BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-157E20
Chromosome1 (Build37)
Map Location 126,189,293 - 126,339,244
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDpp10
Downstream geneLOC666998, Actr3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-157E20.bB6Ng01-157E20.g
ACCDH951575DH951576
length2661,140
definitionDH951575|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157E20, 5' end.DH951576|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157E20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,338,979 - 126,339,244)(126,189,293 - 126,190,463)
sequence
gaattccatcatctatccttatgtttatataaagtagatatattggcaca
tttatctaacaatttttaccaagatgtcatgaatcaatgttacctaatga
ttttgtttttaggataaatcctaaggggtaagaaaacagcctgcatggct
cttataagtgtgtatgtgtttgtgtttgtgtgagtgtgtgtttgtgtgta
tgagtgtgcctgtgtgagtatgtatttgtgagtgtgtgtgattctgtgca
ggtgaatgtgtatttg
gaattctatatggaaaggctgaactgacccctctgattctgactcaactc
tgcaactctaccctgatcattgcattgtggtatctatcagctctatgttg
ggctgtgtgttctagagctcagaaatgtaggaaggactttatatctgtct
ccaaactcactgtgaatgtactatatgctagagagcttgtgggatggcag
aacaatttttctgattctatcaacaggtcttagatggggttacgggcaca
ttaaatgctttcagtcctgtattgaaatgcagtctacctttaaaggtcct
tcccgcaaaggttagcatggtgtttgtcacatcacccacatagagcaagt
gcctgagctatctcccttgccccttctccctccacatttgcacaacaaat
acaataactaattacctttataagcttgcttctatagagttggtttgaac
cctcaattggtacatgctattatcaaaatttgtcaagctcctgtgaagta
gtgctgttgttgttgggaaagttcatattttcttccaatggtcttaagaa
ctaaaacactactcagaaggaaaattccatttatgaattgataagaaagt
cctttttatagttgggggtcaccacaatatgaggaactgtattaaagggt
tacatcattaggaacgatgagaagcacaggttaggtaatcaaatcccaga
caagaaatacaaaattatgaatgctctgtagctacagagaaaatcgctaa
tctgtccattggctttgaacaccacttgctaaagttatgtcatgaacaca
gcctgactgaaaaaccaaactgtgtcttggaaaggtgataaactcttttc
tcttttgccttagctttggtgtgaagagtgctccctgcctgttgtttgct
tggtgcttgttaaatcaccagctctacagtctctcagaacttgctgaata
ggacgatgttgttgtgacagatctgtatccatataactctggcagctatg
aggttcaacaatgacactaaccccacgattaattatatactcttcagagc
agctttcatgttgctatttagtgtttcctgagggctagatgatgcaggga
gacctagcccaggagtgaaggctgatatctctctggtgcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_126338979_126339244
seq2: B6Ng01-157E20.b_44_309 (reverse)

seq1  CAAATACACATTCACATACACAGAAACACACACACTCACAAATACATACT  50
      ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATACACATTCACCTGCACAGAATCACACACACTCACAAATACATACT  50

seq1  CACACAGGCACACTCATACACACAAACACACACTCACACAAACACAAACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACAGGCACACTCATACACACAAACACACACTCACACAAACACAAACA  100

seq1  CATACACACTTATAAGAGCCATGCAGGCTGTTTTCTTACCCCTTAGGATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACACACTTATAAGAGCCATGCAGGCTGTTTTCTTACCCCTTAGGATT  150

seq1  TATCCTAAAAACAAAATCATTAGGTAACATTGATTCATGACATCTTGGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCTAAAAACAAAATCATTAGGTAACATTGATTCATGACATCTTGGTA  200

seq1  AAAATTGTTAGATAAATGTGCCAATATATCTACTTTATATAAACATAAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTGTTAGATAAATGTGCCAATATATCTACTTTATATAAACATAAGG  250

seq1  ATAGATGATGGAATTC  266
      ||||||||||||||||
seq2  ATAGATGATGGAATTC  266

seq1: chr1_126189293_126190463
seq2: B6Ng01-157E20.g_64_1203

seq1  GAATTCTATATGGAAAGGCTGAACTGACCCCTCTGATTCTGACTCAACTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATATGGAAAGGCTGAACTGACCCCTCTGATTCTGACTCAACTC  50

seq1  TGCAACTCTACCCTGATCATTGCATTGTGGTATCTATCAGCTCTATGTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACTCTACCCTGATCATTGCATTGTGGTATCTATCAGCTCTATGTTG  100

seq1  GGCTGTGTGTTCTAGAGCTCAGAAATGTAGGAAGGACTTTATATCTGTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTGTGTTCTAGAGCTCAGAAATGTAGGAAGGACTTTATATCTGTCT  150

seq1  CCAAACTCACTGTGAATGTACTATATGCTAGAGAGCTTGTGGGATGGCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAACTCACTGTGAATGTACTATATGCTAGAGAGCTTGTGGGATGGCAG  200

