BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-115A14
Chromosome1 (Build37)
Map Location 135,373,667 - 135,473,479
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC667371
Upstream geneRbbp5, Tmem81, Cntn2, Nfasc, Lrrn2, Mdm4, LOC638636, Pik3c2b, Ppp1r15b, Plekha6, Golt1a, Kiss1, LOC100038824, Ren1, Etnk2, Sox13
Downstream geneSnrpe, Zc3h11a, LOC667118, Lax1, Atp2b4, Optc, Prelp, LOC100042352, LOC100042358, Fmod, Btg2, EG667414, Chit1, Chi3l1, Mybph, Adora1, Myog, Ppfia4, LOC100042382, Tmem183a, 4933406M09Rik, Cyb5r1, Adipor1, Klhl12, Rabif, 4931440L10Rik, Jarid1b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-115A14.bB6Ng01-115A14.g
ACCDH920404DH920405
length9101,105
definitionDH920404|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-115A14, 5' end.DH920405|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-115A14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(135,472,571 - 135,473,479)(135,373,667 - 135,374,790)
sequence
gaattcctctaatcttttgggaacctcagttcagctcaaattgagattca
tagcttcaatgtgaaaaataatttctagattagtcagtataaagcagagt
tcttagtttatttgtactggctagttttatgtcaacttgacacaagctgg
agtcatctgagaggagggaacaccaattgagaaaatgtctccataatatt
gggctgttaacaagcaagcctgcaagacattttcctagtaattgatgagg
acccagcccattgtggcttgagatactcctgagctggtggtcctggattc
tataagaaatcagaccgagaaagctgcaagaagcaagccagtaagaagca
tccacccatggcctctgcatcagctcctggactgcttgagttcctgctct
ggcttccctcagctatggactattacctggaagtgaagggacacaaaccc
tttcctcttcaagttgcttttggtcatgatgtttcatcactgcaatagaa
caacattaatgaagacaacatttaaatataagcttaagcatgagggttca
aagagagaagaggtgaagaggtgctctgaaagaagacaattagaagagta
tgggtgtggtcttctctgagagaatgaatgctgtaagaatccctgtaagc
tcacagagatcagtctacctctgtctcccaagagctgggattaaaagtgt
gtgccaccatgcccagctagctagttgttttttgtttgtttgcttgtttg
tttccagagactatcaggcatgtttacttggagtctcaggagagatttgg
aacaatgttggaaccgttaagaagatggagcagtttctccatcaggaaca
gttaataaaagtaaagcttttagggaacagggttggggatcatgtatggg
gggagggggg
gaattctcacagattcctgctggatgatgtatgtcttagtcactgttcta
gtgctgtgaagagaagcaccatgatcaaggtggctcttataaaagttgct
gacatttttagagggttagtccattatcatcctggcaggctaggtgtggg
tttttgaaaaccttaaagtggacccccccagcaacacacttcttccaaca
aggtcacacctccttaatccttctaattctatcagagagttccttccact
ccctggtgactaagcattcaggtatacgagtctgtggggtcatccctatg
caaacaccacaacttcctaaccaccaggagaaccagcctccattaatggg
caccacattccctttctagttaaaaaagaacacaaaacccttgaacttgg
ttgatatgagccctacagagtcttctcctgtaacgaacttgaagatggat
gtgtagaaatcccacaaacaagctttaagacaaaagcaaagcaactcgtg
catacgctgtccaggatagaacctagggcctcacattggctaagtatacc
ctctattcttgagctgcgctccagaccaagagtgacagaaaagaaagtct
actgatgtaccaggggcttgcaaagggatctttccctagtaggcctttgg
aggaagaccaatcagctgacacttttatttccatctgttgaaaccaagag
tgagatccctgatcatagaaactggagatgacaacttggtgtcgtgtaag
ccactaaacttgtggtgttttgtcacacagttgtaagagccagttggcca
tgactacattctgacaactgtttggagttgagatgagctgtttgtgccag
cgtgctgcagtttctcctgagaagcacagttgcacagggacccacacctc
aggagatgaatgggcaagaagctacattgtagcaagaccctcacataggc
agagtaaggtaactagacatgactacagtctgagtgtttgctagtatctt
tggaaagagatagagaatccaaacttagggtcagaattacatgttcccaa
agagcaaacatatcatggatgtcatgtggtcttgttaagaagggaggggg
atgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_135472571_135473479
seq2: B6Ng01-115A14.b_47_956 (reverse)

seq1  CCCCCCT--CCCCATACATGATCCCCAACCCTGTTCCCTAAAAGCTTTAC  48
      |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCTCCCCCCATACATGATCCCCAACCCTGTTCCCTAAAAGCTTTAC  50

