BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-144P22
Chromosome1 (Build37)
Map Location 148,799,596 - 148,947,494
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC383571, B830045N13Rik, LOC100043240
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-144P22.bB6Ng01-144P22.g
ACCDH942524DH942525
length873648
definitionDH942524|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-144P22, 5' end.DH942525|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-144P22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(148,946,621 - 148,947,494)(148,799,596 - 148,800,243)
sequence
gaattcatgtgcattaacaaattactctttaagtgggcattctatagagt
tcattttctctttttttaaggaagatgcaaatattaaaaaaattgctttc
ttacattataaatagcaacaataatccaataccttgaacctatttggata
ttaaaagtagctgtttatgctatgttactttataggaaataattaaaaca
aaataaaattttgttaggtattgtgattcctagaacaatccccccccctt
ttttttctgttaaatttgtgattttgtttaggcacaattctagtatgttt
gtagagaacattctagaaaacatccctgaatgaagatataaataaatgtg
atttaattttggtgctgcctaaaatagttgtttttcgtgtattttattaa
aaccacatatatatgcatattttatacatagagagagagtaagtgtatat
acatgtattatttgtgtgggagggtgttcatgtgtatgtgtataaatgta
tgcaaattctgtaacaacatgtctgctcagatgatacaagtgtctgtgca
cttctaaccaatatgtaactaaatacaaacataaactgttagttgaaaaa
taaatatgattttgatgtgtttgaaagtaattgaagacctaaacttgaag
ttatcaatgattactcaaaataaactagaaaacatttaccttgagaaata
cagattatagttccacttaattattgaggtgttatgcataggataatatc
tttgtaggatcaatgaataatagttatagcttcattcttatttacagcaa
aggctttaacccattatctaagttcattttttttaaaaaaaaatatgtgg
tcatatagtgcaaacaccaagtt
gaattctatgttataaaaagattccctgatgaggagtgagaattacattt
acctaaggtaaaagaactaatatttaaaatatacttatgggttgtaatgc
ttcagtaaaatggtgctcttttgtatctccactgagctctatgactttat
taaccctaagtagttgactagtctcccagtgtcagacatgactttcttct
aattgagcaggcatttagttcaagtagagagctgtggtacagcactacgg
caaacttatggttagggtgccatggtgctaattgtgatttatatttatca
cagttagctaaggccattgttcatttatctgtctggaagcttgcatggca
cctctgtcattataaaagctagtctttaggaaggaagatatcagatcagt
tccagcttagtgtataggtctctctcccattaattaaaaaaaagtttctg
taatggagattgagacatatctagcaacctaccacctatgtaccaattca
gaccagtggagtgttgtgtgtgcatgtagatgcatatacatttaatatac
aaatatatacacatatatgcatatacattttatatacatatatatacctt
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtataattgtattggtatata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_148946621_148947494
seq2: B6Ng01-144P22.b_47_919 (reverse)

seq1  AACTTGGTGTTTGCACTATATGACCACATATTTTTTTTTAAAAAAAAATG  50
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
seq2  AACTTGGTGTTTGCACTATATGACCACATATTTTTTTTTAAAAAAAA--T  48

seq1  GAACTTAGATAAT-GGTTAAAGCCTTTGCTGTAAATAAGAATGAAGCTAT  99
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTAGATAATGGGTTAAAGCCTTTGCTGTAAATAAGAATGAAGCTAT  98

seq1  AACTATTATTCATTGATCCTACAAAGATATTATCCTATGCATAACACCTC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATTATTCATTGATCCTACAAAGATATTATCCTATGCATAACACCTC  148

seq1  AATAATTAAGTGGAACTATAATCTGTATTTCTCAAGGTAAATGTTTTCTA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATTAAGTGGAACTATAATCTGTATTTCTCAAGGTAAATGTTTTCTA  198

seq1  GTTTATTTTGAGTAATCATTGATAACTTCAAGTTTAGGTCTTCAATTACT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATTTTGAGTAATCATTGATAACTTCAAGTTTAGGTCTTCAATTACT  248

seq1  TTCAAACACATCAAAATCATATTTATTTTTCAACTAACAGTTTATGTTTG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAACACATCAAAATCATATTTATTTTTCAACTAACAGTTTATGTTTG  298

seq1  TATTTAGTTACATATTGGTTAGAAGTGCACAGACACTTGTATCATCTGAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAGTTACATATTGGTTAGAAGTGCACAGACACTTGTATCATCTGAG  348

seq1  CAGACATGTTGTTACAGAATTTGCATACATTTATACACATACACATGAAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACATGTTGTTACAGAATTTGCATACATTTATACACATACACATGAAC  398

seq1  ACCCTCCCACACAAATAATACATGTATATACACTTACTCTCTCTCTATGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTCCCACACAAATAATACATGTATATACACTTACTCTCTCTCTATGT  448

