BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-151K16
Chromosome1 (Build37)
Map Location 81,917,811 - 82,050,965
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene9430031J16Rik, EG621020, LOC433328, EG665145
Downstream geneIrs1, Rhbdd1, Col4a4, Col4a3, 5230400G24Rik, Tm4sf20, LOC100039491, Hrb, A030005L19Rik, A030014E15Rik, EG621362, A030003K21Rik, LOC665225, LOC100039524, EG665236, LOC665246, Slc19a3, LOC665196, LOC621495
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-151K16.bB6Ng01-151K16.g
ACCDH947430DH947431
length1,1781,104
definitionDH947430|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151K16, 5' end.DH947431|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151K16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(82,049,789 - 82,050,965)(81,917,811 - 81,918,926)
sequence
gaattctcaaaattttcaacctatgtatagacagaagattcagtttttct
tcttctttctcttgagtctcattcttataaatgttactatgaaaagatgg
ccagagagtatgggcacactgatgaaagtgtcctgtgttctttaggtata
aaccagtgaccagtttcagatagtagatagaattgggtaattttctcagc
attcactgatatatggaagtcacctgggtttgtccctccagctttgattt
acaatagtgcattcaaattagtacaggatgaatcttatgactgtcaccaa
gaggtgtcttgtagccagtaagctagccgctggctctcacttttatggca
tttcagaaagtagacttctcctcacatctcctgcaagtgaatcacttgat
gttcttgttaaaagggcatatttctggctctcagtgaaggtctattaagc
tgtgattagagagtatgccctttgaggaaagctgcccgtgcttctgatgt
ataccagtgctaggtgtatagaggagaaatgccagtgctttctggtggtt
gagatgggttcatacaacaaggggagatgataccacaaatcatcactgtt
gaaaataggctcaggcaagcatccctactccgccaagtcaaaaccctctt
acttctggcagagagagaaatggtctcttgatttgttcccactaatagaa
attaagaagagacaaccaagaatgaccagccagcttcaattgctatctaa
tatggcagatagaagtacacactcagttaatgaaaaacactgagtcagtg
aaaatgcagctcttggaggggaagactgtcagaatagaaggacactgatg
catgaagcatacaccaaggtatgattttgatggacaaaatgttcagttat
gacgcacatctactgtttcaaattcaagtcatgcccagatgtagaatttg
aatcatgaagctgcctgtaagaaatttcattctgcagctcttagattatg
catattttgacattttcatccaagttcttctgtgaactcattttttttca
gggtgagttgtactatctatatatggtttccctttaatgtagattcagtt
gttttcttgaaacacctacatcatggcatataagtgacacaagggacagt
gtggtttatggaggagagattgaatgga
gaattccatttttaaaatgtaggccaaacctatcatggagcttatcccca
tagaatattgattctctttcattcaacaggacaccagttgactgtagctc
ttcttccagtggtagggtcttgagagatttctcctatacacatccacatt
ggcatgccaactggagttttcattgtgcagtcctgtttaggagaccatat
agttacgatttcataggtgcagctccctgttgtatataaaagacactata
tggttcccaatgccctggtcctctgtctcttccaaatttcactatgatcc
ctaatatataaatgtcgaaatctatcaactgcagataggcacattcaact
gttctgtatacttttatgctctacctgcctttgctctggaaagataccag
ccccctcccagcttcccttgaatcctaggatagaagacacagacacacag
tggttcaatttcaacttgccttctgggcagttgctgggtgctaccatctc
ccacctggaaaagcacgcccttatcagtttcttatctccatatttcccac
ctaccctaatcttcagtgactaatcccatctggcctctgacaatcatccc
tgactgcctgtctgtagtagaggccccaggccccagctcctcctgcgacc
tcacatggttgcctggttgtcttctctccaaagcatggtgaactcctttt
ctcttcccttacatctccctttcctccagagacccaggtgttctgccttt
accttccactcaacaattagcccatggctttctttactgacagatcaaaa
accaactgggggaacagtaccttaacatcagaactgccccctacatccaa
ccccagtggttactcctaagtaaataaatacgaacaacactaaatagact
cagcagattgtatttatatatgcatgtgtacaagtacataaatatttagc
acaggtatgaaaagaggtcataggctgagaggcacaggagagtttaagtg
aggaggatatgggatgaaattttatgtaatacaatactcacaaattctca
gaaaaataaattatgtaaaaatgcatcttactataagtcattgcttcaca
agat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_82049789_82050965
seq2: B6Ng01-151K16.b_47_1224 (reverse)

