BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-131P03
Chromosome1 (Build37)
Map Location 63,742,296 - 63,868,950
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMdh1b, Fastkd2, 4933402D24Rik
Upstream geneNrp2, LOC100043070, A430093A21Rik, Ndufs1, Eef1b2, Gpr1, 1700039I01Rik, 4930431J08Rik, LOC667644, LOC100042638, Adam23, Gm215
Downstream geneLOC671842, OTTMUSG00000013918, Klf7, Ppia-ps1_583.1, LOC100043124, Creb1, 2310038H17Rik, Ccnyl1, Fzd5, 9430067K14Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-131P03.bB6Ng01-131P03.g
ACCDH932876DH932877
length1,2391,164
definitionDH932876|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131P03, 5' end.DH932877|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131P03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,742,296 - 63,743,556)(63,867,782 - 63,868,950)
sequence
gaattcatatctgacataaaggtctccaactcatttttaattactttttg
tataggaggaaagataaggggtatagttttattcttctacgcatggatat
cacttttcctgaaacaatttcttgaaggaaaaaacgccttttctctggtg
aatgcttttgatctttgccaaaaatcaggtagttgtaactgtgtggtttt
attcctgggtcccatattcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttcatg
tgtgtgcaggtacatgattttcagccaccaaaactatgaatttttgaagc
tacaagcccaataacacagagacagttttggtgagggtctgcatgtctgt
atcatatcacggcagatggcaatatgaagtggggaacattcaggaaggag
gaattatctgatcatacaggaagcaacattatgtataagtctggttcttt
tataattagttcagagcctctcaggaatactttaattgtttctgagggca
gtgctttatatagacctcactctaggtatctgccacttgaaactctcacc
agttattaacactaccacacaggaaaaaaaacaaaaacaaccaaccaact
aaccaaccaattaaccaaccaactaaccaaccaaccaaacaaacaaaccc
tgaaaccaaaacaccaaatcttagggggagcaaaccacatacaatccaca
gtatagttatttgaatgagaatggcccccataggctcatatgtttgaaag
gctgaggccccaggtggtggaacagtttgggaaggattgttggcagggat
atgtcactggctttgagatttcaaaattccatgctattcccagttagatt
tctgtctttgcctcatgcttatgacatcaagatgcatgcctcacaccctg
gactgcctattgtcatactctctactattatggtcacaccctaaagaaat
gctttcttttgtacgtggccttgatatagtgtctcatcacagcatacagt
gaaagcagacacagcacatactgagactcattacagatttttgggtgtgt
tacaaaagttggtttgtagcattgtttgatgtgactatgtatgtggatct
tgaaagaatagaatttgtggctttttcttccagattgcgggcctactcag
gaagagggaaacgagaatgtgactctactagcatgttctctggataccgc
agctcagaatacttggataggtctctctctctaaggctc
gaattcttgtaagcaagatattgctaaatggtgtacagtggtcagccttg
cctttggccaagtattggtctactccaagtactgatgggtagggaagaag
ttaaaccaacatgagaaagagcccaggaacagcagttcacccaagccttg
ctcaaaacagcttcaagtgggtgacagtgatgcatatcacaccatccaat
gaccaaactccaccaggctggaggtcctcatctctgcctcggtcactgct
tctcttgaccagtgtgttcagggtagtgttcgggtttcatgcttgctaat
acattcttctcacttctgactctaattcataactcttctctcatgacttc
tgaaggattgggacaattttctctgcagcaacttccagtagtgctatcat
ctgctattgtggctatgacaaatgataaagcttactatgagtaatttctt
agccatcgttaaccttgcttggcagagcagggccactaagtgctggccag
cctgccttctgtccatcctggtcctcagctgggttgggtcagtgaatgag
tgacacagaacatggaattatacttcacaagaaatgtctcagctgctatc
taggcaggcactgtgagcttggaaaatttccttccaagttgggaattaaa
ggagacaccttacagttgatggccctctgtatctcttaattccacagtca
cagattcaaccaactgcagcttgaaaatatttctcaaagtgcatctgtac
tgaatatttagaggccattcttgtcattgttccctaaaccgtacattctg
tttaagtaggtttatgttgtacccagcattatgagtaacctggacatgag
aggatgccgctggctatatggaaacagcagctacttcatataagggcttg
atttgttatctgtggggtcctgtagccaatgcctactggacacctaagga
taattcatttgtttgatagatgacacgtgctttaaatagaacacttgagg
tactccagaagaaagcaaaggacagaatgcctcttactgtgacatccctg
ttccctccacattgtttccctccctgccaagccccacagagttcatctca
cacccctttcctgcaagcccttgcgctggagccagacctgtaacctgctc
ctccttagtacaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_63742296_63743556
seq2: B6Ng01-131P03.b_50_1288

