BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-147J12
Chromosome1 (Build37)
Map Location 149,700,047 - 149,840,897
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneB830045N13Rik
Downstream geneLOC100042792, LOC435647
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-147J12.bB6Ng01-147J12.g
ACCDH944432DH944433
length7021,050
definitionDH944432|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147J12, 5' end.DH944433|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147J12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(149,840,197 - 149,840,897)(149,700,047 - 149,701,044)
sequence
gaattctcctgtactggggcatatgatcttcacaagaccaagggcctctc
ctccaattgatggcctactaggccatcctctgctacatatgcaactagag
acacagttctggggggtactggttagttcatattgttggtcctcctttag
agattcagacaccttcagttccttgggtactttctctaggtccaccatta
ggggccctgtgatccatccaataactgacagtgagcatccacttctctat
ttgccaggtattagcatggcctcacaagagagtcagcaggaccctttata
atccctttccccttctttactttggttaaatgtctgtaggaagttgtttt
aaaactttttatttttaggattaggtttgtttttattatgggtgactaaa
tattcattgtctttctttttaaatatttatttatttattatatgtaaata
cactgtagctgtcctcagacactccagaagagggagtcagattttgttat
ggatggttgtgagccaccatgtggttgctgggatttgaactcctgacttt
cagaagagcagttgggtgctcttacccactgagccatctcaccagcccca
atatacattgtcttattccatcaaaaatcaaagcagaacttcctatgtca
tgctttattttgtttctttgttttggttggttggttggtatagttttggt
tt
gaattccacagaaaacaggatgaaaataatcattacactctcaacataaa
actggtatagctatttactcagtttctgggttacaaattccacaaagata
ttggaaaattcattaattgtgtattgtattatgaaatattaccctttgtt
gtgattattaattcatattacttgaatcaattgaatgatttatctgggac
ttcaatgagtgcctatattctgctttgcatgtatagagtgtattttctac
cttcctttcctcttctatcttcttgctctaccaaatagtgtatttatttt
tatcttaaatatttattattgtttctaaagagatagaaatatatgacacc
tatcttctattactatcttcactgaacatggaatattgattaatacttca
ttgtgtctacatattccatattttttcattaattgatataatgctataca
ctcagactgactttaagtattaaatgtgatgaacagtacaccaataaaga
tatatatgaatatatctctaaagtaggctgtgctggtttaagtatgcttg
gaccataagaattgacactattagtaggtgtgtcattaatgtaaaaggtg
tggccttgctaaaggaagtgtgtcactgtgtaggtagcattttaggtcct
aggctcatgctcttctcagtgaggacagcttccccctgtctgcctgcaaa
aagagaatcttcttaggatcaagatatataactctcagcttctcagcacc
atgcctgcctgaacactgccgtgtttcctgccatgataataatggactga
acctctgaaactataagctagctccagttaaatgtcatcctttataattt
ttttttacttttggtcagcttttatggagtctcatcatagcaaagaaact
cttgtctggggcaaacagtcggatctgttgtctgtggatagatgtagaac
tatggactcttcagcacatgtccacctttatactgccataatttagccat
gataatatggattaaactctgaactctaatcaccccataacattgtcctt

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_149840197_149840897
seq2: B6Ng01-147J12.b_49_750 (reverse)

seq1  AAACC-AAACTATACCAACCAACCAACCAAAACAAAGAAACAAAATAAAG  49
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCAAAACTATACCAACCAACCAACCAAAACAAAGAAACAAAATAAAG  50

seq1  CATGACATAGGAAGTTCTGCTTTGATTTTTGATGGAATAAGACAATGTAT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGACATAGGAAGTTCTGCTTTGATTTTTGATGGAATAAGACAATGTAT  100

seq1  ATTGGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCAACTGCTCTTC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCAACTGCTCTTC  150

seq1  TGAAAGTCAGGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCAT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGTCAGGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCAT  200

seq1  CCATAACAAAATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTCTGAGGACAGCTACAG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAACAAAATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTCTGAGGACAGCTACAG  250

seq1  TGTATTTACATATAATAAATAAATAAATATTTAAAAAGAAAGACAATGAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTTACATATAATAAATAAATAAATATTTAAAAAGAAAGACAATGAA  300

seq1  TATTTAGTCACCCATAATAAAAACAAACCTAATCCTAAAAATAAAAAGTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAGTCACCCATAATAAAAACAAACCTAATCCTAAAAATAAAAAGTT  350

seq1  TTAAAACAACTTCCTACAGACATTTAACCAAAGTAAAGAAGGGGAAAGGG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAACAACTTCCTACAGACATTTAACCAAAGTAAAGAAGGGGAAAGGG  400

seq1  ATTATAAAGGGTCCTGCTGACTCTCTTGTGAGGCCATGCTAATACCTGGC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATAAAGGGTCCTGCTGACTCTCTTGTGAGGCCATGCTAATACCTGGC  450

seq1  AAATAGAGAAGTGGATGCTCACTGTCAGTTATTGGATGGATCACAGGGCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGAGAAGTGGATGCTCACTGTCAGTTATTGGATGGATCACAGGGCC  500

seq1  CCTAATGGTGGACCTAGAGAAAGTACCCAAGGAACTGAAGGTGTCTGAAT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAATGGTGGACCTAGAGAAAGTACCCAAGGAACTGAAGGTGTCTGAAT  550

