MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-143I07
Chromosome	1 (Build37)
Map Location	26,603,055 - 26,604,176
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	Bai3, LOC665595
Downstream gene	4931408C20Rik, LOC677427
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-143I07.b	B6Ng01-143I07.g
ACC	DH941433	DH941434
length	1,100	1,183
definition	DH941433\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-143I07, 5' end.	DH941434\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-143I07, 3' end.
singlet/doublet	singlet	---
BLAST hit	unique	no hit data
sequence	gaattctttataaatactattagttgaaatggtctcctcaaaaacctaca tggtgtcataataataatatcaggcagtggccctttgaaaaatgatttaa attatgatcaagacaacttttttttttttgattttttttttgagacaggg tttctctgtatagccctggctgtcctggaactcactttgtagaacaggct ggccttgaactcagaaatctgcctgcctctgcctcccaagtgctgggatt aaagacgtgtgccactacttccaggctcaagacatctttaaaaaaaaaag ttccctgtcagtattctgagtattccgtgttcaatcatgtgaaacatcga atgacaatttttctttaccttaagaggatgcaagtttcaagtatcttctt aggaacgagacacagccttcacaaaactgtcaagatcacaggctccgtgg acttggaagtttatatttcagatataaaatacatagcttttctataaaat ccctcattatgcattacttccataacagtcgaaacacagtagatctacat gcaaaagataaggaacaattaatataataaaggacatagcacaaaatttt atgaaaaatgataaccaatatgtaattttgtaacaagttataactttcaa gatttccagggtatagagatcaactcttgggttatagcacatatattaat tagcgagactaagaagtcctttttcttgggaatttaccactatcttttaa tccagaaaataatctggagatgctaagacttatcaataagccctatgatt ctattattacggtaaagtcaagactgccgacctttgcagtactcctaacc ttaacaatgagaaaaggacgttaatgcaaagggatagcaatatgataatt ttgtaattcaaaacaaaactcaatgaaatatattatacttacctttgaaa tctgttttctccttactgagtacatgtagtctgttagatggttttattag tctaaagtaaactatctgagaagaagaaatcccataaaaagtcgtagtat atgcattatagtcattttacattctagctctttaagattggagtttaata	gaattcttcccccacctgatagtcaatcaactgatgtgccaaaaaacggg tcatcgggccctcggtcccagggccctcaaagatatgggaaccggtttgt caggacccaggaagcagtcagagaggcgacccaggaagacccacaagggt ggacctgcgtgccgcctccgacttcctattaatgcctcaaatgagtattc agccggtgccagtggagcctataccatccttgcccccgggaaccatgggc cttattctcggccggggttcactcaccttacagggcttagtagtccaccc tggagttatggattgtcaacattcccctgaaatacaggtcctgtgctcaa gccctaagggcgttttttctattagtaaaggagataggatagctcagctg ctgctcctccctgataataccagggagaaatttgcaggacctgagataaa gaaaatgggctcctcaggaaatgattctgcctatttggttgtatctttaa atgatagacctaagctccgccttaagatcaacggaaaagagtttgaaggc atccttgataccggagcagataaaagtataatttctacacattggtggcc caaagcatggcccaccacagagtcatctcattcattacagggcctaggat atcaatcatgtcccactataagctccgttgccttgacgtgggaatcctct gaaggacagcaagggaaattcataccttatgtgctcccactcccggttaa cctctggggaagggatattatgcagcatttgggccttattttgtccaatg aaacgccccatcgggagggtattcaactaaagcaaaaatatcatggcaaa gatgggttataaagaaggaaaagggttaggacatcagacagggaggatag agcccatctcactatggaaacagacagacagggtctgggttttctagtgc atgggcagcacgcccataccatgaaacgggatcagttgggtctcatgacc tatctttgaactgagctggatcactgtagagacataaactagcatatgac atctactcaccttggaaactcaatttgtaatagaaaagtcagaagtggga accgtctgacctagccttaggagcaatgacattgccatcaggtcccgtac tcgctacgaattcgaatattatataggatttta
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr1_26603055_26604176 seq2: B6Ng01-143I07.b_47_1146 (reverse) seq1 TATTAAACACTCAAATATCTTAAAAGAAGCTTAGAATGTAAAAATGACTA 50 \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TATTAA--ACTCCA--ATCTTAAA--GAGC-TAGAATGT-AAAATGACTA 42 seq1 TAATTGCATATTAACCTACGAACTTTTTATGGGATTTCTTCTTCTCAAGA 100 \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| seq2 TAA-TGCATAT---ACTACG-ACTTTTTATGGGATTTCTTCTTCTC-AGA 86 seq1 TAGTTTTTAACTTTAGACTAATAAAACCATCTTAACAGACTACATGTACT 150 \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAGTTT---ACTTTAGACTAATAAAACCATC-TAACAGACTACATGTAC- 131 seq1 TCAGTAA-GAGAAAACAGATTTTCAAAGGTTAAGTATTAATATTATTTCA 199 \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| seq2 TCAGTAAGGAGAAAACAGA-TTTCAAAGG-TAAGTA-TAATA-TATTTCA 177 seq1 TTGAGTTTTGTTTTGAATTACAAAATTATCATATTGCTATCCCTTTGCAT 249 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTGAGTTTTGTTTTGAATTACAAAATTATCATATTGCTATCCCTTTGCAT 227 seq1 TAACGTCCTTTTCTCATTGTTAAGGTTAGGAGTACTGCAAAGGTCGGCAG 299 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAACGTCCTTTTCTCATTGTTAAGGTTAGGAGTACTGCAAAGGTCGGCAG 277 seq1 TCTTGACTTTACCGTAATAATAGAATCATAGGGCTTATTGATAAGTCTTA 349 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCTTGACTTTACCGTAATAATAGAATCATAGGGCTTATTGATAAGTCTTA 327 seq1 GCATCTCCAGATTATTTTCTGGATTAAAAGATAGTGGTAAATTCCCAAGA 399 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCATCTCCAGATTATTTTCTGGATTAAAAGATAGTGGTAAATTCCCAAGA 377 seq1 AAAAGGACTTCTTAGTCTCGCTAATTAATATATGTGCTATAACCCAAGAG 449 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAAAGGACTTCTTAGTCTCGCTAATTAATATATGTGCTATAACCCAAGAG 427 seq1 TTGATCTCTATACCCTGGAAATCTTGAAAGTTATAACTTGTTACAAAATT 499 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTGATCTCTATACCCTGGAAATCTTGAAAGTTATAACTTGTTACAAAATT 477 seq1 ACATATTGGTTATCATTTTTCATAAAATTTTGTGCTATGTCCTTTATTAT 549 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACATATTGGTTATCATTTTTCATAAAATTTTGTGCTATGTCCTTTATTAT 527 seq1 ATTAATTGTTCCTTATCTTTTGCATGTAGATCTACTGTGTTTCGACTGTT 599 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTAATTGTTCCTTATCTTTTGCATGTAGATCTACTGTGTTTCGACTGTT 577 seq1 ATGGAAGTAATGCATAATGAGGGATTTTATAGAAAAGCTATGTATTTTAT 649 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATGGAAGTAATGCATAATGAGGGATTTTATAGAAAAGCTATGTATTTTAT 627 seq1 ATCTGAAATATAAACTTCCAAGTCCACGGAGCCTGTGATCTTGACAGTTT 699 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATCTGAAATATAAACTTCCAAGTCCACGGAGCCTGTGATCTTGACAGTTT 677 seq1 TGTGAAGGCTGTGTCTCGTTCCTAAGAAGATACTTGAAACTTGCATCCTC 749 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTGAAGGCTGTGTCTCGTTCCTAAGAAGATACTTGAAACTTGCATCCTC 727 seq1 TTAAGGTAAAGAAAAATTGTCATTCGATGTTTCACATGATTGAACACGGA 799 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTAAGGTAAAGAAAAATTGTCATTCGATGTTTCACATGATTGAACACGGA 777 seq1 ATACTCAGAATACTGACAGGGAACTTTTTTTTTTAAAGATGTCTTGAGCC 849 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATACTCAGAATACTGACAGGGAACTTTTTTTTTTAAAGATGTCTTGAGCC 827 seq1 TGGAAGTAGTGGCACACGTCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCA 899 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGGAAGTAGTGGCACACGTCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCA 877 seq1 GGCAGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGTTCTACAAAGTGAGTTCCAGG 949 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGCAGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGTTCTACAAAGTGAGTTCCAGG 927 seq1 ACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAATCAAAAAA 999 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAATCAAAAAA 977 seq1 AAAAAAGTTGTCTTGATCATAATTTAAATCATTTTTCAAAGGGCCACTGC 1049 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAAAAAGTTGTCTTGATCATAATTTAAATCATTTTTCAAAGGGCCACTGC 1027 seq1 CTGATATTATTATTATGACACCATGTAGGTTTTTGAGGAGACCATTTCAA 1099 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTGATATTATTATTATGACACCATGTAGGTTTTTGAGGAGACCATTTCAA 1077 seq1 CTAATAGTATTTATAAAGAATTC 1122 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTAATAGTATTTATAAAGAATTC 1100