seq1  TCCATTC-----TTCCTCCATTAACCACACTGTCCC-TGTGTCACTATGA  44
      |||||||      |||||||| |||||||||||||| |||||||||   |
seq2  TCCATTCAATCTCTCCTCCATAAACCACACTGTCCCTTGTGTCACTTATA  50

seq1  TGCAATGATGTAGTTG-TTCAAG-AAACACTTGAAATCTAACATTAAAGG  92
      ||| ||||||||| || |||||| |||||  || ||||| ||||||||||
seq2  TGCCATGATGTAGGTGTTTCAAGAAAACAACTG-AATCT-ACATTAAAGG  98

seq1  GATA-CATATATAGATAGTACAACTCAACTCTGGAAAAAAAATGAGTTCA  141
      || | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||
seq2  GAAACCATATATAGATAGTACAACTC-ACCCT-GAAAAAAAATGAGTTCA  146

seq1  CAGAAGAACTTGGATGAAAATGTCAAAATTATGCATAATCTTAAGAGCTG  191
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
seq2  CAGAAGAACTTGGATGAAAATGTCAAAA-TATGCATAATC-TAAGAGCTG  194

seq1  CAGAATGAAATTTCTTACAGGCAGCTTCATGATTCAAAATTCTACATCTG  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CAGAATGAAATTTCTTACAGGCAGCTTCATGATTC-AAATTCTACATCTG  243

seq1  GGCATGACTTTGAATTTGAAACAGTAGATGTGCGTCATAACTGAACATTT  291
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATGAC-TTGAATTTGAAACAGTAGATGTGCGTCATAACTGAACATTT  292

seq1  TGTCCATCAAAATCATACCTTGGTGTATGCTTCATGCATCAGTGTCCTTC  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCATCAAAATCATACCTTGGTGTATGCTTCATGCATCAGTGTCCTTC  342

seq1  TATTCTGACAGTCTTCCCCTCCAAGAGCTGCATTTTCACTGACTCAGTGT  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTGACAGTCTTCCCCTCCAAGAGCTGCATTTTCACTGACTCAGTGT  392

seq1  TTTTCATTAACTGAGTGTGTACTTCTATCTGCCATATTAGATAGCAATTG  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCATTAACTGAGTGTGTACTTCTATCTGCCATATTAGATAGCAATTG  442

seq1  AAGCTGGCTGGTCATTCTTGGTTGTCTCTTCTTAATTTCTATTAGTGGGA  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGGCTGGTCATTCTTGGTTGTCTCTTCTTAATTTCTATTAGTGGGA  492

seq1  ACAAATCAAGAGACCATTTCTCTCTCTGCCAGAAGTAAGAGGGTTTTGAC  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATCAAGAGACCATTTCTCTCTCTGCCAGAAGTAAGAGGGTTTTGAC  542

seq1  TTGGCGGAGTAGGGATGCTTGCCTGAGCCTATTTTCAACAGTGATGATTT  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCGGAGTAGGGATGCTTGCCTGAGCCTATTTTCAACAGTGATGATTT  592

seq1  GTGGTATCATCTCCCCTTGTTGTATGAACCCATCTCAACCACCAGAAAGC  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTATCATCTCCCCTTGTTGTATGAACCCATCTCAACCACCAGAAAGC  642

seq1  ACTGGCATTTCTCCTCTATACACCTAGCACTGGTATACATCAGAAGCACG  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCATTTCTCCTCTATACACCTAGCACTGGTATACATCAGAAGCACG  692

seq1  GGCAGCTTTCCTCAAAGGGCATACTCTCTAATCACAGCTTAATAGACCTT  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCTTTCCTCAAAGGGCATACTCTCTAATCACAGCTTAATAGACCTT  742

seq1  CACTGAGAGCCAGAAATATGCCCTTTTAACAAGAACATCAAGTGATTCAC  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGAGAGCCAGAAATATGCCCTTTTAACAAGAACATCAAGTGATTCAC  792

seq1  TTGCAGGAGATGTGAGGAGAAGTCTACTTTCTGAAATGCCATAAAAGTGA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGGAGATGTGAGGAGAAGTCTACTTTCTGAAATGCCATAAAAGTGA  842

seq1  GAGCCAGCGGCTAGCTTACTGGCTACAAGACACCTCTTGGTGACAGTCAT  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCAGCGGCTAGCTTACTGGCTACAAGACACCTCTTGGTGACAGTCAT  892

seq1  AAGATTCATCCTGTACTAATTTGAATGCACTATTGTAAATCAAAGCTGGA  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTCATCCTGTACTAATTTGAATGCACTATTGTAAATCAAAGCTGGA  942

seq1  GGGACAAACCCAGGTGACTTCCATATATCAGTGAATGCTGAGAAAATTAC  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACAAACCCAGGTGACTTCCATATATCAGTGAATGCTGAGAAAATTAC  992

seq1  CCAATTCTATCTACTATCTGAAACTGGTCACTGGTTTATACCTAAAGAAC  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTCTATCTACTATCTGAAACTGGTCACTGGTTTATACCTAAAGAAC  1042

seq1  ACAGGACACTTTCATCAGTGTGCCCATACTCTCTGGCCATCTTTTCATAG  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGACACTTTCATCAGTGTGCCCATACTCTCTGGCCATCTTTTCATAG  1092

seq1  TAACATTTATAAGAATGAGACTCAAGAGAAAGAAGAAGAAAAACTGAATC  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATTTATAAGAATGAGACTCAAGAGAAAGAAGAAGAAAAACTGAATC  1142

seq1  TTCTGTCTATACATAGGTTGAAAATTTTGAGAATTC  1177
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTCTATACATAGGTTGAAAATTTTGAGAATTC  1178

seq1: chr1_81917811_81918926
seq2: B6Ng01-151K16.g_68_1171

seq1  GAATTCCATTTTTAAAATGTAGGCCAAACCTATCATGGAGCTTATCCCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATTTTTAAAATGTAGGCCAAACCTATCATGGAGCTTATCCCCA  50

seq1  TAGAATATTGATTCTCTTTCATTCAACAGGACACCAGTTGACTGTAGCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATATTGATTCTCTTTCATTCAACAGGACACCAGTTGACTGTAGCTC  100

seq1  TTCTTCCAGTGGTAGGGTCTTGAGAGATTTCTCCTATACACATCCACATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCCAGTGGTAGGGTCTTGAGAGATTTCTCCTATACACATCCACATT  150

seq1  GGCATGCCAACTGGAGTTTTCATTGTGCAGTCCTGTTTAGGAGACCATAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATGCCAACTGGAGTTTTCATTGTGCAGTCCTGTTTAGGAGACCATAT  200

seq1  AGTTACGATTTCATAGGTGCAGCTCCCTGTTGTATATAAAAGACACTATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACGATTTCATAGGTGCAGCTCCCTGTTGTATATAAAAGACACTATA  250

seq1  TGGTTCCCAATGCCCTGGTCCTCTGTCTCTTCCAAATTTCACTATGATCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCCCAATGCCCTGGTCCTCTGTCTCTTCCAAATTTCACTATGATCC  300

seq1  CTAATATATAAATGTCGAAATCTATCAACTGCAGATAGGCACATTCAACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATATATAAATGTCGAAATCTATCAACTGCAGATAGGCACATTCAACT  350

seq1  GTTCTGTATACTTTTATGCTCTACCTGCCTTTGCTCTGGAAAGATACCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGTATACTTTTATGCTCTACCTGCCTTTGCTCTGGAAAGATACCAG  400

seq1  CCCCCTCCCAGCTTCCCTTGAATCCTAGGATAGAAGACACAGACACACAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCTCCCAGCTTCCCTTGAATCCTAGGATAGAAGACACAGACACACAG  450

seq1  TGGTTCAATTTCAACTTGCCTTCTGGGCAGTTGCTGGGTGCTACCATCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCAATTTCAACTTGCCTTCTGGGCAGTTGCTGGGTGCTACCATCTC  500

seq1  CCACCTGGAAAAGCACGCCCTTATCAGTTTCTTATCTCCATATTTCCCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTGGAAAAGCACGCCCTTATCAGTTTCTTATCTCCATATTTCCCAC  550

seq1  CTACCCTAATCTTCAGTGACTAATCCCATCTGGCCTCTGACAATCATCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCCTAATCTTCAGTGACTAATCCCATCTGGCCTCTGACAATCATCCC  600

seq1  TGACTGCCTGTCTGTAGTAGAGGCCCCAGGCCCCAGCTCCTCCTGCGACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGCCTGTCTGTAGTAGAGGCCCCAGGCCCCAGCTCCTCCTGCGACC  650

seq1  TCACATGGTTGCCTGGTTGTCTTCTCTCCAAAGCATGGTGAACTCCTTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATGGTTGCCTGGTTGTCTTCTCTCCAAAGCATGGTGAACTCCTTTT  700

seq1  CTCTTCCCTTACATCTCCCTTTCCTCCAGAGACCCAGGTGTTCTGCCTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCCCTTACATCTCCCTTTCCTCCAGAGACCCAGGTGTTCTGCCTTT  750

seq1  ACCTTCCACTCAACAATTAGCCCATGGCTTTCTTTACTGACAGATCAAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCCACTCAACAATTAGCCCATGGCTTTCTTTACTGACAGATCAAAA  800

seq1  ACCAACTGGGGGAACAGTACCTTAACATCAGAACTGCCCCCTACATCCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAACTGGGGGAACAGTACCTTAACATCAGAACTGCCCCCTACATCCAA  850

seq1  CCCCAGTGGTTACTCCTAAGTAAATAAATACGAACAACACTAAATAGACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGTGGTTACTCCTAAGTAAATAAATACGAACAACACTAAATAGACT  900

seq1  CAGCAGATTGTATTTATATATGCATGTGTACAAGTACATAAATATTTAGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGATTGTATTTATATATGCATGTGTACAAGTACATAAATATTTAGC  950

seq1  AACAGTTAATGAAAAGAGGTCATAAGGCTGAGAGGCACAGGAGGAGTTTA  1000
       |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
seq2  -ACAGGT-ATGAAAAGAGGTCAT-AGGCTGAGAGGCACAGGA-GAGTTTA  996

seq1  AGTGAGGAGGATATGGGATGAAA-TTTATGTAAATACAATACTCACAAAA  1049
      ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||
seq2  AGTGAGGAGGATATGGGATGAAATTTTATGT-AATACAATACTCAC-AAA  1044

seq1  TTCTCAGAAAAATAAAATATATGTAAAAAATGCAATCTATACTATAAAGT  1099
      |||||||||||||||| ||| |   |||||||| |||| |||||| ||||
seq2  TTCTCAGAAAAATAAATTATGT---AAAAATGC-ATCT-TACTAT-AAGT  1088

seq1  CATGGCTTTCACAAGAT  1116
      ||| || ||||||||||
seq2  CATTGC-TTCACAAGAT  1104