BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-146N01
Chromosome1 (Build37)
Map Location 186,224,176 - 186,332,583
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG666649, 1700056E22Rik, Dusp10
Downstream geneEG433387, EG629032, LOC666714, Hlx1, Mosc1, Mosc2, LOC100039079, C130074G19Rik, Mark1, Iars2, Bpnt1, Eprs, 9630028B13Rik, LOC100039138, Slc30a10, 5033404E19Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-146N01.bB6Ng01-146N01.g
ACCDH943859DH943860
length1,048810
definitionDH943859|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146N01, 5' end.DH943860|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146N01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(186,331,538 - 186,332,583)(186,224,176 - 186,224,984)
sequence
gaattcctagaagttctaggctggctagcctggcacacacattagcattg
agatcctgtctcaaacaaggtgggggtaaggattgttctttgaccttcat
acatgtgtgaagacatatgtggtcatgagacaagaaggcttacaaggcag
agatggataaagaacctcctccataggaagggtagggctctaattaatgt
ttttacttagatgttaaaatggtctggatgtattaggttatggctacttt
aaattctctggcctccattagagccacaagtatgtggttctggctctcca
tggtgagaatctggtaggattgctgaaggtaaaaggcatacaggtatcag
ggatccctgagactacaaggccccatgagtttctgacatgttctcataga
tatgaacacacatacacacacacacaccaccaccaccaccaccaaaccac
aactatgaaggaacttggaaacagagtattttgatatatttgacaggaat
ccattattgggtgtgctgtggccactttctccaagcataaagctagcctt
tccattcccttaacacatatcttttgcaatatagaagtcttattctttga
aagtccaatttatcacttttttttttcatggatcagaccctcagtgttat
atccaagtgagcaaattccacaacacctagacttcccctaagctttgtct
tgtgtactaccatatgttttgtgttctacaatagtttgatggttgctgcc
cactgttctctgtgttttcttctgatagtctaattatgtatatataccct
tgaaattaccccacattttttattgtttttttttttctattctgtgatcc
agtgtggaaggcatcccactgacctgccttcaagcttgttgtgctttttc
ctcagccactttgggtctttcaatacctcatgaaggcatctgtgccaagc
tcaaaggatcaacttttcacagaaaatcagaaccaagtgttatcatcctg
cagtgctcttagtctctctaccagtgtcctcaagaatgcctatgtaca
gaattcacctgcttacgaattccagataactcttgtgaagatggatggct
tttgttgttttaggtgagtgaacctttaggtcttcacttattggactttg
ctagaaaactactgtgaggaaaagctttgctgccttgggatgagtgaaag
tagtttggctccggaatttgtacagtgtgtactatatatggagatactac
accagttaagagtattttaaggggctggagagatggctcagaggttagga
ggactgactgctcttccagaggtcctgagttcaattcccagcaacctcgt
ggtggctcacaaccatctgtagtgagttctagtgccctgctctggtgtgt
ctgaagagagagacagtgtattcacatagattagatagatagatagatag
atagatagatagatagatagatagatagatagatagacaattaaacaaaa
cttttaaagaaaaagaatattttaagcccttcaaatctgctatgggacat
gtgtattcttctcttaacatctttgtttcttgtatgtgcactaagctact
aaacagtaggagtgggtgcatctgattctagcccaggtgttacttacaat
tagagtgtctaattaattatacagaattaagattgctaactaaagcgaag
agtgtccccagtacagtgagatctgctcaagaatgctgctgcagaggctg
cttcgaccaagactttctggagaaacctgcattgtgtcatcttttctgtc
tcaagagtcgcttcctatctgtcatctttataattcaaaggacaaaaatc
tgcccacccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_186331538_186332583
seq2: B6Ng01-146N01.b_48_1095 (reverse)

seq1  TGTACATAGGCATTCTTGAGGACACTTGGT--AGAGACTAAGAGCACTGC  48
      ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||
seq2  TGTACATAGGCATTCTTGAGGACAC-TGGTAGAGAGACTAAGAGCACTGC  49