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr1_26603055_26604176
seq2: B6Ng01-143I07.b_47_1146 (reverse)

seq1  TATTAAACACTCAAATATCTTAAAAGAAGCTTAGAATGTAAAAATGACTA  50
      ||||||  |||| |  ||||||||   ||| |||||||| ||||||||||
seq2  TATTAA--ACTCCA--ATCTTAAA--GAGC-TAGAATGT-AAAATGACTA  42

seq1  TAATTGCATATTAACCTACGAACTTTTTATGGGATTTCTTCTTCTCAAGA  100
      ||| |||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TAA-TGCATAT---ACTACG-ACTTTTTATGGGATTTCTTCTTCTC-AGA  86

seq1  TAGTTTTTAACTTTAGACTAATAAAACCATCTTAACAGACTACATGTACT  150
      ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| 
seq2  TAGTTT---ACTTTAGACTAATAAAACCATC-TAACAGACTACATGTAC-  131

seq1  TCAGTAA-GAGAAAACAGATTTTCAAAGGTTAAGTATTAATATTATTTCA  199
      ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||
seq2  TCAGTAAGGAGAAAACAGA-TTTCAAAGG-TAAGTA-TAATA-TATTTCA  177

seq1  TTGAGTTTTGTTTTGAATTACAAAATTATCATATTGCTATCCCTTTGCAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTTTTGTTTTGAATTACAAAATTATCATATTGCTATCCCTTTGCAT  227

seq1  TAACGTCCTTTTCTCATTGTTAAGGTTAGGAGTACTGCAAAGGTCGGCAG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACGTCCTTTTCTCATTGTTAAGGTTAGGAGTACTGCAAAGGTCGGCAG  277

seq1  TCTTGACTTTACCGTAATAATAGAATCATAGGGCTTATTGATAAGTCTTA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGACTTTACCGTAATAATAGAATCATAGGGCTTATTGATAAGTCTTA  327

seq1  GCATCTCCAGATTATTTTCTGGATTAAAAGATAGTGGTAAATTCCCAAGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCTCCAGATTATTTTCTGGATTAAAAGATAGTGGTAAATTCCCAAGA  377

seq1  AAAAGGACTTCTTAGTCTCGCTAATTAATATATGTGCTATAACCCAAGAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGACTTCTTAGTCTCGCTAATTAATATATGTGCTATAACCCAAGAG  427

seq1  TTGATCTCTATACCCTGGAAATCTTGAAAGTTATAACTTGTTACAAAATT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCTCTATACCCTGGAAATCTTGAAAGTTATAACTTGTTACAAAATT  477

seq1  ACATATTGGTTATCATTTTTCATAAAATTTTGTGCTATGTCCTTTATTAT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATTGGTTATCATTTTTCATAAAATTTTGTGCTATGTCCTTTATTAT  527

seq1  ATTAATTGTTCCTTATCTTTTGCATGTAGATCTACTGTGTTTCGACTGTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATTGTTCCTTATCTTTTGCATGTAGATCTACTGTGTTTCGACTGTT  577

seq1  ATGGAAGTAATGCATAATGAGGGATTTTATAGAAAAGCTATGTATTTTAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ATCTGAAATATAAACTTCCAAGTCCACGGAGCCTGTGATCTTGACAGTTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TGTGAAGGCTGTGTCTCGTTCCTAAGAAGATACTTGAAACTTGCATCCTC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TTAAGGTAAAGAAAAATTGTCATTCGATGTTTCACATGATTGAACACGGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGTAAAGAAAAATTGTCATTCGATGTTTCACATGATTGAACACGGA  777

seq1  ATACTCAGAATACTGACAGGGAACTTTTTTTTTTAAAGATGTCTTGAGCC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTCAGAATACTGACAGGGAACTTTTTTTTTTAAAGATGTCTTGAGCC  827

seq1  TGGAAGTAGTGGCACACGTCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGTAGTGGCACACGTCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCA  877

seq1  GGCAGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGTTCTACAAAGTGAGTTCCAGG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGTTCTACAAAGTGAGTTCCAGG  927

seq1  ACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAATCAAAAAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAATCAAAAAA  977

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      |||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATAGTATTTATAAAGAATTC  1100

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