BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155H02
Chromosome1 (Build37)
Map Location 46,820,956 - 46,957,853
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc39a10
Upstream geneEG666819, Wdr75, EG433297, LOC383644, Slc40a1, LOC670603, EG227054, LOC100042453, EG212225, Dnahc7b, LOC666855
Downstream geneEG227061, LOC666869
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155H02.bB6Ng01-155H02.g
ACCDH950225DH950226
length1,1151,162
definitionDH950225|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155H02, 5' end.DH950226|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155H02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(46,820,956 - 46,822,078)(46,956,673 - 46,957,853)
sequence
gaattcttcctttgatggtttgttgtcatttagaatttctggaattagac
tctatcaaattttaatcttgagactttgtatttatgcattcagtagatgc
taaaagaaagaaaaagaaaagagagaaaagaaaaaaaaagaaatctagtt
ctgaccagcaagatgactcagtgactagtgacttgagttagagcccctga
acccacaagggaggaggagtgtagtccagcaagctgacctttaacttcca
ctctctcggtagtcatgttcactcactaccttgcaacacacaccaaataa
acaaacaaacagacaaatatataaataaaagtctaacttgaatctggata
tttctccattggttcagcattcctagccacacacgtgcaggagaacatat
gtgcctgactttaaaatgcattatgatggggtgatggttttattcacaaa
atgtgttcaactagatgttgcagagaacatataactggtgtttggaagaa
cttgtaactgtttccagaggatactatcttttttagatactgggcacttg
taaattgctcctgcagctgaagaatgttccaggcatgtggaattgctacc
ctgggttgggggcggggagtgtgatatatttgtatagtcccatccttcta
taatgacagccattctgctgatgactgtgaggttctcacgagcgctttcc
attactccttcctctgaggtagcctgtgttctgtcctacagctggcatgt
ttgactcacacctttcttctatgctaactaagctgttatggagatgccca
cagcattctgtgtggcaggactgattagcttgtgagaacaagataaagaa
acagagagctactatttgtgccttcaaaatttgagcagtaatgtgtgttt
cagagcagggttaaaagtgcattgggtcgttacttcttaagacataagct
gaagttaggtattagatagattatatgtatgatgttagtcatatgaacat
ctgtagctgtaacttgttatcaaagggaatgtgactttcaaaactgcagt
gtgtgtgaataaacatatggatctttaagaagctgtgttatggagctctg
aagagcttggcattt
gaattcatatgtaacttgatgagttccagacttgacttctatcaaggttt
tcttagaggaaattaacaaagaaaataagaaaggaaaggaaaggtattcg
tcttttagagaattgaaatgacagagctgagctgaaccttgactgtgtac
aaatttgatggggattagtttagctatcttgactaagaggagaatacctg
cacacacacacatacaggctagtctggaactcatatataacttgatgaaa
atcaataatcatcctctgacaacctccataatgctgggttacaatcactg
tgcctggctctggatcttgctttctgttcaactatccctgtatgtgttca
tcagtgtactctcaacacacatgcaatccacttggcacagaagccacatt
tattgagcttatgttgaatgaagcagcctctgaccatgaggaaacagaat
taagtctgaaacaagagaagacagaggatgaacaccagatatccttgctc
tggagaaacacggtccatctagcttcccatgctacatggcctttcctcat
gctttctccttccagatggaggctgagcagataaagtattattgtgatta
gctaatattcctcagagaatgctgcccacggtgtcatctaacctgcacaa
caagtacccatgaaataggcatacttctattttatgtagaaagaaaccta
gccttggaggatatgggtgtatataagctacattatgaacaaaatgacaa
tatcaagacttacctcatggtccctatgccccgtctcccaaatgcactat
aaaacaaattgctttactttgggcacagtagagtgggcaagagggcaaca
tgcaaatgggccttcttgtttagcctcttgactcaatctactttaggtct
ttaccagcagtagaggagtcatctctgcttgtgccctacctagtaatttc
cttctcattaccttcactccttttctgccatatctagagtctatacattg
gacagggaactacctgtccatgctgattcggtctgggcagaggtaagcta
tgcctcacccttcacagcacaccagatctagtcatagacttcaaggggag
ctggttcgtcttcagggccaggccattattattggacttagattaactgg
ggaaatgattga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_46820956_46822078
seq2: B6Ng01-155H02.b_49_1163

