BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-158D04
Chromosome1 (Build37)
Map Location 12,000,983 - 12,107,232
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneC030045D06Rik, A830018L16Rik
Downstream geneLOC665262, LOC100039709, LOC621353, LOC100039733, Sulf1, Slco5a1, LOC383490, Prdm14
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-158D04.bB6Ng01-158D04.g
ACCDH952216DH952217
length1,059949
definitionDH952216|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158D04, 5' end.DH952217|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158D04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,000,983 - 12,002,055)(12,106,278 - 12,107,232)
sequence
gaattctatatagaactcacatggggatgtcagtaacaaactcataaact
ctgaggactttaatccatgatgttatgtctggatttggtggagcaagcca
gtccatctacttgacttttcagtatggagatcttataagaatctcattac
ttctggtcaaagactacctagcaagcaaccttatcccccatgttgccctc
tctttttcttcccgagttaagtaccatttgttttcctcactggttagaaa
ccatgatctgttcttcctaccttcttactgccaagctaagtggtgcagtg
ttctttgtgtgagaccggttatctcctattgtcagtaattaatgagttat
aagttctggtaggtaatatccaaggaggacattttattttcatggtagaa
ttcttcgggatgatgccaattttgaagtgtcagttttctaacactttggt
tataacctgagaaattctatctctgttgcaagaaaatacagcacatttag
gggaccaggggttcagaagcatctgaaaagactccatgaactccctctag
gtattcaagcccactcttcataccattccttacctttgaatgaggactag
acatgcaggctcacatctaatacacagagtacaatgatgatgcactacag
tttttgagattaggcagtaacagactgacacacactttagctagatttgt
gggctcatgttgatgaaaagggaagtcataagaagttgagagctattttc
aacctctagcatacaataaattgaaatcctaactctcacagcctcaaaag
cccaacatcctcatgagaaggctgggagttgatcctaacctgtaggattt
gccatcaagtgcagatctagccaaagccttatctgcagcctgtgagggaa
acttgtacagatgaactagctaaacctgaatgacttccatgagatcagga
gatgcaatgcatgatgctgtcactacatgtagtagttgtttgattttgtc
attgggcatttacctgctgtgtggtcagatgcctcaaactgatatctctg
actcagtct
gaattcccaaaaaaaccatgggacagctgcattatcctctttcgtattac
ataggagagaccccctaataatgctaagctgtgatatttagttcatcagt
aataacagtttggatttagggaacagttgcattgattaaccaatataatt
tccagaagacacaggaaagcataattaccaagctctggtcttccaaacat
ctctgtgcaggttggactgcccatgtagacacaaatcccttccttactct
gagagaagagtggatcaggaagggagaagaaaggaagaaggggttggagg
cgtggggtgctgacacatgttctggggtgtaagttttaatattcaacata
ttttgagtcctattgacaccttcaactctaatgacagagaaagctattac
aatgggaatttaaagaaaatagtatcaaatagctaaattaaagaaacgaa
ggatttggatagttgtgttaactgggcaagtatctttgtctttctgttct
tcctttttaatagtgaaatagtagtagagattccatgtaaaaatcttagc
gtttgtgttaatgcaccacaaatgctaaagtgttactattattttatacc
tatatctgagattggagttaaatggatctatactaactatttctattatt
taactgtcaactgtttcagattgtaaaatagtttggcttggtttagtatt
actaaaaacttttgacatattctctggagtctcatgactttggatataaa
taaggtctacatagtgacagtttactcttatagcatcaacctcagaagac
aagatactagctacaacaaagcttgacttataaaaactactattgcaaag
aagtggtagagttgccttgtatcagatgtgggcaatgtgatcactatatc
cagtggataggtggcagttggtagcaaaggatgtagaagtgagagaagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_12000983_12002055
seq2: B6Ng01-158D04.b_45_1103

seq1  GAATTCTATATAGAACTCACATGGGGATGTCAGTAACAAACTCATAAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATATAGAACTCACATGGGGATGTCAGTAACAAACTCATAAACT  50

seq1  CTGAGGACTTTAATCCATGATGTTATGTCTGGATTTGGTGGAGCAAGCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGACTTTAATCCATGATGTTATGTCTGGATTTGGTGGAGCAAGCCA  100

seq1  GTCCATCTACTTGACTTTTCAGTATGGAGATCTTATAAGAATCTCATTAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCATCTACTTGACTTTTCAGTATGGAGATCTTATAAGAATCTCATTAC  150

