaaactctgcctcgtgagtgtttccaggcctctcggcctgt
caagcagacttcactggagtgggcatagcaggaggagatgggggagattt
acagagggtcaggaaattgaacagaggtgtgtaataatggggaatgggga
actggggtagccaccagatagttccagatgccaggaaagcaaaaggttct
caggactattagtaacactatgtaagttcccttcagtatattaatggaca
agggttaatgttctgaattgttaaatgttatattgtagacataataatat
ctactgtggtaattttttgatgttccattgaaaatatattctgttcttcc
ttagtgtttggtcatgtcaacttggtcagggatgttattcaagccatctt
atcttcttatggacacctgacatcctcttggcttacaatttgctgacaga
gaggtacttacgctcttaagtctgtagatttttatttcttgctttattct
ctgagatactgctttacaaacacagatgctctgttattaaaagctgatat
taaggactgttacacattctcaagggattgaagctgtaatagctacttta
atcctcataattcttatgtggaagcctacctcaagcaatattaatgtgta
ttcactcccaattccttttggtttagtgtttgcctaacatcattttaata
gactctcagacttctattatctgtgtcaattacttcaaagaaaggcatgg
agaactcctcagctttaagacagtcatggtggtttaagaactgttctctt
ttatccaccaattttgaagttcgagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_67341482_67341982
seq2: B6Ng01-113I04.b_48_548

seq1  GAATTCAAACACTCTCTTCTGACTCTGTGGGCACCAGAAATACCACACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAACACTCTCTTCTGACTCTGTGGGCACCAGAAATACCACACAC  50

seq1  ACAGATACATACATATATATACATACATACATACATACATACATACACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATACATACATATATATACATACATACATACATACATACATACACAT  100

seq1  ATAAAACCTATGATCATCTAATTTACATTGATCTATTTAAGAAAGATCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAACCTATGATCATCTAATTTACATTGATCTATTTAAGAAAGATCAG  150

seq1  AAGATGAAGATCATGCCCACTCTGATAGAAATTCACAGTAAGACAGCCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGAAGATCATGCCCACTCTGATAGAAATTCACAGTAAGACAGCCCT  200

seq1  GTAACATCTTTTAAAGTGGATTCGTCTATTGTAAAGTCTCATATTGCCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACATCTTTTAAAGTGGATTCGTCTATTGTAAAGTCTCATATTGCCTT  250

seq1  TTCCTCTGATGTAATCATTAGGTCATCTACAAGTGAAAAGTACCACAGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCTGATGTAATCATTAGGTCATCTACAAGTGAAAAGTACCACAGGA  300

seq1  ATCTTTTGTTAATCGGATGAGTAGTTGGTTACTGGATATATTATGCCCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTTGTTAATCGGATGAGTAGTTGGTTACTGGATATATTATGCCCAC  350

seq1  AAAGAGGAAAAAGTAAACTGCTGTTGAGAGACAGAGACAGAGAGACAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGGAAAAAGTAAACTGCTGTTGAGAGACAGAGACAGAGAGACAGAG  400

seq1  AGACACAGGACAGAGAGACACAGAGAAAGACAGGGAGAGGGAGAGAGAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACAGGACAGAGAGACACAGAGAAAGACAGGGAGAGGGAGAGAGAGA  450

seq1  CAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  500

seq1  G  501
      |
seq2  G  501

seq1: chr1_67516779_67517798
seq2: B6Ng01-113I04.g_68_1093 (reverse)

seq1  CCTTGAACTTC-AAATTGGT-GTTTAAAGAG-ACCGTCTTTAAACCACAC  47
      ||| ||||||| |||||||| | | |||||| || ||  |||||||||  
seq2  CCTCGAACTTCAAAATTGGTGGATAAAAGAGAACAGTTCTTAAACCACCA  50

seq1  TGACTGTC-TAAAGCTGAGGAGTTCTCCATGCCTTACTTTGAATGTAGTG  96
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||
seq2  TGACTGTCTTAAAGCTGAGGAGTTCTCCATGCCTTTCTTTGAAGTAATTG  100

seq1  ACACAGATAATAGAAGTCTGAGAGTCTA-TAAAATGATGTTTAGGCAAAC  145
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||
seq2  ACACAGATAATAGAAGTCTGAGAGTCTATTAAAATGATG-TTAGGCAAAC  149