seq1  TTTTATTAACTGTTCCTGATGGAGAAACCTGCTCCATCTTCTTAACGGTT  98
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTAACTGTTCCTGATGGAGAAA-CTGCTCCATCTTCTTAACGGTT  99

seq1  CCAACATTGTTCCAAATCTCTCCTGAGACTCCAAGTAAACATGCCTGATA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACATTGTTCCAAATCTCTCCTGAGACTCCAAGTAAACATGCCTGATA  149

seq1  GTCTCTGGAAACAAACAAGCAAACAAACAAAAAACAACTAGCTAGCTGGG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTGGAAACAAACAAGCAAACAAACAAAAAACAACTAGCTAGCTGGG  199

seq1  CATGGTGGCACACACTTTTAATCCCAGCTCTTGGGAGACAGAGGTAGACT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTGGCACACACTTTTAATCCCAGCTCTTGGGAGACAGAGGTAGACT  249

seq1  GATCTCTGTGAGCTTACAGGGATTCTTACAGCATTCATTCTCTCAGAGAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCTGTGAGCTTACAGGGATTCTTACAGCATTCATTCTCTCAGAGAA  299

seq1  GACCACACCCATACTCTTCTAATTGTCTTCTTTCAGAGCACCTCTTCACC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCACACCCATACTCTTCTAATTGTCTTCTTTCAGAGCACCTCTTCACC  349

seq1  TCTTCTCTCTTTGAACCCTCATGCTTAAGCTTATATTTAAATGTTGTCTT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTCTCTTTGAACCCTCATGCTTAAGCTTATATTTAAATGTTGTCTT  399

seq1  CATTAATGTTGTTCTATTGCAGTGATGAAACATCATGACCAAAAGCAACT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAATGTTGTTCTATTGCAGTGATGAAACATCATGACCAAAAGCAACT  449

seq1  TGAAGAGGAAAGGGTTTGTGTCCCTTCACTTCCAGGTAATAGTCCATAGC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAGGAAAGGGTTTGTGTCCCTTCACTTCCAGGTAATAGTCCATAGC  499

seq1  TGAGGGAAGCCAGAGCAGGAACTCAAGCAGTCCAGGAGCTGATGCAGAGG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGAAGCCAGAGCAGGAACTCAAGCAGTCCAGGAGCTGATGCAGAGG  549

seq1  CCATGGGTGGATGCTTCTTACTGGCTTGCTTCTTGCAGCTTTCTCGGTCT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGGTGGATGCTTCTTACTGGCTTGCTTCTTGCAGCTTTCTCGGTCT  599

seq1  GATTTCTTATAGAATCCAGGACCACCAGCTCAGGAGTATCTCAAGCCACA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCTTATAGAATCCAGGACCACCAGCTCAGGAGTATCTCAAGCCACA  649

seq1  ATGGGCTGGGTCCTCATCAATTACTAGGAAAATGTCTTGCAGGCTTGCTT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCTGGGTCCTCATCAATTACTAGGAAAATGTCTTGCAGGCTTGCTT  699

seq1  GTTAACAGCCCAATATTATGGAGACATTTTCTCAATTGGTGTTCCCTCCT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAACAGCCCAATATTATGGAGACATTTTCTCAATTGGTGTTCCCTCCT  749

seq1  CTCAGATGACTCCAGCTTGTGTCAAGTTGACATAAAACTAGCCAGTACAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGATGACTCCAGCTTGTGTCAAGTTGACATAAAACTAGCCAGTACAA  799

seq1  ATAAACTAAGAACTCTGCTTTATACTGACTAATCTAGAAATTATTTTTCA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACTAAGAACTCTGCTTTATACTGACTAATCTAGAAATTATTTTTCA  849

seq1  CATTGAAGCTATGAATCTCAATTTGAGCTGAACTGAGGTTCCCAAAAGAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGAAGCTATGAATCTCAATTTGAGCTGAACTGAGGTTCCCAAAAGAT  899

seq1  TAGAGGAATTC  909
      |||||||||||
seq2  TAGAGGAATTC  910

seq1: chr1_135373667_135374790
seq2: B6Ng01-115A14.g_69_1173

seq1  GAATTCTCACAGATTCCTGCTGGATGATGTATGTCTTAGTCACTGTTCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCACAGATTCCTGCTGGATGATGTATGTCTTAGTCACTGTTCTA  50

seq1  GTGCTGTGAAGAGAAGCACCATGATCAAGGTGGCTCTTATAAAAGTTGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGTGAAGAGAAGCACCATGATCAAGGTGGCTCTTATAAAAGTTGCT  100

seq1  GACATTTTTAGAGGGTTAGTCCATTATCATCCTGGCAGGCTAGGTGTGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATTTTTAGAGGGTTAGTCCATTATCATCCTGGCAGGCTAGGTGTGGG  150