seq1  GAATTCTTCCTTTGATGGTTTGTTGTCATTTAGAATTTCTGGAATTAGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCTTTGATGGTTTGTTGTCATTTAGAATTTCTGGAATTAGAC  50

seq1  TCTATCAAATTTTAATCTTGAGACTTTGTATTTATGCATTCAGTAGATGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCAAATTTTAATCTTGAGACTTTGTATTTATGCATTCAGTAGATGC  100

seq1  TAAAAGAAAGAAAAAGAAAAGAGAGAAAAGAAAAAAAAAGAAATCTAGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGAAAGAAAAAGAAAAGAGAGAAAAGAAAAAAAAAGAAATCTAGTT  150

seq1  CTGACCAGCAAGATGACTCAGTGACTAGTGACTTGAGTTAGAGCCCCTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCAGCAAGATGACTCAGTGACTAGTGACTTGAGTTAGAGCCCCTGA  200

seq1  ACCCACAAGGGAGGAGGAGTGTAGTCCAGCAAGCTGACCTTTAACTTCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCACAAGGGAGGAGGAGTGTAGTCCAGCAAGCTGACCTTTAACTTCCA  250

seq1  CTCTCTCGGTAGTCATGTTCACTCACTACCTTGCAACACACACCAAATAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCGGTAGTCATGTTCACTCACTACCTTGCAACACACACCAAATAA  300

seq1  ACAAACAAACAGACAAATATATAAATAAAAGTCTAACTTGAATCTGGATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACAAACAGACAAATATATAAATAAAAGTCTAACTTGAATCTGGATA  350

seq1  TTTCTCCATTGGTTCAGCATTCCTAGCCACACACGTGCAGGAGAACATAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCCATTGGTTCAGCATTCCTAGCCACACACGTGCAGGAGAACATAT  400

seq1  GTGCCTGACTTTAAAATGCATTATGATGGGGTGATGGTTTTATTCACAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTGACTTTAAAATGCATTATGATGGGGTGATGGTTTTATTCACAAA  450

seq1  ATGTGTTCAACTAGATGTTGCAGAGAACATATAACTGGTGTTTGGAAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTTCAACTAGATGTTGCAGAGAACATATAACTGGTGTTTGGAAGAA  500

seq1  CTTGTAACTGTTTCCAGAGGATACTATCTTTTTTAGATACTGGGCACTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTAACTGTTTCCAGAGGATACTATCTTTTTTAGATACTGGGCACTTG  550

seq1  TAAATTGCTCCTGCAGCTGAAGAATGTTCCAGGCATGTGGAATTGCTACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTGCTCCTGCAGCTGAAGAATGTTCCAGGCATGTGGAATTGCTACC  600

seq1  CTGGGTTGGGGGCGGGGAGTGTGATATATTTGTATAGTCCCATCCTTCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTTGGGGGCGGGGAGTGTGATATATTTGTATAGTCCCATCCTTCTA  650

seq1  TAATGACAGCCATTCTGCTGATGACTGTGAGGTTCTCACGAGCGCTTTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGACAGCCATTCTGCTGATGACTGTGAGGTTCTCACGAGCGCTTTCC  700

seq1  ATTACTCCTTCCTCTGAGGTAGCCTGTGTTCTGTCCTACAGCTGGCATGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACTCCTTCCTCTGAGGTAGCCTGTGTTCTGTCCTACAGCTGGCATGT  750