seq1  TTCTGGTCAAAGACTACCTAGCAAGCAACCTTATCCCCCATGTTGCCCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGTCAAAGACTACCTAGCAAGCAACCTTATCCCCCATGTTGCCCTC  200

seq1  TCTTTTTCTTCCCGAGTTAAGTACCATTTGTTTTCCTCACTGGTTAGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTTCTTCCCGAGTTAAGTACCATTTGTTTTCCTCACTGGTTAGAAA  250

seq1  CCATGATCTGTTCTTCCTACCTTCTTACTGCCAAGCTAAGTGGTGCAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGATCTGTTCTTCCTACCTTCTTACTGCCAAGCTAAGTGGTGCAGTG  300

seq1  TTCTTTGTGTGAGACCGGTTATCTCCTATTGTCAGTAATTAATGAGTTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTGTGTGAGACCGGTTATCTCCTATTGTCAGTAATTAATGAGTTAT  350

seq1  AAGTTCTGGTAGGTAATATCCAAGGAGGACATTTTATTTTCATGGTAGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCTGGTAGGTAATATCCAAGGAGGACATTTTATTTTCATGGTAGAA  400

seq1  TTCTTCGGGATGATGCCAATTTTGAAGTGTCAGTTTTCTAACACTTTGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCGGGATGATGCCAATTTTGAAGTGTCAGTTTTCTAACACTTTGGT  450

seq1  TATAACCTGAGAAATTCTATCTCTGTTGCAAGAAAATACAGCACATTTAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAACCTGAGAAATTCTATCTCTGTTGCAAGAAAATACAGCACATTTAG  500

seq1  GGGACCAGGGGTTCAGAAGCATCTGAAAAGACTCCATGAACTCCCTCTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCAGGGGTTCAGAAGCATCTGAAAAGACTCCATGAACTCCCTCTAG  550

seq1  GTATTCAAGCCCACTCTTCATACCATTCCTTACCTTTGAATGAGGACTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTCAAGCCCACTCTTCATACCATTCCTTACCTTTGAATGAGGACTAG  600

seq1  ACATGCAGGCTCACATCTAATACACAGAGTACAATGATGATGCACTACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCAGGCTCACATCTAATACACAGAGTACAATGATGATGCACTACAG  650

seq1  TTTTTGAGATTAGGCAGTAACAGACTGACACACACTTTAGCTAGATTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGAGATTAGGCAGTAACAGACTGACACACACTTTAGCTAGATTTGT  700

seq1  GGGCTCATGTTGATGAAAAGGGAAGTCATAAGAAGTTGAGAGCTATTTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCATGTTGATGAAAAGGGAAGTCATAAGAAGTTGAGAGCTATTTTC  750

seq1  AACCTCTAGCATACAATAAATTGAAATCCTAACTCTCACAGCCTCAAAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTCTAGCATACAATAAATTGAAATCCTAACTCTCACAGCCTCAAAAG  800

seq1  CCCAACATCCTCATGAGAAGGCTGGGAGTTGATCCTAACCTGTAGGATTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAACATCCTCATGAGAAGGCTGGGAGTTGATCCTAACCTGTAGGATTT  850

seq1  GCCATCAAGTGCAGATCTAGCCAAAGCCTTATCTGCAGCCTGTGAGGGAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATCAAGTGCAGATCTAGCCAAAGCCTTATCTGCAGCCTGTGAGGGAA  900

seq1  ACTTGTACAGATGAACTAGCTAAACCTGAATGACTTCCATGAGATCAGGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTACAGATGAACTAGCTAAACCTGAATGACTTCCATGAGATCAGGA  950

seq1  GATGCAATGCATGAATGCTGTCACTACAATTGTTAATAAGTTGTTTGATT  1000
      ||||||||||||| ||||||||||||||  |||  |  |||||||||| |
seq2  GATGCAATGCATG-ATGCTGTCACTACA--TGT--AGTAGTTGTTTGA-T  994

seq1  TTTGTCCTTTGGGATTTTACCTTGCTGTGTGGTCCAGAATGGCTCCAAAC  1050
      ||||| | |||||  |||||| ||||||||||| ||| ||| || |||||
seq2  TTTGT-CATTGGGCATTTACC-TGCTGTGTGGT-CAG-ATGCCT-CAAAC  1039

seq1  TGATAATCTTCTTGGCTCAGTCT  1073
      |||| ||||   || ||||||||
seq2  TGAT-ATCT--CTGACTCAGTCT  1059

seq1: chr1_12106278_12107232
seq2: B6Ng01-158D04.g_66_1014 (reverse)

