BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-124L22
Chromosome1 (Build37)
Map Location 65,201,428 - 65,370,290
singlet/doubletdoublet
Overlap geneIdh1, Pip5k3, Pthr2
Upstream geneLOC100043124, Creb1, 2310038H17Rik, Ccnyl1, Fzd5, 9430067K14Rik, LOC667245, LOC100043141, 4921521F21Rik, LOC667276, Cryge, Crygd, Crygc, Crygb, LOC654356, Cryga, D630023F18Rik
Downstream geneLOC100042716, EG628894, LOC100043165, LOC383520, EG667775, Crygf, LOC667781, EG667786, Mtap2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-124L22.bB6Ng01-124L22.g
ACCDH927574DH927575
length1,1691,118
definitionDH927574|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124L22, 5' end.DH927575|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124L22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(65,369,120 - 65,370,290)(65,201,428 - 65,202,541)
sequence
gaattcaattccaatgttgcacattagcactcacaattactataactgga
ataaattatttgtttaatagacaaagattatcagaataagtaaggaaaaa
ttcatgtgtgaactgtttgcataaaatgttcctagctgagcacaccttta
atctaagcacttgagtggcagaggcaggtacatctctgtgagtttgaggt
cagcttgatctacacagtgagttcctgactatatagacaaatcctgtctc
aaaacaaaacaaaaaagacattcctaaaatatataaatgtatgaaaaatt
taataaactaatgggaaatataagtacttgtttaaaagatagtattacaa
attttcaagataaaaagtttctggaggtcctaatacgcaataatgtgaac
atacttagtacttgaatagtaaacttagatgtaggtaaaactgttaagtt
taaaattgtgtccatatcacatttaaaacatttttaaaggattgaaaaaa
ttacactaaattaacaaagcaaaaaattggtgttgattaaatattactat
tttaatgtgattgtttaagtatatataattttaatattccaatcataagt
atctatagagtattagaagcctttatattgataacatgtttaagcactag
acatgaatttctaaacttaatgtatttagtaacatagtttcaaagtactt
gatttgagaactattcaatgaacttttcaatgaaaatattcaccatcaag
ctattattaaaaacatgtatcttaagaaataaaaggtcaagtgatcatta
ttctggatacagaacatatgaacagtgtaactgataagcttaacctggag
gattctataaaacacagtgttggaaagtggagcacacacatttcctttga
aaaccatatagatcattcatcaggagtggctgcagtaaagggccaccaag
tctcacacactttgataagtcaccatcatgcaaactacaattttctgatc
ataatgaatggaaaatcagtcacagtttctgaacattacaaaccagcata
cgcagatattaacctgaaaattatattgaggtatagatagctttagaaga
catgctcgttcagtagtggaaacttaggaactcaagtaatcaacccccaa
tttctgacctgaattagaa
gaattctcctatgcccctgaatcctgctgctgccaacattttgctgagga
gtcattttccaggtcagtagtcctgaccctcctgtggttacaaaatcaac
cattagcctgtggacacattagtcagcagctaatctgatagttgttttag
acattaactggctcttggccagatgctgggcttgggcaatgtagtggcac
tcatttgagtgactcccagaatctttgagagcaggaggggtgaagagatc
acccagtccaaagccattgttctgttccacactgtttcttcctcctaagc
ttccaaacctgaaacaaacaggtggagagagacaaggctttgctgagtca
ggactcctgaagtccctttgccaatggccattgacatattctgtagtctc
aagcaaagctccttccactgccttcatgtccttccttacaacatattagt
agtgatagctaccacctaccatgaagagtctatgaaacaaaagatagtag
aaatgggattcatccttttgtttgtttgtttgtaacagattctcacatag
tacctagccttgaccttgctctgtattggaggataaccttaaacttctga
tgctctgccttcagctccaggcctataccactatgtctgactttatgcag
agctcatcattaaacggaggagggtcagtggcagtaggtaaatactctac
tccccaagtccttccctaaacacaaagcttcataaattatgaccttgcca
ataaagggtgaaatggctgttgtaataattatcaaagtattaacagtcaa
aagtccaaacagaaggttagtaagcatagataggcaaggtgaatataaac
ttgttgacactcttatgttaggagtcagtcttggtatgttgctgaggctg
atctaaactttggctcctcaagtcatcctctatctcagatttccaggtag
ctggggaccatgggacacataccgtcacccaagatgacaccttatttttt
gaattgtaaagatttaagtcagaactttttaggtttgttttttttccaga
caggggtggctctgggctgtctgtgatctcaccagtctggaagacaccct
ggccttggaccttaaaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_65369120_65370290
seq2: B6Ng01-124L22.b_45_1213 (reverse)

