BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-132E21
Chromosome1 (Build37)
Map Location 186,989,691 - 187,114,924
singlet/doubletdoublet
Overlap geneIars2
Upstream geneEG433387, EG629032, LOC666714, Hlx1, Mosc1, Mosc2, LOC100039079, C130074G19Rik, Mark1
Downstream geneBpnt1, Eprs, 9630028B13Rik, LOC100039138, Slc30a10, 5033404E19Rik, LOC677785, Lyplal1
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-132E21.bB6Ng01-132E21.g
ACCDH933142DH933143
length1,104956
definitionDH933142|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132E21, 5' end.DH933143|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132E21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(187,113,815 - 187,114,924)(186,989,691 - 186,990,648)
sequence
gaattctatgctaggccagctagggctgcacagtgagactttgtatcaaa
actgagctgctcgtgtgcctggtgcctctttacaatgagctagagctgct
ggtagatgaccaccatgctgtcctgagggcagaccaggactagctgggca
gatctgtaatgacactggccttcacagtgcgcccatggcaccagtgggaa
tggcagtcactcagatgtggtcagttaccttactatatgcaaagtcagtg
atctagactgtcatccaccttaaacatccacagttgggcaaaatatgaga
aaccagatacatcctgagagagtaaaataggatagacgataaagtgtcca
aaggcagcatggatgtgcgaaggccagagcggcatgtcaactgctgagca
agctcttcttccaggctctactgcgaaaacgagaaggatcccaagcgccg
ctcgtgtcagacagcattggcagaaattttggatgtgttggtccgtgctt
ttgcccccattcttcctcacttggcagaagaggtgtttcagcacattccc
tatgttacaggtaaggagaactgctctctgcatgggagggatcacgcgag
gggttgaccgagctgttacaagttcacacatggacactggcagtgtctgt
gatgaggctctgtgccttcatacagagttaggactgcatctggtgccttc
tgaaatgtatggagccttgacaatattgagaaatcacttttgcttaaatt
gtttataagagtctggagagatgactctttagttaagtcactggctgctc
gtccagaggacccaggttcaattccgagcacccacatagcaactcatacc
tgcctgtagctccagttctaggggtcagacacagacatctatgaatgcaa
aacactaataaacataaaataaaattagctaaaaaaaaatctttgggctg
gagagatggctcagcagttagtcactgactgctttccagaggtcctgagt
tcaatccccacaaccaccatggttgcctcacagccattctgatgggatcg
atgcactccttgactgtactgagacagataccgtgactcacatacataat
aata
gaattcaaacatttagaactcaggtcaaaaagccaggcctggccacaggc
acacctacaaccccagagtcaagagggtggagacaggacaatcactgggg
cttgctggtgacagcctagctcctccaagttcagtgagagaacttttctc
aagggtataaggcagagaatggctgggcaggaaacctgacattacgtcca
gcctctgagcatgcacgtgtgtgttcatgcccttctccctacgtgtgcat
atacttcaaacataatacatatatgcatgcttgcacacacacagagagag
agacagagacagacagagacagagacagagacagagagacagagagagaa
taaaaacgtaagttatatgataccaccctaccagatgtgatgtggaggaa
gtgtgtcactggaggccaacttggaggaagtgaatcactagatacactgg
gcagaccaccctagaaaggccaatcccaccccaccaccagcctccttgat
ttctgctctaccagtaaaccttctgctgccaaaactggaactccaaataa
accctccttcctttaagttgcctcttgtcgcagtcacattcatgagaaaa
gcaattagttcggtctcttacttgttcttcctgaagctacagagttagta
atgttagcattaatcacggtgggaattgaatacaactctctgcagccaac
tggcaaaaaaatgcaaaactcaattttagggcaattgactgctcagtcaa
tagacaatcggaaagggggaaatgtgtgctctccaggccagtcctgcggg
aacctgggctgttactcagaattagcacagctactcagaattgcatgttc
ctgggtgggagggaagatacacaaaagaataaagaaacacactgaggtcc
ttcttccttctcttctctacatagatagatggatggatagataggtagat
agatag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_187113815_187114924
seq2: B6Ng01-132E21.b_44_1147 (reverse)

seq1  TATT-TTATGTATGTGAGTACACTGTATCTGTCTTCAGTACAGTACAAGA  49
      |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  | ||
seq2  TATTATTATGTATGTGAGT-CACGGTATCTGTC-TCAGTACAGTCAAGGA  48

seq1  GTGCATCGGATCCCATTACAGATGGCTGTGA-GCAACCAT-GTGGTTGTG  97
      ||||||| |||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||||
seq2  GTGCATC-GATCCCATCAGA-ATGGCTGTGAGGCAACCATGGTGGTTGTG  96

