BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-138G18
Chromosome1 (Build37)
Map Location 77,864,995 - 77,983,180
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039137, Tfdp1-ps, Epha4, LOC100039330
Downstream genePax3, LOC100039210, Sgpp2, LOC100039382, Farsb, Mogat1, Acsl3, Utp14b, LOC620521, Kcne4, LOC100039260, EG545332
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-138G18.bB6Ng01-138G18.g
ACCDH937687DH937688
length589662
definitionDH937687|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-138G18, 5' end.DH937688|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-138G18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(77,982,586 - 77,983,180)(77,864,995 - 77,865,652)
sequence
ccttctatctggaccatcagtgtggaatccagtagcatcatccagatact
cgctgaggtcaagacacaagacattgttcaaaaacaaagcaaaacaaata
tcatgttcttttttaaattgtctgtggctcctagattctatttggtcaca
cacaatgctataataatgtctgtgcataaggaagtgaaagttgaagtgga
attctctagatggtcaaagggaacggatgggaggatgaggtggggggtca
ggttaataggagaatatgttcagcataaagctataccactatgaagatcg
ataaataaaagagagagagatgtgccacagggagactggggtaggatgct
gctattagactgggattctgtttcttcatcttgtatatatctgaaccaga
tccagggcaactttaatccttctgggtatcccttaactgtagcatcagtc
agataacctgctctctccatctctgttatggtcaggactgggtaagtagc
aagagataaatgttcccccaagtaaccctcgcaggatggcattcatctca
agtgcatatggcatagaatgaggggaggttaaagtgtga
gaattcaacctgcaggtgtattttatacctgcagcccttagacttgactg
ctgctggggtatcatctgtattagacaacccttataagtctcctctttcc
tttcctcccttaccaacctctctccccacctacatccatctcttttcctc
ctcctttcttcacctcttccttctttcatttctctctctctctctctctc
tctctctctctctctctctctctctcatctacacacagagaatctcttgg
ttatgtttttatagagaatgttgactaatactaataagatgttaaggatg
gaactggaagaggggctgtgtgggggaggactaggaggagaagtgggact
gcgatcaagatgatgagagagagagagagagagagagagagagagaggaa
tggggctgaagagaaggcttatagttaagactgtctactgatcttgcaga
gaacccagcttcagttcccagcacacacctcaggcagctcacagatacct
caactccagatccaggggatccaacacttctgggccactgtgggacctac
atgcccacccgataagcccgatggtgaaataccttaaaattttaaataac
ataaaataaatcgttaaagaggtatttatatctgtattatgggtgtattc
cagtgaaacaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_77982586_77983180
seq2: B6Ng01-138G18.b_48_642 (reverse)

seq1  TCACACTTT-ACCTCCCCTCACTTCTATGCCATGTGCACCTGAGATGAAT  49
      ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||
seq2  TCACACTTTAACCTCCCCTCA-TTCTATGCCATATGCACTTGAGATGAAT  49

seq1  GCCATCCTGCGAGGGTTACTTGGGGGAACATTTATCTCTTGCTACTTACC  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATCCTGCGAGGGTTACTTGGGGGAACATTTATCTCTTGCTACTTACC  99

seq1  CAGTCCTGACCATAACAGAGATGGAGAGAGCAGGTTATCTGACTGATGCT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCTGACCATAACAGAGATGGAGAGAGCAGGTTATCTGACTGATGCT  149

seq1  ACAGTTAAGGGATACCCAGAAGGATTAAAGTTGCCCTGGATCTGGTTCAG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTAAGGGATACCCAGAAGGATTAAAGTTGCCCTGGATCTGGTTCAG  199

seq1  ATATATACAAGATGAAGAAACAGAATCCCAGTCTAATAGCAGCATCCTAC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATACAAGATGAAGAAACAGAATCCCAGTCTAATAGCAGCATCCTAC  249

seq1  CCCAGTCTCCCTGTGGCACATCTCTCTCTCTTTTATTTATCGATCTTCAT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTCTCCCTGTGGCACATCTCTCTCTCTTTTATTTATCGATCTTCAT  299