seq1  TTGACTCACACCTTCCTTCTATGCTAACTAAGCTGTTATGGAGATGCCCA  800
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTCACACCTTTCTTCTATGCTAACTAAGCTGTTATGGAGATGCCCA  800

seq1  CAGCATTCTGTGTGGCAGGACTGATTAGCTTGTGAGAACAAGATAAAGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATTCTGTGTGGCAGGACTGATTAGCTTGTGAGAACAAGATAAAGAA  850

seq1  ACAGAGAGCTACTATTTGTGCCTTCAAAATTTGAGCAGTAATGTGTGTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGAGCTACTATTTGTGCCTTCAAAATTTGAGCAGTAATGTGTGTTT  900

seq1  CAGAGCAGGGTTAAAAGTGCATTTGGTCGTTACTTCTTAAGACATAAGCT  950
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCAGGGTTAAAAGTGCATTGGGTCGTTACTTCTTAAGACATAAGCT  950

seq1  GAAGTTAGGTAATTAGATAGATTATATGTATGATGTTAGTCATATGAACA  1000
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTAGGT-ATTAGATAGATTATATGTATGATGTTAGTCATATGAACA  999

seq1  TCTGTAGCTGTAACTTGTTATCAAAGGGAATGTGACTTTCAAAAACTGCA  1050
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 
seq2  TCTGTAGCTGTAACTTGTTATCAAAGGGAATGTGACTTTC-AAAACTGC-  1047

seq1  AGTGTGTGTGAAATAAACATAT-GATCTTTAAAGAAGCTGTGTTAATGGA  1099
      |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||
seq2  AGTGTGTGTG-AATAAACATATGGATCTTT-AAGAAGCTGTGTT-ATGGA  1094

seq1  GGCTCTGAAGGAGTCTTGGCATTT  1123
       |||||||| ||| ||||||||||
seq2  -GCTCTGAA-GAG-CTTGGCATTT  1115

seq1: chr1_46956673_46957853
seq2: B6Ng01-155H02.g_70_1231 (reverse)

seq1  TCAATCATTTTTCACCAGTTAAATTCTAAGTACAAATAAAAAATGCCCTG  50
      |||||||  |||| ||||||||  ||||||| |||   || |||| ||||
seq2  TCAATCA--TTTCCCCAGTTAA--TCTAAGTCCAA--TAATAATGGCCTG  44

seq1  GCCTGGAAGACAGAGCACAGCTCCCCACTGAAGTCTATGACTAGATCCTG  100
      |||  |||||| || | |||||||||  |||||||||||||||||| |||
seq2  GCCCTGAAGAC-GAAC-CAGCTCCCC-TTGAAGTCTATGACTAGAT-CTG  90

seq1  GTGTGCCTTGTGGAGGGTGAGGCATAGCCTACCTCTGGCCCAGGACCGAA  150
      ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||
seq2  GTGTGC--TGTGAAGGGTGAGGCATAGCTTACCTCT-GCCCA-GACCGAA  136

seq1  TTCAGCATGGACAGGTAGTTCCCTGT-CAATGTTATAGACTCTAGAATAT  199
       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||
seq2  -TCAGCATGGACAGGTAGTTCCCTGTCCAATG-TATAGACTCTAG-ATAT  183

seq1  GGCAGAAAAGGAGTGAAGGTAATGAGAAGGAAATTTACTAGGTTAGGGCA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
seq2  GGCAGAAAAGGAGTGAAGGTAATGAGAAGGAAA-TTACTAGG-TAGGGCA  231

seq1  CAAGCAGAGATGGACTCCTCTACTGCTGGTAAAGACCTAAAGTAGATTGA  299
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAGAGAT-GACTCCTCTACTGCTGGTAAAGACCTAAAGTAGATTGA  280

seq1  GTCAAGAGGCTAAACAAGAAGGCCCATTTGCATGTTGCCCTCTTGCCCAC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAGAGGCTAAACAAGAAGGCCCATTTGCATGTTGCCCTCTTGCCCAC  330