seq1  GAATTCATATCTGACATAAAGGTCTCCAACTCATTTTTAATTACTTTTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATATCTGACATAAAGGTCTCCAACTCATTTTTAATTACTTTTTG  50

seq1  TATAGGAGGAAAGATAAGGGGTATAGTTTTATTCTTCTACGCATGGATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGGAGGAAAGATAAGGGGTATAGTTTTATTCTTCTACGCATGGATAT  100

seq1  CACTTTTCCTGAAACAATTTCTTGAAGGAAAAAACGCCTTTTCTCTGGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTTCCTGAAACAATTTCTTGAAGGAAAAAACGCCTTTTCTCTGGTG  150

seq1  AATGCTTTTGATCTTTGCCAAAAATCAGGTAGTTGTAACTGTGTGGTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCTTTTGATCTTTGCCAAAAATCAGGTAGTTGTAACTGTGTGGTTTT  200

seq1  ATTCCTGGGTCCCATATTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTGGGTCCCATATTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATG  250

seq1  TGTGTGCAGGTACATGATTTTCAGCCACCAAAACTATGAATTTTTGAAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGCAGGTACATGATTTTCAGCCACCAAAACTATGAATTTTTGAAGC  300

seq1  TACAAGCCCAATAACACAGAGACAGTTTTGGTGAGGGTCTGCATGTCTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGCCCAATAACACAGAGACAGTTTTGGTGAGGGTCTGCATGTCTGT  350

seq1  ATCATATCACGGCAGATGGCAATATGAAGTGGGGAACATTCAGGAAGGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATATCACGGCAGATGGCAATATGAAGTGGGGAACATTCAGGAAGGAG  400

seq1  GAATTATCTGATCATACAGGAAGCAACATTATGTATAAGTCTGGTTCTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTATCTGATCATACAGGAAGCAACATTATGTATAAGTCTGGTTCTTT  450

seq1  TATAATTAGTTCAGAGCCTCTCAGGAATACTTTAATTGTTTCTGAGGGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATTAGTTCAGAGCCTCTCAGGAATACTTTAATTGTTTCTGAGGGCA  500

seq1  GTGCTTTATATAGACCTCACTCTAGGTATCTGCCACTTGAAACTCTCACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTTATATAGACCTCACTCTAGGTATCTGCCACTTGAAACTCTCACC  550

seq1  AGTTATTAACACTACCACACAGGAAAAAAAACAAAAACAACCAACCAACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATTAACACTACCACACAGGAAAAAAAACAAAAACAACCAACCAACT  600

seq1  AACCAACCAATTAACCAACCAACTAACCAACCAACCAAACAAACAAACCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAACCAATTAACCAACCAACTAACCAACCAACCAAACAAACAAACCC  650

seq1  TGAAACCAAAACACCAAATCTTAGGGGGAGCAAACCACATACAATCCACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACCAAAACACCAAATCTTAGGGGGAGCAAACCACATACAATCCACA  700

seq1  GTATAGTTATTTGAATGAGAATGGCCCCCATAGGCTCATATGTTTG-AAG  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GTATAGTTATTTGAATGAGAATGGCCCCCATAGGCTCATATGTTTGAAAG  750

seq1  GCTGAGGCCCCAGGTGGTGGAACAGTTTGGGAAGGATTGTTGGCAGGGAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGGCCCCAGGTGGTGGAACAGTTTGGGAAGGATTGTTGGCAGGGAT  800