seq1  GGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAAGCAGTCAGTGACCTTAACTGCTG  147
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
seq2  GGG-ATTGAACTCAGGACCTCTGGAAAGCAGTCAGTGAC--TAACTGCTG  143

seq1  AGCCATCTCTCCAGCCCAAAGATTTTTTTTTTAGCTAATTTTTATTTTAT  197
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AGCCATCTCTCCAGCCCAAAGA-TTTTTTTTTAGCTAA-TTTTATTTTAT  191

seq1  GTTTATTAGTGTTTTGCATTCATAGATGTCTGTGTCTGACCCCTAGAACT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATTAGTGTTTTGCATTCATAGATGTCTGTGTCTGACCCCTAGAACT  241

seq1  GGAGCTACAGGCAGGTATGAGTTGCTATGTGGGTGCTCGGAATTGAACCT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTACAGGCAGGTATGAGTTGCTATGTGGGTGCTCGGAATTGAACCT  291

seq1  GGGTCCTCTGGACGAGCAGCCAGTGACTTAACTAAAGAGTCATCTCTCCA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCTCTGGACGAGCAGCCAGTGACTTAACTAAAGAGTCATCTCTCCA  341

seq1  GACTCTTATAAACAATTTAAGCAAAAGTGATTTCTCAATATTGTCAAGGC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCTTATAAACAATTTAAGCAAAAGTGATTTCTCAATATTGTCAAGGC  391

seq1  TCCATACATTTCAGAAGGCACCAGATGCAGTCCTAACTCTGTATGAAGGC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATACATTTCAGAAGGCACCAGATGCAGTCCTAACTCTGTATGAAGGC  441

seq1  ACAGAGCCTCATCACAGACACTGCCAGTGTCCATGTGTGAACTTGTAACA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGCCTCATCACAGACACTGCCAGTGTCCATGTGTGAACTTGTAACA  491

seq1  GCTCGGTCAACCCCTCGCGTGATCCCTCCCATGCAGAGAGCAGTTCTCCT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCGGTCAACCCCTCGCGTGATCCCTCCCATGCAGAGAGCAGTTCTCCT  541

seq1  TACCTGTAACATAGGGAATGTGCTGAAACACCTCTTCTGCCAAGTGAGGA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGTAACATAGGGAATGTGCTGAAACACCTCTTCTGCCAAGTGAGGA  591

seq1  AGAATGGGGGCAAAAGCACGGACCAACACATCCAAAATTTCTGCCAATGC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGGGGGCAAAAGCACGGACCAACACATCCAAAATTTCTGCCAATGC  641

seq1  TGTCTGACACGAGCGGCGCTTGGGATCCTTCTCGTTTTCGCAGTAGAGCC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGACACGAGCGGCGCTTGGGATCCTTCTCGTTTTCGCAGTAGAGCC  691

seq1  TGGAAGAAGAGCTTGCTCAGCAGTTGACATGCCGCTCTGGCCTTCGCACA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGAAGAGCTTGCTCAGCAGTTGACATGCCGCTCTGGCCTTCGCACA  741

seq1  TCCATGCTGCCTTTGGACACTTTATCGTCTATCCTATTTTACTCTCTCAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGCTGCCTTTGGACACTTTATCGTCTATCCTATTTTACTCTCTCAG  791

seq1  GATGTATCTGGTTTCTCATATTTTGCCCAACTGTGGATGTTTAAGGTGGA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTATCTGGTTTCTCATATTTTGCCCAACTGTGGATGTTTAAGGTGGA  841

seq1  TGACAGTCTAGATCACTGACTTTGCATATAGTAAGGTAACTGACCACATC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGTCTAGATCACTGACTTTGCATATAGTAAGGTAACTGACCACATC  891

seq1  TGAGTGACTGCCATTCCCACTGGTGCCATGGGCGCACTGTGAAGGCCAGT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGACTGCCATTCCCACTGGTGCCATGGGCGCACTGTGAAGGCCAGT  941

seq1  GTCATTACAGATCTGCCCAGCTAGTCCTGGTCTGCCCTCAGGACAGCATG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTACAGATCTGCCCAGCTAGTCCTGGTCTGCCCTCAGGACAGCATG  991

seq1  GTGGTCATCTACCAGCAGCTCTAGCTCATTGTAAAGAGGCACCAGGCACA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCATCTACCAGCAGCTCTAGCTCATTGTAAAGAGGCACCAGGCACA  1041