seq1  TTTTTGAAAACCTTAAAGTGGACCCCCCCAGCAACACACTTCTTCCAACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGAAAACCTTAAAGTGGACCCCCCCAGCAACACACTTCTTCCAACA  200

seq1  AGGTCACACCTCCTTAATCCTTCTAATTCTATCAGAGAGTTCCTTCCACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCACACCTCCTTAATCCTTCTAATTCTATCAGAGAGTTCCTTCCACT  250

seq1  CCCTGGTGACTAAGCATTCAGGTATACGAGTCTGTGGGGTCATCCCTATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGTGACTAAGCATTCAGGTATACGAGTCTGTGGGGTCATCCCTATG  300

seq1  CAAACACCACAACTTCCTAACCACCAGGAGAACCAGCCTCCATTAATGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACACCACAACTTCCTAACCACCAGGAGAACCAGCCTCCATTAATGGG  350

seq1  CACCACATTCCCTTTCTAGTTAAAAAAGAACACAAAACCCTTGAACTTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACATTCCCTTTCTAGTTAAAAAAGAACACAAAACCCTTGAACTTGG  400

seq1  TTGATATGAGCCCTACAGAGTCTTCTCCTGTAACGAACTTGAAGATGGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATATGAGCCCTACAGAGTCTTCTCCTGTAACGAACTTGAAGATGGAT  450

seq1  GTGTAGAAATCCCACAAACAAGCTTTAAGACAAAAGCAAAGCAACTCGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAGAAATCCCACAAACAAGCTTTAAGACAAAAGCAAAGCAACTCGTG  500

seq1  CATACGCTGTCCAGGATAGAACCTAGGGCCTCACATTGGCTAAGTATACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACGCTGTCCAGGATAGAACCTAGGGCCTCACATTGGCTAAGTATACC  550

seq1  CTCTATTCTTGAGCTGCGCTCCAGACCAAGAGTGACAGAAAAGAAAGTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATTCTTGAGCTGCGCTCCAGACCAAGAGTGACAGAAAAGAAAGTCT  600

seq1  ACTGATGTACCAGGGGCTTGCAAAGGGATCTTTCCCTAGTAGGCCTTTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGATGTACCAGGGGCTTGCAAAGGGATCTTTCCCTAGTAGGCCTTTGG  650

seq1  AGGAAGACCAATCAGCTGACACTTTTATTTCCATCTGTTGAAACCAAGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGACCAATCAGCTGACACTTTTATTTCCATCTGTTGAAACCAAGAG  700

seq1  TGAGATCCCTGATCATAGAAACTGGAGATGACAACTTGGTGTCGTGTAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATCCCTGATCATAGAAACTGGAGATGACAACTTGGTGTCGTGTAAG  750

seq1  CCACTAAACTTGTGGTGTTTTGTCACACAGTTGTAAGAGCCAGTTGGCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTAAACTTGTGGTGTTTTGTCACACAGTTGTAAGAGCCAGTTGGCCA  800

seq1  TGACTACATTCTGACAACTGTTTGGAGTTGAGATGAGCTGTTTGTGCCAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTACATTCTGACAACTGTTTGGAGTTGAGATGAGCTGTTTGTGCCAG  850

seq1  CGTGCTGCAGTTTCTCCTGAGAAAGCACAGTTGCACAGGGACCCACACCT  900
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGCTGCAGTTTCTCCTGAG-AAGCACAGTTGCACAGGGACCCACACCT  899

seq1  CAGGAGGATGAAATGGGCAAGAAGCTACATTTGTAGCAAGACCCTCAACA  950
      ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||
seq2  CAGGA-GATG-AATGGGCAAGAAGCTACA-TTGTAGCAAGACCCTC-ACA  945

seq1  TAAGCAGAGTTAAGGTTAACTAGACAATGACTACAGTTCTGAGTGTTTTG  1000
      || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||
seq2  TAGGCAGAG-TAAGG-TAACTAGAC-ATGACTACAG-TCTGAGTG-TTTG  990

seq1  CTAGTATCTTTGGAAAGAAGGATAGAGAATCCAAACTTAGGGTCAGAATT  1050
      ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTATCTTTGGAAAGA--GATAGAGAATCCAAACTTAGGGTCAGAATT  1038

seq1  ACATTGTTCCCAAAGGAGCAAAACAATATCATGGATGCCATGTGGTCTTG  1100
      ||| |||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||||
seq2  ACA-TGTTCCCAAA-GAGCAAA--CATATCATGGATGTCATGTGGTCTTG  1084

seq1  TTATAAAGAAGGGAGGGGGATGTG  1124
      ||   |||||||||||||||||||
seq2  TT---AAGAAGGGAGGGGGATGTG  1105