seq1  AGGATGATAACACTTGGTTCTGATTTTCTTGTGAAAGGTTGATCCTTTGA  98
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
seq2  AGGATGATAACACTTGGTTCTGATTTTC-TGTGAAAAGTTGATCCTTTGA  98

seq1  GCTTGGCACAGATGCCTTCATGAGGTATTGAAAGA-CCAAAGTGGCTGAG  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GCTTGGCACAGATGCCTTCATGAGGTATTGAAAGACCCAAAGTGGCTGAG  148

seq1  GAAAAAGCACAACAAGCTTGAAGGCAGGTCAGT-GGATGCCTTCCACACT  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GAAAAAGCACAACAAGCTTGAAGGCAGGTCAGTGGGATGCCTTCCACACT  198

seq1  GGATCACAGAATAGAAAAAAAAAAACAATAAAAAATGTGGGGTAATTTCA  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCACAGAATAGAAAAAAAAAAACAATAAAAAATGTGGGGTAATTTCA  248

seq1  AGGGTATATATACATAATTAGACTATCAGAAGAAAACACAGAGAACAGTG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTATATATACATAATTAGACTATCAGAAGAAAACACAGAGAACAGTG  298

seq1  GGCAGCAACCATCAAACTATTGTAGAACACAAAACATATGGTAGTACACA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCAACCATCAAACTATTGTAGAACACAAAACATATGGTAGTACACA  348

seq1  AGACAAAGCTTAGGGGAAGTCTAGGTGTTGTGGAATTTGCTCACTTGGAT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAAGCTTAGGGGAAGTCTAGGTGTTGTGGAATTTGCTCACTTGGAT  398

seq1  ATAACACTGAGGGTCTGATCCATGAAAAAAAAAAGTGATAAATTGGACTT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACACTGAGGGTCTGATCCATGAAAAAAAAAAGTGATAAATTGGACTT  448

seq1  TCAAAGAATAAGACTTCTATATTGCAAAAGATATGTGTTAAGGGAATGGA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGAATAAGACTTCTATATTGCAAAAGATATGTGTTAAGGGAATGGA  498

seq1  AAGGCTAGCTTTATGCTTGGAGAAAGTGGCCACAGCACACCCAATAATGG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTAGCTTTATGCTTGGAGAAAGTGGCCACAGCACACCCAATAATGG  548

seq1  ATTCCTGTCAAATATATCAAAATACTCTGTTTCCAAGTTCCTTCATAGTT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTGTCAAATATATCAAAATACTCTGTTTCCAAGTTCCTTCATAGTT  598

seq1  GTGGTTTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTTCATA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTTTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTTCATA  648

seq1  TCTATGAGAACATGTCAGAAACTCATGGGGCCTTGTAGTCTCAGGGATCC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATGAGAACATGTCAGAAACTCATGGGGCCTTGTAGTCTCAGGGATCC  698

seq1  CTGATACCTGTATGCCTTTTACCTTCAGCAATCCTACCAGATTCTCACCA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATACCTGTATGCCTTTTACCTTCAGCAATCCTACCAGATTCTCACCA  748

seq1  TGGAGAGCCAGAACCACATACTTGTGGCTCTAATGGAGGCCAGAGAATTT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGAGCCAGAACCACATACTTGTGGCTCTAATGGAGGCCAGAGAATTT  798

seq1  AAAGTAGCCATAACCTAATACATCCAGACCATTTTAACATCTAAGTAAAA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTAGCCATAACCTAATACATCCAGACCATTTTAACATCTAAGTAAAA  848

seq1  ACATTAATTAGAGCCCTACCCTTCCTATGGAGGAGGTTCTTTATCCATCT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTAATTAGAGCCCTACCCTTCCTATGGAGGAGGTTCTTTATCCATCT  898

seq1  CTGCCTTGTAAGCCTTCTTGTCTCATGACCACATATGTCTTCACACATGT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTTGTAAGCCTTCTTGTCTCATGACCACATATGTCTTCACACATGT  948