seq1  CGAGCAGCTCAGTTTTGATACAAAGTCTCACTGTGCAGCCCTAGCTGGCC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGCAGCTCAGTTTTGATACAAAGTCTCACTGTGCAGCCCTAGCTGGCC  1091

seq1  TAGCATAGAATTC  1110
      |||||||||||||
seq2  TAGCATAGAATTC  1104

seq1: chr1_186989691_186990648
seq2: B6Ng01-132E21.g_67_1022

seq1  GAATTCAAACATTTAGAACTCAGGTCAAAAAGCCAGGCCTGGCCACAGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAACATTTAGAACTCAGGTCAAAAAGCCAGGCCTGGCCACAGGC  50

seq1  ACACCTACAACCCCAGAGTCAAGAGGGTGGAGACAGGACAATCACTGGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTACAACCCCAGAGTCAAGAGGGTGGAGACAGGACAATCACTGGGG  100

seq1  CTTGCTGGTGACAGCCTAGCTCCTCCAAGTTCAGTGAGAGAACTTTTCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTGGTGACAGCCTAGCTCCTCCAAGTTCAGTGAGAGAACTTTTCTC  150

seq1  AAGGGTATAAGGCAGAGAATGGCTGGGCAGGAAACCTGACATTACGTCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTATAAGGCAGAGAATGGCTGGGCAGGAAACCTGACATTACGTCCA  200

seq1  GCCTCTGAGCATGCACGTGTGTGTTCATGCCCTTCTCCCTACGTGTGCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTGAGCATGCACGTGTGTGTTCATGCCCTTCTCCCTACGTGTGCAT  250

seq1  ATACTTCAAACATAATACATATATGCATGCTTGCACACACACAGAGAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTCAAACATAATACATATATGCATGCTTGCACACACACAGAGAGAG  300

seq1  AGACAGAGACAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGAGACAGAGAGAGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAGACAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGAGACAGAGAGAGAA  350

seq1  TAAAAACGTAAGTTATATGATACCACCCTACCAGATGTGATGTGGAGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAACGTAAGTTATATGATACCACCCTACCAGATGTGATGTGGAGGAA  400

seq1  GTGTGTCACTGGAGGCCAACTTGGAGGAAGTGAATCACTAGATACACTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTCACTGGAGGCCAACTTGGAGGAAGTGAATCACTAGATACACTGG  450

seq1  GCAGACCACCCTAGAAAGGCCAATCCCACCCCACCACCAGCCTCCTTGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGACCACCCTAGAAAGGCCAATCCCACCCCACCACCAGCCTCCTTGAT  500

seq1  TTCTGCTCTACCAGTAAACCTTCTGCTGCCAAAACTGGAACTCCAAATAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCTCTACCAGTAAACCTTCTGCTGCCAAAACTGGAACTCCAAATAA  550

seq1  ACCCTCCTTCCTTTAAGTTGCCTCTTGTCGCAGTCACATTCATGAGAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTCCTTCCTTTAAGTTGCCTCTTGTCGCAGTCACATTCATGAGAAAA  600

seq1  GCAATTAGTTCGGTCTCTTACTTGTTCTTCCTGAAGCTACAGAGTTAGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATTAGTTCGGTCTCTTACTTGTTCTTCCTGAAGCTACAGAGTTAGTA  650

seq1  ATGTTAGCATTAATCACGGTGGGAATTGAATACAACTCTCTGCAGCCAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAGCATTAATCACGGTGGGAATTGAATACAACTCTCTGCAGCCAAC  700

seq1  TGGCAAAAAAATGCAAAACTCAATTTTAGGGCAATTGACTGCTCAGTCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAAAAAAATGCAAAACTCAATTTTAGGGCAATTGACTGCTCAGTCAA  750

seq1  TAGACAATCGGAAAGGGGGAAATGTGTGCTCTCCAGGCCAGTCCTGCGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACAATCGGAAAGGGGGAAATGTGTGCTCTCCAGGCCAGTCCTGCGGG  800

seq1  AACCTGGGCTGTTACTCAGAATTAGCACAGCTACTCAGAATTGCATGTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTGGGCTGTTACTCAGAATTAGCACAGCTACTCAGAATTGCATGTTC  850

seq1  CTGGGTGGGAGGGAAGATAACACAAAAAGAATAAAGAAACACACTGAGGT  900
      |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTGGGAGGGAAGAT-ACAC-AAAAGAATAAAGAAACACACTGAGGT  898

seq1  CCTTCTTCCTTCTCTTCTCTACATAGATAGATGGATGGATAGATAGGTAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTTCCTTCTCTTCTCTACATAGATAGATGGATGGATAGATAGGTAG  948

seq1  ATAGATAG  958
      ||||||||
seq2  ATAGATAG  956