seq1  TCTACTGTGCCCAAAGTAAAGCAATTTGTTTTATAGTGCATTTGGGAGAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTGTGCCCAAAGTAAAGCAATTTGTTTTATAGTGCATTTGGGAGAC  380

seq1  GGGGCATAGGGACCATGAGGTAAGTCTTGATATTGTCATTTTGTTCATAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCATAGGGACCATGAGGTAAGTCTTGATATTGTCATTTTGTTCATAA  430

seq1  TGTAGCTTATATACACCCATATCCTCCAAGGCTAGGTTTCTTTCTACATA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGCTTATATACACCCATATCCTCCAAGGCTAGGTTTCTTTCTACATA  480

seq1  AAATAGAAGTATGCCTATTTCATGGGTACTTGTTGTGCAGGTTAGATGAC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGAAGTATGCCTATTTCATGGGTACTTGTTGTGCAGGTTAGATGAC  530

seq1  ACCGTGGGCAGCATTCTCTGAGGAATATTAGCTAATCACAATAATACTTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGTGGGCAGCATTCTCTGAGGAATATTAGCTAATCACAATAATACTTT  580

seq1  ATCTGCTCAGCCTCCATCTGGAAGGAGAAAGCATGAGGAAAGGCCATGTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCTCAGCCTCCATCTGGAAGGAGAAAGCATGAGGAAAGGCCATGTA  630

seq1  GCATGGGAAGCTAGATGGACCGTGTTTCTCCAGAGCAAGGATATCTGGTG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGGAAGCTAGATGGACCGTGTTTCTCCAGAGCAAGGATATCTGGTG  680

seq1  TTCATCCTCTGTCTTCTCTTGTTTCAGACTTAATTCTGTTTCCTCATGGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCCTCTGTCTTCTCTTGTTTCAGACTTAATTCTGTTTCCTCATGGT  730

seq1  CAGAGGCTGCTTCATTCAACATAAGCTCAATAAATGTGGCTTCTGTGCCA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGCTGCTTCATTCAACATAAGCTCAATAAATGTGGCTTCTGTGCCA  780

seq1  AGTGGATTGCATGTGTGTTGAGAGTACACTGATGAACACATACAGGGATA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGATTGCATGTGTGTTGAGAGTACACTGATGAACACATACAGGGATA  830

seq1  GTTGAACAGAAAGCAAGATCCAGAGCCAGGCACAGTGATTGTAACCCAGC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAACAGAAAGCAAGATCCAGAGCCAGGCACAGTGATTGTAACCCAGC  880

seq1  ATTATGGAGGTTGTCAGAGGATGATTATTGATTTTCATCAAGTTATATAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGGAGGTTGTCAGAGGATGATTATTGATTTTCATCAAGTTATATAT  930

seq1  GAGTTCCAGACTAGCCTGTATGTGTGTGTGTGCAGGTATTCTCCTCTTAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCCAGACTAGCCTGTATGTGTGTGTGTGCAGGTATTCTCCTCTTAG  980

seq1  TCAAGATAGCTAAACTAATCCCCATCAAATTTGTACACAGTCAAGGTTCA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGATAGCTAAACTAATCCCCATCAAATTTGTACACAGTCAAGGTTCA  1030

seq1  GCTCAGCTCTGTCATTTCAATTCTCTAAAAGACGAATACCTTTCCTTTCC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGCTCTGTCATTTCAATTCTCTAAAAGACGAATACCTTTCCTTTCC  1080

seq1  TTTCTTATTTTCTTTGTTAATTTCCTCTAAGAAAACCTTGATAGAAGTCA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTATTTTCTTTGTTAATTTCCTCTAAGAAAACCTTGATAGAAGTCA  1130

seq1  AGTCTGGAACTCATCAAGTTACATATGAATTC  1181
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGGAACTCATCAAGTTACATATGAATTC  1162