seq1  ATGAAGGTCAAAGAACAATCCTTACCCCCACCTTGTTTGAGACAGGATCT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGGTCAAAGAACAATCCTTACCCCCACCTTGTTTGAGACAGGATCT  998

seq1  CAATGCTAATGTGTGTGCCAGGCTAGCCAGCCTAGAACTTCTAGGAATTC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGCTAATGTGTGTGCCAGGCTAGCCAGCCTAGAACTTCTAGGAATTC  1048

seq1: chr1_186224176_186224984
seq2: B6Ng01-146N01.g_71_880

seq1  GAATTCACCTGCTTACGAATTCCAGATAACTCTTGTGAAGATGGATGGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCTGCTTACGAATTCCAGATAACTCTTGTGAAGATGGATGGCT  50

seq1  TTTGTTGTTTTAGGTGAGTGAACCTTTAGGTCTTCACTTATTGGACTTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTGTTTTAGGTGAGTGAACCTTTAGGTCTTCACTTATTGGACTTTG  100

seq1  CTAGAAAACTACTGTGAGGAAAAGCTTTGCTGCCTTGGGATGAGTGAAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAAACTACTGTGAGGAAAAGCTTTGCTGCCTTGGGATGAGTGAAAG  150

seq1  TAGTTTGGCTCCGGAATTTGTACAGTGTGTACTATATATGGAGATACTAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTGGCTCCGGAATTTGTACAGTGTGTACTATATATGGAGATACTAC  200

seq1  ACCAGTTAAGAGTATTTTAAGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGAGGTTAGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTTAAGAGTATTTTAAGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGAGGTTAGGA  250

seq1  GGACTGACTGCTCTTCCAGAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCTCGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGACTGCTCTTCCAGAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCTCGT  300

seq1  GGTGGCTCACAACCATCTGTAGTGAGTTCTAGTGCCCTGCTCTGGTGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCTCACAACCATCTGTAGTGAGTTCTAGTGCCCTGCTCTGGTGTGT  350

seq1  CTGAAGAGAGAGACAGTGTATTCACATAGATTAGATAGATAGATAGATAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGAGAGAGACAGTGTATTCACATAGATTAGATAGATAGATAGATAG  400

seq1  ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGACAATTAAACAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGACAATTAAACAAAA  450

seq1  CTTTTAAAGAAAAAGAATATTTTAAGCCCTTCAAATCTGCTATGGGACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAAAGAAAAAGAATATTTTAAGCCCTTCAAATCTGCTATGGGACAT  500

seq1  GTGTATTCTTCTCTTAACATCTTTGTTTCTTGTATGTGCACTAAGCTACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATTCTTCTCTTAACATCTTTGTTTCTTGTATGTGCACTAAGCTACT  550

seq1  AAACAGTAGGAGTGGGTGCATCTGATTCTAGCCCAGGTGTTACTTACAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGTAGGAGTGGGTGCATCTGATTCTAGCCCAGGTGTTACTTACAAT  600

seq1  TAGAGTGTCTAATTAATTATACAGAATTAAGATTGCTAACTAAAGCGAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTGTCTAATTAATTATACAGAATTAAGATTGCTAACTAAAGCGAAG  650

seq1  AGTGTCCCCAGTACAGTGAGATCTGCTCAAGAATGCTGCTGCAGAGGCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCCCCAGTACAGTGAGATCTGCTCAAGAATGCTGCTGCAGAGGCTG  700

seq1  CTTCGACCAAGACTTTCTGGAGAAACCTGCATTGTGTCATC-TTTCTGTC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTTCGACCAAGACTTTCTGGAGAAACCTGCATTGTGTCATCTTTTCTGTC  750

seq1  TCAAGAGTCGCTTCCTATCTGTCATCTTTATAAATCAAAGGACAAAAATC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCAAGAGTCGCTTCCTATCTGTCATCTTTATAATTCAAAGGACAAAAATC  800

seq1  TGCCCACCCC  809
      ||||||||||
seq2  TGCCCACCCC  810