seq1  ATGTCACTGGCTTTGAGATTTCAAAATTCCATGCTATTCCCAGTTAGATT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCACTGGCTTTGAGATTTCAAAATTCCATGCTATTCCCAGTTAGATT  850

seq1  TCTGTCTTTGCCTCATGCTTATGACATCAAGATGCATGCCTCACACCCTG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTTTGCCTCATGCTTATGACATCAAGATGCATGCCTCACACCCTG  900

seq1  GACTGCCTATTGTCATACTCTCTACTATTATGGTCACACCCTAAAGAAAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCCTATTGTCATACTCTCTACTATTATGGTCACACCCTAAAGAAAT  950

seq1  GCTTTCTTTTGTACGTGGCCTTGATTATAGTGTCTCATCACAGCAATACA  999
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| 
seq2  GCTTTCTTTTGTACGTGGCCTTGA-TATAGTGTCTCATCACAGC-ATAC-  997

seq1  AGTGAAAGCAGGACACAGCACATACTGAGAACTCATTACAAGATTTTTGG  1049
      |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  AGTGAAAGCA-GACACAGCACATACTGAG-ACTCATTAC-AGATTTTTGG  1044

seq1  GTGTG-TACAAAAGTTGGTTTGGTAGCATTGTTTGAATGTGACTAATGTA  1098
      ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||
seq2  GTGTGTTACAAAAGTTGGTTT-GTAGCATTGTTTG-ATGTGACT-ATGTA  1091

seq1  TGTGGTTCTTGAAAAGGATAGAATTTGTGGCTTTTTCCTCCCAGATTGTC  1148
      ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |
seq2  TGTGGATCTTG-AAAGAATAGAATTTGTGGCTTTTT-CTTCCAGATTG-C  1138

seq1  GGGAGCATACTTCCAGGAAGAGGGGAAACAGAGTATGTGGCATCTTCACT  1198
      ||  || ||||  |||||||| ||||||| ||| ||||| | |||  |||
seq2  GG--GCCTACT--CAGGAAGA-GGGAAAC-GAGAATGTGAC-TCT--ACT  1179

seq1  AAAAGCCATGTGTCTCTGTAT-CAGCAAAGCAAGAGACTTGTGATTAGGT  1247
      |     ||||| |||||| || | |||   ||  | ||||| || |||||
seq2  A----GCATGT-TCTCTGGATACCGCAGCTCAGAATACTTG-GA-TAGGT  1222

seq1  CTCTCTCT---AGGCTC  1261
      ||||||||   ||||||
seq2  CTCTCTCTCTAAGGCTC  1239

seq1: chr1_63867782_63868950
seq2: B6Ng01-131P03.g_66_1229 (reverse)

seq1  TTTGTACTAGGGA-GAGCAGGTTACA-GTCTGGGCTCAGCGC-AGGGC-T  46
      ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||   |||||| ||||| |
seq2  TTTGTACTAAGGAGGAGCAGGTTACAGGTCTGGCTCCAGCGCAAGGGCTT  50

seq1  GCAGGGAAGGGGTGAG-GATGAACTCTGTGGGGCTTTGTGCAGGGGAGGG  95
      ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   ||| |||||||
seq2  GCAGGAAAGGGGTGTGAGATGAACTCTGTGGGGCTT--GGCA-GGGAGGG  97

seq1  ACACAATGTGGAGGGAACAGGGATGTCACAGTAAGAGGCATTCTGTCCTT  145
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AAACAATGTGGAGGGAACAGGGATGTCACAGTAAGAGGCATTCTGTCC-T  146

seq1  TTGCTGTCTTCTGGGAGTACCCTCAAGTGTTCTATTTAAAGCACGTTGTC  195
      ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTGCTTTCTTCT-GGAGTA-CCTCAAGTGTTCTATTTAAAGCACG-TGTC  193

seq1  ATCTATCAAACAAATGAATTATCCTTAGGTGTCCAGTAGGCATTGGCTAC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATCAAACAAATGAATTATCCTTAGGTGTCCAGTAGGCATTGGCTAC  243

seq1  AGGACCCCCACAGATAACAAATCAAGCCCCTTATATGAAGTAGCCTGCTG  295
      |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||
seq2  AGGA-CCCCACAGATAACAAATCAAG-CCCTTATATGAAGTAG-CTGCTG  290