seq1  CTCTAAAGGAGGACCAACAATATGAACTAACCAGTACCCCCCAGAACTGT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAAAGGAGGACCAACAATATGAACTAACCAGTACCCCCCAGAACTGT  600

seq1  GTCTCTAGTTGCATATGTAGCAGAGGATGGCCTAGTAGGCCATCAATTGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTAGTTGCATATGTAGCAGAGGATGGCCTAGTAGGCCATCAATTGG  650

seq1  AGGAGAGGCCCTTGGTCTTGTGAAGATCATATGCCCCAGTACAGGAGAAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAGGCCCTTGGTCTTGTGAAGATCATATGCCCCAGTACAGGAGAAT  700

seq1  TC  701
      ||
seq2  TC  702

seq1: chr1_149700047_149701044
seq2: B6Ng01-147J12.g_70_1064

seq1  GAATTCCACAGAAAACAGGATGAAAATAATCATTACACTCTCAACATAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACAGAAAACAGGATGAAAATAATCATTACACTCTCAACATAAA  50

seq1  ACTGGTATAGCTATTTACTCAGTTTCTGGGTTACAAATTCCACAAAGATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTATAGCTATTTACTCAGTTTCTGGGTTACAAATTCCACAAAGATA  100

seq1  TTGGAAAATTCATTAATTGTGTATTGTATTATGAAATATTACCCTTTGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAAAATTCATTAATTGTGTATTGTATTATGAAATATTACCCTTTGTT  150

seq1  GTGATTATTAATTCATATTACTTGAATCAATTGAATGATTTATCTGGGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTATTAATTCATATTACTTGAATCAATTGAATGATTTATCTGGGAC  200

seq1  TTCAATGAGTGCCTATATTCTGCTTTGCATGTATAGAGTGTATTTTCTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATGAGTGCCTATATTCTGCTTTGCATGTATAGAGTGTATTTTCTAC  250

seq1  CTTCCTTTCCTCTTCTATCTTCTTGCTCTACCAAATAGTGTATTTATTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTTCCTCTTCTATCTTCTTGCTCTACCAAATAGTGTATTTATTTT  300

seq1  TATCTTAAATATTTATTATTGTTTCTAAAGAGATAGAAATATATGACACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTAAATATTTATTATTGTTTCTAAAGAGATAGAAATATATGACACC  350

seq1  TATCTTCTATTACTATCTTCACTGAACATGGAATATTGATTAATACTTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTCTATTACTATCTTCACTGAACATGGAATATTGATTAATACTTCA  400

seq1  TTGTGTCTACATATTCCATATTTTTTCATTAATTGATATAATGCTATACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTCTACATATTCCATATTTTTTCATTAATTGATATAATGCTATACA  450

seq1  CTCAGACTGACTTTAAGTATTAAATGTGATGAACAGTACACCAATAAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGACTGACTTTAAGTATTAAATGTGATGAACAGTACACCAATAAAGA  500

seq1  TATATATGAATATATCTCTAAAGTAGGCTGTGCTGGTTTAAGTATGCTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATGAATATATCTCTAAAGTAGGCTGTGCTGGTTTAAGTATGCTTG  550

seq1  GACCATAAGAATTGACACTATTAGTAGGTGTGTCATTAATGTAAAAGGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCATAAGAATTGACACTATTAGTAGGTGTGTCATTAATGTAAAAGGTG  600

seq1  TGGCCTTGCTAAAGGAAGTGTGTCACTGTGTAGGTAGCATTTTAGGTCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTTGCTAAAGGAAGTGTGTCACTGTGTAGGTAGCATTTTAGGTCCT  650

seq1  AGGCTCATGCTCTTCTCAGTGAGGACAGCTTCCCCCTGTCTGCCTGC-AA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AGGCTCATGCTCTTCTCAGTGAGGACAGCTTCCCCCTGTCTGCCTGCAAA  700

seq1  AAGAGAATCTTCTTAGGATCAAGATATATAACTCTCAGCTTCTCAGCACC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAATCTTCTTAGGATCAAGATATATAACTCTCAGCTTCTCAGCACC  750

seq1  ATGCCTGCCTGAACACTGCCGTGTTTCCTGCCATGATAATAATGGACTGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTGCCTGAACACTGCCGTGTTTCCTGCCATGATAATAATGGACTGA  800

seq1  ACCTCTGAAACTATAAGCTAGCTCCAGTTAAATGTCATCCTTTATAATTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTGAAACTATAAGCTAGCTCCAGTTAAATGTCATCCTTTATAATTT  850

seq1  TTTTTTACTTTTGGTCAGC-TTTATGGAGTCTCATCATAGCAAAGAAACT  898
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTACTTTTGGTCAGCTTTTATGGAGTCTCATCATAGCAAAGAAACT  900

seq1  CTTGTCTGGGGCAAACAGTCGGATTCTGTTGTCTGTGGAATAAGATGTAG  948
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||
seq2  CTTGTCTGGGGCAAACAGTCGGA-TCTGTTGTCTGTGGA--TAGATGTAG  947

seq1  AACTATGGACTCTTCAAGCACAATGTCCACCTTTATACTGCCATAATTTA  998
      ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATGGACTCTTC-AGCAC-ATGTCCACCTTTATACTGCCATAATTTA  995