seq1  CCTTCTCCTCACCTCTACATCCTTTGCTACCAACT-CCACCTAACCACTG  49
      |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
seq2  CCTTCT-CTCACTTCTACATCCTTTGCTACCAACTGCCACCTATCCACTG  49

seq1  GATATTAGTGATCACATTGCCCACATCTTGATCCAAGGCAAACTCTACCA  99
      |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||
seq2  GATA-TAGTGATCACATTGCCCACATC-TGATACAAGGC-AACTCTACCA  96

seq1  CTTCTTCTGCAATAGTAGTTTTTTATAAGTCAAGCTTTGTTGTAGCTAGT  149
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTT-TGCAATAGTAG-TTTTTATAAGTCAAGCTTTGTTGTAGCTAGT  144

seq1  ATCTTGTCTTCTGAGGTTGATGCTATAAGAGTAAACTGTCACTATGTAGA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTGTCTTCTGAGGTTGATGCTATAAGAGTAAACTGTCACTATGTAGA  194

seq1  CCTTATTTATATCCTAAAGTCATGAGACTCCAGAGAATATGTCAAAAGTT  249
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTATTTATATCC-AAAGTCATGAGACTCCAGAGAATATGTCAAAAGTT  243

seq1  TTTAGTAATACTAAACCAAGCCAAACTATTTTACAATCTGAAACAGTTGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTAATACTAAACCAAGCCAAACTATTTTACAATCTGAAACAGTTGA  293

seq1  CAGTTAAATAATAGAAATAGTTAGTATAGATCCATTTAACTCCAATCTCA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTAAATAATAGAAATAGTTAGTATAGATCCATTTAACTCCAATCTCA  343

seq1  GATATAGGTATAAAATAATAGTAACACTTTAGCATTTGTGGTGCATTAAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATAGGTATAAAATAATAGTAACACTTTAGCATTTGTGGTGCATTAAC  393

seq1  ACAAACGCTAAGATTTTTACATGGAATCTCTACTACTATTTCACTATTAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACGCTAAGATTTTTACATGGAATCTCTACTACTATTTCACTATTAA  443

seq1  AAAGGAAGAACAGAAAGACAAAGATACTTGCCCAGTTAACACAACTATCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAAGAACAGAAAGACAAAGATACTTGCCCAGTTAACACAACTATCC  493

seq1  AAATCCTTCGTTTCTTTAATTTAGCTATTTGATACTATTTTCTTTAAATT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCCTTCGTTTCTTTAATTTAGCTATTTGATACTATTTTCTTTAAATT  543

seq1  CCCATTGTAATAGCTTTCTCTGTCATTAGAGCTGAAGGTGTCAATAGGAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CCCATTGTAATAGCTTTCTCTGTCATTAGAGTTGAAGGTGTCAATAGGAC  593

seq1  TCAAAATATGTTGAATATTAAAACTTACACCCCAGAACATGTGTCAGCAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAATATGTTGAATATTAAAACTTACACCCCAGAACATGTGTCAGCAC  643

seq1  CCCACGCCTCCAACCCCTTCTTCCTTTCTTCTCCCTTCCTGATCCACTCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACGCCTCCAACCCCTTCTTCCTTTCTTCTCCCTTCCTGATCCACTCT  693

seq1  TCTCTCAGAGTAAGGAAGGGATTTGTGTCTACATGGGCAGTCCAACCTGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCAGAGTAAGGAAGGGATTTGTGTCTACATGGGCAGTCCAACCTGC  743

seq1  ACAGAGATGTTTGGAAGACCAGAGCTTGGTAATTATGCTTTCCTGTGTCT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGATGTTTGGAAGACCAGAGCTTGGTAATTATGCTTTCCTGTGTCT  793

seq1  TCTGGAAATTATATTGGTTAATCAATGCAACTGTTCCCTAAATCCAAACT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAAATTATATTGGTTAATCAATGCAACTGTTCCCTAAATCCAAACT  843

seq1  GTTATTACTGATGAACTAAATATCACAGCTTAGCATTATTAGGGGGTCTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTACTGATGAACTAAATATCACAGCTTAGCATTATTAGGGGGTCTC  893

seq1  TCCTATGTAATACGAAAGAGGATAATGCAGCTGTCCCATGGTTTTTTTTG  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TCCTATGTAATACGAAAGAGGATAATGCAGCTGTCCCATGGTTTTTTTGG  943

seq1  GAATTC  955
      ||||||
seq2  GAATTC  949