seq1  AGTGGTATAGCTTTATGCTGAACATATTCTCCTATTAACCTGACCCCCCA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTATAGCTTTATGCTGAACATATTCTCCTATTAACCTGACCCCCCA  349

seq1  CCTCATCCTCCCATCCGTTCCCTTTGACCATCTAGAGAATTCCACTTCAA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATCCTCCCATCCGTTCCCTTTGACCATCTAGAGAATTCCACTTCAA  399

seq1  CTTTCACTTCCTTATGCACAGACATTATTATAGCATTGTGTGTGACCAAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCACTTCCTTATGCACAGACATTATTATAGCATTGTGTGTGACCAAA  449

seq1  TAGAATCTAGGAGCCACAGACAATTTAAAAAAGAACATGATATTTGTTTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATCTAGGAGCCACAGACAATTTAAAAAAGAACATGATATTTGTTTT  499

seq1  GCTTTGTTTTTGAACAATGTCTTGTGTCTTGACCTCAGCGAGTATCTGGA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGTTTTTGAACAATGTCTTGTGTCTTGACCTCAGCGAGTATCTGGA  549

seq1  TGATGCTACTGGATTCCACACTGATGGTCCAGATAGAAGGGAATTC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGCTACTGGATTCCACACTGATGGTCCAGATAGAAGGGAATTC  595

seq1: chr1_77864995_77865652
seq2: B6Ng01-138G18.g_66_727

seq1  GAATTCAACCTGCAGGTGTATTTTATACCTGCAGCCCTTAGACTTGACTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACCTGCAGGTGTATTTTATACCTGCAGCCCTTAGACTTGACTG  50

seq1  CTGCTGGGGTATCATCTGTATTAGACAACCCTTATAAGTCTCCTCTTTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGGGGTATCATCTGTATTAGACAACCCTTATAAGTCTCCTCTTTCC  100

seq1  TTTCCTCCCTTACCAACCTCTCTCCCCACCTACATCCATCTCTTTTCCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTCCCTTACCAACCTCTCTCCCCACCTACATCCATCTCTTTTCCTC  150

seq1  CTCCTTTCTTCACCTCTTCCTTCTTTCATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTTCTTCACCTCTTCCTTCTTTCATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  200

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCTACACACAGAGAATCTCTTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCTACACACAGAGAATCTCTTGG  250

seq1  TTATGTTTTTATAGAGAATGTTGACTAATACTAATAAGATGTTAAGGATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTTTTTATAGAGAATGTTGACTAATACTAATAAGATGTTAAGGATG  300

seq1  GAACTGGAAGAGGGGCTGTGTGGGGGAGGACTAGGAGGAGAAGTGGGACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGGAAGAGGGGCTGTGTGGGGGAGGACTAGGAGGAGAAGTGGGACT  350

seq1  GCGATCAAGATGATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGATCAAGATGATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAA  400

seq1  TGGGGCTGAAGAGAAGGCTTATAGTTAAGACTGTCTACTGATCTTGCAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGCTGAAGAGAAGGCTTATAGTTAAGACTGTCTACTGATCTTGCAGA  450

seq1  GAACCCAGCTTCAGTTCCCAGCACACACCTCAGGCAGCTCACAGATACCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCCAGCTTCAGTTCCCAGCACACACCTCAGGCAGCTCACAGATACCT  500

seq1  CAACTCCAGATCCAGGGGATCCAACACTTCT-GGCCACTGTGGGTACCTA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
seq2  CAACTCCAGATCCAGGGGATCCAACACTTCTGGGCCACTGTGGG-ACCTA  549

seq1  CATGCCCA-CCGACAAGCCCGTATGGTGAAATA-CATAAAATTTTAAATA  597
      |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||
seq2  CATGCCCACCCGATAAGCCCG-ATGGTGAAATACCTTAAAATTTTAAATA  598

seq1  ACAT-AAATAAATCTTTAAAGAGGTATTTATATCTGTATTATGG--TTAT  644
      |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||
seq2  ACATAAAATAAATCGTTAAAGAGGTATTTATATCTGTATTATGGGTGTAT  648

seq1  TCCAGTGAAACAAG  658
      ||||||||||||||
seq2  TCCAGTGAAACAAG  662