seq1  TTCTAAATTCAGGTCAGAAA-TGGGGGTTGATTTACTGAGTTTCCTAAGT  49
      |||| ||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||||||
seq2  TTCT-AATTCAGGTCAGAAATTGGGGGTTGATTACTTGAG-TTCCTAAGT  48

seq1  TTCAACTAACTGAACGAAGCAATGTC-TCTAAAGCTATCTATACCTC-AT  97
      ||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||
seq2  TTCCACT-ACTGAACG-AGC-ATGTCTTCTAAAGCTATCTATACCTCAAT  95

seq1  ATAATTTTCAGGTTAATATCTGCGTATGCTGGTTTGTAAATGTTCAGAAA  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ATAATTTTCAGGTTAATATCTGCGTATGCTGGTTTGT-AATGTTCAGAAA  144

seq1  CTGTGACTGATTTTTCCATTCATTATGATCAGAAAA-TGTAGTTTGCATG  196
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CTGTGACTGA-TTTTCCATTCATTATGATCAGAAAATTGTAGTTTGCATG  193

seq1  ATGGTGACTTATCAAAGTGTGTTGAGACTTGGTGG-CCTTTACTGCAGCC  245
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ATGGTGACTTATCAAAGTGTG-TGAGACTTGGTGGCCCTTTACTGCAGCC  242

seq1  ACTCCTGATGAATGATCTATATGGTTTTCAAAGG-AATGTGTGTGCTCCA  294
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ACTCCTGATGAATGATCTATATGGTTTTCAAAGGAAATGTGTGTGCTCCA  292

seq1  CTTTCCAACACTGTGTTTTATAGAATCCTCCAGGTTAAGCTTATCAGTTA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCAACACTGTGTTTTATAGAATCCTCCAGGTTAAGCTTATCAGTTA  342

seq1  CACTGTTCATATGTTCTGTATCCAGAATAATGATCACTTGACCTTTTATT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTTCATATGTTCTGTATCCAGAATAATGATCACTTGACCTTTTATT  392

seq1  TCTTAAGATACATGTTTTTAATAATAGCTTGATGGTGAATATTTTCATTG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAGATACATGTTTTTAATAATAGCTTGATGGTGAATATTTTCATTG  442

seq1  AAAAGTTCATTGAATAGTTCTCAAATCAAGTACTTTGAAACTATGTTACT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTTCATTGAATAGTTCTCAAATCAAGTACTTTGAAACTATGTTACT  492

seq1  AAATACATTAAGTTTAGAAATTCATGTCTAGTGCTTAAACATGTTATCAA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACATTAAGTTTAGAAATTCATGTCTAGTGCTTAAACATGTTATCAA  542

seq1  TATAAAGGCTTCTAATACTCTATAGATACTTATGATTGGAATATTAAAAT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAGGCTTCTAATACTCTATAGATACTTATGATTGGAATATTAAAAT  592

seq1  TATATATACTTAAACAATCACATTAAAATAGTAATATTTAATCAACACCA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATACTTAAACAATCACATTAAAATAGTAATATTTAATCAACACCA  642

seq1  ATTTTTTGCTTTGTTAATTTAGTGTAATTTTTTCAATCCTTTAAAAATGT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTTGCTTTGTTAATTTAGTGTAATTTTTTCAATCCTTTAAAAATGT  692