seq1  TTTCCATATAGCCAGCGGCATCCTCTCATGTCCAGGTTACTCATAATGCT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCATATAGCCAGCGGCATCCTCTCATGTCCAGGTTACTCATAATGCT  340

seq1  GGGTACAACATAAACCTACTTAAACAGAATGTACGGTTTAGGGAACAATG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTACAACATAAACCTACTTAAACAGAATGTACGGTTTAGGGAACAATG  390

seq1  ACAAGAATGGCCTCTAAATATTCAGTACAGATGCACTTTGAGAAATATTT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGAATGGCCTCTAAATATTCAGTACAGATGCACTTTGAGAAATATTT  440

seq1  TCAAGCTGCAGTTGGTTGAATCTGTGACTGTGGAATTAAGAGATACAGAG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGCTGCAGTTGGTTGAATCTGTGACTGTGGAATTAAGAGATACAGAG  490

seq1  GGCCATCAACTGTAAGGTGTCTCCTTTAATTCCCAACTTGGAAGGAAATT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCATCAACTGTAAGGTGTCTCCTTTAATTCCCAACTTGGAAGGAAATT  540

seq1  TTCCAAGCTCACAGTGCCTGCCTAGATAGCAGCTGAGACATTTCTTGTGA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAGCTCACAGTGCCTGCCTAGATAGCAGCTGAGACATTTCTTGTGA  590

seq1  AGTATAATTCCATGTTCTGTGTCACTCATTCACTGACCCAACCCAGCTGA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATAATTCCATGTTCTGTGTCACTCATTCACTGACCCAACCCAGCTGA  640

seq1  GGACCAGGATGGACAGAAGGCAGGCTGGCCAGCACTTAGTGGCCCTGCTC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCAGGATGGACAGAAGGCAGGCTGGCCAGCACTTAGTGGCCCTGCTC  690

seq1  TGCCAAGCAAGGTTAACGATGGCTAAGAAATTACTCATAGTAAGCTTTAT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAAGCAAGGTTAACGATGGCTAAGAAATTACTCATAGTAAGCTTTAT  740

seq1  CATTTGTCATAGCCACAATAGCAGATGATAGCACTACTGGAAGTTGCTGC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTCATAGCCACAATAGCAGATGATAGCACTACTGGAAGTTGCTGC  790

seq1  AGAGAAAATTGTCCCAATCCTTCAGAAGTCATGAGAGAAGAGTTATGAAT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAATTGTCCCAATCCTTCAGAAGTCATGAGAGAAGAGTTATGAAT  840

seq1  TAGAGTCAGAAGTGAGAAGAATGTATTAGCAAGCATGAAACCCGAACACT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTCAGAAGTGAGAAGAATGTATTAGCAAGCATGAAACCCGAACACT  890

seq1  ACCCTGAACACACTGGTCAAGAGAAGCAGTGACCGAGGCAGAGATGAGGA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGAACACACTGGTCAAGAGAAGCAGTGACCGAGGCAGAGATGAGGA  940

seq1  CCTCCAGCCTGGTGGAGTTTGGTCATTGGATGGTGTGATATGCATCACTG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCAGCCTGGTGGAGTTTGGTCATTGGATGGTGTGATATGCATCACTG  990

seq1  TCACCCACTTGAAGCTGTTTTGAGCAAGGCTTGGGTGAACTGCTGTTCCT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCACTTGAAGCTGTTTTGAGCAAGGCTTGGGTGAACTGCTGTTCCT  1040

seq1  GGGCTCTTTCTCATGTTGGTTTAACTTCTTCCCTACCCATCAGTACTTGG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCTTTCTCATGTTGGTTTAACTTCTTCCCTACCCATCAGTACTTGG  1090

seq1  AGTAGACCAATACTTGGCCAAAGGCAAGGCTGACCACTGTACACCATTTA  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGACCAATACTTGGCCAAAGGCAAGGCTGACCACTGTACACCATTTA  1140

seq1  GCAATATCTTGCTTACAAGAATTC  1169
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATATCTTGCTTACAAGAATTC  1164