BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-116M21
Chromosome1 (Build37)
Map Location 17,733,554 - 17,733,712
singlet/doubletsinglet
Overlap geneCrispld1
Upstream geneLOC100040056, LOC665496, EG545306, Jph1, Gdap1, LOC383495, Rbm6-ps1, Ppia-ps1_125.1, Pi15
Downstream geneLOC665564, LOC100040126, Crisp4, EG574082, EG654460, Defb17, LOC383499
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-116M21.bB6Ng01-116M21.g
ACCDH921712DH921713
length159971
definitionDH921712|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-116M21, 5' end.DH921713|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-116M21, 3' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
catacctatatgtgtttgtaaatgtatgtgcatgtgtatgtatatataat
ctgagtgcatgcttgttcatgtggaaatgtacctgtgtgtgtgcgtgtga
gcacatctgagtatgtgtgtatgtataagtttttgtgtgtgtatgtgtgt
gtatgtgtg
gaattcctctacttgcttaagggtcatgggcttgtttagatttctgcctg
tttgatttaagtttggtatgtggtatctgtctagaaaatgatccatttca
tctagattttccagtttgcttgagtataggattttgtaataggatttgat
gaattttttaatttctccatttctgttgttgtgtcttccttttcatttct
gattttgctaatttggatactgcttctgggccctttagttagtttggcta
gggatttatccatcttgttgattctctcaaagaaccagattttggttttg
ttgattttttgttgttctctttgtttctatttcattgatttcagccctga
gtttgactattccctgctgtctattcctctttcctgtgttgtttcttttt
gtcctagagctcttaggtttgctgtttagttggtagtgtaagatctctct
agattctttaccgtgtctcttagtgctatgaattttcctcttataactgc
tttcatttagttccataagtttgtgaatgatatgccaatactttcattaa
attctcagaagcctttaatttctttatttatcccctgactaagttatcat
tgagtatagaattattcagtttccacatgaatgtgggctttctgttgtat
ttgctgttattgaagaccagtcttcagccacggagatctgataagatgca
tgagattgtttcaatcttcttatatcagttgagggttgttttgtgagcat
atatgtggtcagtcttggagaaagtacaatgaggtgctgagaaggtatat
ttttagttttagagtgaattgtccttctagatgtctgttaaatccctttg
gttcataacctgtattagtttcaatgggtctctgtttagtctgtattcca
tgacctatccattgatgagagtgtgtagttgaagtctctcatattattat
ttgggtcatgtgtgtttgagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_17733554_17733712
seq2: B6Ng01-116M21.b_52_210

seq1  CATACCTATATGTGTTTGTAAATGTATGTGCATGTGTATGTATATATAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACCTATATGTGTTTGTAAATGTATGTGCATGTGTATGTATATATAAT  50

seq1  CTGAGTGCATGCTTGTTCATGTGGAAATGTACCTGTGTGTGTGCGTGTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTGCATGCTTGTTCATGTGGAAATGTACCTGTGTGTGTGCGTGTGA  100

seq1  GCACATCTGAGTATGTGTGTATGTATAAGTTTTTGTGTGTGTATGTGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATCTGAGTATGTGTGTATGTATAAGTTTTTGTGTGTGTATGTGTGT  150

seq1  GTATGTGTG  159
      |||||||||
seq2  GTATGTGTG  159