BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-158H24
Chromosome1 (Build37)
Map Location 77,831,104 - 77,982,976
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039137, Tfdp1-ps, Epha4, LOC100039330
Downstream genePax3, LOC100039210, Sgpp2, LOC100039382, Farsb, Mogat1, Acsl3, Utp14b, LOC620521, Kcne4, LOC100039260, EG545332
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-158H24.bB6Ng01-158H24.g
ACCDH952433DH952434
length8421,073
definitionDH952433|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158H24, 5' end.DH952434|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158H24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(77,831,104 - 77,831,620)(77,981,906 - 77,982,976)
sequence
gaattctttgtttagctctgtaccccatttttaatggggttatttagaat
acccaagatacaatttgcaaaacacaagaaaattaagaagaatgaagacc
aaagtgtggatactttgccccttcttagaattgggaacaaaacacccatg
gaatgagttatagagacaaagtttggagctaaaacgaaaagatggaccat
ctagagactaccccacctggggatccatcctataatcagcctccaaacgc
agacaccatcgcatacaccagcaagattttgctgaaaggaccctgatata
gctgtcttgagtgaggctatgccagtgcctggcaaatacagaagtggatg
ctcacagtcaactataggatggaatacagggccctcaatggaggagctag
agaaagtacccaaagagctgaaggggtctgagccctataggtagaacaac
aatatgaactaaccagtaccccccagagctcatgtctctagctatatatg
tagcagaagatggcctagtcagccatcattgggaagagaggccccttggt
cttgcaaactttatatgccccagtacaggggaatgccagggccaagaagt
gggagtgggtgggtaggggagcagggcaggggagggtatagggaactttc
aagatagcattttgaaatgtaaataaataaaaatatctaatacaaaaata
aaattcatatatacacacacacacacacactcacgtgtgtgttatattat
atactaaaatgatgtggatatgaaggattaaaacagctttcagaacaacc
tatttttctgtttcctaaagcaatattgggaagttatacttt
gaattctctagatggtcaaagggaacggatgggaggatgaggtggggggt
caggttaataggagaatatgttcagcataaagctataccactatgaagat
cgataaataaaagagagagagatgtgccacagggagactggggtaggatg
ctgctattagactgggattctgtttcttcatcttgtatatatctgaacca
gatccagggcaactttaatccttctgggtatcccttaactgtagcatcag
tcagataacctgctctctccatctctgttatggtcaggactgggtaagta
gcaagagataaatgttcccccaagtaaccctcgcaggatggcattcatct
caggtgcacatggcatagaagtgaggggaggtaaagtgtgaaggcccatg
ctccctccagagggcagaccacccagctattctgagcatttgtacagaaa
ggctaataatctacaatacacacacacacacacacacacacacacatatg
tatatgtgtatatataatcacattgagtttaaggttagtctgcttacatc
cagtaaaagagataagccctgaggaagaataaagtcggccatctgattgc
ttagaataccgagattcataaatttgtatggtttggcccaactttaaaaa
ctttacatctgcaaagttaagaaataaaaccccaaagcatgtggggcctg
agagccagctcagtaaggaaaggtgtgagctgccaagcctcatggctaca
gtcctctaacctggaccacacagtggaagggagggagtcccatatggtga
tgggaaagaaccagctcccatgagctgcctttgacctctatgcatgtgcc
atggcatatacaaacctatacacttaaacacacacatgtacctcaaataa
aatagttgttaaagtaattatgtcattgttaaataagggggaaatgttat
cgagaagtacagaaaacaaaattaactaggataatgtgcgttaagagcct
ctcaataccctcgattcagtacccacagaataaatggtaccctccctggg
tgtttgtttgaattcaaatcaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_77831104_77831620
seq2: B6Ng01-158H24.b_364_888

seq1  TATGCCAGTGCCTGGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAACTATAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCAGTGCCTGGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAACTATAG  50

seq1  GATGGAATACAGGGCCCTCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAAGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGAATACAGGGCCCTCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAAGAG  100

seq1  CTGAAGGGGTCTGAGCCCTATAGGTAGAACAACAATATGAACTAACCAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGGGGTCTGAGCCCTATAGGTAGAACAACAATATGAACTAACCAGT  150

seq1  ACCCCCCAGAGCTCATGTCTCTAGCTATATATGTAGCAGAAGATGGCCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCCCAGAGCTCATGTCTCTAGCTATATATGTAGCAGAAGATGGCCTA  200

seq1  GTCAGCCATCATTGGGAAGAGAGGCCCCTTGGTCTTGCAAACTTTATATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGCCATCATTGGGAAGAGAGGCCCCTTGGTCTTGCAAACTTTATATG  250

seq1  CCCCAGTACAGGGGAATGCCAGGGCCAAGAAGTGGGAGTGGGTGGGTAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGTACAGGGGAATGCCAGGGCCAAGAAGTGGGAGTGGGTGGGTAGG  300

seq1  GGAGCAGGGCAGGGGAGGGTATAGGGAACTTTCAAGATAGCA-TTTGAAA  349
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GGAGCAGGGCAGGGGAGGGTATAGGGAACTTTCAAGATAGCATTTTGAAA  350

seq1  TGTAAATAAAT-AAAATATCTAATA-AAAAAT-AAATTCATATATACACA  396
      ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||
seq2  TGTAAATAAATAAAAATATCTAATACAAAAATAAAATTCATATATACACA  400

seq1  CACACACACACACACACATATAT-ATATATCATATACTAAAATGAGGTGG  445
      ||||||||||||| ||| | | |  ||||| |||||||||||||| ||||
seq2  CACACACACACACTCACGTGTGTGTTATATTATATACTAAAATGATGTGG  450