seq1  ACT-AACCAAAAGGAATTTGGAGTGAATACACATTAATATTGCTTGAGGT  194
      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAACCAAAAGGAATTGGGAGTGAATACACATTAATATTGCTTGAGGT  199

seq1  AGGCTT-CACATAAGAATTATGAGGATTAAAGTAGCTATTACAGCTTCAA  243
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTCCACATAAGAATTATGAGGATTAAAGTAGCTATTACAGCTTCAA  249

seq1  TCCCTTGAGAATGTGTAACAGTCCTTAATATCAGCTTTTAATAACAGAGC  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTGAGAATGTGTAACAGTCCTTAATATCAGCTTTTAATAACAGAGC  299

seq1  ATCTGTGTTTGTAAAGCAGTATCTCAGAGAATAAAGCAAGAAATAAAAAT  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTGTTTGTAAAGCAGTATCTCAGAGAATAAAGCAAGAAATAAAAAT  349

seq1  CTACAGACTTAAGAGCGTAAGTACCTCTCTGTCAGCAAATTGTAAGCCAA  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGACTTAAGAGCGTAAGTACCTCTCTGTCAGCAAATTGTAAGCCAA  399

seq1  GAGGATGTCAGGTGTCCATAAGAAGATAAGATGGCTTGAATAACATCCCT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATGTCAGGTGTCCATAAGAAGATAAGATGGCTTGAATAACATCCCT  449

seq1  GACCAAGTTGACATGACCAAACACTAAGGAAGAACAGAATATATTTTCAA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAAGTTGACATGACCAAACACTAAGGAAGAACAGAATATATTTTCAA  499

seq1  TGGAACATCAAAAAATTACCACAGTAGATATTATTATGTCTACAATATAA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACATCAAAAAATTACCACAGTAGATATTATTATGTCTACAATATAA  549

seq1  CATTTAACAATTCAGAACATTAACCCTTGTCCATTAATATACTGAAGGGA  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTAACAATTCAGAACATTAACCCTTGTCCATTAATATACTGAAGGGA  599

seq1  ACTTACATAGTGTTACTAATAGTCCTGAGAACCTTTTGCTTTCCTGGCAT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTACATAGTGTTACTAATAGTCCTGAGAACCTTTTGCTTTCCTGGCAT  649

seq1  CTGGAACTATCTGGTGGCTACCCCAGTTCCCCATTCCCCATTATTACACA  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAACTATCTGGTGGCTACCCCAGTTCCCCATTCCCCATTATTACACA  699

seq1  CCTCTGTTCAATTTCCTGACCCTCTGTAAATCTCCCCCATCTCCTCCTGC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGTTCAATTTCCTGACCCTCTGTAAATCTCCCCCATCTCCTCCTGC  749

seq1  TATGCCCACTCCAGTGAAGTCTGCTTGACAGGCCGAGAGGCCTGGAAACA  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCCACTCCAGTGAAGTCTGCTTGACAGGCCGAGAGGCCTGGAAACA  799

seq1  CTCACGAGGCAGAGTTTCAAGGAAACTATGCCTCCTGGAACCTTGGCATT  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACGAGGCAGAGTTTCAAGGAAACTATGCCTCCTGGAACCTTGGCATT  849

seq1  CTCATAGCCCGAATACTCAAACCCTATCCCATTGTTAGTCTGGTGTATGG  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATAGCCCGAATACTCAAACCCTATCCCATTGTTAGTCTGGTGTATGG  899

seq1  TTCCACATGCTCTCTTTCAGTATTGTTTATTATAAATGCCTTTAAGATTT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACATGCTCTCTTTCAGTATTGTTTATTATAAATGCCTTTAAGATTT  949

seq1  GATTTTTTGACATAGCTAAGCCTTTGCCAGTGTACCAATGTCCTAGAAAA  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTTTGACATAGCTAAGCCTTTGCCAGTGTACCAATGTCCTAGAAAA  999

seq1  TCCTTGAAGCTGATGAGCTTGGAATTC  1020
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGAAGCTGATGAGCTTGGAATTC  1026