BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-168G15
Chromosome1 (Build37)
Map Location 159,702,973 - 159,846,300
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC433368, Ralgps2, Angptl1, 4930439D14Rik, 1700057K13Rik, Rasal2, Gabarapl2-ps1_1522.1, 2810025M15Rik, BC026585, Lztr2, LOC664935, LOC100039217
Downstream gene6430517E21Rik, Astn1, Pappa2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-168G15.bB6Ng01-168G15.g
ACCDH959657DH959658
length1,1331,157
definitionDH959657|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168G15, 5' end.DH959658|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168G15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(159,702,973 - 159,704,127)(159,845,141 - 159,846,300)
sequence
gaattcattattattcctttttattcatgtttctaaaaatgtgtttttgt
gtacaacagtaaggcattagaggtctgtttaaaattatgtctgtttagca
gaataattgaataggttctcatcctagggcctatgacctgtctaacccca
ggccccccctccccccattcaaagtctggtataaataaggcaggaaggaa
ctgtgggataagggatgattgattgacagtgtgacctcaaatgtagtttg
cccaagacatgaaagacacaaaattaaaatatatttctgtttaaaggttt
atctttggtagatagtgcaacctcctactttctctttagcgtttacgctt
ttgacaagtggtgctcattagcatcttcaccagagaaggaagaactcaaa
tcagtccctttggatgctagagaagattattttgtaaaagactcagttgg
ggaggagtcggaaacaactcatataaatgagatttgggattacccttggt
ttaaaatgatggagctttgaataaaaatatcacagagaatgtgtaaatta
ttttaggtgttttagagtgtatggtttctggaattaggaaggttttagaa
taataggtaaaagccgtttctatccatggctttaggaaagtagactgggg
aaatgcttgatgtaattgttattctgcatatgagatctcttcccgttagg
gaatgggtactgagatttggtttttccctgatagcaggtgtagatttata
aagattctttctctctatttcctagagcccatttggatcacacatatcca
ttagcaagatagtaactataacacaatgcataaatgtactaaatacaaga
gaatctattgtgggctatgtgctgctctgagcttcaggggagattttaaa
taaaattttttaactgccatgcaagtaaatttatgacttctatatttgta
gatgagaactgagaggagagatttcataccagtttgaggattggggttga
cgcatgagtttcattcaacctggacttactactttttggtgcagcttaag
aaagaaagtcctaattacaggataactaagcctgtgagtctcaattctgg
cccaaagaatacctcgccctattcatgatgttt
gaattctatgtttagaattgatatattgttagatcaactgggaatgacta
gagtcatatcatctattgatttacatcaaggttgatggtaaatgaccttg
gataaaggatataatctagaatggtatttgtaacacaaatggagtgtaaa
gtttaatggctagccctttgcactgaggacctcttagatatatcgttgaa
gtttaaaggggtctcagaaggcaggaagtcaaacattccaaccagcagaa
aaaaacacttgagaacaccccctctcccttatgacctggcttgaataatt
ctgaggacacaactttattccctcacctggaggcaggtcactggactact
ctccttaagaccaaatcactgttgaatccagaatgttttcttcttggtta
taatagtttctaatatttgaataaaagcataattctttccaaatcacatt
ccttcaattagtccatacaaacagattagactccgtaacgccccaactgc
cttttttggggccactgaattaagaatgagactccaatcatggtatacaa
aaggacagtcatctccagttagtgagagacagggccatgtaacagtttct
ttcatatttggaagttctcacttaggaacataagagttagattgcaaagg
caattatttttccaaaaaaaaagttgtattaactctatcttctttttctt
taaagaaaacaatgtgagaatagccaataagggtaacagaatgggtagaa
gtgtgctgattttgtcctgttccatttaatcccaccccacttgtgcccta
ccatgctgtggttactggaagcctatttcccagaatgccccagaaaacct
aacctcctggtctcatatgagtcctaacattttatttgaaagcaattacg
atgccatatgtactgctagcatggagcatagagcatagctcagttcaaat
ccaagctctgccctttgtgtgtatttcctgttgggaaaaccttgtgctgt
gtccttaccttcaggctagaataatacctgtagagtcctacatcattgtg
aatgcagtagaatttgaaagaacaatgaaattccctaccctgtggtcaga
tgtcagcttaggcctcctaagctgcttttcttaaactccgagaatcagac
tttctag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_159702973_159704127
seq2: B6Ng01-168G15.b_45_1177