seq1  TTTAAATGTGATATGGACACAATTTTAAACTTAACAGTTTTACCTACATC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATGTGATATGGACACAATTTTAAACTTAACAGTTTTACCTACATC  742

seq1  TAAGTTTACTATTCAAGTACTAAGTATGTTCACATTATTGCGTATTAGGA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTTACTATTCAAGTACTAAGTATGTTCACATTATTGCGTATTAGGA  792

seq1  CCTCCAGAAACTTTTTATCTTGAAAATTTGTAATACTATCTTTTAAACAA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCAGAAACTTTTTATCTTGAAAATTTGTAATACTATCTTTTAAACAA  842

seq1  GTACTTATATTTCCCATTAGTTTATTAAATTTTTCATACATTTATATATT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTATATTTCCCATTAGTTTATTAAATTTTTCATACATTTATATATT  892

seq1  TTAGGAATGTCTTTTTTGTTTTGTTTTGAGACAGGATTTGTCTATATAGT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGAATGTCTTTTTTGTTTTGTTTTGAGACAGGATTTGTCTATATAGT  942

seq1  CAGGAACTCACTGTGTAGATCAAGCTGACCTCAAACTCACAGAGATGTAC  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAACTCACTGTGTAGATCAAGCTGACCTCAAACTCACAGAGATGTAC  992

seq1  CTGCCTCTGCCACTCAAGTGCTTAGATTAAAGGTGTGCTCAGCTAGGAAC  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCTGCCACTCAAGTGCTTAGATTAAAGGTGTGCTCAGCTAGGAAC  1042

seq1  ATTTTATGCAAACAGTTCACACATGAATTTTTCCTTACTTATTCTGATAA  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTATGCAAACAGTTCACACATGAATTTTTCCTTACTTATTCTGATAA  1092

seq1  TCTTTGTCTATTAAACAAATAATTTATTCCAGTTATAGTAATTGTGAGTG  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGTCTATTAAACAAATAATTTATTCCAGTTATAGTAATTGTGAGTG  1142

seq1  CTAATGTGCAACATTGGAATTGAATTC  1171
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGTGCAACATTGGAATTGAATTC  1169

seq1: chr1_65201428_65202541
seq2: B6Ng01-124L22.g_72_1189

seq1  GAATTCTCCTATGCCCCTGAATCCTGCTGCTGCCAACATTTTGCTGAGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTATGCCCCTGAATCCTGCTGCTGCCAACATTTTGCTGAGGA  50

seq1  GTCATTTTCCAGGTCAGTAGTCCTGACCCTCCTGTGGTTACAAAATCAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTTTCCAGGTCAGTAGTCCTGACCCTCCTGTGGTTACAAAATCAAC  100

seq1  CATTAGCCTGTGGACACATTAGTCAGCAGCTAATCTGATAGTTGTTTTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAGCCTGTGGACACATTAGTCAGCAGCTAATCTGATAGTTGTTTTAG  150

seq1  ACATTAACTGGCTCTTGGCCAGATGCTGGGCTTGGGCAATGTAGTGGCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTAACTGGCTCTTGGCCAGATGCTGGGCTTGGGCAATGTAGTGGCAC  200

seq1  TCATTTGAGTGACTCCCAGAATCTTTGAGAGCAGGAGGGGTGAAGAGATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTGAGTGACTCCCAGAATCTTTGAGAGCAGGAGGGGTGAAGAGATC  250

seq1  ACCCAGTCCAAAGCCATTGTTCTGTTCCACACTGTTTCTTCCTCCTAAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGTCCAAAGCCATTGTTCTGTTCCACACTGTTTCTTCCTCCTAAGC  300

seq1  TTCCAAACCTGAAACAAACAGGTGGAGAGAGACAAGGCTTTGCTGAGTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAACCTGAAACAAACAGGTGGAGAGAGACAAGGCTTTGCTGAGTCA  350