seq1  ATTTGAA-GATTAAAACAACGATCAG-ACCAGCAATTTTTC-AATTCCCA  492
      || |||| |||||||||| |  |||| || | | |||||||   |||| |
seq2  ATATGAAGGATTAAAACAGCTTTCAGAACAACCTATTTTTCTGTTTCCTA  500

seq1  AAGCAATATTGGGAAGTTATACTTT  517
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAATATTGGGAAGTTATACTTT  525

seq1: chr1_77981906_77982976
seq2: B6Ng01-158H24.g_67_1139 (reverse)

seq1  TTTGTATTTGAATTC-AACAAACA-CCAGGGA-GGTACCATTTATTCTGT  47
      |||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTTG-ATTTGAATTCAAACAAACACCCAGGGAGGGTACCATTTATTCTGT  49

seq1  GGGTACCTGATCGAGGGTATTTGAG-GGCTCTTAACGCACATTATCCTCG  96
      ||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
seq2  GGGTACTGAATCGAGGGTA-TTGAGAGGCTCTTAACGCACATTATCCTAG  98

seq1  TAATTTTTGTTTTCTTGTACTTCTCGATAACATTTCCCCCTTATTTAACA  146
      | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTTTGTTTTC-TGTACTTCTCGATAACATTTCCCCCTTATTTAACA  147

seq1  ATGACATAATTACTTTAACAACTATTTTATTTGAGGTACATGTGTGTGTT  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACATAATTACTTTAACAACTATTTTATTTGAGGTACATGTGTGTGTT  197

seq1  TAAGTGTATAGGTTTGTATATGCCATGGCACATGCATAGAGGTCAAAGGC  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGTATAGGTTTGTATATGCCATGGCACATGCATAGAGGTCAAAGGC  247

seq1  AGCTCATGGGAGCTGGTTCTTTCCCATCACCATATGGGACTCCCTCCCTT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCATGGGAGCTGGTTCTTTCCCATCACCATATGGGACTCCCTCCCTT  297

seq1  CCACTGTGTGGTCCAGGTTAGAGGACTGTAGCCATGAGGCTTGGCAGCTC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGTGTGGTCCAGGTTAGAGGACTGTAGCCATGAGGCTTGGCAGCTC  347

seq1  ACACCTTTCCTTACTGAGCTGGCTCTCAGGCCCCACATGCTTTGGGGTTT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTTTCCTTACTGAGCTGGCTCTCAGGCCCCACATGCTTTGGGGTTT  397

seq1  TATTTCTTAACTTTGCAGATGTAAAG-TTTTAAAGTTGGGCCAAACCATA  445
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCTTAACTTTGCAGATGTAAAGTTTTTAAAGTTGGGCCAAACCATA  447

seq1  CAAATTTATGAATCTCGGTATTCTAAGCAATCAGATGGCCGACTTTATTC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTTATGAATCTCGGTATTCTAAGCAATCAGATGGCCGACTTTATTC  497

seq1  TTCCTCAGGGCTTATCTCTTTTACTGGATGTAAGCAGACTAACCTTAAAC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCAGGGCTTATCTCTTTTACTGGATGTAAGCAGACTAACCTTAAAC  547

seq1  TCAATGTGATTATATATACACATATACATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGTGATTATATATACACATATACATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  597

seq1  TGTGTGTGTATTGTAGATTATTAGCCTTTCTGTACAAATGCTCAGAATAG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTATTGTAGATTATTAGCCTTTCTGTACAAATGCTCAGAATAG  647

seq1  CTGGGTGGTCTGCCCTCTGGAGGGAGCATGGGCCTTCACACTTTACCTCC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTGGTCTGCCCTCTGGAGGGAGCATGGGCCTTCACACTTTACCTCC  697

seq1  CCTCACTTCTATGCCATGTGCACCTGAGATGAATGCCATCCTGCGAGGGT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCACTTCTATGCCATGTGCACCTGAGATGAATGCCATCCTGCGAGGGT  747

seq1  TACTTGGGGGAACATTTATCTCTTGCTACTTACCCAGTCCTGACCATAAC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGGGGGAACATTTATCTCTTGCTACTTACCCAGTCCTGACCATAAC  797

seq1  AGAGATGGAGAGAGCAGGTTATCTGACTGATGCTACAGTTAAGGGATACC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATGGAGAGAGCAGGTTATCTGACTGATGCTACAGTTAAGGGATACC  847

seq1  CAGAAGGATTAAAGTTGCCCTGGATCTGGTTCAGATATATACAAGATGAA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGGATTAAAGTTGCCCTGGATCTGGTTCAGATATATACAAGATGAA  897

seq1  GAAACAGAATCCCAGTCTAATAGCAGCATCCTACCCCAGTCTCCCTGTGG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAGAATCCCAGTCTAATAGCAGCATCCTACCCCAGTCTCCCTGTGG  947

seq1  CACATCTCTCTCTCTTTTATTTATCGATCTTCATAGTGGTATAGCTTTAT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCTCTCTCTCTTTTATTTATCGATCTTCATAGTGGTATAGCTTTAT  997

seq1  GCTGAACATATTCTCCTATTAACCTGACCCCCCACCTCATCCTCCCATCC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAACATATTCTCCTATTAACCTGACCCCCCACCTCATCCTCCCATCC  1047

seq1  GTTCCCTTTGACCATCTAGAGAATTC  1071
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCCTTTGACCATCTAGAGAATTC  1073