seq1  GAATTCATTATTATTCCTTTTTATTCATGTTTCTAAAAATGTGTTTTTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTATTATTCCTTTTTATTCATGTTTCTAAAAATGTGTTTTTGT  50

seq1  GTACAACAGTAAGGCATTAGAGGTCTGTTTAAAATTATGTCTGTTTAGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAACAGTAAGGCATTAGAGGTCTGTTTAAAATTATGTCTGTTTAGCA  100

seq1  GAATAATTGAATAGGTTCTCATCCTAGGGCCTATGACCTGTCTAACCCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAATTGAATAGGTTCTCATCCTAGGGCCTATGACCTGTCTAACCCCA  150

seq1  GGCCCCCCCTCCCCCCATTCAAAGTCTGGTATAAATAAGGCAGGAAGGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCCCCCTCCCCCCATTCAAAGTCTGGTATAAATAAGGCAGGAAGGAA  200

seq1  CTGTGGGATAAGGGATGATTGATTGACAGTGTGACCTCAAATGTAGTTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGGATAAGGGATGATTGATTGACAGTGTGACCTCAAATGTAGTTTG  250

seq1  CCCAAGACATGAAAGACACAAAATTAAAATATATTTCTGTTTAAAGGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGACATGAAAGACACAAAATTAAAATATATTTCTGTTTAAAGGTTT  300

seq1  ATCTTTGGTAGATAGTGCAACCTCCTACTTTCTCTTTAGCGTTTACGCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTGGTAGATAGTGCAACCTCCTACTTTCTCTTTAGCGTTTACGCTT  350

seq1  TTGACAAGTGGTGCTCATTAGCATCTTCACCAGAGAAGGAAGAACTCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACAAGTGGTGCTCATTAGCATCTTCACCAGAGAAGGAAGAACTCAAA  400

seq1  TCAGTCCCTTTGGATGCTAGAGAAGATTATTTTGTAAAAGACTCAGTTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCCCTTTGGATGCTAGAGAAGATTATTTTGTAAAAGACTCAGTTGG  450

seq1  GGAGGAGTCGGAAACAACTCATATAAATGAGATTTGGGATTACCCTTGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAGTCGGAAACAACTCATATAAATGAGATTTGGGATTACCCTTGGT  500

seq1  TTAAAATGATGGAGCTTTGAATAAAAATATCACAGAGAATGTGTAAATTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATGATGGAGCTTTGAATAAAAATATCACAGAGAATGTGTAAATTA  550

seq1  TTTTAGGTGTTTTAGAGTGTATGGTTTCTGGAATTAGGAAGGTTTTAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGGTGTTTTAGAGTGTATGGTTTCTGGAATTAGGAAGGTTTTAGAA  600

seq1  TAATAGGTAAAAGCCGTTTCTATCCATGGCTTTAGGAAAGTAGACTGGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGGTAAAAGCCGTTTCTATCCATGGCTTTAGGAAAGTAGACTGGGG  650

seq1  AAATGCTTGATGTAATTGTTATTCTGCATATGAGATCTCTTCCCGTTAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCTTGATGTAATTGTTATTCTGCATATGAGATCTCTTCCCGTTAGG  700

seq1  GAATGGGTACTGAGATTTGGTTTTTCCCTGATAGCAGGTGTAGATTTATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGGTACTGAGATTTGGTTTTTCCCTGATAGCAGGTGTAGATTTATA  750

seq1  AAGATTCTTTCTCTCTATTTCCTAGAGCCCATTTGGATCACACATATCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTCTTTCTCTCTATTTCCTAGAGCCCATTTGGATCACACATATCCA  800

seq1  TTAGCAAGATAGTAACTATAACACAATGCATAAATGTACTAAATACAAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCAAGATAGTAACTATAACACAATGCATAAATGTACTAAATACAAGA  850

seq1  GAATCTATTGTGGGCTATGTGCTGCTCTGAGCTTCAGGGGAGATTTTAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTATTGTGGGCTATGTGCTGCTCTGAGCTTCAGGGGAGATTTTAAA  900

seq1  TAAAATTTTTTAACTGCCATGCAAAGTAAATTTTATGACTTCTATTATTT  950
      |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||
seq2  TAAAATTTTTTAACTGCCATGC-AAGTAAA-TTTATGACTTCTAT--ATT  946

seq1  TGTAGATGAGAACTGAAGAGGAGAAGAATTTCATACCAAGTTTGAGGATT  1000
      ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||||
seq2  TGTAGATGAGAACTG-AGAGGAGA--GATTTCATACC-AGTTTGAGGATT  992

seq1  GGGGTTGGAACGCATGAGTTTCATTTCAAAACCTGGACTTACTACTTTTT  1050
      |||||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTTG--ACGCATGAGTTTCATT---CAACCTGGACTTACTACTTTTT  1037

seq1  TGTGCAGCCTTTAAGAAAGACAGTCCTAAATACAGGATAACTTAAAGCCT  1100
       |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||
seq2  GGTGCAGC--TTAAGAAAGAAAGTCCTAATTACAGGATAACT--AAGCCT  1083

seq1  GTGAGTCTCAAATTCCTGGCCAAAAGAATAACCTCGCCCTTATTTCATGA  1150
      |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||   |||||||
seq2  GTGAGTCTCAA--TTCTGGCCCAAAGAAT-ACCTCGCCCT--ATTCATGA  1128

seq1  TGTTT  1155
      |||||
seq2  TGTTT  1133

seq1: chr1_159845141_159846300
seq2: B6Ng01-168G15.g_67_1223 (reverse)

seq1  CTAGAAAAGTCTGATTTTCGGAGTTTAGG--AAGCAAGCTTAGTGAGGCC  48
      |||| ||||||||||| |||||||||| |  |||| ||||||| ||||||
seq2  CTAG-AAAGTCTGATTCTCGGAGTTTAAGAAAAGC-AGCTTAG-GAGGCC  47

seq1  TAAGCTGGCATCTGA-CACAGGGT-GTGAATTTCATTTGTTCTATCAAAT  96
      ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||
seq2  TAAGCTGACATCTGACCACAGGGTAGGGAATTTCA-TTGTTCTTTCAAAT  96

seq1  TCTTACTGCATCCAC-ATGATGTAAGGACTCTACAGGTATTATTCTAGCC  145
      || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TC-TACTGCATTCACAATGATGT-AGGACTCTACAGGTATTATTCTAGCC  144

seq1  TGAAGGTAAGGACACAGCACCAAGGTTTTCCCAACAGGAAATACACACAA  195
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGTAAGGACACAGCA-CAAGGTTTTCCCAACAGGAAATACACACAA  193

seq1  AGGGGCAGAGCTTGGATTTGAACTGAGCTATGCTCTATGCTCCATGCTAG  245
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-GGGCAGAGCTTGGATTTGAACTGAGCTATGCTCTATGCTCCATGCTAG  242

seq1  CAGTACATATGGCATCGTAATTGCTTTCAAATAAAATGTTAGGACTCATA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACATATGGCATCGTAATTGCTTTCAAATAAAATGTTAGGACTCATA  292

seq1  AGAGACCAGGAGGTTAGGTTTTCTGGGGCATTCTGGGAAATAGGCTTCCA  345
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACCAGGAGGTTAGGTTTTCTGGGGCATTCTGGGAAATAGGCTTCCA  342

seq1  GTAACCACAGCATGGTAGGGCACAAGTGGGGTGGGATTAAATGGAACAGG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACCACAGCATGGTAGGGCACAAGTGGGGTGGGATTAAATGGAACAGG  392

seq1  ACAAAATCAGCACACTTCTACCCATTCTGTTACCCTTATTGGCTATTCTC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAATCAGCACACTTCTACCCATTCTGTTACCCTTATTGGCTATTCTC  442

seq1  ACATTGTTTTCTTTAAAGAAAAAGAAGATAGAGTTAATACAACTTTTTTT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGTTTTCTTTAAAGAAAAAGAAGATAGAGTTAATACAACTTTTTTT  492

seq1  TTGGAAAAATAATTGCCTTTGCAATCTAACTCTTATGTTCCTAAGTGAGA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAAAAATAATTGCCTTTGCAATCTAACTCTTATGTTCCTAAGTGAGA  542

seq1  ACTTCCAAATATGAAAGAAACTGTTACATGGCCCTGTCTCTCACTAACTG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCAAATATGAAAGAAACTGTTACATGGCCCTGTCTCTCACTAACTG  592

seq1  GAGATGACTGTCCTTTTGTATACCATGATTGGAGTCTCATTCTTAATTCA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGACTGTCCTTTTGTATACCATGATTGGAGTCTCATTCTTAATTCA  642

seq1  GTGGCCCCAAAAAAGGCAGTTGGGGCGTTACGGAGTCTAATCTGTTTGTA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCCCAAAAAAGGCAGTTGGGGCGTTACGGAGTCTAATCTGTTTGTA  692

seq1  TGGACTAATTGAAGGAATGTGATTTGGAAAGAATTATGCTTTTATTCAAA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTAATTGAAGGAATGTGATTTGGAAAGAATTATGCTTTTATTCAAA  742

seq1  TATTAGAAACTATTATAACCAAGAAGAAAACATTCTGGATTCAACAGTGA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAGAAACTATTATAACCAAGAAGAAAACATTCTGGATTCAACAGTGA  792

seq1  TTTGGTCTTAAGGAGAGTAGTCCAGTGACCTGCCTCCAGGTGAGGGAATA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTCTTAAGGAGAGTAGTCCAGTGACCTGCCTCCAGGTGAGGGAATA  842

seq1  AAGTTGTGTCCTCAGAATTATTCAAGCCAGGTCATAAGGGAGAGGGGGTG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGTGTCCTCAGAATTATTCAAGCCAGGTCATAAGGGAGAGGGGGTG  892

seq1  TTCTCAAGTGTTTTTTTCTGCTGGTTGGAATGTTTGACTTCCTGCCTTCT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAAGTGTTTTTTTCTGCTGGTTGGAATGTTTGACTTCCTGCCTTCT  942

seq1  GAGACCCCTTTAAACTTCAACGATATATCTAAGAGGTCCTCAGTGCAAAG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCCCTTTAAACTTCAACGATATATCTAAGAGGTCCTCAGTGCAAAG  992

seq1  GGCTAGCCATTAAACTTTACACTCCATTTGTGTTACAAATACCATTCTAG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAGCCATTAAACTTTACACTCCATTTGTGTTACAAATACCATTCTAG  1042

seq1  ATTATATCCTTTATCCAAGGTCATTTACCATCAACCTTGATGTAAATCAA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATATCCTTTATCCAAGGTCATTTACCATCAACCTTGATGTAAATCAA  1092

seq1  TAGATGATATGACTCTAGTCATTCCCAGTTGATCTAACAATATATCAATT  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGATATGACTCTAGTCATTCCCAGTTGATCTAACAATATATCAATT  1142

seq1  CTAAACATAGAATTC  1160
      |||||||||||||||
seq2  CTAAACATAGAATTC  1157