seq1  ATAAAATATGCATATATATGTGGTTTTAATAAAATACACGAAAAACAACT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATATGCATATATATGTGGTTTTAATAAAATACACGAAAAACAACT  498

seq1  ATTTTAGGCAGCACCAAAATTAAATCACATTTATTTATATCTTCATTCAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAGGCAGCACCAAAATTAAATCACATTTATTTATATCTTCATTCAG  548

seq1  GGATGTTTTCTAGAATGTTCTCTACAAACATACTAGAATTGTGCCTAAAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTTTTCTAGAATGTTCTCTACAAACATACTAGAATTGTGCCTAAAC  598

seq1  AAAATCACAAATTTAACAGAAAAAAAAGGGGGGGGGATTGTTCTAGGAAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCACAAATTTAACAGAAAAAAAAGGGGGGGGGATTGTTCTAGGAAT  648

seq1  CACAATACCTAACAAAATTTTATTTTGTTTTAATTATTTCCTATAAAGTA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATACCTAACAAAATTTTATTTTGTTTTAATTATTTCCTATAAAGTA  698

seq1  ACATAGCATAAACAGCTACTTTTAATATCCAAATAGGTTCAAGGTATTGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGCATAAACAGCTACTTTTAATATCCAAATAGGTTCAAGGTATTGG  748

seq1  ATTATTGTTGCTATTTATAATGTAAGAAAGCAATTTTTTTAATATTTGCA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTGTTGCTATTTATAATGTAAGAAAGCAATTTTTTTAATATTTGCA  798

seq1  TCTTCCTTAAAAAAAGAGAAAATGAACTCTATAGAATGCCCACTTAAAGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCTTAAAAAAAGAGAAAATGAACTCTATAGAATGCCCACTTAAAGA  848

seq1  GTAATTTGTTAATGCACATGAATTC  874
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTTGTTAATGCACATGAATTC  873

seq1: chr1_148799596_148800243
seq2: B6Ng01-144P22.g_64_711

seq1  GAATTCTATGTTATAAAAAGATTCCCTGATGAGGAGTGAGAATTACATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATGTTATAAAAAGATTCCCTGATGAGGAGTGAGAATTACATTT  50

seq1  ACCTAAGGTAAAAGAACTAATATTTAAAATATACTTATGGGTTGTAATGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAAGGTAAAAGAACTAATATTTAAAATATACTTATGGGTTGTAATGC  100

seq1  TTCAGTAAAATGGTGCTCTTTTGTATCTCCACTGAGCTCTATGACTTTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTAAAATGGTGCTCTTTTGTATCTCCACTGAGCTCTATGACTTTAT  150

seq1  TAACCCTAAGTAGTTGACTAGTCTCCCAGTGTCAGACATGACTTTCTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCCTAAGTAGTTGACTAGTCTCCCAGTGTCAGACATGACTTTCTTCT  200

seq1  AATTGAGCAGGCATTTAGTTCAAGTAGAGAGCTGTGGTACAGCACTACGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGAGCAGGCATTTAGTTCAAGTAGAGAGCTGTGGTACAGCACTACGG  250

seq1  CAAACTTATGGTTAGGGTGCCATGGTGCTAATTGTGATTTATATTTATCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTTATGGTTAGGGTGCCATGGTGCTAATTGTGATTTATATTTATCA  300

seq1  CAGTTAGCTAAGGCCATTGTTCATTTATCTGTCTGGAAGCTTGCATGGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTAGCTAAGGCCATTGTTCATTTATCTGTCTGGAAGCTTGCATGGCA  350

seq1  CCTCTGTCATTATAAAAGCTAGTCTTTAGGAAGGAAGATATCAGATCAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGTCATTATAAAAGCTAGTCTTTAGGAAGGAAGATATCAGATCAGT  400

seq1  TCCAGCTTAGTGTATAGGTCTCTCTCCCATTAATTAAAAAAAAGTTTCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTTAGTGTATAGGTCTCTCTCCCATTAATTAAAAAAAAGTTTCTG  450

seq1  TAATGGAGATTGAGACATATCTAGCAACCTACCACCTATGTACCAATTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGGAGATTGAGACATATCTAGCAACCTACCACCTATGTACCAATTCA  500

seq1  GACCAGTGGAGTGTTGTGTGTGCATGTAGATGCATATACATTTAATATAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGTGGAGTGTTGTGTGTGCATGTAGATGCATATACATTTAATATAC  550

seq1  AAATATATACACATATATGCATATACATTTTATATACATATATATACCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATATACACATATATGCATATACATTTTATATACATATATATACCTT  600

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATAATTGTATTGGTATATA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATAATTGTATTGGTATATA  648