BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-153E07
Chromosome1 (Build37)
Map Location 125,648,520 - 125,794,964
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDpp10
Upstream geneLOC666983
Downstream geneLOC666998
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-153E07.bB6Ng01-153E07.g
ACCDH948630DH948631
length8451,026
definitionDH948630|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-153E07, 5' end.DH948631|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-153E07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,648,520 - 125,649,363)(125,793,933 - 125,794,964)
sequence
gaattcctgaagagacttctgctcaaactgtctatgatttttgactgaat
ttaggtcttcaagaagaaaggaactgagaagccctgcggctgtggccgca
tcaccatgtacttcagaccttccattaataaacaccaacgttgcttctct
gtaaagctctcttctgtcacttgagtcaagatctcagttcctctaagcag
aagtgctttcagacctttctcagcatggaacaaagaacactatgacacca
ggaactgagcatcatctcttgctgtgggtaacagaaaaaaaaagacatgg
tttagaaaatgattctctaaagtatttacttcaaataccaagctgacaga
gcctgggtatatcaatgctgggacttcctggctgtctagaaaaagcctga
agctctagttcagtgagagagaccctgtgtgaaaggaataatgtgaggag
tgatacttagaacatgaacacctaaaaacagcctgtgtacacacatatgt
gtatgcatatttacatgcatgtgtacatagattacacacacataacccac
ccacacacacacacacacacacgagcaaagagacagggattatctcagaa
gaggacaaaagaacattaagagatctgtgaaaaaaaaagaaatgctatat
tcttggatcaagtttaaacctcttgaaggttgacaaaaagggatcttgac
acaaaaatatatgtcacttcaaagattacctgcactgaattaatattcat
ttctagtgcccccttgtccctctgtgtatatgtatgcatatatatatata
tatatgcacgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtga
gaattctatagagaattcatcattcttgtcctgtgccatgttttctgtgc
tgttcaataaatgttgagcaaagttctttgttaaggagagataataggga
caggtcaggtccatgctacagacagaccacagacaggccagtaaccacaa
actgctaaaaaatggagatatgatgacagaaatgcagaattcagtgcaga
ctaattttttttggtcaatgaaattgaagaggacatcattatttcattcc
ctaatgtgacattgatgcattgttgtgttctctggcattacatttatgta
taatctaacacctaacctagctgtttgtaatactgacacaaagatggttt
cctagtcctatttactgggacaacaatcagaaaaaaagcaagcaaaaact
tgtataaaactgggtccctcaacagttcattatgacttgaggaggggccc
acaaggccctacactcctttagggattactggcaattaatgaatgttgaa
ggagagggactacatcctttagtgatgttaaccaaggctaagttaccctc
actctagtaaataatcctctactcaggcttaacccaggaacaaattaaat
tcagtgatcactcgcaaacattgggtatgaaagtagatcttacaggagtg
agagaagggtgaaataggggaagagtcattaaaaatgagtaatagtcatt
atagaattatatgacacctaataaaaattatttaattaaagtaaaacagt
tctttaaaataaagacattcaaatattaaaaatatatttgtcttctcttt
tgggaaagaagagaaaagactcaatatgtacatagtcttttatgacataa
agaatgtgattgtacttgtacagatgatatgctattattatgcatattgt
gcaaaaatccaagtgggttgatcatagcgactattgttgctagcacaaca
atagagcctgcttagagtattagaacgtcatggtagatattaccacaaac
aatttctcggcgctatatttaccagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_125648520_125649363
seq2: B6Ng01-153E07.b_44_887

seq1  GAATTCCTGAAGAGACTTCTGCTCAAACTGTCTATGATTTTTGACTGAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGAAGAGACTTCTGCTCAAACTGTCTATGATTTTTGACTGAAT  50

seq1  TTAGGTCTTCAAGAAGAAAGGAACTGAGAAGCCCTGCGGCTGTGGCCGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGTCTTCAAGAAGAAAGGAACTGAGAAGCCCTGCGGCTGTGGCCGCA  100

seq1  TCACCATGTACTTCAGACCTTCCATTAATAAACACCAACGTTGCTTCTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCATGTACTTCAGACCTTCCATTAATAAACACCAACGTTGCTTCTCT  150

seq1  GTAAAGCTCTCTTCTGTCACTTGAGTCAAGATCTCAGTTCCTCTAAGCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGCTCTCTTCTGTCACTTGAGTCAAGATCTCAGTTCCTCTAAGCAG  200

seq1  AAGTGCTTTCAGACCTTTCTCAGCATGGAACAAAGAACACTATGACACCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCTTTCAGACCTTTCTCAGCATGGAACAAAGAACACTATGACACCA  250

seq1  GGAACTGAGCATCATCTCTTGCTGTGGGTAACAGAAAAAAAAAGACATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTGAGCATCATCTCTTGCTGTGGGTAACAGAAAAAAAAAGACATGG  300

seq1  TTTAGAAAATGATTCTCTAAAGTATTTACTTCAAATACCAAGCTGACAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAAAATGATTCTCTAAAGTATTTACTTCAAATACCAAGCTGACAGA  350

seq1  GCCTGGGTATATCAATGCTGGGACTTCCTGGCTGTCTAGAAAAAGCCTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGGTATATCAATGCTGGGACTTCCTGGCTGTCTAGAAAAAGCCTGA  400

seq1  AGCTCTAGTTCAGTGAGAGAGACCCTGTGTGAAAGGAATAATGTGAGGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTAGTTCAGTGAGAGAGACCCTGTGTGAAAGGAATAATGTGAGGAG  450

seq1  TGATACTTAGAACATGAACACCTAAAAACAGCCTGTGTACACACATATGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATACTTAGAACATGAACACCTAAAAACAGCCTGTGTACACACATATGT  500

seq1  GTATGCATATTTACATGCATGTGTACATAGATTACACACACATAACCCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGCATATTTACATGCATGTGTACATAGATTACACACACATAACCCAC  550

seq1  CCACACACACACACACACACACGAGCAAAGAGACAGGGATTATCTCAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACACACACACACACACACGAGCAAAGAGACAGGGATTATCTCAGAA  600

seq1  GAGGACAAAAGAACATTAAGAGATCTGTGAAAAAAAAAGAAATGCTATAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACAAAAGAACATTAAGAGATCTGTGAAAAAAAAAGAAATGCTATAT  650

seq1  TCTTGGATCAAGTTTAAACCTCTTGAAGGTTGACAAAAAGGGATCTTGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGATCAAGTTTAAACCTCTTGAAGGTTGACAAAAAGGGATCTTGAC  700

seq1  ACAAAAATATATGTCACTTCAAAGATTACCTGCACTGAATTAATATTCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAATATATGTCACTTCAAAGATTACCTGCACTGAATTAATATTCAT  750

seq1  TTCTAGTGCCCCCTTGTCCCTCTGTGTATATGTATGCATATATATATATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGTGCCCCCTTGTCCCTCTGTGTATATGTATGCATATATATATATA  800

seq1  TATATGCACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGCACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  844

seq1: chr1_125793933_125794964
seq2: B6Ng01-153E07.g_69_1094 (reverse)

seq1  CCTGTTAAATTATAGCTGCCGAGAAATTGTTTGTGGTATAATCTAACATG  50
      |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||
seq2  CCTGGTAAA-TATAGC-GCCGAGAAATTGTTTGTGGTAATATCTACCATG  48

seq1  ACGTTCTAAATAACTCTAAGCAGGCTCTATTGTTGTGCTAGCAAACAATA  100
      |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ACGTTCTAA--TACTCTAAGCAGGCTCTATTGTTGTGCTAGC-AACAATA  95

seq1  GTCGCTATGATCAACCCACTTTGGATTTCTGCACAATATGCATAATAATA  150
      ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GTCGCTATGATCAACCCAC-TTGGATTTTTGCACAATATGCATAATAATA  144

seq1  GCATATCATCTGCTACAAGTACAATCACATTCTTTATGTCATTAAAGACT  200
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GCATATCATCTG-TACAAGTACAATCACATTCTTTATGTCATAAAAGACT  193

seq1  ATGTACATATTGATGTC-TTTCTCTTCTTT-CCAAAAGAGAAGACAAATA  248
      ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  ATGTACATATTGA-GTCTTTTCTCTTCTTTCCCAAAAGAGAAGACAAATA  242

seq1  TATTTTTAATATTTGAATGTCTTTATTTTAAAGAACTGTTTTACTTTAAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTAATATTTGAATGTCTTTATTTTAAAGAACTGTTTTACTTTAAT  292

seq1  TAAATAATTTTTATTAGGTGTCATATAATTCTATAATGACTATTACTCAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATAATTTTTATTAGGTGTCATATAATTCTATAATGACTATTACTCAT  342

seq1  TTTTAATGACTCTTCCCCTATTTCACCCTTCTCTCACTCCTGTAAGATCT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATGACTCTTCCCCTATTTCACCCTTCTCTCACTCCTGTAAGATCT  392

seq1  ACTTTCATACCCAATGTTTGCGAGTGATCACTGAATTTAATTTGTTCCTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCATACCCAATGTTTGCGAGTGATCACTGAATTTAATTTGTTCCTG  442

seq1  GGTTAAGCCTGAGTAGAGGATTATTTACTAGAGTGAGGGTAACTTAGCCT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAAGCCTGAGTAGAGGATTATTTACTAGAGTGAGGGTAACTTAGCCT  492

seq1  TGGTTAACATCACTAAAGGATGTAGTCCCTCTCCTTCAACATTCATTAAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTAACATCACTAAAGGATGTAGTCCCTCTCCTTCAACATTCATTAAT  542

seq1  TGCCAGTAATCCCTAAAGGAGTGTAGGGCCTTGTGGGCCCCTCCTCAAGT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGTAATCCCTAAAGGAGTGTAGGGCCTTGTGGGCCCCTCCTCAAGT  592

seq1  CATAATGAACTGTTGAGGGACCCAGTTTTATACAAGTTTTTGCTTGCTTT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAATGAACTGTTGAGGGACCCAGTTTTATACAAGTTTTTGCTTGCTTT  642

seq1  TTTTCTGATTGTTGTCCCAGTAAATAGGACTAGGAAACCATCTTTGTGTC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTGATTGTTGTCCCAGTAAATAGGACTAGGAAACCATCTTTGTGTC  692

seq1  AGTATTACAAACAGCTAGGTTAGGTGTTAGATTATACATAAATGTAATGC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTACAAACAGCTAGGTTAGGTGTTAGATTATACATAAATGTAATGC  742

seq1  CAGAGAACACAACAATGCATCAATGTCACATTAGGGAATGAAATAATGAT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAACACAACAATGCATCAATGTCACATTAGGGAATGAAATAATGAT  792

seq1  GTCCTCTTCAATTTCATTGACCAAAAAAAATTAGTCTGCACTGAATTCTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCTTCAATTTCATTGACCAAAAAAAATTAGTCTGCACTGAATTCTG  842

seq1  CATTTCTGTCATCATATCTCCATTTTTTAGCAGTTTGTGGTTACTGGCCT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCTGTCATCATATCTCCATTTTTTAGCAGTTTGTGGTTACTGGCCT  892

seq1  GTCTGTGGTCTGTCTGTAGCATGGACCTGACCTGTCCCTATTATCTCTCC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTGGTCTGTCTGTAGCATGGACCTGACCTGTCCCTATTATCTCTCC  942

seq1  TTAACAAAGAACTTTGCTCAACATTTATTGAACAGCACAGAAAACATGGC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACAAAGAACTTTGCTCAACATTTATTGAACAGCACAGAAAACATGGC  992

seq1  ACAGGACAAGAATGATGAATTCTCTATAGAATTC  1032
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGACAAGAATGATGAATTCTCTATAGAATTC  1026