seq1  AACAATTTTTCTGATTCTATCAACAGGTCTTAGATGGGGTTACGGGCACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATTTTTCTGATTCTATCAACAGGTCTTAGATGGGGTTACGGGCACA  250

seq1  TTAAATGCTTTCAGTCCTGTATTGAAATGCAGTCTACCTTTAAAGGTCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATGCTTTCAGTCCTGTATTGAAATGCAGTCTACCTTTAAAGGTCCT  300

seq1  TCCCGCAAAGGTTAGCATGGTGTTTGTCACATCACCCACATAGAGCAAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCGCAAAGGTTAGCATGGTGTTTGTCACATCACCCACATAGAGCAAGT  350

seq1  GCCTGAGCTATCTCCCTTGCCCCTTCTCCCTCCACATTTGCACAACAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGAGCTATCTCCCTTGCCCCTTCTCCCTCCACATTTGCACAACAAAT  400

seq1  ACAATAACTAATTACCTTTATAAGCTTGCTTCTATAGAGTTGGTTTGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATAACTAATTACCTTTATAAGCTTGCTTCTATAGAGTTGGTTTGAAC  450

seq1  CCTCAATTGGTACATGCTATTATCAAAATTTGTCAAGCTCCTGTGAAGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAATTGGTACATGCTATTATCAAAATTTGTCAAGCTCCTGTGAAGTA  500

seq1  GTGCTGTTGTTGTTGGGAAAGTTCATATTTTCTTCCAATGGTCTTAAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGTTGTTGTTGGGAAAGTTCATATTTTCTTCCAATGGTCTTAAGAA  550

seq1  CTAAAACACTACTCAGAAGGAAAATTCCATTTATGAATTGATAAGAAAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAACACTACTCAGAAGGAAAATTCCATTTATGAATTGATAAGAAAGT  600

seq1  CCTTTTTATAGTTGGGGGTCACCACAATATGAGGAACTGTATTAAAGGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTTATAGTTGGGGGTCACCACAATATGAGGAACTGTATTAAAGGGT  650

seq1  TACATCATTAGGAACGATGAGAAGCACAGGTTAGGTAATCAAATCCCAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATCATTAGGAACGATGAGAAGCACAGGTTAGGTAATCAAATCCCAGA  700

seq1  CAAGAAATACAAAATTATGAATGCTCTGTAGCTACAGAGAAAATCGCTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAAATACAAAATTATGAATGCTCTGTAGCTACAGAGAAAATCGCTAA  750

seq1  TCTGTCCATTGGCTTTGAACACCACTTGCTAAAGTTATGTCATGAACACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCCATTGGCTTTGAACACCACTTGCTAAAGTTATGTCATGAACACA  800

seq1  GCCTGACTGAAAAACCAAACTGTGTCTTGGAAAGGTGATAAACTCTTTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGACTGAAAAACCAAACTGTGTCTTGGAAAGGTGATAAACTCTTTTC  850

seq1  TCTTTTGCCTTAGCTTTGGTGTGAAGAGTGCTCCCTGCCTGTTGTTTGCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTGCCTTAGCTTTGGTGTGAAGAGTGCTCCCTGCCTGTTGTTTGCT  900

seq1  TGGTGCTTGTTAAAATCACCAGCTCTAACAGTCTCTCAGAACTTGCTGAA  950
      ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGCTTGTT-AAATCACCAGCTCT-ACAGTCTCTCAGAACTTGCTGAA  948

seq1  TAAGGAAGGATGTTGTTGTGAACAGATCTGTATCCATATTAAACTCTGGC  1000
      ||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||
seq2  TA--GGACGATGTTGTTGTG-ACAGATCTGTATCCATAT--AACTCTGGC  993

seq1  AAGCTATGAGGTTCAACAATGACAACTAACCCCAAACGATTAAAATTAAT  1050
       |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||   | ||
seq2  -AGCTATGAGGTTCAACAATGAC-ACTAACCCC--ACGATTAA---TTAT  1036

seq1  ATCACTCTTCCAGAGCAGGCTTTCATTGTTTGCTATTTTATGTTGTTTCC  1100
      || |||||| ||||||| ||||||||   ||||||||   |  |||||||
seq2  AT-ACTCTT-CAGAGCA-GCTTTCAT--GTTGCTATT---TAGTGTTTCC  1078

seq1  TTGAGGGGCTAGATGTATGCAGTGGAGACCTAGCCCCAGGGAAAGTGAAG  1150
       ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||   |||||||
seq2  -TGA-GGGCTAGATG-ATGCAG-GGAGACCTAG-CCCAGG---AGTGAAG  1120

seq1  GCTTGATAGTCTCTCT-GTGCC  1171
      || ||||| ||||||| |||||
seq2  GC-TGATA-TCTCTCTGGTGCC  1140