seq1  GGACTCCTGAAGTCCCTTTGCCAATGGCCATTGACATATTCTGTAGTCTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCCTGAAGTCCCTTTGCCAATGGCCATTGACATATTCTGTAGTCTC  400

seq1  AAGCAAAGCTCCTTCCACTGCCTTCATGTCCTTCCTTACAACATATTAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAAGCTCCTTCCACTGCCTTCATGTCCTTCCTTACAACATATTAGT  450

seq1  AGTGATAGCTACCACCTACCATGAAGAGTCTATGAAACAAAAGATAGTAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATAGCTACCACCTACCATGAAGAGTCTATGAAACAAAAGATAGTAG  500

seq1  AAATGGGATTCATCCTTTTGTTTGTTTGTTTGTAACAGATTCTCACATAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGGATTCATCCTTTTGTTTGTTTGTTTGTAACAGATTCTCACATAG  550

seq1  TACCTAGCCTTGACCTTGCTCTGTATTGGAGGATAACCTTAAACTTCTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTAGCCTTGACCTTGCTCTGTATTGGAGGATAACCTTAAACTTCTGA  600

seq1  TGCTCTGCCTTCAGCTCCAGGCCTATACCACTATGTCTGACTTTATGCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTGCCTTCAGCTCCAGGCCTATACCACTATGTCTGACTTTATGCAG  650

seq1  AGCTCATCATTAAACGGAGGAGGGTCAGTGGCAGTAGGTAAATACTCTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCATCATTAAACGGAGGAGGGTCAGTGGCAGTAGGTAAATACTCTAC  700

seq1  TCCCCAAGTCCTTCCCTAAACACAAAGCTTCATAAATTATGACCTTGCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCAAGTCCTTCCCTAAACACAAAGCTTCATAAATTATGACCTTGCCA  750

seq1  ATAAAGGGTGAAATGGCTGTTGTAATAATTATCAAAGTATTAACAGTCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGGGTGAAATGGCTGTTGTAATAATTATCAAAGTATTAACAGTCAA  800

seq1  AAGTCCAAACAGAA-GTTAGTAAGCATAGATAAGGCAAGGTGAATATAAA  849
      |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCAAACAGAAGGTTAGTAAGCATAGAT-AGGCAAGGTGAATATAAA  849

seq1  CTTGTTGACAACTCTTATGTTAAGAGTCAGTCTTGTTATGTTGCTGAGGC  899
      ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CTTGTTGAC-ACTCTTATGTTAGGAGTCAGTCTTGGTATGTTGCTGAGGC  898

seq1  TGATCTTAAACTTTGGCT-CTCAAGTCATCCTCTAATCTTCAGATTTCCA  948
      ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||
seq2  TGATC-TAAACTTTGGCTCCTCAAGTCATCCTCT-ATC-TCAGATTTCCA  945

seq1  AGTAGCT-GAGACCAT-GGACACATACCGTCACCCAAGATGACA-CTTAT  995
       |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GGTAGCTGGGGACCATGGGACACATACCGTCACCCAAGATGACACCTTAT  995

seq1  TTTTTGAA-TGTAAA-ATTTAAGTCTAGAACTTTTTA-GTTTGTTTTTTT  1042
      |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
seq2  TTTTTGAATTGTAAAGATTTAAGTC-AGAACTTTTTAGGTTTGTTTTTTT  1044

seq1  TCAAGACAGGTGTAGCTCT-GGCTGTCCTGGATCTCACCAGTCTG--AGA  1089
      || ||||||| || ||||| |||||||   |||||||||||||||  |||
seq2  TCCAGACAGGGGTGGCTCTGGGCTGTCTGTGATCTCACCAGTCTGGAAGA  1094

seq1  CCACGCTGGCCTT-GACCTTAGAAAG  1114
       ||| |||||||| ||||||| ||||
seq2  -CACCCTGGCCTTGGACCTTA-AAAG  1118